MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR03

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015170	TCTCC	2	10	82	91	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_015170	CCGGC	2	10	678	687	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3	NC_015170	TGCCG	2	10	5654	5663	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_015170	GGGCA	2	10	5888	5897	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015170	CTTTT	2	10	22602	22611	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015170	CGACC	2	10	23215	23224	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_015170	GCCAG	2	10	31649	31658	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_015170	CCGCT	2	10	37321	37330	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_015170	CCACC	2	10	39946	39955	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
10	NC_015170	GTGAC	2	10	40365	40374	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015170	CTGAG	2	10	40630	40639	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015170	GCTGA	2	10	40694	40703	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015170	AAAAG	2	10	40712	40721	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015170	TGGAA	2	10	62868	62877	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015170	TTTGC	2	10	68709	68718	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015170	CCCAC	2	10	84015	84024	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
17	NC_015170	CGGCA	2	10	93824	93833	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_015170	GTAGG	2	10	98979	98988	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015170	CGGCG	2	10	116383	116392	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_015170	GCCCC	2	10	124332	124341	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.