MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR01

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015169	CTCA	2	8	5	12	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015169	TCCC	2	8	5267	5274	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_015169	TTAT	2	8	11231	11238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015169	GAGC	2	8	14272	14279	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015169	AGGC	2	8	16237	16244	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015169	GCCC	2	8	21956	21963	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_015169	GGCC	2	8	22596	22603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015169	GCCT	2	8	29608	29615	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015169	CATC	2	8	29854	29861	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015169	ACTG	2	8	31317	31324	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015169	TTGC	2	8	31521	31528	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015169	CGTG	2	8	39469	39476	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015169	GCCC	2	8	50093	50100	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_015169	GGGC	2	8	50242	50249	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015169	TCTG	2	8	62783	62790	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015169	TCCT	2	8	68160	68167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015169	CGGC	2	8	69306	69313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015169	GTAT	2	8	69345	69352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015169	TGCC	2	8	75203	75210	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015169	TGCG	2	8	77096	77103	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015169	GGCT	2	8	77295	77302	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015169	CGTC	2	8	77313	77320	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015169	GGGC	2	8	77839	77846	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015169	CTGG	2	8	88894	88901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015169	CGCC	2	8	103188	103195	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_015169	GGCC	2	8	112252	112259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015169	CGTT	2	8	116041	116048	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015169	TGGG	2	8	117633	117640	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015169	GCCG	3	12	117658	117669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015169	CTCA	2	8	132298	132305	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015169	AAGG	2	8	132320	132327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015169	GGCG	2	8	136120	136127	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015169	TCGC	2	8	136242	136249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015169	GGGC	2	8	136286	136293	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015169	CTGC	2	8	136816	136823	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015169	CAGA	2	8	141796	141803	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015169	GCCC	2	8	143097	143104	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_015169	GCCC	2	8	145777	145784	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_015169	CTGC	2	8	149836	149843	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015169	AGCC	2	8	154548	154555	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015169	TCTG	2	8	160519	160526	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015169	CCGG	2	8	162427	162434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015169	GGGA	2	8	165275	165282	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015169	AATA	2	8	165292	165299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015169	GTGG	2	8	179191	179198	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015169	GCCA	2	8	179283	179290	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015169	AAAT	2	8	190779	190786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015169	AGGG	2	8	191922	191929	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015169	GGAC	2	8	196067	196074	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015169	GACC	2	8	196081	196088	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015169	TCAC	2	8	196148	196155	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015169	CCTT	2	8	197302	197309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015169	ATTC	2	8	198288	198295	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015169	GGGC	2	8	198367	198374	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015169	GCCC	2	8	202495	202502	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_015169	GACG	2	8	203020	203027	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015169	AGCC	2	8	203038	203045	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015169	TGGG	2	8	206192	206199	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015169	TCCT	2	8	208361	208368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015169	TAAG	2	8	212774	212781	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015169	TGCT	2	8	217147	217154	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015169	GGAG	2	8	220085	220092	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015169	AAGG	2	8	221551	221558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015169	GCGG	2	8	229262	229269	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015169	CCAC	2	8	230164	230171	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_015169	GCCA	2	8	237452	237459	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015169	GGCC	2	8	239662	239669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015169	TCGC	2	8	242463	242470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015169	CTGG	2	8	242622	242629	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015169	CTGG	2	8	242910	242917	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015169	GCCG	2	8	243087	243094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015169	AGCG	2	8	243139	243146	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015169	GCGG	2	8	244646	244653	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015169	GTGG	2	8	246699	246706	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015169	GGAG	2	8	253054	253061	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015169	ATCA	2	8	253357	253364	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015169	CACC	2	8	259338	259345	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
78	NC_015169	AGGC	2	8	260180	260187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015169	GCCA	2	8	261194	261201	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015169	ATGC	2	8	262975	262982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015169	GCTG	2	8	272753	272760	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015169	CGGC	2	8	276195	276202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015169	GCAC	2	8	276760	276767	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015169	CCCA	2	8	284095	284102	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_015169	GGCC	2	8	288676	288683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015169	GGAT	2	8	297744	297751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015169	TGCC	2	8	300762	300769	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015169	ATCC	2	8	311487	311494	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015169	GCGG	2	8	314388	314395	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.