MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR03

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015170	GC	3	6	1101	1106	0 %	0 %	50 %	50 %	325284807
2	NC_015170	GC	3	6	1131	1136	0 %	0 %	50 %	50 %	325284807
3	NC_015170	GC	3	6	1417	1422	0 %	0 %	50 %	50 %	325284807
4	NC_015170	GC	3	6	2441	2446	0 %	0 %	50 %	50 %	325284808
5	NC_015170	GC	3	6	4929	4934	0 %	0 %	50 %	50 %	325284810
6	NC_015170	GC	3	6	7091	7096	0 %	0 %	50 %	50 %	325284811
7	NC_015170	CT	3	6	7150	7155	0 %	50 %	0 %	50 %	325284811
8	NC_015170	CG	3	6	7634	7639	0 %	0 %	50 %	50 %	325284812
9	NC_015170	GC	4	8	8585	8592	0 %	0 %	50 %	50 %	325284812
10	NC_015170	GC	3	6	9148	9153	0 %	0 %	50 %	50 %	325284813
11	NC_015170	GC	3	6	9907	9912	0 %	0 %	50 %	50 %	325284813
12	NC_015170	CA	3	6	10358	10363	50 %	0 %	0 %	50 %	325284813
13	NC_015170	AG	3	6	13096	13101	50 %	0 %	50 %	0 %	325284815
14	NC_015170	GC	3	6	13990	13995	0 %	0 %	50 %	50 %	325284816
15	NC_015170	GC	3	6	14351	14356	0 %	0 %	50 %	50 %	325284816
16	NC_015170	GC	3	6	15304	15309	0 %	0 %	50 %	50 %	325284817
17	NC_015170	TC	3	6	22474	22479	0 %	50 %	0 %	50 %	325284824
18	NC_015170	AC	3	6	23137	23142	50 %	0 %	0 %	50 %	325284825
19	NC_015170	CG	3	6	24421	24426	0 %	0 %	50 %	50 %	325284827
20	NC_015170	CG	3	6	24938	24943	0 %	0 %	50 %	50 %	325284828
21	NC_015170	GC	3	6	27397	27402	0 %	0 %	50 %	50 %	325284830
22	NC_015170	CA	3	6	30697	30702	50 %	0 %	0 %	50 %	325284832
23	NC_015170	CG	3	6	30825	30830	0 %	0 %	50 %	50 %	325284832
24	NC_015170	CG	3	6	30848	30853	0 %	0 %	50 %	50 %	325284832
25	NC_015170	GC	3	6	31888	31893	0 %	0 %	50 %	50 %	325284833
26	NC_015170	GC	3	6	32904	32909	0 %	0 %	50 %	50 %	325284833
27	NC_015170	TC	3	6	37135	37140	0 %	50 %	0 %	50 %	325284836
28	NC_015170	GC	3	6	44730	44735	0 %	0 %	50 %	50 %	325284839
29	NC_015170	GC	3	6	47257	47262	0 %	0 %	50 %	50 %	325284841
30	NC_015170	GC	3	6	50134	50139	0 %	0 %	50 %	50 %	325284843
31	NC_015170	GC	3	6	50410	50415	0 %	0 %	50 %	50 %	325284843
32	NC_015170	TG	3	6	52601	52606	0 %	50 %	50 %	0 %	325284845
33	NC_015170	CG	3	6	56772	56777	0 %	0 %	50 %	50 %	325284848
34	NC_015170	GT	3	6	57337	57342	0 %	50 %	50 %	0 %	325284849
35	NC_015170	CT	3	6	58062	58067	0 %	50 %	0 %	50 %	325284849
36	NC_015170	CG	3	6	58448	58453	0 %	0 %	50 %	50 %	325284849
37	NC_015170	CT	3	6	60102	60107	0 %	50 %	0 %	50 %	325284850
38	NC_015170	CA	3	6	64665	64670	50 %	0 %	0 %	50 %	325284854
39	NC_015170	CG	3	6	66488	66493	0 %	0 %	50 %	50 %	325284855
40	NC_015170	GC	3	6	67074	67079	0 %	0 %	50 %	50 %	325284856
41	NC_015170	AC	3	6	67334	67339	50 %	0 %	0 %	50 %	325284857
42	NC_015170	AC	3	6	67867	67872	50 %	0 %	0 %	50 %	325284857
43	NC_015170	CA	3	6	67890	67895	50 %	0 %	0 %	50 %	325284857
44	NC_015170	CG	3	6	77451	77456	0 %	0 %	50 %	50 %	325284865
45	NC_015170	TG	3	6	78654	78659	0 %	50 %	50 %	0 %	325284866
46	NC_015170	GT	3	6	80521	80526	0 %	50 %	50 %	0 %	325284867
47	NC_015170	AT	3	6	80563	80568	50 %	50 %	0 %	0 %	325284867
48	NC_015170	GC	3	6	80985	80990	0 %	0 %	50 %	50 %	325284868
49	NC_015170	GC	3	6	81334	81339	0 %	0 %	50 %	50 %	325284868
50	NC_015170	TC	3	6	81438	81443	0 %	50 %	0 %	50 %	325284868
51	NC_015170	GC	3	6	82309	82314	0 %	0 %	50 %	50 %	325284869
52	NC_015170	GC	3	6	82580	82585	0 %	0 %	50 %	50 %	325284869
53	NC_015170	CG	3	6	83286	83291	0 %	0 %	50 %	50 %	325284869
54	NC_015170	GC	3	6	86181	86186	0 %	0 %	50 %	50 %	325284871
55	NC_015170	GC	3	6	87099	87104	0 %	0 %	50 %	50 %	325284872
56	NC_015170	GC	3	6	87399	87404	0 %	0 %	50 %	50 %	325284872
57	NC_015170	GC	3	6	88064	88069	0 %	0 %	50 %	50 %	325284873
58	NC_015170	CG	3	6	91410	91415	0 %	0 %	50 %	50 %	325284876
59	NC_015170	TC	3	6	93734	93739	0 %	50 %	0 %	50 %	325284878
60	NC_015170	TC	3	6	96076	96081	0 %	50 %	0 %	50 %	325284880
61	NC_015170	CG	3	6	97828	97833	0 %	0 %	50 %	50 %	325284881
62	NC_015170	CA	3	6	100693	100698	50 %	0 %	0 %	50 %	325284884
63	NC_015170	GC	3	6	100833	100838	0 %	0 %	50 %	50 %	325284884
64	NC_015170	GC	3	6	101451	101456	0 %	0 %	50 %	50 %	325284885
65	NC_015170	AG	3	6	101570	101575	50 %	0 %	50 %	0 %	325284885
66	NC_015170	CG	3	6	102789	102794	0 %	0 %	50 %	50 %	325284886
67	NC_015170	CG	3	6	103921	103926	0 %	0 %	50 %	50 %	325284887
68	NC_015170	GC	3	6	105341	105346	0 %	0 %	50 %	50 %	325284890
69	NC_015170	CA	3	6	105986	105991	50 %	0 %	0 %	50 %	325284890
70	NC_015170	GC	3	6	107185	107190	0 %	0 %	50 %	50 %	325284892
71	NC_015170	GC	3	6	107266	107271	0 %	0 %	50 %	50 %	325284892
72	NC_015170	GC	3	6	109920	109925	0 %	0 %	50 %	50 %	325284894
73	NC_015170	GC	3	6	110285	110290	0 %	0 %	50 %	50 %	325284894
74	NC_015170	GC	3	6	110475	110480	0 %	0 %	50 %	50 %	325284894
75	NC_015170	GC	3	6	111169	111174	0 %	0 %	50 %	50 %	325284895
76	NC_015170	GC	3	6	112458	112463	0 %	0 %	50 %	50 %	325284896
77	NC_015170	TG	3	6	114610	114615	0 %	50 %	50 %	0 %	325284899
78	NC_015170	GC	3	6	114693	114698	0 %	0 %	50 %	50 %	325284899
79	NC_015170	GC	3	6	117465	117470	0 %	0 %	50 %	50 %	325284902
80	NC_015170	AC	3	6	118248	118253	50 %	0 %	0 %	50 %	325284903
81	NC_015170	GC	3	6	120607	120612	0 %	0 %	50 %	50 %	325284904
82	NC_015170	CG	3	6	125050	125055	0 %	0 %	50 %	50 %	325284909
83	NC_015170	CG	3	6	126449	126454	0 %	0 %	50 %	50 %	325284909
84	NC_015170	TC	3	6	127199	127204	0 %	50 %	0 %	50 %	325284910

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.