MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV1

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015178	CGGCAA	2	12	5941	5952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325112997
2	NC_015178	GAAGAT	2	12	6842	6853	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325112997
3	NC_015178	GCTCGG	2	12	11897	11908	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325113002
4	NC_015178	GCTTGG	2	12	13804	13815	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	325113006
5	NC_015178	GTGGGT	2	12	15939	15950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325113007
6	NC_015178	AAACAA	2	12	16574	16585	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	325113008
7	NC_015178	CGGTCG	2	12	23354	23365	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325113018
8	NC_015178	ATCGCC	2	12	35033	35044	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325113030
9	NC_015178	ACCGGC	2	12	35702	35713	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325113030
10	NC_015178	CTTGCG	2	12	36137	36148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113031
11	NC_015178	CGCTGC	2	12	37083	37094	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325113031
12	NC_015178	ATCCTG	2	12	41011	41022	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325113033
13	NC_015178	CGCAAC	2	12	41403	41414	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325113033
14	NC_015178	CATCCC	2	12	42456	42467	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	325113034
15	NC_015178	CTATGT	2	12	43601	43612	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325113035
16	NC_015178	GCCGGT	2	12	46867	46878	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325113039
17	NC_015178	AACCGC	2	12	48195	48206	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325113040
18	NC_015178	CCGATC	2	12	49632	49643	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325113044
19	NC_015178	GCGCCG	2	12	49698	49709	0 %	0 %	50 %	50 %	325113045
20	NC_015178	GAGCCG	2	12	53281	53292	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325113049
21	NC_015178	CCGATG	2	12	54046	54057	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325113049
22	NC_015178	GGACGA	2	12	55699	55710	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	325113052
23	NC_015178	GCCTCC	2	12	55875	55886	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	325113052
24	NC_015178	CGGCCG	2	12	57580	57591	0 %	0 %	50 %	50 %	325113054
25	NC_015178	GCGATG	2	12	57877	57888	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325113054
26	NC_015178	GGGTCG	2	12	57910	57921	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325113054
27	NC_015178	GCTCGG	2	12	60370	60381	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325113055
28	NC_015178	GGTCTC	2	12	61379	61390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113055
29	NC_015178	GGCAAG	2	12	63301	63312	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	325113058
30	NC_015178	ATCTCG	2	12	65276	65287	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325113059
31	NC_015178	TCGCGC	2	12	65297	65308	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325113059
32	NC_015178	GAGCTT	2	12	65666	65677	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325113060
33	NC_015178	CAACGA	2	12	68768	68779	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	325113064
34	NC_015178	GCGCGA	2	12	69434	69445	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325113065
35	NC_015178	CGAGGC	2	12	72777	72788	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325113069
36	NC_015178	AGTCGA	2	12	76954	76965	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325113074
37	NC_015178	GGTCAG	2	12	78447	78458	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325113078
38	NC_015178	GTGCGG	2	12	85296	85307	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325113086
39	NC_015178	CATTCC	2	12	86394	86405	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	325113087
40	NC_015178	CGGATA	2	12	86849	86860	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325113087
41	NC_015178	CGCGCC	2	12	87995	88006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113088
42	NC_015178	GCTTCG	2	12	88645	88656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113089
43	NC_015178	ACGAGG	2	12	93178	93189	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	325113092
44	NC_015178	GCCGGC	2	12	103087	103098	0 %	0 %	50 %	50 %	325113105
45	NC_015178	CGCTGG	2	12	105966	105977	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325113108
46	NC_015178	TCGCGG	2	12	108284	108295	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325113109
47	NC_015178	GGCGCG	2	12	110261	110272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113110
48	NC_015178	GGCCGG	2	12	114550	114561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113114
49	NC_015178	AGTTCC	2	12	114906	114917	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325113114
50	NC_015178	CGGCAC	2	12	117105	117116	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325113117
51	NC_015178	CCTTGC	2	12	118141	118152	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325113118
52	NC_015178	AGGCCG	2	12	119236	119247	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325113119
53	NC_015178	GCCTCG	2	12	122551	122562	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325113123
54	NC_015178	GCCTGA	2	12	124917	124928	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325113126
55	NC_015178	TGCCTT	2	12	125543	125554	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325113126
56	NC_015178	TCGACA	2	12	128205	128216	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325113129
57	NC_015178	CCGCGA	2	12	128770	128781	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325113129
58	NC_015178	CGACGG	2	12	134140	134151	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325113135
59	NC_015178	CTGCGC	2	12	134786	134797	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325113135
60	NC_015178	TCCATT	2	12	135489	135500	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	325113136
61	NC_015178	CGACGG	2	12	137291	137302	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325113138
62	NC_015178	CTGCGC	2	12	137937	137948	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325113138
63	NC_015178	CTGGTG	2	12	140120	140131	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	325113141
64	NC_015178	GATCGA	2	12	154773	154784	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325113154
65	NC_015178	ATCGAG	2	12	159412	159423	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325113158
66	NC_015178	TGGTGT	2	12	161217	161228	0 %	50 %	50 %	0 %	325113161
67	NC_015178	ACCCAC	2	12	161753	161764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113162
68	NC_015178	ACCCAC	2	12	163085	163096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113163
69	NC_015178	AAATAC	2	12	164734	164745	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	325113164
70	NC_015178	TCGGTG	2	12	169445	169456	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	325113166
71	NC_015178	CATCCT	2	12	171660	171671	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	325113166
72	NC_015178	GGATGA	2	12	177014	177025	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	325113172
73	NC_015178	CGAACG	2	12	177146	177157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113172
74	NC_015178	TCGCCA	2	12	177540	177551	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325113173
75	NC_015178	CGCGGG	2	12	180318	180329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113176
76	NC_015178	CCTCGC	2	12	180789	180800	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	325113176
77	NC_015178	CGAGGA	2	12	183434	183445	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	325113177
78	NC_015178	CGGCCG	2	12	183520	183531	0 %	0 %	50 %	50 %	325113177
79	NC_015178	GCCCAT	2	12	185152	185163	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325113179
80	NC_015178	GTCTGC	2	12	186334	186345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113179
81	NC_015178	CTGATC	2	12	187187	187198	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325113180
82	NC_015178	GTGCGG	2	12	190808	190819	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325113186
83	NC_015178	GGCAAG	2	12	191958	191969	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	325113187
84	NC_015178	GCCGGC	2	12	192363	192374	0 %	0 %	50 %	50 %	325113187
85	NC_015178	GTGACG	2	12	195820	195831	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325113189
86	NC_015178	TCCTGC	2	12	195997	196008	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325113189
87	NC_015178	GCCAAA	2	12	196390	196401	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	325113189
88	NC_015178	GCGGAG	2	12	197703	197714	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	325113192
89	NC_015178	ATCACA	2	12	199403	199414	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	325113194
90	NC_015178	TCGAGG	2	12	206793	206804	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325113203
91	NC_015178	ACCCAC	2	12	207267	207278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113204
92	NC_015178	CGGCGA	2	12	210521	210532	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325113208
93	NC_015178	CCGCGC	2	12	211140	211151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113208
94	NC_015178	CCTGGC	2	12	212833	212844	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325113209
95	NC_015178	CGCCTA	2	12	214799	214810	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325113212
96	NC_015178	GTTCCG	2	12	216492	216503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113213
97	NC_015178	GGCAGT	2	12	216920	216931	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325113213
98	NC_015178	GCGCTC	2	12	225458	225469	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325113223
99	NC_015178	ATCGCG	2	12	232778	232789	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325113230
100	NC_015178	GCGCGA	2	12	232917	232928	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325113230
101	NC_015178	GTGGGT	2	12	237481	237492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325113235
102	NC_015178	TGGCCC	2	12	242024	242035	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325113240
103	NC_015178	CGAGGC	2	12	246874	246885	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325113246
104	NC_015178	GGCAAG	2	12	247079	247090	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	325113246
105	NC_015178	CGCCGG	2	12	247468	247479	0 %	0 %	50 %	50 %	325113246
106	NC_015178	TGACCG	2	12	249109	249120	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325113250
107	NC_015178	CGAGCG	2	12	255418	255429	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325113259
108	NC_015178	GATCGG	2	12	259941	259952	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325113264
109	NC_015178	GCGCCG	2	12	261237	261248	0 %	0 %	50 %	50 %	325113264
110	NC_015178	CTGACC	2	12	261338	261349	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325113264
111	NC_015178	TCCCCC	2	12	262694	262705	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	325113267
112	NC_015178	AGATCG	2	12	264411	264422	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325113270
113	NC_015178	GTGGGT	2	12	271061	271072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325113276

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.