MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR03

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015170	GCCGC	3	15	1982	1996	0 %	0 %	40 %	60 %	325284808
2	NC_015170	AGAAC	2	10	3213	3222	60 %	0 %	20 %	20 %	325284809
3	NC_015170	ACACA	2	10	5917	5926	60 %	0 %	0 %	40 %	325284811
4	NC_015170	CGCTG	2	10	6015	6024	0 %	20 %	40 %	40 %	325284811
5	NC_015170	CCGGG	2	10	6860	6869	0 %	0 %	60 %	40 %	325284811
6	NC_015170	CGCGC	2	10	7952	7961	0 %	0 %	40 %	60 %	325284812
7	NC_015170	ACTCC	2	10	12520	12529	20 %	20 %	0 %	60 %	325284815
8	NC_015170	CTGAA	2	10	12611	12620	40 %	20 %	20 %	20 %	325284815
9	NC_015170	CGGCC	2	10	14294	14303	0 %	0 %	40 %	60 %	325284816
10	NC_015170	GTCTC	2	10	16252	16261	0 %	40 %	20 %	40 %	325284818
11	NC_015170	GACCT	2	10	18429	18438	20 %	20 %	20 %	40 %	325284820
12	NC_015170	CGAAC	2	10	18595	18604	40 %	0 %	20 %	40 %	325284820
13	NC_015170	ACGGG	2	10	18938	18947	20 %	0 %	60 %	20 %	325284821
14	NC_015170	CCTGA	2	10	19288	19297	20 %	20 %	20 %	40 %	325284821
15	NC_015170	TGACC	2	10	19963	19972	20 %	20 %	20 %	40 %	325284822
16	NC_015170	GGCGG	2	10	20662	20671	0 %	0 %	80 %	20 %	325284823
17	NC_015170	GCCGC	2	10	22253	22262	0 %	0 %	40 %	60 %	325284824
18	NC_015170	CGCCC	2	10	22408	22417	0 %	0 %	20 %	80 %	325284824
19	NC_015170	GCTGC	2	10	32518	32527	0 %	20 %	40 %	40 %	325284833
20	NC_015170	CTGCC	2	10	32741	32750	0 %	20 %	20 %	60 %	325284833
21	NC_015170	CAGGG	2	10	33525	33534	20 %	0 %	60 %	20 %	325284834
22	NC_015170	CTGCG	2	10	34088	34097	0 %	20 %	40 %	40 %	325284834
23	NC_015170	TCGGC	2	10	34387	34396	0 %	20 %	40 %	40 %	325284834
24	NC_015170	CCAGA	2	10	35515	35524	40 %	0 %	20 %	40 %	325284835
25	NC_015170	GACCT	2	10	36811	36820	20 %	20 %	20 %	40 %	325284836
26	NC_015170	GTCAG	2	10	37097	37106	20 %	20 %	40 %	20 %	325284836
27	NC_015170	CATGC	2	10	43712	43721	20 %	20 %	20 %	40 %	325284838
28	NC_015170	CTCTA	2	10	44425	44434	20 %	40 %	0 %	40 %	325284839
29	NC_015170	TAGCG	2	10	47960	47969	20 %	20 %	40 %	20 %	325284842
30	NC_015170	CCCAG	2	10	48018	48027	20 %	0 %	20 %	60 %	325284842
31	NC_015170	ACCAG	2	10	48915	48924	40 %	0 %	20 %	40 %	325284842
32	NC_015170	CAGCG	2	10	51529	51538	20 %	0 %	40 %	40 %	325284844
33	NC_015170	GGACT	2	10	54574	54583	20 %	20 %	40 %	20 %	325284847
34	NC_015170	CGCGA	2	10	56420	56429	20 %	0 %	40 %	40 %	325284848
35	NC_015170	CTGCG	2	10	58279	58288	0 %	20 %	40 %	40 %	325284849
36	NC_015170	GCCAC	2	10	58536	58545	20 %	0 %	20 %	60 %	325284849
37	NC_015170	GCTGG	2	10	59708	59717	0 %	20 %	60 %	20 %	325284849
38	NC_015170	TCCAC	2	10	60264	60273	20 %	20 %	0 %	60 %	325284850
39	NC_015170	GCCCA	2	10	61119	61128	20 %	0 %	20 %	60 %	325284850
40	NC_015170	TCTGC	2	10	61954	61963	0 %	40 %	20 %	40 %	325284851
41	NC_015170	GCTGC	2	10	62556	62565	0 %	20 %	40 %	40 %	325284851
42	NC_015170	CCGCC	2	10	63074	63083	0 %	0 %	20 %	80 %	325284853
43	NC_015170	AAGTA	2	10	65140	65149	60 %	20 %	20 %	0 %	325284854
44	NC_015170	AGCCG	2	10	65955	65964	20 %	0 %	40 %	40 %	325284855
45	NC_015170	CTGGG	2	10	66174	66183	0 %	20 %	60 %	20 %	325284855
46	NC_015170	TCCCC	2	10	66701	66710	0 %	20 %	0 %	80 %	325284856
47	NC_015170	AGTGG	2	10	66983	66992	20 %	20 %	60 %	0 %	325284856
48	NC_015170	CGCTG	2	10	68969	68978	0 %	20 %	40 %	40 %	325284859
49	NC_015170	CCAGC	2	10	69462	69471	20 %	0 %	20 %	60 %	325284859
50	NC_015170	GCGCT	2	10	70951	70960	0 %	20 %	40 %	40 %	325284860
51	NC_015170	TGGCC	2	10	72158	72167	0 %	20 %	40 %	40 %	325284861
52	NC_015170	TCGCC	2	10	72262	72271	0 %	20 %	20 %	60 %	325284861
53	NC_015170	CCGGC	2	10	72665	72674	0 %	0 %	40 %	60 %	325284861
54	NC_015170	CTGGC	2	10	73477	73486	0 %	20 %	40 %	40 %	325284862
55	NC_015170	CTGGA	2	10	73588	73597	20 %	20 %	40 %	20 %	325284862
56	NC_015170	CGCAC	2	10	74948	74957	20 %	0 %	20 %	60 %	325284863
57	NC_015170	GCTGC	2	10	75660	75669	0 %	20 %	40 %	40 %	325284864
58	NC_015170	TGGGC	2	10	76169	76178	0 %	20 %	60 %	20 %	325284864
59	NC_015170	CGGGC	2	10	76365	76374	0 %	0 %	60 %	40 %	325284864
60	NC_015170	TGGCC	2	10	76460	76469	0 %	20 %	40 %	40 %	325284864
61	NC_015170	GCCCT	2	10	76470	76479	0 %	20 %	20 %	60 %	325284864
62	NC_015170	CTGGG	2	10	76989	76998	0 %	20 %	60 %	20 %	325284864
63	NC_015170	GCGCC	2	10	77610	77619	0 %	0 %	40 %	60 %	325284865
64	NC_015170	AGCGC	2	10	78136	78145	20 %	0 %	40 %	40 %	325284865
65	NC_015170	CGCGC	2	10	79987	79996	0 %	0 %	40 %	60 %	325284867
66	NC_015170	TAGCG	2	10	80080	80089	20 %	20 %	40 %	20 %	325284867
67	NC_015170	CCGCG	2	10	80370	80379	0 %	0 %	40 %	60 %	325284867
68	NC_015170	CGCTG	2	10	80869	80878	0 %	20 %	40 %	40 %	325284868
69	NC_015170	GGAAT	2	10	81659	81668	40 %	20 %	40 %	0 %	325284868
70	NC_015170	TTCGC	2	10	83655	83664	0 %	40 %	20 %	40 %	325284869
71	NC_015170	GTGGC	2	10	83876	83885	0 %	20 %	60 %	20 %	325284869
72	NC_015170	GGCCT	2	10	83904	83913	0 %	20 %	40 %	40 %	325284869
73	NC_015170	GCAGC	2	10	83936	83945	20 %	0 %	40 %	40 %	325284869
74	NC_015170	GAGCA	2	10	84256	84265	40 %	0 %	40 %	20 %	325284870
75	NC_015170	TCCGG	2	10	85002	85011	0 %	20 %	40 %	40 %	325284870
76	NC_015170	CCCCG	2	10	85131	85140	0 %	0 %	20 %	80 %	325284870
77	NC_015170	GCGCC	3	15	86027	86041	0 %	0 %	40 %	60 %	325284871
78	NC_015170	TGGCG	2	10	86471	86480	0 %	20 %	60 %	20 %	325284871
79	NC_015170	ACCAG	2	10	87244	87253	40 %	0 %	20 %	40 %	325284872
80	NC_015170	GCCGC	2	10	87592	87601	0 %	0 %	40 %	60 %	325284873
81	NC_015170	CGCCC	2	10	88150	88159	0 %	0 %	20 %	80 %	325284873
82	NC_015170	CGCCC	2	10	88378	88387	0 %	0 %	20 %	80 %	325284873
83	NC_015170	GGCTG	2	10	89285	89294	0 %	20 %	60 %	20 %	325284874
84	NC_015170	GCTCC	2	10	89504	89513	0 %	20 %	20 %	60 %	325284874
85	NC_015170	GCGCC	2	10	91015	91024	0 %	0 %	40 %	60 %	325284876
86	NC_015170	CGGCT	2	10	91246	91255	0 %	20 %	40 %	40 %	325284876
87	NC_015170	CTGAC	2	10	91373	91382	20 %	20 %	20 %	40 %	325284876
88	NC_015170	GCGAG	2	10	91844	91853	20 %	0 %	60 %	20 %	325284877
89	NC_015170	GCGCG	2	10	93179	93188	0 %	0 %	60 %	40 %	325284878
90	NC_015170	CCCAG	2	10	93578	93587	20 %	0 %	20 %	60 %	325284878
91	NC_015170	CAGCC	2	10	94424	94433	20 %	0 %	20 %	60 %	325284879
92	NC_015170	GCGCG	2	10	94601	94610	0 %	0 %	60 %	40 %	325284879
93	NC_015170	AGGTC	2	10	94694	94703	20 %	20 %	40 %	20 %	325284879
94	NC_015170	CGGCG	2	10	96334	96343	0 %	0 %	60 %	40 %	325284880
95	NC_015170	GCCTC	2	10	97363	97372	0 %	20 %	20 %	60 %	325284881
96	NC_015170	CGGCG	2	10	97379	97388	0 %	0 %	60 %	40 %	325284881
97	NC_015170	CGCGG	2	10	97506	97515	0 %	0 %	60 %	40 %	325284881
98	NC_015170	GGTCA	2	10	98211	98220	20 %	20 %	40 %	20 %	325284881
99	NC_015170	AAGGT	2	10	101700	101709	40 %	20 %	40 %	0 %	325284885
100	NC_015170	GGCCA	2	10	101843	101852	20 %	0 %	40 %	40 %	325284885
101	NC_015170	CCCCA	2	10	103031	103040	20 %	0 %	0 %	80 %	325284886
102	NC_015170	GCCGC	2	10	103891	103900	0 %	0 %	40 %	60 %	325284887
103	NC_015170	CCCAG	2	10	104590	104599	20 %	0 %	20 %	60 %	325284888
104	NC_015170	GCGCC	2	10	104612	104621	0 %	0 %	40 %	60 %	325284888
105	NC_015170	CGCGG	2	10	106239	106248	0 %	0 %	60 %	40 %	325284890
106	NC_015170	GCGCC	2	10	106587	106596	0 %	0 %	40 %	60 %	325284891
107	NC_015170	GCGCC	2	10	108705	108714	0 %	0 %	40 %	60 %	325284893
108	NC_015170	GCGCC	2	10	109935	109944	0 %	0 %	40 %	60 %	325284894
109	NC_015170	GCCGG	2	10	110116	110125	0 %	0 %	60 %	40 %	325284894
110	NC_015170	GGGCG	2	10	110500	110509	0 %	0 %	80 %	20 %	325284894
111	NC_015170	GCCGC	2	10	110513	110522	0 %	0 %	40 %	60 %	325284894
112	NC_015170	GCCGG	2	10	111121	111130	0 %	0 %	60 %	40 %	325284895
113	NC_015170	ACCCT	2	10	111522	111531	20 %	20 %	0 %	60 %	325284895
114	NC_015170	GCCCG	2	10	113026	113035	0 %	0 %	40 %	60 %	325284897
115	NC_015170	CTGGC	2	10	113130	113139	0 %	20 %	40 %	40 %	325284897
116	NC_015170	GGGCC	2	10	113447	113456	0 %	0 %	60 %	40 %	325284898
117	NC_015170	GCGCA	2	10	113843	113852	20 %	0 %	40 %	40 %	325284898
118	NC_015170	AGCGG	2	10	114051	114060	20 %	0 %	60 %	20 %	325284898
119	NC_015170	CCGCG	2	10	114346	114355	0 %	0 %	40 %	60 %	325284899
120	NC_015170	GTTCC	2	10	115073	115082	0 %	40 %	20 %	40 %	325284900
121	NC_015170	ACCTG	2	10	115486	115495	20 %	20 %	20 %	40 %	325284900
122	NC_015170	TGGGG	2	10	115601	115610	0 %	20 %	80 %	0 %	325284900
123	NC_015170	AGCCG	2	10	115967	115976	20 %	0 %	40 %	40 %	325284900
124	NC_015170	CGCTG	2	10	116060	116069	0 %	20 %	40 %	40 %	325284900
125	NC_015170	AGCCC	2	10	120337	120346	20 %	0 %	20 %	60 %	325284904
126	NC_015170	GCCGC	2	10	121676	121685	0 %	0 %	40 %	60 %	325284906
127	NC_015170	TGTGC	2	10	121849	121858	0 %	40 %	40 %	20 %	325284906
128	NC_015170	GCGGG	2	10	124039	124048	0 %	0 %	80 %	20 %	325284908
129	NC_015170	ACCAG	2	10	124143	124152	40 %	0 %	20 %	40 %	325284908
130	NC_015170	CGCGG	2	10	124590	124599	0 %	0 %	60 %	40 %	325284909
131	NC_015170	CGACT	2	10	125362	125371	20 %	20 %	20 %	40 %	325284909
132	NC_015170	CCTGA	2	10	125605	125614	20 %	20 %	20 %	40 %	325284909
133	NC_015170	CGGGC	2	10	127261	127270	0 %	0 %	60 %	40 %	325284910
134	NC_015170	GCTGG	2	10	128219	128228	0 %	20 %	60 %	20 %	325284911
135	NC_015170	GGTCA	2	10	131716	131725	20 %	20 %	40 %	20 %	325284915
136	NC_015170	GCGCA	2	10	132052	132061	20 %	0 %	40 %	40 %	325284915

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.