MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV1

Total Repeats: 271

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015178	GATAA	2	10	2473	2482	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015178	AGGGG	2	10	2510	2519	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015178	CTGGT	2	10	2924	2933	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015178	AGGGC	2	10	3407	3416	20 %	0 %	60 %	20 %	325112995
5	NC_015178	GGCGA	2	10	3735	3744	20 %	0 %	60 %	20 %	325112995
6	NC_015178	TTCCT	2	10	4363	4372	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_015178	CGGTC	2	10	4444	4453	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_015178	CGGCG	2	10	4999	5008	0 %	0 %	60 %	40 %	325112996
9	NC_015178	CGGGG	2	10	5514	5523	0 %	0 %	80 %	20 %	325112996
10	NC_015178	CATCG	2	10	5966	5975	20 %	20 %	20 %	40 %	325112997
11	NC_015178	ATGCC	2	10	6040	6049	20 %	20 %	20 %	40 %	325112997
12	NC_015178	GATCT	2	10	8078	8087	20 %	40 %	20 %	20 %	325112999
13	NC_015178	CGGCT	2	10	10099	10108	0 %	20 %	40 %	40 %	325113001
14	NC_015178	GCCGC	2	10	10554	10563	0 %	0 %	40 %	60 %	325113002
15	NC_015178	CCGTT	2	10	15089	15098	0 %	40 %	20 %	40 %	325113007
16	NC_015178	TATAA	2	10	16341	16350	60 %	40 %	0 %	0 %	325113008
17	NC_015178	TAGGA	2	10	16442	16451	40 %	20 %	40 %	0 %	325113008
18	NC_015178	GAAGC	2	10	17341	17350	40 %	0 %	40 %	20 %	325113009
19	NC_015178	GCGCC	2	10	18916	18925	0 %	0 %	40 %	60 %	325113011
20	NC_015178	CGATC	2	10	19028	19037	20 %	20 %	20 %	40 %	325113011
21	NC_015178	CCTCG	2	10	19468	19477	0 %	20 %	20 %	60 %	325113011
22	NC_015178	GCAGG	2	10	20038	20047	20 %	0 %	60 %	20 %	325113012
23	NC_015178	CGCCT	2	10	20648	20657	0 %	20 %	20 %	60 %	325113013
24	NC_015178	CAAGC	2	10	20955	20964	40 %	0 %	20 %	40 %	325113014
25	NC_015178	CGGCG	2	10	23772	23781	0 %	0 %	60 %	40 %	325113018
26	NC_015178	TCCTT	2	10	27361	27370	0 %	60 %	0 %	40 %	325113022
27	NC_015178	AGGCA	2	10	30818	30827	40 %	0 %	40 %	20 %	325113026
28	NC_015178	GCGTG	2	10	32846	32855	0 %	20 %	60 %	20 %	325113028
29	NC_015178	CTGCA	2	10	33090	33099	20 %	20 %	20 %	40 %	325113028
30	NC_015178	CGGCG	2	10	39207	39216	0 %	0 %	60 %	40 %	325113033
31	NC_015178	CGGCG	2	10	39423	39432	0 %	0 %	60 %	40 %	325113033
32	NC_015178	CGGCG	2	10	40587	40596	0 %	0 %	60 %	40 %	325113033
33	NC_015178	CGCAC	2	10	41725	41734	20 %	0 %	20 %	60 %	325113034
34	NC_015178	CGCGC	2	10	42973	42982	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
35	NC_015178	CCGGA	2	10	43270	43279	20 %	0 %	40 %	40 %	325113035
36	NC_015178	TGCCG	2	10	43787	43796	0 %	20 %	40 %	40 %	325113035
37	NC_015178	GCCGC	2	10	44338	44347	0 %	0 %	40 %	60 %	325113035
38	NC_015178	ACGCT	2	10	45302	45311	20 %	20 %	20 %	40 %	325113037
39	NC_015178	TCGGG	2	10	46938	46947	0 %	20 %	60 %	20 %	325113039
40	NC_015178	CGGCC	2	10	49773	49782	0 %	0 %	40 %	60 %	325113045
41	NC_015178	GCCGC	2	10	50427	50436	0 %	0 %	40 %	60 %	325113046
42	NC_015178	CCGGA	2	10	51566	51575	20 %	0 %	40 %	40 %	325113046
43	NC_015178	GCGGT	2	10	51843	51852	0 %	20 %	60 %	20 %	325113047
44	NC_015178	ATGAA	2	10	52485	52494	60 %	20 %	20 %	0 %	325113047
45	NC_015178	CGGCG	2	10	53250	53259	0 %	0 %	60 %	40 %	325113049
46	NC_015178	GACGG	2	10	53482	53491	20 %	0 %	60 %	20 %	325113049
47	NC_015178	GCGAG	2	10	53588	53597	20 %	0 %	60 %	20 %	325113049
48	NC_015178	GCGAG	2	10	54176	54185	20 %	0 %	60 %	20 %	325113050
49	NC_015178	CATCG	2	10	54706	54715	20 %	20 %	20 %	40 %	325113050
50	NC_015178	GGGGC	2	10	57089	57098	0 %	0 %	80 %	20 %	325113054
51	NC_015178	AGCCG	2	10	57278	57287	20 %	0 %	40 %	40 %	325113054
52	NC_015178	GCAGC	2	10	57503	57512	20 %	0 %	40 %	40 %	325113054
53	NC_015178	GCGCG	2	10	57806	57815	0 %	0 %	60 %	40 %	325113054
54	NC_015178	GCCAC	2	10	57973	57982	20 %	0 %	20 %	60 %	325113054
55	NC_015178	CCGCC	2	10	58414	58423	0 %	0 %	20 %	80 %	325113055
56	NC_015178	GCGCC	2	10	59391	59400	0 %	0 %	40 %	60 %	325113055
57	NC_015178	GGCCA	2	10	60123	60132	20 %	0 %	40 %	40 %	325113055
58	NC_015178	CCGCT	2	10	60302	60311	0 %	20 %	20 %	60 %	325113055
59	NC_015178	CCGGC	2	10	60916	60925	0 %	0 %	40 %	60 %	325113055
60	NC_015178	CGCGG	2	10	61877	61886	0 %	0 %	60 %	40 %	325113056
61	NC_015178	GGCGA	2	10	62366	62375	20 %	0 %	60 %	20 %	325113056
62	NC_015178	CCGCG	2	10	67257	67266	0 %	0 %	40 %	60 %	325113061
63	NC_015178	AATCA	2	10	67752	67761	60 %	20 %	0 %	20 %	325113061
64	NC_015178	GCCGA	2	10	68068	68077	20 %	0 %	40 %	40 %	325113062
65	NC_015178	GCTGC	2	10	69330	69339	0 %	20 %	40 %	40 %	325113065
66	NC_015178	CGACC	2	10	69838	69847	20 %	0 %	20 %	60 %	325113066
67	NC_015178	GCAGG	2	10	71332	71341	20 %	0 %	60 %	20 %	325113067
68	NC_015178	GCGGA	2	10	72751	72760	20 %	0 %	60 %	20 %	325113069
69	NC_015178	GGGCC	2	10	73386	73395	0 %	0 %	60 %	40 %	325113070
70	NC_015178	ATGGG	2	10	73848	73857	20 %	20 %	60 %	0 %	325113071
71	NC_015178	ACGCC	2	10	75611	75620	20 %	0 %	20 %	60 %	325113073
72	NC_015178	GACCA	2	10	77768	77777	40 %	0 %	20 %	40 %	325113077
73	NC_015178	CGATC	2	10	78192	78201	20 %	20 %	20 %	40 %	325113077
74	NC_015178	CGCGG	2	10	78300	78309	0 %	0 %	60 %	40 %	325113078
75	NC_015178	TTGGA	2	10	78498	78507	20 %	40 %	40 %	0 %	325113078
76	NC_015178	CGGGC	2	10	80147	80156	0 %	0 %	60 %	40 %	325113080
77	NC_015178	CGGGC	2	10	81810	81819	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
78	NC_015178	TGGGC	2	10	83431	83440	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015178	GCTAT	2	10	83536	83545	20 %	40 %	20 %	20 %	325113083
80	NC_015178	GTCAT	2	10	85032	85041	20 %	40 %	20 %	20 %	325113085
81	NC_015178	TCGCC	2	10	85228	85237	0 %	20 %	20 %	60 %	325113086
82	NC_015178	GGCGC	2	10	86960	86969	0 %	0 %	60 %	40 %	325113087
83	NC_015178	CATGG	2	10	89519	89528	20 %	20 %	40 %	20 %	325113090
84	NC_015178	GGCCG	2	10	90338	90347	0 %	0 %	60 %	40 %	325113090
85	NC_015178	TGCTC	2	10	90682	90691	0 %	40 %	20 %	40 %	325113090
86	NC_015178	CGCGC	2	10	91676	91685	0 %	0 %	40 %	60 %	325113091
87	NC_015178	CGATG	2	10	92195	92204	20 %	20 %	40 %	20 %	325113092
88	NC_015178	CGATG	2	10	92216	92225	20 %	20 %	40 %	20 %	325113092
89	NC_015178	GCGCA	2	10	92244	92253	20 %	0 %	40 %	40 %	325113092
90	NC_015178	GCTGC	2	10	94068	94077	0 %	20 %	40 %	40 %	325113093
91	NC_015178	GGGGT	2	10	95251	95260	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015178	CTTAT	2	10	95858	95867	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_015178	TGGCT	2	10	96143	96152	0 %	40 %	40 %	20 %	325113096
94	NC_015178	GCCGC	2	10	97348	97357	0 %	0 %	40 %	60 %	325113098
95	NC_015178	CTATT	2	10	98138	98147	20 %	60 %	0 %	20 %	325113098
96	NC_015178	GCTTG	2	10	98212	98221	0 %	40 %	40 %	20 %	325113099
97	NC_015178	CGACC	2	10	98833	98842	20 %	0 %	20 %	60 %	325113099
98	NC_015178	CTGGT	2	10	103010	103019	0 %	40 %	40 %	20 %	325113105
99	NC_015178	GACGA	2	10	104006	104015	40 %	0 %	40 %	20 %	325113106
100	NC_015178	AGCAC	2	10	105870	105879	40 %	0 %	20 %	40 %	325113108
101	NC_015178	ACGGC	2	10	108383	108392	20 %	0 %	40 %	40 %	325113109
102	NC_015178	CGGCG	2	10	109426	109435	0 %	0 %	60 %	40 %	325113110
103	NC_015178	CGCGG	2	10	110688	110697	0 %	0 %	60 %	40 %	325113111
104	NC_015178	GGCCG	2	10	111078	111087	0 %	0 %	60 %	40 %	325113111
105	NC_015178	CCGGC	2	10	111557	111566	0 %	0 %	40 %	60 %	325113112
106	NC_015178	AGAAC	2	10	111610	111619	60 %	0 %	20 %	20 %	325113112
107	NC_015178	TATCG	2	10	113194	113203	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015178	CAGCG	2	10	115058	115067	20 %	0 %	40 %	40 %	325113114
109	NC_015178	CAGGT	2	10	117437	117446	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015178	CGCTG	2	10	117514	117523	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_015178	GGCCA	2	10	117525	117534	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_015178	CGATG	2	10	118589	118598	20 %	20 %	40 %	20 %	325113119
113	NC_015178	CTCAG	2	10	121167	121176	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_015178	TCCGC	2	10	122828	122837	0 %	20 %	20 %	60 %	325113123
115	NC_015178	GGTCG	2	10	128249	128258	0 %	20 %	60 %	20 %	325113129
116	NC_015178	GATCC	2	10	129619	129628	20 %	20 %	20 %	40 %	325113130
117	NC_015178	GGGCC	2	10	130068	130077	0 %	0 %	60 %	40 %	325113131
118	NC_015178	GGCGC	2	10	130109	130118	0 %	0 %	60 %	40 %	325113131
119	NC_015178	ACGGC	2	10	131478	131487	20 %	0 %	40 %	40 %	325113132
120	NC_015178	TGGCC	2	10	132129	132138	0 %	20 %	40 %	40 %	325113133
121	NC_015178	TTGAT	2	10	133521	133530	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015178	GGCCG	2	10	134509	134518	0 %	0 %	60 %	40 %	325113135
123	NC_015178	TTGAT	2	10	136672	136681	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015178	GGCCG	2	10	137660	137669	0 %	0 %	60 %	40 %	325113138
125	NC_015178	GGGGC	2	10	140442	140451	0 %	0 %	80 %	20 %	325113142
126	NC_015178	CCTCG	2	10	141449	141458	0 %	20 %	20 %	60 %	325113143
127	NC_015178	AGGGC	2	10	141978	141987	20 %	0 %	60 %	20 %	325113143
128	NC_015178	GCAAA	2	10	143826	143835	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_015178	ATCTC	2	10	144401	144410	20 %	40 %	0 %	40 %	325113145
130	NC_015178	GGCGC	2	10	145816	145825	0 %	0 %	60 %	40 %	325113147
131	NC_015178	CGAAG	2	10	146118	146127	40 %	0 %	40 %	20 %	325113147
132	NC_015178	CTCGC	2	10	147344	147353	0 %	20 %	20 %	60 %	325113148
133	NC_015178	CGGCG	2	10	147421	147430	0 %	0 %	60 %	40 %	325113148
134	NC_015178	TCCAG	2	10	148919	148928	20 %	20 %	20 %	40 %	325113150
135	NC_015178	CCAGT	2	10	149292	149301	20 %	20 %	20 %	40 %	325113150
136	NC_015178	ACCCG	2	10	149419	149428	20 %	0 %	20 %	60 %	325113150
137	NC_015178	GCCGC	2	10	151342	151351	0 %	0 %	40 %	60 %	325113152
138	NC_015178	CCGGC	2	10	151422	151431	0 %	0 %	40 %	60 %	325113152
139	NC_015178	GCTGA	2	10	153528	153537	20 %	20 %	40 %	20 %	325113153
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177	NC_015178	CCGAC	2	10	186134	186143	20 %	0 %	20 %	60 %	325113179
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243	NC_015178	CCGAT	2	10	253198	253207	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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265	NC_015178	GCGCT	2	10	267232	267241	0 %	20 %	40 %	40 %	325113273
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268	NC_015178	GATTA	2	10	269978	269987	40 %	40 %	20 %	0 %	325113275
269	NC_015178	CCGTT	2	10	270211	270220	0 %	40 %	20 %	40 %	325113276
270	NC_015178	AGGCA	2	10	271084	271093	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
271	NC_015178	ATGAC	2	10	271490	271499	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.