MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR01

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015169	AGCCG	2	10	12987	12996	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_015169	CAGGC	2	10	85811	85820	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_015169	GCGGG	2	10	103205	103214	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015169	TGCCG	2	10	122868	122877	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_015169	TGCGC	2	10	136326	136335	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015169	GGGAA	2	10	141841	141850	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015169	GCGGG	2	10	153207	153216	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015169	CTGCG	2	10	163806	163815	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_015169	CCTCA	2	10	165117	165126	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_015169	TGGCC	2	10	171096	171105	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_015169	GGGCA	2	10	174010	174019	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015169	TCAGT	2	10	176552	176561	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015169	GTTAC	2	10	179244	179253	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015169	CCTCT	2	10	184580	184589	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_015169	GCCAG	2	10	204015	204024	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_015169	TTATT	2	10	212642	212651	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015169	GGCCG	2	10	219769	219778	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18	NC_015169	AGCCC	2	10	220184	220193	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_015169	GTGCC	2	10	230090	230099	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_015169	CAGGC	2	10	237402	237411	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_015169	CCGGC	2	10	246505	246514	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_015169	CCTGG	2	10	255369	255378	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_015169	CACCC	2	10	263034	263043	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
24	NC_015169	GAGCC	2	10	263070	263079	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015169	GCGCC	2	10	276159	276168	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_015169	GGCGG	2	10	276662	276671	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015169	CGGCA	2	10	295842	295851	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_015169	CACGA	2	10	302562	302571	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_015169	CCGGA	2	10	303454	303463	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_015169	CCGCC	2	10	303550	303559	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
31	NC_015169	CCGAC	2	10	310307	310316	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_015169	AAGGG	2	10	314363	314372	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.