MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR03

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015170	CGTG	2	8	220	227	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015170	GGCA	2	8	604	611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015170	GCAA	2	8	5460	5467	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015170	TTTC	2	8	5740	5747	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015170	CGGG	2	8	11528	11535	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015170	TCGT	2	8	14905	14912	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015170	ACAA	2	8	16224	16231	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015170	GCGG	2	8	23238	23245	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015170	ATGG	2	8	23260	23267	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015170	GGCT	2	8	28327	28334	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015170	CTGC	2	8	34953	34960	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015170	TTCG	2	8	34980	34987	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015170	CTGC	2	8	35090	35097	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015170	CGGC	2	8	35196	35203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015170	CCCA	2	8	37559	37566	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_015170	GCTG	2	8	37626	37633	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015170	TTGC	2	8	37962	37969	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015170	TGGC	2	8	38235	38242	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015170	AGAT	2	8	38787	38794	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015170	GTTC	2	8	38867	38874	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015170	TCAG	2	8	39076	39083	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015170	ACCG	2	8	39602	39609	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015170	GTGG	2	8	39986	39993	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015170	ACGG	2	8	40067	40074	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015170	GGAC	2	8	40147	40154	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015170	GCGG	2	8	40657	40664	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015170	GAAA	2	8	44399	44406	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015170	CGGG	2	8	47917	47924	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015170	TGCC	2	8	53888	53895	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015170	AGCG	2	8	63864	63871	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015170	TGAG	2	8	63903	63910	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015170	AAAG	2	8	64324	64331	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015170	GCAA	2	8	65558	65565	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015170	GCCC	2	8	65589	65596	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_015170	CCAT	2	8	72917	72924	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015170	CTGA	2	8	84144	84151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015170	AATA	2	8	85392	85399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015170	CGGG	2	8	94036	94043	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015170	GCCA	2	8	94049	94056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015170	GGGC	2	8	95133	95140	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015170	AGGG	2	8	99483	99490	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015170	CCAG	2	8	99689	99696	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015170	CGGG	2	8	100083	100090	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015170	GAAT	2	8	100109	100116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015170	GCAG	2	8	102396	102403	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015170	CAGC	2	8	103217	103224	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015170	TCTG	2	8	104412	104419	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015170	CCTG	2	8	104461	104468	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015170	CAGC	2	8	114779	114786	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015170	CGAG	2	8	116411	116418	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015170	GATA	2	8	128089	128096	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015170	ATCT	2	8	128100	128107	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015170	GCCC	2	8	129243	129250	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_015170	CGTG	2	8	129261	129268	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015170	GCCA	2	8	131065	131072	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015170	GCGG	2	8	131081	131088	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015170	CCAG	2	8	131131	131138	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015170	CGGT	2	8	132190	132197	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.