MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV1

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015178	GATAA	2	10	2473	2482	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015178	AGGGG	2	10	2510	2519	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015178	CTGGT	2	10	2924	2933	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015178	TTCCT	2	10	4363	4372	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_015178	CGGTC	2	10	4444	4453	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015178	CGCGC	2	10	42973	42982	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_015178	CGGGC	2	10	81810	81819	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_015178	TGGGC	2	10	83431	83440	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015178	GGGGT	2	10	95251	95260	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015178	CTTAT	2	10	95858	95867	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015178	TATCG	2	10	113194	113203	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015178	CAGGT	2	10	117437	117446	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015178	CGCTG	2	10	117514	117523	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_015178	GGCCA	2	10	117525	117534	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015178	CTCAG	2	10	121167	121176	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_015178	TTGAT	2	10	133521	133530	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015178	TTGAT	2	10	136672	136681	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015178	GCAAA	2	10	143826	143835	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015178	CGCGG	2	10	167649	167658	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_015178	AGGGG	2	10	167664	167673	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015178	TGCAG	2	10	167793	167802	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015178	CCGCG	2	10	175116	175125	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_015178	CGGCC	2	10	188107	188116	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_015178	GGATG	2	10	192656	192665	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015178	CGCCC	2	10	196573	196582	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
26	NC_015178	GCCGA	2	10	204643	204652	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_015178	TGGGG	2	10	206367	206376	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015178	TCGTT	2	10	214090	214099	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015178	GCTGT	2	10	216217	216226	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015178	TCAAT	2	10	229175	229184	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015178	TATCG	2	10	231110	231119	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015178	GTCGG	2	10	235440	235449	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015178	CAGGC	2	10	242213	242222	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_015178	CGGGG	2	10	250038	250047	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015178	CCGAT	2	10	253198	253207	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_015178	TGCGG	2	10	258170	258179	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015178	TATAA	2	10	266954	266963	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015178	AGGCA	2	10	271084	271093	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015178	ATGAC	2	10	271490	271499	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.