MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV1

Total Repeats: 469

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015178	CTC	2	6	2432	2437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_015178	GGC	2	6	2601	2606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015178	CCG	2	6	2686	2691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015178	GAT	2	6	2782	2787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015178	GCA	2	6	2938	2943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015178	CAG	2	6	2944	2949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015178	GTA	2	6	4197	4202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015178	GTT	2	6	4264	4269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015178	CGG	2	6	4406	4411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015178	TCG	2	6	4436	4441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015178	CGG	2	6	4590	4595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015178	GGT	2	6	5740	5745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015178	AGC	2	6	5757	5762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015178	AAC	2	6	5806	5811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015178	GGA	2	6	5817	5822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015178	TCG	2	6	7034	7039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015178	CTG	2	6	7118	7123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015178	GAA	2	6	7134	7139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015178	GCG	2	6	12186	12191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015178	TGT	2	6	12196	12201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015178	CGG	2	6	12202	12207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015178	GCT	2	6	12278	12283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015178	CGC	2	6	12299	12304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_015178	GAA	2	6	12333	12338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015178	TGT	2	6	13244	13249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015178	TAT	2	6	13251	13256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015178	GCC	4	12	13280	13291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015178	CCT	3	9	13296	13304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_015178	CCG	4	12	13305	13316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015178	CCA	2	6	13329	13334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_015178	GCC	2	6	13349	13354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015178	GGC	2	6	13954	13959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015178	GCC	2	6	13967	13972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015178	GCG	2	6	14083	14088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015178	GCC	2	6	14097	14102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015178	CAC	2	6	14257	14262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_015178	CGG	2	6	14418	14423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015178	GAC	2	6	14442	14447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015178	GAT	2	6	14600	14605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015178	TCA	2	6	14721	14726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015178	CCA	2	6	14812	14817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_015178	CAT	2	6	14829	14834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015178	CCA	2	6	14856	14861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015178	CTA	2	6	14915	14920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015178	AGG	2	6	15967	15972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015178	GAT	2	6	15973	15978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015178	TTG	2	6	16040	16045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015178	TTA	2	6	16081	16086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015178	GCA	2	6	20270	20275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015178	ATC	2	6	20321	20326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015178	GCT	2	6	20489	20494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015178	CGG	2	6	21242	21247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015178	GTC	2	6	21596	21601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015178	AGA	3	9	21819	21827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015178	CGA	2	6	21844	21849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015178	GGC	2	6	21852	21857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015178	GGC	2	6	22345	22350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015178	TGC	3	9	22671	22679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015178	TGC	2	6	22686	22691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015178	CCG	2	6	22700	22705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_015178	TGT	2	6	22749	22754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015178	CGC	2	6	25246	25251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015178	AAT	2	6	25346	25351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015178	GTA	2	6	28632	28637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015178	CGC	2	6	28639	28644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015178	GCA	2	6	28712	28717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015178	CGC	2	6	28731	28736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_015178	GCT	2	6	28814	28819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015178	ATC	2	6	29473	29478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015178	ACC	2	6	29496	29501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015178	CGC	2	6	30378	30383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015178	CGC	2	6	30426	30431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015178	ATT	2	6	30433	30438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015178	AGT	2	6	30459	30464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015178	CGC	2	6	31164	31169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_015178	CGG	2	6	32323	32328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015178	GTG	2	6	36030	36035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015178	AAC	2	6	41525	41530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015178	TGA	2	6	43004	43009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015178	GGC	2	6	43020	43025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015178	GAG	2	6	43064	43069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015178	GGT	2	6	44602	44607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015178	CGT	2	6	44616	44621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015178	ATG	2	6	44660	44665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015178	GGC	2	6	44714	44719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015178	CGC	2	6	45483	45488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_015178	GCC	2	6	47489	47494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_015178	CGT	2	6	48284	48289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015178	GGC	3	9	62851	62859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015178	CAC	2	6	62898	62903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_015178	GCC	2	6	62925	62930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_015178	TGC	2	6	62941	62946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015178	GGC	2	6	63055	63060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015178	TGT	2	6	63149	63154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015178	ATG	2	6	69232	69237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015178	CTG	2	6	69242	69247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015178	TCA	2	6	71872	71877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015178	AGG	2	6	72355	72360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015178	ATC	2	6	72377	72382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015178	CGG	2	6	72405	72410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015178	AAT	2	6	72494	72499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015178	TGC	2	6	72513	72518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015178	TCA	2	6	72531	72536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015178	CTT	2	6	72553	72558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015178	ACG	2	6	72663	72668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015178	GCC	3	9	73137	73145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_015178	GAT	2	6	76194	76199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015178	CCT	2	6	78563	78568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_015178	ATA	2	6	78576	78581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015178	ACC	2	6	78614	78619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_015178	CAA	2	6	78678	78683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015178	CGG	2	6	78853	78858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015178	GTT	2	6	80627	80632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015178	AGG	2	6	80693	80698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015178	TCG	2	6	80732	80737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015178	GAC	2	6	80841	80846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015178	CGG	2	6	80928	80933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015178	AAC	2	6	81022	81027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015178	TAC	2	6	81178	81183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015178	GTG	2	6	81220	81225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015178	CAA	2	6	81246	81251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015178	CAG	2	6	81287	81292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015178	CAA	2	6	81357	81362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015178	CAA	2	6	81609	81614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015178	GCA	2	6	81677	81682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015178	ACG	2	6	81835	81840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015178	CAA	2	6	81855	81860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015178	GGC	2	6	81913	81918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015178	ACT	2	6	81929	81934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015178	CAA	2	6	81966	81971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015178	CAG	2	6	81985	81990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015178	CTC	2	6	82026	82031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_015178	GAT	2	6	83418	83423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015178	TCG	2	6	83460	83465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015178	CCT	2	6	90894	90899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_015178	CAA	2	6	90956	90961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015178	ATC	2	6	95264	95269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015178	GGC	2	6	95310	95315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015178	TGT	2	6	95326	95331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015178	GCC	2	6	95759	95764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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273	NC_015178	GAC	2	6	192498	192503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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276	NC_015178	GCA	2	6	192637	192642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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404	NC_015178	GGA	2	6	246235	246240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
405	NC_015178	TGC	2	6	248384	248389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
406	NC_015178	ACA	2	6	248401	248406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
407	NC_015178	CGC	2	6	248461	248466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
408	NC_015178	GCC	2	6	248471	248476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
409	NC_015178	GGC	2	6	248513	248518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
410	NC_015178	CAC	2	6	248549	248554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
411	NC_015178	GCC	2	6	248770	248775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
412	NC_015178	GAT	2	6	248777	248782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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414	NC_015178	TGC	3	9	248988	248996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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418	NC_015178	TCC	2	6	250798	250803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
419	NC_015178	CGC	2	6	250823	250828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
420	NC_015178	GCA	2	6	250833	250838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_015178	ATT	2	6	251488	251493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_015178	AGA	2	6	251524	251529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
423	NC_015178	TTG	2	6	251558	251563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
424	NC_015178	ACA	2	6	251597	251602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_015178	TAG	2	6	251791	251796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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427	NC_015178	GGC	2	6	251871	251876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
428	NC_015178	TGG	2	6	251950	251955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
429	NC_015178	AGA	2	6	252673	252678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_015178	CTT	2	6	253033	253038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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436	NC_015178	GGC	2	6	253167	253172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
437	NC_015178	GGA	2	6	253335	253340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_015178	TGT	2	6	257092	257097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
440	NC_015178	TCC	2	6	258012	258017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
441	NC_015178	TTG	2	6	258115	258120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_015178	AAG	3	9	262253	262261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_015178	CCG	2	6	263081	263086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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451	NC_015178	CTC	2	6	264208	264213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.