MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR03

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015170	TCTCC	2	10	82	91	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_015170	CCGGC	2	10	678	687	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3	NC_015170	GCCGC	3	15	1982	1996	0 %	0 %	40 %	60 %	325284808
4	NC_015170	AGAAC	2	10	3213	3222	60 %	0 %	20 %	20 %	325284809
5	NC_015170	TGCCG	2	10	5654	5663	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015170	GGGCA	2	10	5888	5897	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015170	ACACA	2	10	5917	5926	60 %	0 %	0 %	40 %	325284811
8	NC_015170	CGCTG	2	10	6015	6024	0 %	20 %	40 %	40 %	325284811
9	NC_015170	CCGGG	2	10	6860	6869	0 %	0 %	60 %	40 %	325284811
10	NC_015170	CGCGC	2	10	7952	7961	0 %	0 %	40 %	60 %	325284812
11	NC_015170	ACTCC	2	10	12520	12529	20 %	20 %	0 %	60 %	325284815
12	NC_015170	CTGAA	2	10	12611	12620	40 %	20 %	20 %	20 %	325284815
13	NC_015170	CGGCC	2	10	14294	14303	0 %	0 %	40 %	60 %	325284816
14	NC_015170	GTCTC	2	10	16252	16261	0 %	40 %	20 %	40 %	325284818
15	NC_015170	GACCT	2	10	18429	18438	20 %	20 %	20 %	40 %	325284820
16	NC_015170	CGAAC	2	10	18595	18604	40 %	0 %	20 %	40 %	325284820
17	NC_015170	ACGGG	2	10	18938	18947	20 %	0 %	60 %	20 %	325284821
18	NC_015170	CCTGA	2	10	19288	19297	20 %	20 %	20 %	40 %	325284821
19	NC_015170	TGACC	2	10	19963	19972	20 %	20 %	20 %	40 %	325284822
20	NC_015170	GGCGG	2	10	20662	20671	0 %	0 %	80 %	20 %	325284823
21	NC_015170	GCCGC	2	10	22253	22262	0 %	0 %	40 %	60 %	325284824
22	NC_015170	CGCCC	2	10	22408	22417	0 %	0 %	20 %	80 %	325284824
23	NC_015170	CTTTT	2	10	22602	22611	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015170	CGACC	2	10	23215	23224	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_015170	GCCAG	2	10	31649	31658	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_015170	GCTGC	2	10	32518	32527	0 %	20 %	40 %	40 %	325284833
27	NC_015170	CTGCC	2	10	32741	32750	0 %	20 %	20 %	60 %	325284833
28	NC_015170	CAGGG	2	10	33525	33534	20 %	0 %	60 %	20 %	325284834
29	NC_015170	CTGCG	2	10	34088	34097	0 %	20 %	40 %	40 %	325284834
30	NC_015170	TCGGC	2	10	34387	34396	0 %	20 %	40 %	40 %	325284834
31	NC_015170	CCAGA	2	10	35515	35524	40 %	0 %	20 %	40 %	325284835
32	NC_015170	GACCT	2	10	36811	36820	20 %	20 %	20 %	40 %	325284836
33	NC_015170	GTCAG	2	10	37097	37106	20 %	20 %	40 %	20 %	325284836
34	NC_015170	CCGCT	2	10	37321	37330	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_015170	CCACC	2	10	39946	39955	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
36	NC_015170	GTGAC	2	10	40365	40374	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015170	CTGAG	2	10	40630	40639	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015170	GCTGA	2	10	40694	40703	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015170	AAAAG	2	10	40712	40721	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015170	CATGC	2	10	43712	43721	20 %	20 %	20 %	40 %	325284838
41	NC_015170	CTCTA	2	10	44425	44434	20 %	40 %	0 %	40 %	325284839
42	NC_015170	TAGCG	2	10	47960	47969	20 %	20 %	40 %	20 %	325284842
43	NC_015170	CCCAG	2	10	48018	48027	20 %	0 %	20 %	60 %	325284842
44	NC_015170	ACCAG	2	10	48915	48924	40 %	0 %	20 %	40 %	325284842
45	NC_015170	CAGCG	2	10	51529	51538	20 %	0 %	40 %	40 %	325284844
46	NC_015170	GGACT	2	10	54574	54583	20 %	20 %	40 %	20 %	325284847
47	NC_015170	CGCGA	2	10	56420	56429	20 %	0 %	40 %	40 %	325284848
48	NC_015170	CTGCG	2	10	58279	58288	0 %	20 %	40 %	40 %	325284849
49	NC_015170	GCCAC	2	10	58536	58545	20 %	0 %	20 %	60 %	325284849
50	NC_015170	GCTGG	2	10	59708	59717	0 %	20 %	60 %	20 %	325284849
51	NC_015170	TCCAC	2	10	60264	60273	20 %	20 %	0 %	60 %	325284850
52	NC_015170	GCCCA	2	10	61119	61128	20 %	0 %	20 %	60 %	325284850
53	NC_015170	TCTGC	2	10	61954	61963	0 %	40 %	20 %	40 %	325284851
54	NC_015170	GCTGC	2	10	62556	62565	0 %	20 %	40 %	40 %	325284851
55	NC_015170	TGGAA	2	10	62868	62877	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015170	CCGCC	2	10	63074	63083	0 %	0 %	20 %	80 %	325284853
57	NC_015170	AAGTA	2	10	65140	65149	60 %	20 %	20 %	0 %	325284854
58	NC_015170	AGCCG	2	10	65955	65964	20 %	0 %	40 %	40 %	325284855
59	NC_015170	CTGGG	2	10	66174	66183	0 %	20 %	60 %	20 %	325284855
60	NC_015170	TCCCC	2	10	66701	66710	0 %	20 %	0 %	80 %	325284856
61	NC_015170	AGTGG	2	10	66983	66992	20 %	20 %	60 %	0 %	325284856
62	NC_015170	TTTGC	2	10	68709	68718	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015170	CGCTG	2	10	68969	68978	0 %	20 %	40 %	40 %	325284859
64	NC_015170	CCAGC	2	10	69462	69471	20 %	0 %	20 %	60 %	325284859
65	NC_015170	GCGCT	2	10	70951	70960	0 %	20 %	40 %	40 %	325284860
66	NC_015170	TGGCC	2	10	72158	72167	0 %	20 %	40 %	40 %	325284861
67	NC_015170	TCGCC	2	10	72262	72271	0 %	20 %	20 %	60 %	325284861
68	NC_015170	CCGGC	2	10	72665	72674	0 %	0 %	40 %	60 %	325284861
69	NC_015170	CTGGC	2	10	73477	73486	0 %	20 %	40 %	40 %	325284862
70	NC_015170	CTGGA	2	10	73588	73597	20 %	20 %	40 %	20 %	325284862
71	NC_015170	CGCAC	2	10	74948	74957	20 %	0 %	20 %	60 %	325284863
72	NC_015170	GCTGC	2	10	75660	75669	0 %	20 %	40 %	40 %	325284864
73	NC_015170	TGGGC	2	10	76169	76178	0 %	20 %	60 %	20 %	325284864
74	NC_015170	CGGGC	2	10	76365	76374	0 %	0 %	60 %	40 %	325284864
75	NC_015170	TGGCC	2	10	76460	76469	0 %	20 %	40 %	40 %	325284864
76	NC_015170	GCCCT	2	10	76470	76479	0 %	20 %	20 %	60 %	325284864
77	NC_015170	CTGGG	2	10	76989	76998	0 %	20 %	60 %	20 %	325284864
78	NC_015170	GCGCC	2	10	77610	77619	0 %	0 %	40 %	60 %	325284865
79	NC_015170	AGCGC	2	10	78136	78145	20 %	0 %	40 %	40 %	325284865
80	NC_015170	CGCGC	2	10	79987	79996	0 %	0 %	40 %	60 %	325284867
81	NC_015170	TAGCG	2	10	80080	80089	20 %	20 %	40 %	20 %	325284867
82	NC_015170	CCGCG	2	10	80370	80379	0 %	0 %	40 %	60 %	325284867
83	NC_015170	CGCTG	2	10	80869	80878	0 %	20 %	40 %	40 %	325284868
84	NC_015170	GGAAT	2	10	81659	81668	40 %	20 %	40 %	0 %	325284868
85	NC_015170	TTCGC	2	10	83655	83664	0 %	40 %	20 %	40 %	325284869
86	NC_015170	GTGGC	2	10	83876	83885	0 %	20 %	60 %	20 %	325284869
87	NC_015170	GGCCT	2	10	83904	83913	0 %	20 %	40 %	40 %	325284869
88	NC_015170	GCAGC	2	10	83936	83945	20 %	0 %	40 %	40 %	325284869
89	NC_015170	CCCAC	2	10	84015	84024	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
90	NC_015170	GAGCA	2	10	84256	84265	40 %	0 %	40 %	20 %	325284870
91	NC_015170	TCCGG	2	10	85002	85011	0 %	20 %	40 %	40 %	325284870
92	NC_015170	CCCCG	2	10	85131	85140	0 %	0 %	20 %	80 %	325284870
93	NC_015170	GCGCC	3	15	86027	86041	0 %	0 %	40 %	60 %	325284871
94	NC_015170	TGGCG	2	10	86471	86480	0 %	20 %	60 %	20 %	325284871
95	NC_015170	ACCAG	2	10	87244	87253	40 %	0 %	20 %	40 %	325284872
96	NC_015170	GCCGC	2	10	87592	87601	0 %	0 %	40 %	60 %	325284873
97	NC_015170	CGCCC	2	10	88150	88159	0 %	0 %	20 %	80 %	325284873
98	NC_015170	CGCCC	2	10	88378	88387	0 %	0 %	20 %	80 %	325284873
99	NC_015170	GGCTG	2	10	89285	89294	0 %	20 %	60 %	20 %	325284874
100	NC_015170	GCTCC	2	10	89504	89513	0 %	20 %	20 %	60 %	325284874
101	NC_015170	GCGCC	2	10	91015	91024	0 %	0 %	40 %	60 %	325284876
102	NC_015170	CGGCT	2	10	91246	91255	0 %	20 %	40 %	40 %	325284876
103	NC_015170	CTGAC	2	10	91373	91382	20 %	20 %	20 %	40 %	325284876
104	NC_015170	GCGAG	2	10	91844	91853	20 %	0 %	60 %	20 %	325284877
105	NC_015170	GCGCG	2	10	93179	93188	0 %	0 %	60 %	40 %	325284878
106	NC_015170	CCCAG	2	10	93578	93587	20 %	0 %	20 %	60 %	325284878
107	NC_015170	CGGCA	2	10	93824	93833	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_015170	CAGCC	2	10	94424	94433	20 %	0 %	20 %	60 %	325284879
109	NC_015170	GCGCG	2	10	94601	94610	0 %	0 %	60 %	40 %	325284879
110	NC_015170	AGGTC	2	10	94694	94703	20 %	20 %	40 %	20 %	325284879
111	NC_015170	CGGCG	2	10	96334	96343	0 %	0 %	60 %	40 %	325284880
112	NC_015170	GCCTC	2	10	97363	97372	0 %	20 %	20 %	60 %	325284881
113	NC_015170	CGGCG	2	10	97379	97388	0 %	0 %	60 %	40 %	325284881
114	NC_015170	CGCGG	2	10	97506	97515	0 %	0 %	60 %	40 %	325284881
115	NC_015170	GGTCA	2	10	98211	98220	20 %	20 %	40 %	20 %	325284881
116	NC_015170	GTAGG	2	10	98979	98988	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015170	AAGGT	2	10	101700	101709	40 %	20 %	40 %	0 %	325284885
118	NC_015170	GGCCA	2	10	101843	101852	20 %	0 %	40 %	40 %	325284885
119	NC_015170	CCCCA	2	10	103031	103040	20 %	0 %	0 %	80 %	325284886
120	NC_015170	GCCGC	2	10	103891	103900	0 %	0 %	40 %	60 %	325284887
121	NC_015170	CCCAG	2	10	104590	104599	20 %	0 %	20 %	60 %	325284888
122	NC_015170	GCGCC	2	10	104612	104621	0 %	0 %	40 %	60 %	325284888
123	NC_015170	CGCGG	2	10	106239	106248	0 %	0 %	60 %	40 %	325284890
124	NC_015170	GCGCC	2	10	106587	106596	0 %	0 %	40 %	60 %	325284891
125	NC_015170	GCGCC	2	10	108705	108714	0 %	0 %	40 %	60 %	325284893
126	NC_015170	GCGCC	2	10	109935	109944	0 %	0 %	40 %	60 %	325284894
127	NC_015170	GCCGG	2	10	110116	110125	0 %	0 %	60 %	40 %	325284894
128	NC_015170	GGGCG	2	10	110500	110509	0 %	0 %	80 %	20 %	325284894
129	NC_015170	GCCGC	2	10	110513	110522	0 %	0 %	40 %	60 %	325284894
130	NC_015170	GCCGG	2	10	111121	111130	0 %	0 %	60 %	40 %	325284895
131	NC_015170	ACCCT	2	10	111522	111531	20 %	20 %	0 %	60 %	325284895
132	NC_015170	GCCCG	2	10	113026	113035	0 %	0 %	40 %	60 %	325284897
133	NC_015170	CTGGC	2	10	113130	113139	0 %	20 %	40 %	40 %	325284897
134	NC_015170	GGGCC	2	10	113447	113456	0 %	0 %	60 %	40 %	325284898
135	NC_015170	GCGCA	2	10	113843	113852	20 %	0 %	40 %	40 %	325284898
136	NC_015170	AGCGG	2	10	114051	114060	20 %	0 %	60 %	20 %	325284898
137	NC_015170	CCGCG	2	10	114346	114355	0 %	0 %	40 %	60 %	325284899
138	NC_015170	GTTCC	2	10	115073	115082	0 %	40 %	20 %	40 %	325284900
139	NC_015170	ACCTG	2	10	115486	115495	20 %	20 %	20 %	40 %	325284900
140	NC_015170	TGGGG	2	10	115601	115610	0 %	20 %	80 %	0 %	325284900
141	NC_015170	AGCCG	2	10	115967	115976	20 %	0 %	40 %	40 %	325284900
142	NC_015170	CGCTG	2	10	116060	116069	0 %	20 %	40 %	40 %	325284900
143	NC_015170	CGGCG	2	10	116383	116392	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
144	NC_015170	AGCCC	2	10	120337	120346	20 %	0 %	20 %	60 %	325284904
145	NC_015170	GCCGC	2	10	121676	121685	0 %	0 %	40 %	60 %	325284906
146	NC_015170	TGTGC	2	10	121849	121858	0 %	40 %	40 %	20 %	325284906
147	NC_015170	GCGGG	2	10	124039	124048	0 %	0 %	80 %	20 %	325284908
148	NC_015170	ACCAG	2	10	124143	124152	40 %	0 %	20 %	40 %	325284908
149	NC_015170	GCCCC	2	10	124332	124341	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
150	NC_015170	CGCGG	2	10	124590	124599	0 %	0 %	60 %	40 %	325284909
151	NC_015170	CGACT	2	10	125362	125371	20 %	20 %	20 %	40 %	325284909
152	NC_015170	CCTGA	2	10	125605	125614	20 %	20 %	20 %	40 %	325284909
153	NC_015170	CGGGC	2	10	127261	127270	0 %	0 %	60 %	40 %	325284910
154	NC_015170	GCTGG	2	10	128219	128228	0 %	20 %	60 %	20 %	325284911
155	NC_015170	GGTCA	2	10	131716	131725	20 %	20 %	40 %	20 %	325284915
156	NC_015170	GCGCA	2	10	132052	132061	20 %	0 %	40 %	40 %	325284915

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.