MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR01

Total Repeats: 307

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015169	TGACC	2	10	647	656	20 %	20 %	20 %	40 %	325284552
2	NC_015169	AGCCC	2	10	920	929	20 %	0 %	20 %	60 %	325284552
3	NC_015169	CAGCC	2	10	3952	3961	20 %	0 %	20 %	60 %	325284556
4	NC_015169	GTCCT	2	10	5546	5555	0 %	40 %	20 %	40 %	325284557
5	NC_015169	TCAGT	2	10	9448	9457	20 %	40 %	20 %	20 %	325284560
6	NC_015169	CGGCG	2	10	10026	10035	0 %	0 %	60 %	40 %	325284560
7	NC_015169	AGCCC	2	10	11898	11907	20 %	0 %	20 %	60 %	325284562
8	NC_015169	AGCCG	2	10	12987	12996	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_015169	CGCAG	2	10	14657	14666	20 %	0 %	40 %	40 %	325284564
10	NC_015169	CGGCT	2	10	18482	18491	0 %	20 %	40 %	40 %	325284568
11	NC_015169	CTGTG	2	10	19575	19584	0 %	40 %	40 %	20 %	325284568
12	NC_015169	GGCAG	2	10	19622	19631	20 %	0 %	60 %	20 %	325284568
13	NC_015169	GGCGC	2	10	20737	20746	0 %	0 %	60 %	40 %	325284569
14	NC_015169	CGCGC	2	10	21152	21161	0 %	0 %	40 %	60 %	325284569
15	NC_015169	CCGGC	2	10	21796	21805	0 %	0 %	40 %	60 %	325284570
16	NC_015169	GCGCC	2	10	24098	24107	0 %	0 %	40 %	60 %	325284573
17	NC_015169	GTTGG	2	10	24312	24321	0 %	40 %	60 %	0 %	325284573
18	NC_015169	CTCGC	2	10	25967	25976	0 %	20 %	20 %	60 %	325284575
19	NC_015169	GCGCG	2	10	26370	26379	0 %	0 %	60 %	40 %	325284575
20	NC_015169	GCTGG	2	10	26631	26640	0 %	20 %	60 %	20 %	325284575
21	NC_015169	CGGGC	2	10	26848	26857	0 %	0 %	60 %	40 %	325284575
22	NC_015169	AGGGC	2	10	30036	30045	20 %	0 %	60 %	20 %	325284578
23	NC_015169	GAAGA	2	10	31213	31222	60 %	0 %	40 %	0 %	325284580
24	NC_015169	GCCAT	2	10	31748	31757	20 %	20 %	20 %	40 %	325284581
25	NC_015169	GCGCC	2	10	32448	32457	0 %	0 %	40 %	60 %	325284581
26	NC_015169	CTGAA	2	10	34621	34630	40 %	20 %	20 %	20 %	325284582
27	NC_015169	CGCTG	2	10	36298	36307	0 %	20 %	40 %	40 %	325284583
28	NC_015169	AGCCG	2	10	37057	37066	20 %	0 %	40 %	40 %	325284584
29	NC_015169	GCCGC	2	10	43669	43678	0 %	0 %	40 %	60 %	325284589
30	NC_015169	GCCTG	2	10	44994	45003	0 %	20 %	40 %	40 %	325284590
31	NC_015169	CCTGA	2	10	45678	45687	20 %	20 %	20 %	40 %	325284591
32	NC_015169	GGGGC	2	10	48702	48711	0 %	0 %	80 %	20 %	325284594
33	NC_015169	TGCCG	2	10	49402	49411	0 %	20 %	40 %	40 %	325284594
34	NC_015169	TGGCC	2	10	53087	53096	0 %	20 %	40 %	40 %	325284596
35	NC_015169	CGTGA	2	10	53157	53166	20 %	20 %	40 %	20 %	325284596
36	NC_015169	GCCCC	2	10	53438	53447	0 %	0 %	20 %	80 %	325284596
37	NC_015169	AGCGG	2	10	53597	53606	20 %	0 %	60 %	20 %	325284597
38	NC_015169	TCACC	2	10	53672	53681	20 %	20 %	0 %	60 %	325284597
39	NC_015169	GCCCC	2	10	53979	53988	0 %	0 %	20 %	80 %	325284597
40	NC_015169	CCAAC	2	10	55094	55103	40 %	0 %	0 %	60 %	325284597
41	NC_015169	GGCCT	2	10	55350	55359	0 %	20 %	40 %	40 %	325284597
42	NC_015169	CGGCA	2	10	55446	55455	20 %	0 %	40 %	40 %	325284597
43	NC_015169	GGAGC	2	10	56077	56086	20 %	0 %	60 %	20 %	325284598
44	NC_015169	GCCAG	2	10	56917	56926	20 %	0 %	40 %	40 %	325284600
45	NC_015169	CGTGC	2	10	57045	57054	0 %	20 %	40 %	40 %	325284600
46	NC_015169	CGGCG	2	10	58042	58051	0 %	0 %	60 %	40 %	325284601
47	NC_015169	TCCAG	2	10	59045	59054	20 %	20 %	20 %	40 %	325284602
48	NC_015169	GGCAT	2	10	59569	59578	20 %	20 %	40 %	20 %	325284603
49	NC_015169	CGCGC	2	10	59728	59737	0 %	0 %	40 %	60 %	325284604
50	NC_015169	GCGCC	2	10	60199	60208	0 %	0 %	40 %	60 %	325284604
51	NC_015169	CGTGG	2	10	60246	60255	0 %	20 %	60 %	20 %	325284604
52	NC_015169	GTGCC	2	10	60787	60796	0 %	20 %	40 %	40 %	325284605
53	NC_015169	CGCCC	2	10	63673	63682	0 %	0 %	20 %	80 %	325284607
54	NC_015169	GCGCC	2	10	63791	63800	0 %	0 %	40 %	60 %	325284607
55	NC_015169	CCAGT	2	10	63817	63826	20 %	20 %	20 %	40 %	325284607
56	NC_015169	CGGCG	2	10	64424	64433	0 %	0 %	60 %	40 %	325284608
57	NC_015169	GGCCG	2	10	65126	65135	0 %	0 %	60 %	40 %	325284609
58	NC_015169	GGCCG	2	10	65225	65234	0 %	0 %	60 %	40 %	325284609
59	NC_015169	CGCGC	2	10	67012	67021	0 %	0 %	40 %	60 %	325284611
60	NC_015169	GCCGT	2	10	67543	67552	0 %	20 %	40 %	40 %	325284611
61	NC_015169	GGGCG	2	10	68072	68081	0 %	0 %	80 %	20 %	325284611
62	NC_015169	CTCTT	2	10	69382	69391	0 %	60 %	0 %	40 %	325284613
63	NC_015169	CACCC	2	10	69779	69788	20 %	0 %	0 %	80 %	325284613
64	NC_015169	CCCGG	2	10	69827	69836	0 %	0 %	40 %	60 %	325284613
65	NC_015169	CCGGC	2	10	70430	70439	0 %	0 %	40 %	60 %	325284614
66	NC_015169	GCGTG	2	10	70508	70517	0 %	20 %	60 %	20 %	325284614
67	NC_015169	CCGCG	2	10	70607	70616	0 %	0 %	40 %	60 %	325284614
68	NC_015169	CCGGG	2	10	71048	71057	0 %	0 %	60 %	40 %	325284614
69	NC_015169	TGCGC	2	10	71788	71797	0 %	20 %	40 %	40 %	325284615
70	NC_015169	TGTGC	2	10	73767	73776	0 %	40 %	40 %	20 %	325284616
71	NC_015169	TCGCC	2	10	76482	76491	0 %	20 %	20 %	60 %	325284619
72	NC_015169	GACCT	2	10	81848	81857	20 %	20 %	20 %	40 %	325284623
73	NC_015169	TGACC	2	10	82258	82267	20 %	20 %	20 %	40 %	325284623
74	NC_015169	CGCTG	2	10	82279	82288	0 %	20 %	40 %	40 %	325284623
75	NC_015169	GCCGC	2	10	83673	83682	0 %	0 %	40 %	60 %	325284624
76	NC_015169	CGTGA	2	10	83863	83872	20 %	20 %	40 %	20 %	325284624
77	NC_015169	TGAAC	2	10	85013	85022	40 %	20 %	20 %	20 %	325284625
78	NC_015169	GCTGA	2	10	85257	85266	20 %	20 %	40 %	20 %	325284625
79	NC_015169	AGGCC	2	10	85337	85346	20 %	0 %	40 %	40 %	325284625
80	NC_015169	CAGGC	2	10	85811	85820	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_015169	GGTCA	2	10	86255	86264	20 %	20 %	40 %	20 %	325284626
82	NC_015169	GTGGG	2	10	87088	87097	0 %	20 %	80 %	0 %	325284626
83	NC_015169	TGGAC	2	10	87191	87200	20 %	20 %	40 %	20 %	325284626
84	NC_015169	CGGCC	2	10	88361	88370	0 %	0 %	40 %	60 %	325284627
85	NC_015169	CGCGC	2	10	88442	88451	0 %	0 %	40 %	60 %	325284627
86	NC_015169	CTGAC	2	10	90923	90932	20 %	20 %	20 %	40 %	325284628
87	NC_015169	GCCGG	2	10	92630	92639	0 %	0 %	60 %	40 %	325284630
88	NC_015169	GGCCT	2	10	93607	93616	0 %	20 %	40 %	40 %	325284630
89	NC_015169	GGCGG	2	10	95307	95316	0 %	0 %	80 %	20 %	325284631
90	NC_015169	AACGG	2	10	95366	95375	40 %	0 %	40 %	20 %	325284631
91	NC_015169	GCCGC	2	10	96720	96729	0 %	0 %	40 %	60 %	325284632
92	NC_015169	GCCCG	2	10	97429	97438	0 %	0 %	40 %	60 %	325284633
93	NC_015169	CGGGG	2	10	98749	98758	0 %	0 %	80 %	20 %	325284634
94	NC_015169	CGGCG	2	10	98945	98954	0 %	0 %	60 %	40 %	325284634
95	NC_015169	CGCGG	2	10	98986	98995	0 %	0 %	60 %	40 %	325284634
96	NC_015169	GGGCC	2	10	100312	100321	0 %	0 %	60 %	40 %	325284635
97	NC_015169	GCTGG	2	10	101485	101494	0 %	20 %	60 %	20 %	325284636
98	NC_015169	GCGGG	2	10	103205	103214	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015169	AGGGC	2	10	108288	108297	20 %	0 %	60 %	20 %	325284642
100	NC_015169	GGGCA	2	10	108307	108316	20 %	0 %	60 %	20 %	325284642
101	NC_015169	GCCTG	2	10	108347	108356	0 %	20 %	40 %	40 %	325284642
102	NC_015169	GCGCC	2	10	109381	109390	0 %	0 %	40 %	60 %	325284642
103	NC_015169	CGGCG	2	10	110303	110312	0 %	0 %	60 %	40 %	325284643
104	NC_015169	TGTGG	2	10	110503	110512	0 %	40 %	60 %	0 %	325284643
105	NC_015169	CACGC	2	10	111465	111474	20 %	0 %	20 %	60 %	325284644
106	NC_015169	ACGCC	2	10	112454	112463	20 %	0 %	20 %	60 %	325284645
107	NC_015169	GCGCC	2	10	112820	112829	0 %	0 %	40 %	60 %	325284645
108	NC_015169	CGGCG	2	10	115234	115243	0 %	0 %	60 %	40 %	325284647
109	NC_015169	GCCGC	2	10	119089	119098	0 %	0 %	40 %	60 %	325284650
110	NC_015169	AGGTG	2	10	119854	119863	20 %	20 %	60 %	0 %	325284650
111	NC_015169	TGGGT	2	10	119866	119875	0 %	40 %	60 %	0 %	325284650
112	NC_015169	TTCTC	2	10	119884	119893	0 %	60 %	0 %	40 %	325284651
113	NC_015169	CCGCG	2	10	121064	121073	0 %	0 %	40 %	60 %	325284652
114	NC_015169	CTGGT	2	10	121222	121231	0 %	40 %	40 %	20 %	325284652
115	NC_015169	CGGCC	2	10	122374	122383	0 %	0 %	40 %	60 %	325284653
116	NC_015169	GGCCG	2	10	122464	122473	0 %	0 %	60 %	40 %	325284653
117	NC_015169	TGCCG	2	10	122868	122877	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_015169	GCCCG	2	10	123784	123793	0 %	0 %	40 %	60 %	325284654
119	NC_015169	GCCAG	2	10	124182	124191	20 %	0 %	40 %	40 %	325284654
120	NC_015169	GGCCC	2	10	126877	126886	0 %	0 %	40 %	60 %	325284657
121	NC_015169	TGGCC	2	10	129111	129120	0 %	20 %	40 %	40 %	325284659
122	NC_015169	CACTT	2	10	130287	130296	20 %	40 %	0 %	40 %	325284660
123	NC_015169	GCTGG	2	10	131564	131573	0 %	20 %	60 %	20 %	325284661
124	NC_015169	CGGCG	3	15	132072	132086	0 %	0 %	60 %	40 %	325284661
125	NC_015169	CAGCT	2	10	134357	134366	20 %	20 %	20 %	40 %	325284665
126	NC_015169	GGCGA	2	10	134951	134960	20 %	0 %	60 %	20 %	325284665
127	NC_015169	TGCGC	2	10	136326	136335	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_015169	GCCTG	2	10	136707	136716	0 %	20 %	40 %	40 %	325284668
129	NC_015169	CTCCG	2	10	136773	136782	0 %	20 %	20 %	60 %	325284668
130	NC_015169	CCGGC	2	10	137076	137085	0 %	0 %	40 %	60 %	325284669
131	NC_015169	GCGCC	2	10	138644	138653	0 %	0 %	40 %	60 %	325284670
132	NC_015169	TGCTG	2	10	138804	138813	0 %	40 %	40 %	20 %	325284671
133	NC_015169	GGGCA	2	10	139588	139597	20 %	0 %	60 %	20 %	325284671
134	NC_015169	GTGCG	2	10	139646	139655	0 %	20 %	60 %	20 %	325284671
135	NC_015169	CCGGC	2	10	139771	139780	0 %	0 %	40 %	60 %	325284671
136	NC_015169	GCCGC	2	10	141317	141326	0 %	0 %	40 %	60 %	325284672
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255	NC_015169	CCTGG	2	10	255369	255378	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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259	NC_015169	GCTGG	2	10	262612	262621	0 %	20 %	60 %	20 %	325284769
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269	NC_015169	CGCCC	2	10	270350	270359	0 %	0 %	20 %	80 %	325284775
270	NC_015169	AGCTC	2	10	271812	271821	20 %	20 %	20 %	40 %	325284776
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273	NC_015169	TGGGC	2	10	273573	273582	0 %	20 %	60 %	20 %	325284777
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276	NC_015169	GGCGG	2	10	276662	276671	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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282	NC_015169	TGACC	2	10	285448	285457	20 %	20 %	20 %	40 %	325284788
283	NC_015169	AGCGC	2	10	285643	285652	20 %	0 %	40 %	40 %	325284788
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286	NC_015169	CGCTG	2	10	289402	289411	0 %	20 %	40 %	40 %	325284790
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292	NC_015169	TGACG	2	10	295392	295401	20 %	20 %	40 %	20 %	325284794
293	NC_015169	CGGCA	2	10	295842	295851	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
294	NC_015169	TGGCC	2	10	298528	298537	0 %	20 %	40 %	40 %	325284796
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297	NC_015169	CCGGA	2	10	303454	303463	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
298	NC_015169	CCGCC	2	10	303550	303559	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
299	NC_015169	ACCGC	2	10	304038	304047	20 %	0 %	20 %	60 %	325284800
300	NC_015169	GCGCC	2	10	307988	307997	0 %	0 %	40 %	60 %	325284801
301	NC_015169	AGCTC	2	10	309249	309258	20 %	20 %	20 %	40 %	325284802
302	NC_015169	CGGGA	2	10	310121	310130	20 %	0 %	60 %	20 %	325284803
303	NC_015169	CCGAC	2	10	310307	310316	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
304	NC_015169	GGGCC	2	10	310726	310735	0 %	0 %	60 %	40 %	325284804
305	NC_015169	CGGCG	2	10	313939	313948	0 %	0 %	60 %	40 %	325284805
306	NC_015169	AGTCG	2	10	314060	314069	20 %	20 %	40 %	20 %	325284805
307	NC_015169	AAGGG	2	10	314363	314372	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.