MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV3

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015179	GC	3	6	776	781	0 %	0 %	50 %	50 %	325113278
2	NC_015179	GA	3	6	1952	1957	50 %	0 %	50 %	0 %	325113280
3	NC_015179	CA	3	6	2471	2476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015179	GC	4	8	2506	2513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015179	GA	3	6	2593	2598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015179	CG	3	6	3803	3808	0 %	0 %	50 %	50 %	325113282
7	NC_015179	CG	3	6	4495	4500	0 %	0 %	50 %	50 %	325113283
8	NC_015179	CG	3	6	4570	4575	0 %	0 %	50 %	50 %	325113283
9	NC_015179	GC	3	6	6359	6364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015179	GC	3	6	7230	7235	0 %	0 %	50 %	50 %	325113286
11	NC_015179	CA	3	6	7946	7951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015179	GC	3	6	8475	8480	0 %	0 %	50 %	50 %	325113287
13	NC_015179	GC	3	6	8520	8525	0 %	0 %	50 %	50 %	325113287
14	NC_015179	GC	3	6	8544	8549	0 %	0 %	50 %	50 %	325113287
15	NC_015179	CT	3	6	9255	9260	0 %	50 %	0 %	50 %	325113287
16	NC_015179	CG	3	6	9379	9384	0 %	0 %	50 %	50 %	325113288
17	NC_015179	GC	4	8	9432	9439	0 %	0 %	50 %	50 %	325113288
18	NC_015179	CG	3	6	9735	9740	0 %	0 %	50 %	50 %	325113288
19	NC_015179	GC	3	6	10308	10313	0 %	0 %	50 %	50 %	325113289
20	NC_015179	GC	4	8	10345	10352	0 %	0 %	50 %	50 %	325113289
21	NC_015179	AC	3	6	11124	11129	50 %	0 %	0 %	50 %	325113289
22	NC_015179	AC	3	6	11134	11139	50 %	0 %	0 %	50 %	325113289
23	NC_015179	GC	3	6	11336	11341	0 %	0 %	50 %	50 %	325113290
24	NC_015179	CG	3	6	11793	11798	0 %	0 %	50 %	50 %	325113290
25	NC_015179	GC	3	6	12948	12953	0 %	0 %	50 %	50 %	325113291
26	NC_015179	CG	3	6	13464	13469	0 %	0 %	50 %	50 %	325113291
27	NC_015179	CG	3	6	13618	13623	0 %	0 %	50 %	50 %	325113292
28	NC_015179	GC	3	6	13976	13981	0 %	0 %	50 %	50 %	325113292
29	NC_015179	GC	3	6	15867	15872	0 %	0 %	50 %	50 %	325113293
30	NC_015179	GC	3	6	15981	15986	0 %	0 %	50 %	50 %	325113293
31	NC_015179	CA	3	6	16405	16410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015179	AT	3	6	18344	18349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015179	AT	3	6	18374	18379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015179	CG	3	6	18854	18859	0 %	0 %	50 %	50 %	325113299
35	NC_015179	AC	3	6	20803	20808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015179	CG	4	8	22450	22457	0 %	0 %	50 %	50 %	325113302
37	NC_015179	CG	3	6	22531	22536	0 %	0 %	50 %	50 %	325113302
38	NC_015179	GC	3	6	22671	22676	0 %	0 %	50 %	50 %	325113302
39	NC_015179	CG	4	8	22874	22881	0 %	0 %	50 %	50 %	325113302
40	NC_015179	GC	4	8	23363	23370	0 %	0 %	50 %	50 %	325113302
41	NC_015179	CG	3	6	23659	23664	0 %	0 %	50 %	50 %	325113302
42	NC_015179	GA	3	6	24385	24390	50 %	0 %	50 %	0 %	325113303
43	NC_015179	TC	3	6	24691	24696	0 %	50 %	0 %	50 %	325113304
44	NC_015179	TA	3	6	24832	24837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015179	AG	3	6	24869	24874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015179	GA	3	6	25631	25636	50 %	0 %	50 %	0 %	325113305
47	NC_015179	CG	4	8	25725	25732	0 %	0 %	50 %	50 %	325113305
48	NC_015179	CG	3	6	26080	26085	0 %	0 %	50 %	50 %	325113305
49	NC_015179	CG	3	6	26634	26639	0 %	0 %	50 %	50 %	325113305
50	NC_015179	CG	3	6	27357	27362	0 %	0 %	50 %	50 %	325113306
51	NC_015179	TC	3	6	27421	27426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015179	CG	3	6	27502	27507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015179	GA	3	6	27837	27842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015179	CG	4	8	27907	27914	0 %	0 %	50 %	50 %	325113307
55	NC_015179	TG	3	6	27985	27990	0 %	50 %	50 %	0 %	325113307
56	NC_015179	GC	3	6	28124	28129	0 %	0 %	50 %	50 %	325113307
57	NC_015179	TA	3	6	28398	28403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015179	GA	3	6	28406	28411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015179	GC	3	6	30123	30128	0 %	0 %	50 %	50 %	325113308
60	NC_015179	CG	3	6	30176	30181	0 %	0 %	50 %	50 %	325113308
61	NC_015179	AC	3	6	30951	30956	50 %	0 %	0 %	50 %	325113309
62	NC_015179	AG	3	6	31060	31065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015179	GC	3	6	31303	31308	0 %	0 %	50 %	50 %	325113310
64	NC_015179	CG	3	6	31454	31459	0 %	0 %	50 %	50 %	325113310
65	NC_015179	GC	3	6	31913	31918	0 %	0 %	50 %	50 %	325113310
66	NC_015179	GT	3	6	32343	32348	0 %	50 %	50 %	0 %	325113311
67	NC_015179	GC	3	6	32950	32955	0 %	0 %	50 %	50 %	325113311
68	NC_015179	GC	3	6	33162	33167	0 %	0 %	50 %	50 %	325113311
69	NC_015179	TC	3	6	34264	34269	0 %	50 %	0 %	50 %	325113312
70	NC_015179	GC	3	6	34393	34398	0 %	0 %	50 %	50 %	325113312
71	NC_015179	CG	3	6	35020	35025	0 %	0 %	50 %	50 %	325113313
72	NC_015179	AC	3	6	35770	35775	50 %	0 %	0 %	50 %	325113314
73	NC_015179	CG	3	6	36068	36073	0 %	0 %	50 %	50 %	325113315
74	NC_015179	AT	3	6	36622	36627	50 %	50 %	0 %	0 %	325113315
75	NC_015179	GC	3	6	37673	37678	0 %	0 %	50 %	50 %	325113316
76	NC_015179	GC	3	6	37802	37807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015179	TG	3	6	38251	38256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015179	AG	3	6	38714	38719	50 %	0 %	50 %	0 %	325113318
79	NC_015179	GC	3	6	39291	39296	0 %	0 %	50 %	50 %	325113319
80	NC_015179	TC	3	6	39588	39593	0 %	50 %	0 %	50 %	325113319
81	NC_015179	CG	4	8	39717	39724	0 %	0 %	50 %	50 %	325113319
82	NC_015179	GC	3	6	39950	39955	0 %	0 %	50 %	50 %	325113319
83	NC_015179	CG	3	6	40287	40292	0 %	0 %	50 %	50 %	325113320
84	NC_015179	GC	5	10	40563	40572	0 %	0 %	50 %	50 %	325113320
85	NC_015179	GC	3	6	40898	40903	0 %	0 %	50 %	50 %	325113320
86	NC_015179	CT	3	6	41299	41304	0 %	50 %	0 %	50 %	325113321
87	NC_015179	TC	3	6	41354	41359	0 %	50 %	0 %	50 %	325113321
88	NC_015179	CA	3	6	41683	41688	50 %	0 %	0 %	50 %	325113321
89	NC_015179	GC	3	6	41951	41956	0 %	0 %	50 %	50 %	325113321
90	NC_015179	CA	3	6	42217	42222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015179	TA	3	6	42378	42383	50 %	50 %	0 %	0 %	325113322
92	NC_015179	GA	3	6	43123	43128	50 %	0 %	50 %	0 %	325113322
93	NC_015179	CG	3	6	43432	43437	0 %	0 %	50 %	50 %	325113323
94	NC_015179	CG	3	6	43741	43746	0 %	0 %	50 %	50 %	325113323
95	NC_015179	AC	3	6	44365	44370	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015179	GC	3	6	44939	44944	0 %	0 %	50 %	50 %	325113325
97	NC_015179	CG	3	6	45524	45529	0 %	0 %	50 %	50 %	325113326
98	NC_015179	GC	3	6	45585	45590	0 %	0 %	50 %	50 %	325113326
99	NC_015179	CG	3	6	47394	47399	0 %	0 %	50 %	50 %	325113329
100	NC_015179	CG	3	6	47755	47760	0 %	0 %	50 %	50 %	325113330
101	NC_015179	TG	3	6	47808	47813	0 %	50 %	50 %	0 %	325113330
102	NC_015179	GC	3	6	47863	47868	0 %	0 %	50 %	50 %	325113330
103	NC_015179	AC	3	6	48934	48939	50 %	0 %	0 %	50 %	325113332
104	NC_015179	GC	3	6	48948	48953	0 %	0 %	50 %	50 %	325113332
105	NC_015179	GC	3	6	49024	49029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015179	CG	3	6	50259	50264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015179	CG	3	6	50547	50552	0 %	0 %	50 %	50 %	325113335
108	NC_015179	GC	4	8	50958	50965	0 %	0 %	50 %	50 %	325113335
109	NC_015179	AG	3	6	51737	51742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015179	TA	3	6	51790	51795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015179	AG	3	6	52559	52564	50 %	0 %	50 %	0 %	325113336
112	NC_015179	AG	3	6	52585	52590	50 %	0 %	50 %	0 %	325113336
113	NC_015179	GC	4	8	52990	52997	0 %	0 %	50 %	50 %	325113336
114	NC_015179	GC	3	6	53916	53921	0 %	0 %	50 %	50 %	325113338
115	NC_015179	GA	3	6	54034	54039	50 %	0 %	50 %	0 %	325113338

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.