MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV3

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015179	CGGC	2	8	402	409	0 %	0 %	50 %	50 %	325113278
2	NC_015179	AGGT	2	8	593	600	25 %	25 %	50 %	0 %	325113278
3	NC_015179	CGGT	2	8	945	952	0 %	25 %	50 %	25 %	325113278
4	NC_015179	TCAA	2	8	1599	1606	50 %	25 %	0 %	25 %	325113279
5	NC_015179	GTCC	2	8	2844	2851	0 %	25 %	25 %	50 %	325113281
6	NC_015179	ACGG	2	8	3002	3009	25 %	0 %	50 %	25 %	325113281
7	NC_015179	ATCA	2	8	3015	3022	50 %	25 %	0 %	25 %	325113281
8	NC_015179	GTTC	2	8	3212	3219	0 %	50 %	25 %	25 %	325113281
9	NC_015179	TCGA	2	8	3523	3530	25 %	25 %	25 %	25 %	325113281
10	NC_015179	GGGC	2	8	3898	3905	0 %	0 %	75 %	25 %	325113282
11	NC_015179	CCGA	2	8	4745	4752	25 %	0 %	25 %	50 %	325113284
12	NC_015179	GGCC	2	8	5055	5062	0 %	0 %	50 %	50 %	325113284
13	NC_015179	CCCG	2	8	5377	5384	0 %	0 %	25 %	75 %	325113284
14	NC_015179	GATC	2	8	5652	5659	25 %	25 %	25 %	25 %	325113284
15	NC_015179	GACC	2	8	5886	5893	25 %	0 %	25 %	50 %	325113284
16	NC_015179	GCCG	2	8	7080	7087	0 %	0 %	50 %	50 %	325113286
17	NC_015179	CGGC	3	12	7193	7204	0 %	0 %	50 %	50 %	325113286
18	NC_015179	CATC	2	8	7437	7444	25 %	25 %	0 %	50 %	325113286
19	NC_015179	ATGG	2	8	8157	8164	25 %	25 %	50 %	0 %	325113287
20	NC_015179	TGCG	2	8	8184	8191	0 %	25 %	50 %	25 %	325113287
21	NC_015179	TCGA	2	8	8257	8264	25 %	25 %	25 %	25 %	325113287
22	NC_015179	CGGG	2	8	8375	8382	0 %	0 %	75 %	25 %	325113287
23	NC_015179	CCGA	2	8	8424	8431	25 %	0 %	25 %	50 %	325113287
24	NC_015179	CAGG	2	8	8531	8538	25 %	0 %	50 %	25 %	325113287
25	NC_015179	CTGG	2	8	8606	8613	0 %	25 %	50 %	25 %	325113287
26	NC_015179	GGCT	2	8	8617	8624	0 %	25 %	50 %	25 %	325113287
27	NC_015179	GTTC	2	8	8861	8868	0 %	50 %	25 %	25 %	325113287
28	NC_015179	GCCG	2	8	8881	8888	0 %	0 %	50 %	50 %	325113287
29	NC_015179	GGCC	2	8	8915	8922	0 %	0 %	50 %	50 %	325113287
30	NC_015179	CATC	2	8	9338	9345	25 %	25 %	0 %	50 %	325113288
31	NC_015179	CCGC	2	8	9782	9789	0 %	0 %	25 %	75 %	325113288
32	NC_015179	GGTG	2	8	10016	10023	0 %	25 %	75 %	0 %	325113288
33	NC_015179	CCGC	2	8	10058	10065	0 %	0 %	25 %	75 %	325113288
34	NC_015179	GCCC	2	8	10145	10152	0 %	0 %	25 %	75 %	325113288
35	NC_015179	GGTC	2	8	10516	10523	0 %	25 %	50 %	25 %	325113289
36	NC_015179	CCGA	2	8	11900	11907	25 %	0 %	25 %	50 %	325113290
37	NC_015179	ACGA	2	8	12140	12147	50 %	0 %	25 %	25 %	325113290
38	NC_015179	CGCA	2	8	12160	12167	25 %	0 %	25 %	50 %	325113290
39	NC_015179	ATTT	2	8	13596	13603	25 %	75 %	0 %	0 %	325113291
40	NC_015179	GGCG	2	8	13612	13619	0 %	0 %	75 %	25 %	325113292
41	NC_015179	GCGA	2	8	13698	13705	25 %	0 %	50 %	25 %	325113292
42	NC_015179	CGGG	2	8	13712	13719	0 %	0 %	75 %	25 %	325113292
43	NC_015179	CGAG	2	8	13912	13919	25 %	0 %	50 %	25 %	325113292
44	NC_015179	AGAT	2	8	14106	14113	50 %	25 %	25 %	0 %	325113292
45	NC_015179	CCCG	2	8	14251	14258	0 %	0 %	25 %	75 %	325113292
46	NC_015179	TCGC	2	8	14361	14368	0 %	25 %	25 %	50 %	325113292
47	NC_015179	AGGC	2	8	14475	14482	25 %	0 %	50 %	25 %	325113292
48	NC_015179	ATCG	2	8	14872	14879	25 %	25 %	25 %	25 %	325113293
49	NC_015179	AGAT	2	8	15107	15114	50 %	25 %	25 %	0 %	325113293
50	NC_015179	ATCA	2	8	15832	15839	50 %	25 %	0 %	25 %	325113293
51	NC_015179	AGGC	2	8	16277	16284	25 %	0 %	50 %	25 %	325113293
52	NC_015179	CAGC	2	8	17057	17064	25 %	0 %	25 %	50 %	325113295
53	NC_015179	GATC	2	8	17352	17359	25 %	25 %	25 %	25 %	325113296
54	NC_015179	GCAG	2	8	18457	18464	25 %	0 %	50 %	25 %	325113299
55	NC_015179	CCAT	2	8	18921	18928	25 %	25 %	0 %	50 %	325113299
56	NC_015179	TGGA	2	8	19035	19042	25 %	25 %	50 %	0 %	325113299
57	NC_015179	TCCG	2	8	19237	19244	0 %	25 %	25 %	50 %	325113299
58	NC_015179	GACG	2	8	20233	20240	25 %	0 %	50 %	25 %	325113301
59	NC_015179	TGCC	2	8	20261	20268	0 %	25 %	25 %	50 %	325113301
60	NC_015179	GCCG	2	8	21493	21500	0 %	0 %	50 %	50 %	325113302
61	NC_015179	GCGG	2	8	21783	21790	0 %	0 %	75 %	25 %	325113302
62	NC_015179	CGGG	2	8	22274	22281	0 %	0 %	75 %	25 %	325113302
63	NC_015179	GCCG	2	8	22588	22595	0 %	0 %	50 %	50 %	325113302
64	NC_015179	GTGG	2	8	22605	22612	0 %	25 %	75 %	0 %	325113302
65	NC_015179	GGAT	2	8	22816	22823	25 %	25 %	50 %	0 %	325113302
66	NC_015179	GTGC	2	8	22899	22906	0 %	25 %	50 %	25 %	325113302
67	NC_015179	GCGG	2	8	22991	22998	0 %	0 %	75 %	25 %	325113302
68	NC_015179	GGCA	2	8	23012	23019	25 %	0 %	50 %	25 %	325113302
69	NC_015179	GGCG	2	8	23255	23262	0 %	0 %	75 %	25 %	325113302
70	NC_015179	GGCG	2	8	23303	23310	0 %	0 %	75 %	25 %	325113302
71	NC_015179	TGGG	2	8	23440	23447	0 %	25 %	75 %	0 %	325113302
72	NC_015179	CCAT	2	8	24280	24287	25 %	25 %	0 %	50 %	325113303
73	NC_015179	AGGC	2	8	24566	24573	25 %	0 %	50 %	25 %	325113304
74	NC_015179	CGGC	3	12	24625	24636	0 %	0 %	50 %	50 %	325113304
75	NC_015179	GCAC	2	8	25544	25551	25 %	0 %	25 %	50 %	325113305
76	NC_015179	CACC	2	8	26160	26167	25 %	0 %	0 %	75 %	325113305
77	NC_015179	CCAG	2	8	26466	26473	25 %	0 %	25 %	50 %	325113305
78	NC_015179	CGGC	2	8	26600	26607	0 %	0 %	50 %	50 %	325113305
79	NC_015179	CGGC	2	8	26880	26887	0 %	0 %	50 %	50 %	325113305
80	NC_015179	GGCC	2	8	27241	27248	0 %	0 %	50 %	50 %	325113306
81	NC_015179	GTCG	2	8	28085	28092	0 %	25 %	50 %	25 %	325113307
82	NC_015179	CGCT	2	8	28154	28161	0 %	25 %	25 %	50 %	325113307
83	NC_015179	GATT	2	8	28587	28594	25 %	50 %	25 %	0 %	325113308
84	NC_015179	TGCT	2	8	28704	28711	0 %	50 %	25 %	25 %	325113308
85	NC_015179	GCGG	2	8	29104	29111	0 %	0 %	75 %	25 %	325113308
86	NC_015179	GATC	2	8	29409	29416	25 %	25 %	25 %	25 %	325113308
87	NC_015179	TTGC	2	8	29498	29505	0 %	50 %	25 %	25 %	325113308
88	NC_015179	GCAT	2	8	29506	29513	25 %	25 %	25 %	25 %	325113308
89	NC_015179	TTCT	2	8	30378	30385	0 %	75 %	0 %	25 %	325113309
90	NC_015179	CGGC	2	8	30607	30614	0 %	0 %	50 %	50 %	325113309
91	NC_015179	GGTT	2	8	30659	30666	0 %	50 %	50 %	0 %	325113309
92	NC_015179	CGAG	2	8	30846	30853	25 %	0 %	50 %	25 %	325113309
93	NC_015179	GGTG	2	8	30865	30872	0 %	25 %	75 %	0 %	325113309
94	NC_015179	GCTC	2	8	31681	31688	0 %	25 %	25 %	50 %	325113310
95	NC_015179	GATC	2	8	32085	32092	25 %	25 %	25 %	25 %	325113310
96	NC_015179	AACC	2	8	32102	32109	50 %	0 %	0 %	50 %	325113310
97	NC_015179	GATG	2	8	32504	32511	25 %	25 %	50 %	0 %	325113311
98	NC_015179	CTGG	2	8	33039	33046	0 %	25 %	50 %	25 %	325113311
99	NC_015179	AGCA	2	8	33564	33571	50 %	0 %	25 %	25 %	325113312
100	NC_015179	CAGT	2	8	33953	33960	25 %	25 %	25 %	25 %	325113312
101	NC_015179	GCGT	2	8	34248	34255	0 %	25 %	50 %	25 %	325113312
102	NC_015179	GGCT	2	8	35176	35183	0 %	25 %	50 %	25 %	325113313
103	NC_015179	CCAC	2	8	35458	35465	25 %	0 %	0 %	75 %	325113314
104	NC_015179	CGTA	2	8	36176	36183	25 %	25 %	25 %	25 %	325113315
105	NC_015179	ATCT	2	8	36213	36220	25 %	50 %	0 %	25 %	325113315
106	NC_015179	TGAA	2	8	36430	36437	50 %	25 %	25 %	0 %	325113315
107	NC_015179	GAGT	2	8	36656	36663	25 %	25 %	50 %	0 %	325113315
108	NC_015179	ACGC	2	8	38025	38032	25 %	0 %	25 %	50 %	325113317
109	NC_015179	GCCG	2	8	38043	38050	0 %	0 %	50 %	50 %	325113317
110	NC_015179	CCGA	2	8	38546	38553	25 %	0 %	25 %	50 %	325113318
111	NC_015179	GGCA	2	8	40354	40361	25 %	0 %	50 %	25 %	325113320
112	NC_015179	CTGC	2	8	41159	41166	0 %	25 %	25 %	50 %	325113321
113	NC_015179	CGGC	2	8	41167	41174	0 %	0 %	50 %	50 %	325113321
114	NC_015179	GATG	2	8	41705	41712	25 %	25 %	50 %	0 %	325113321
115	NC_015179	GCCG	2	8	42091	42098	0 %	0 %	50 %	50 %	325113321
116	NC_015179	TGGG	2	8	42456	42463	0 %	25 %	75 %	0 %	325113322
117	NC_015179	CGGC	2	8	43035	43042	0 %	0 %	50 %	50 %	325113322
118	NC_015179	CGTC	2	8	43072	43079	0 %	25 %	25 %	50 %	325113322
119	NC_015179	CGTG	2	8	43533	43540	0 %	25 %	50 %	25 %	325113323
120	NC_015179	AGGC	2	8	45234	45241	25 %	0 %	50 %	25 %	325113325
121	NC_015179	CCAG	2	8	46032	46039	25 %	0 %	25 %	50 %	325113327
122	NC_015179	GCGT	2	8	46500	46507	0 %	25 %	50 %	25 %	325113328
123	NC_015179	GCCG	2	8	46688	46695	0 %	0 %	50 %	50 %	325113328
124	NC_015179	GCCG	2	8	46816	46823	0 %	0 %	50 %	50 %	325113328
125	NC_015179	CTTC	2	8	46979	46986	0 %	50 %	0 %	50 %	325113328
126	NC_015179	TCAC	2	8	48030	48037	25 %	25 %	0 %	50 %	325113330
127	NC_015179	TGCG	2	8	48895	48902	0 %	25 %	50 %	25 %	325113332
128	NC_015179	CGGG	2	8	49323	49330	0 %	0 %	75 %	25 %	325113333
129	NC_015179	CAGC	2	8	49340	49347	25 %	0 %	25 %	50 %	325113333
130	NC_015179	CGCT	2	8	49510	49517	0 %	25 %	25 %	50 %	325113333
131	NC_015179	CTCG	2	8	49553	49560	0 %	25 %	25 %	50 %	325113333
132	NC_015179	GCCG	2	8	50040	50047	0 %	0 %	50 %	50 %	325113334
133	NC_015179	CATC	2	8	51373	51380	25 %	25 %	0 %	50 %	325113335
134	NC_015179	CGGG	2	8	52457	52464	0 %	0 %	75 %	25 %	325113336
135	NC_015179	GCAA	2	8	52791	52798	50 %	0 %	25 %	25 %	325113336
136	NC_015179	CAGG	2	8	52871	52878	25 %	0 %	50 %	25 %	325113336
137	NC_015179	ACCC	2	8	53435	53442	25 %	0 %	0 %	75 %	325113337
138	NC_015179	CGCC	2	8	53479	53486	0 %	0 %	25 %	75 %	325113337

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.