MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV1

Total Repeats: 232

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015178	AGGGC	2	10	3407	3416	20 %	0 %	60 %	20 %	325112995
2	NC_015178	GGCGA	2	10	3735	3744	20 %	0 %	60 %	20 %	325112995
3	NC_015178	CGGCG	2	10	4999	5008	0 %	0 %	60 %	40 %	325112996
4	NC_015178	CGGGG	2	10	5514	5523	0 %	0 %	80 %	20 %	325112996
5	NC_015178	CATCG	2	10	5966	5975	20 %	20 %	20 %	40 %	325112997
6	NC_015178	ATGCC	2	10	6040	6049	20 %	20 %	20 %	40 %	325112997
7	NC_015178	GATCT	2	10	8078	8087	20 %	40 %	20 %	20 %	325112999
8	NC_015178	CGGCT	2	10	10099	10108	0 %	20 %	40 %	40 %	325113001
9	NC_015178	GCCGC	2	10	10554	10563	0 %	0 %	40 %	60 %	325113002
10	NC_015178	CCGTT	2	10	15089	15098	0 %	40 %	20 %	40 %	325113007
11	NC_015178	TATAA	2	10	16341	16350	60 %	40 %	0 %	0 %	325113008
12	NC_015178	TAGGA	2	10	16442	16451	40 %	20 %	40 %	0 %	325113008
13	NC_015178	GAAGC	2	10	17341	17350	40 %	0 %	40 %	20 %	325113009
14	NC_015178	GCGCC	2	10	18916	18925	0 %	0 %	40 %	60 %	325113011
15	NC_015178	CGATC	2	10	19028	19037	20 %	20 %	20 %	40 %	325113011
16	NC_015178	CCTCG	2	10	19468	19477	0 %	20 %	20 %	60 %	325113011
17	NC_015178	GCAGG	2	10	20038	20047	20 %	0 %	60 %	20 %	325113012
18	NC_015178	CGCCT	2	10	20648	20657	0 %	20 %	20 %	60 %	325113013
19	NC_015178	CAAGC	2	10	20955	20964	40 %	0 %	20 %	40 %	325113014
20	NC_015178	CGGCG	2	10	23772	23781	0 %	0 %	60 %	40 %	325113018
21	NC_015178	TCCTT	2	10	27361	27370	0 %	60 %	0 %	40 %	325113022
22	NC_015178	AGGCA	2	10	30818	30827	40 %	0 %	40 %	20 %	325113026
23	NC_015178	GCGTG	2	10	32846	32855	0 %	20 %	60 %	20 %	325113028
24	NC_015178	CTGCA	2	10	33090	33099	20 %	20 %	20 %	40 %	325113028
25	NC_015178	CGGCG	2	10	39207	39216	0 %	0 %	60 %	40 %	325113033
26	NC_015178	CGGCG	2	10	39423	39432	0 %	0 %	60 %	40 %	325113033
27	NC_015178	CGGCG	2	10	40587	40596	0 %	0 %	60 %	40 %	325113033
28	NC_015178	CGCAC	2	10	41725	41734	20 %	0 %	20 %	60 %	325113034
29	NC_015178	CCGGA	2	10	43270	43279	20 %	0 %	40 %	40 %	325113035
30	NC_015178	TGCCG	2	10	43787	43796	0 %	20 %	40 %	40 %	325113035
31	NC_015178	GCCGC	2	10	44338	44347	0 %	0 %	40 %	60 %	325113035
32	NC_015178	ACGCT	2	10	45302	45311	20 %	20 %	20 %	40 %	325113037
33	NC_015178	TCGGG	2	10	46938	46947	0 %	20 %	60 %	20 %	325113039
34	NC_015178	CGGCC	2	10	49773	49782	0 %	0 %	40 %	60 %	325113045
35	NC_015178	GCCGC	2	10	50427	50436	0 %	0 %	40 %	60 %	325113046
36	NC_015178	CCGGA	2	10	51566	51575	20 %	0 %	40 %	40 %	325113046
37	NC_015178	GCGGT	2	10	51843	51852	0 %	20 %	60 %	20 %	325113047
38	NC_015178	ATGAA	2	10	52485	52494	60 %	20 %	20 %	0 %	325113047
39	NC_015178	CGGCG	2	10	53250	53259	0 %	0 %	60 %	40 %	325113049
40	NC_015178	GACGG	2	10	53482	53491	20 %	0 %	60 %	20 %	325113049
41	NC_015178	GCGAG	2	10	53588	53597	20 %	0 %	60 %	20 %	325113049
42	NC_015178	GCGAG	2	10	54176	54185	20 %	0 %	60 %	20 %	325113050
43	NC_015178	CATCG	2	10	54706	54715	20 %	20 %	20 %	40 %	325113050
44	NC_015178	GGGGC	2	10	57089	57098	0 %	0 %	80 %	20 %	325113054
45	NC_015178	AGCCG	2	10	57278	57287	20 %	0 %	40 %	40 %	325113054
46	NC_015178	GCAGC	2	10	57503	57512	20 %	0 %	40 %	40 %	325113054
47	NC_015178	GCGCG	2	10	57806	57815	0 %	0 %	60 %	40 %	325113054
48	NC_015178	GCCAC	2	10	57973	57982	20 %	0 %	20 %	60 %	325113054
49	NC_015178	CCGCC	2	10	58414	58423	0 %	0 %	20 %	80 %	325113055
50	NC_015178	GCGCC	2	10	59391	59400	0 %	0 %	40 %	60 %	325113055
51	NC_015178	GGCCA	2	10	60123	60132	20 %	0 %	40 %	40 %	325113055
52	NC_015178	CCGCT	2	10	60302	60311	0 %	20 %	20 %	60 %	325113055
53	NC_015178	CCGGC	2	10	60916	60925	0 %	0 %	40 %	60 %	325113055
54	NC_015178	CGCGG	2	10	61877	61886	0 %	0 %	60 %	40 %	325113056
55	NC_015178	GGCGA	2	10	62366	62375	20 %	0 %	60 %	20 %	325113056
56	NC_015178	CCGCG	2	10	67257	67266	0 %	0 %	40 %	60 %	325113061
57	NC_015178	AATCA	2	10	67752	67761	60 %	20 %	0 %	20 %	325113061
58	NC_015178	GCCGA	2	10	68068	68077	20 %	0 %	40 %	40 %	325113062
59	NC_015178	GCTGC	2	10	69330	69339	0 %	20 %	40 %	40 %	325113065
60	NC_015178	CGACC	2	10	69838	69847	20 %	0 %	20 %	60 %	325113066
61	NC_015178	GCAGG	2	10	71332	71341	20 %	0 %	60 %	20 %	325113067
62	NC_015178	GCGGA	2	10	72751	72760	20 %	0 %	60 %	20 %	325113069
63	NC_015178	GGGCC	2	10	73386	73395	0 %	0 %	60 %	40 %	325113070
64	NC_015178	ATGGG	2	10	73848	73857	20 %	20 %	60 %	0 %	325113071
65	NC_015178	ACGCC	2	10	75611	75620	20 %	0 %	20 %	60 %	325113073
66	NC_015178	GACCA	2	10	77768	77777	40 %	0 %	20 %	40 %	325113077
67	NC_015178	CGATC	2	10	78192	78201	20 %	20 %	20 %	40 %	325113077
68	NC_015178	CGCGG	2	10	78300	78309	0 %	0 %	60 %	40 %	325113078
69	NC_015178	TTGGA	2	10	78498	78507	20 %	40 %	40 %	0 %	325113078
70	NC_015178	CGGGC	2	10	80147	80156	0 %	0 %	60 %	40 %	325113080
71	NC_015178	GCTAT	2	10	83536	83545	20 %	40 %	20 %	20 %	325113083
72	NC_015178	GTCAT	2	10	85032	85041	20 %	40 %	20 %	20 %	325113085
73	NC_015178	TCGCC	2	10	85228	85237	0 %	20 %	20 %	60 %	325113086
74	NC_015178	GGCGC	2	10	86960	86969	0 %	0 %	60 %	40 %	325113087
75	NC_015178	CATGG	2	10	89519	89528	20 %	20 %	40 %	20 %	325113090
76	NC_015178	GGCCG	2	10	90338	90347	0 %	0 %	60 %	40 %	325113090
77	NC_015178	TGCTC	2	10	90682	90691	0 %	40 %	20 %	40 %	325113090
78	NC_015178	CGCGC	2	10	91676	91685	0 %	0 %	40 %	60 %	325113091
79	NC_015178	CGATG	2	10	92195	92204	20 %	20 %	40 %	20 %	325113092
80	NC_015178	CGATG	2	10	92216	92225	20 %	20 %	40 %	20 %	325113092
81	NC_015178	GCGCA	2	10	92244	92253	20 %	0 %	40 %	40 %	325113092
82	NC_015178	GCTGC	2	10	94068	94077	0 %	20 %	40 %	40 %	325113093
83	NC_015178	TGGCT	2	10	96143	96152	0 %	40 %	40 %	20 %	325113096
84	NC_015178	GCCGC	2	10	97348	97357	0 %	0 %	40 %	60 %	325113098
85	NC_015178	CTATT	2	10	98138	98147	20 %	60 %	0 %	20 %	325113098
86	NC_015178	GCTTG	2	10	98212	98221	0 %	40 %	40 %	20 %	325113099
87	NC_015178	CGACC	2	10	98833	98842	20 %	0 %	20 %	60 %	325113099
88	NC_015178	CTGGT	2	10	103010	103019	0 %	40 %	40 %	20 %	325113105
89	NC_015178	GACGA	2	10	104006	104015	40 %	0 %	40 %	20 %	325113106
90	NC_015178	AGCAC	2	10	105870	105879	40 %	0 %	20 %	40 %	325113108
91	NC_015178	ACGGC	2	10	108383	108392	20 %	0 %	40 %	40 %	325113109
92	NC_015178	CGGCG	2	10	109426	109435	0 %	0 %	60 %	40 %	325113110
93	NC_015178	CGCGG	2	10	110688	110697	0 %	0 %	60 %	40 %	325113111
94	NC_015178	GGCCG	2	10	111078	111087	0 %	0 %	60 %	40 %	325113111
95	NC_015178	CCGGC	2	10	111557	111566	0 %	0 %	40 %	60 %	325113112
96	NC_015178	AGAAC	2	10	111610	111619	60 %	0 %	20 %	20 %	325113112
97	NC_015178	CAGCG	2	10	115058	115067	20 %	0 %	40 %	40 %	325113114
98	NC_015178	CGATG	2	10	118589	118598	20 %	20 %	40 %	20 %	325113119
99	NC_015178	TCCGC	2	10	122828	122837	0 %	20 %	20 %	60 %	325113123
100	NC_015178	GGTCG	2	10	128249	128258	0 %	20 %	60 %	20 %	325113129
101	NC_015178	GATCC	2	10	129619	129628	20 %	20 %	20 %	40 %	325113130
102	NC_015178	GGGCC	2	10	130068	130077	0 %	0 %	60 %	40 %	325113131
103	NC_015178	GGCGC	2	10	130109	130118	0 %	0 %	60 %	40 %	325113131
104	NC_015178	ACGGC	2	10	131478	131487	20 %	0 %	40 %	40 %	325113132
105	NC_015178	TGGCC	2	10	132129	132138	0 %	20 %	40 %	40 %	325113133
106	NC_015178	GGCCG	2	10	134509	134518	0 %	0 %	60 %	40 %	325113135
107	NC_015178	GGCCG	2	10	137660	137669	0 %	0 %	60 %	40 %	325113138
108	NC_015178	GGGGC	2	10	140442	140451	0 %	0 %	80 %	20 %	325113142
109	NC_015178	CCTCG	2	10	141449	141458	0 %	20 %	20 %	60 %	325113143
110	NC_015178	AGGGC	2	10	141978	141987	20 %	0 %	60 %	20 %	325113143
111	NC_015178	ATCTC	2	10	144401	144410	20 %	40 %	0 %	40 %	325113145
112	NC_015178	GGCGC	2	10	145816	145825	0 %	0 %	60 %	40 %	325113147
113	NC_015178	CGAAG	2	10	146118	146127	40 %	0 %	40 %	20 %	325113147
114	NC_015178	CTCGC	2	10	147344	147353	0 %	20 %	20 %	60 %	325113148
115	NC_015178	CGGCG	2	10	147421	147430	0 %	0 %	60 %	40 %	325113148
116	NC_015178	TCCAG	2	10	148919	148928	20 %	20 %	20 %	40 %	325113150
117	NC_015178	CCAGT	2	10	149292	149301	20 %	20 %	20 %	40 %	325113150
118	NC_015178	ACCCG	2	10	149419	149428	20 %	0 %	20 %	60 %	325113150
119	NC_015178	GCCGC	2	10	151342	151351	0 %	0 %	40 %	60 %	325113152
120	NC_015178	CCGGC	2	10	151422	151431	0 %	0 %	40 %	60 %	325113152
121	NC_015178	GCTGA	2	10	153528	153537	20 %	20 %	40 %	20 %	325113153
122	NC_015178	CGGCC	2	10	153812	153821	0 %	0 %	40 %	60 %	325113153
123	NC_015178	CGCTG	2	10	154096	154105	0 %	20 %	40 %	40 %	325113153
124	NC_015178	AAAGC	2	10	154752	154761	60 %	0 %	20 %	20 %	325113154
125	NC_015178	CGGCC	2	10	155850	155859	0 %	0 %	40 %	60 %	325113155
126	NC_015178	TGCGC	2	10	156136	156145	0 %	20 %	40 %	40 %	325113156
127	NC_015178	TCCCG	2	10	157901	157910	0 %	20 %	20 %	60 %	325113157
128	NC_015178	GCGCC	2	10	158689	158698	0 %	0 %	40 %	60 %	325113158
129	NC_015178	TCGCC	2	10	158775	158784	0 %	20 %	20 %	60 %	325113158
130	NC_015178	ACCAA	2	10	161158	161167	60 %	0 %	0 %	40 %	325113161
131	NC_015178	AACGG	2	10	162605	162614	40 %	0 %	40 %	20 %	325113162
132	NC_015178	AACGG	2	10	163937	163946	40 %	0 %	40 %	20 %	325113163
133	NC_015178	CCCAC	2	10	164964	164973	20 %	0 %	0 %	80 %	325113164
134	NC_015178	ACCCC	2	10	165878	165887	20 %	0 %	0 %	80 %	325113165
135	NC_015178	CGGAT	2	10	165917	165926	20 %	20 %	40 %	20 %	325113165
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231	NC_015178	GATTA	2	10	269978	269987	40 %	40 %	20 %	0 %	325113275
232	NC_015178	CCGTT	2	10	270211	270220	0 %	40 %	20 %	40 %	325113276

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.