MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR01

Total Repeats: 265

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015169	CG	3	6	2582	2587	0 %	0 %	50 %	50 %	325284554
2	NC_015169	AG	3	6	4819	4824	50 %	0 %	50 %	0 %	325284556
3	NC_015169	GC	3	6	5679	5684	0 %	0 %	50 %	50 %	325284557
4	NC_015169	AG	3	6	7280	7285	50 %	0 %	50 %	0 %	325284558
5	NC_015169	CA	3	6	9170	9175	50 %	0 %	0 %	50 %	325284559
6	NC_015169	CG	3	6	11778	11783	0 %	0 %	50 %	50 %	325284562
7	NC_015169	CT	3	6	13094	13099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015169	CT	3	6	13421	13426	0 %	50 %	0 %	50 %	325284563
9	NC_015169	AC	3	6	14930	14935	50 %	0 %	0 %	50 %	325284564
10	NC_015169	GC	3	6	15232	15237	0 %	0 %	50 %	50 %	325284564
11	NC_015169	GC	3	6	15678	15683	0 %	0 %	50 %	50 %	325284565
12	NC_015169	GA	3	6	16489	16494	50 %	0 %	50 %	0 %	325284566
13	NC_015169	GC	3	6	17056	17061	0 %	0 %	50 %	50 %	325284566
14	NC_015169	GA	3	6	17191	17196	50 %	0 %	50 %	0 %	325284566
15	NC_015169	CT	3	6	17484	17489	0 %	50 %	0 %	50 %	325284566
16	NC_015169	AT	3	6	17927	17932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015169	GC	3	6	20780	20785	0 %	0 %	50 %	50 %	325284569
18	NC_015169	GC	3	6	22764	22769	0 %	0 %	50 %	50 %	325284572
19	NC_015169	CG	3	6	23315	23320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015169	GC	3	6	26842	26847	0 %	0 %	50 %	50 %	325284575
21	NC_015169	TC	3	6	27097	27102	0 %	50 %	0 %	50 %	325284575
22	NC_015169	GC	3	6	27755	27760	0 %	0 %	50 %	50 %	325284576
23	NC_015169	CT	3	6	28211	28216	0 %	50 %	0 %	50 %	325284576
24	NC_015169	CA	3	6	29545	29550	50 %	0 %	0 %	50 %	325284576
25	NC_015169	CA	3	6	29749	29754	50 %	0 %	0 %	50 %	325284577
26	NC_015169	GC	3	6	31010	31015	0 %	0 %	50 %	50 %	325284580
27	NC_015169	GC	3	6	33010	33015	0 %	0 %	50 %	50 %	325284581
28	NC_015169	CG	3	6	33187	33192	0 %	0 %	50 %	50 %	325284581
29	NC_015169	GC	3	6	35257	35262	0 %	0 %	50 %	50 %	325284582
30	NC_015169	GC	3	6	35567	35572	0 %	0 %	50 %	50 %	325284582
31	NC_015169	GT	3	6	35824	35829	0 %	50 %	50 %	0 %	325284583
32	NC_015169	GC	3	6	38082	38087	0 %	0 %	50 %	50 %	325284584
33	NC_015169	CA	3	6	39006	39011	50 %	0 %	0 %	50 %	325284585
34	NC_015169	CA	3	6	39851	39856	50 %	0 %	0 %	50 %	325284586
35	NC_015169	CG	3	6	40055	40060	0 %	0 %	50 %	50 %	325284586
36	NC_015169	CG	3	6	40685	40690	0 %	0 %	50 %	50 %	325284587
37	NC_015169	GT	3	6	40966	40971	0 %	50 %	50 %	0 %	325284587
38	NC_015169	CA	3	6	44173	44178	50 %	0 %	0 %	50 %	325284589
39	NC_015169	TG	3	6	44926	44931	0 %	50 %	50 %	0 %	325284590
40	NC_015169	GA	3	6	46650	46655	50 %	0 %	50 %	0 %	325284592
41	NC_015169	CA	3	6	48079	48084	50 %	0 %	0 %	50 %	325284593
42	NC_015169	GC	3	6	48327	48332	0 %	0 %	50 %	50 %	325284593
43	NC_015169	GC	3	6	49461	49466	0 %	0 %	50 %	50 %	325284594
44	NC_015169	GC	3	6	56450	56455	0 %	0 %	50 %	50 %	325284598
45	NC_015169	GA	4	8	59545	59552	50 %	0 %	50 %	0 %	325284603
46	NC_015169	CT	3	6	60326	60331	0 %	50 %	0 %	50 %	325284604
47	NC_015169	GT	3	6	60872	60877	0 %	50 %	50 %	0 %	325284605
48	NC_015169	GC	3	6	61173	61178	0 %	0 %	50 %	50 %	325284605
49	NC_015169	CG	3	6	61415	61420	0 %	0 %	50 %	50 %	325284605
50	NC_015169	CG	3	6	61641	61646	0 %	0 %	50 %	50 %	325284605
51	NC_015169	TC	3	6	62141	62146	0 %	50 %	0 %	50 %	325284605
52	NC_015169	GA	3	6	62163	62168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015169	CA	3	6	62202	62207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015169	CG	3	6	63032	63037	0 %	0 %	50 %	50 %	325284606
55	NC_015169	GC	3	6	63710	63715	0 %	0 %	50 %	50 %	325284607
56	NC_015169	AC	3	6	63926	63931	50 %	0 %	0 %	50 %	325284607
57	NC_015169	CA	3	6	64063	64068	50 %	0 %	0 %	50 %	325284607
58	NC_015169	CG	3	6	64550	64555	0 %	0 %	50 %	50 %	325284608
59	NC_015169	GC	3	6	65155	65160	0 %	0 %	50 %	50 %	325284609
60	NC_015169	CG	3	6	65233	65238	0 %	0 %	50 %	50 %	325284609
61	NC_015169	CG	3	6	66902	66907	0 %	0 %	50 %	50 %	325284611
62	NC_015169	GA	3	6	67637	67642	50 %	0 %	50 %	0 %	325284611
63	NC_015169	GC	3	6	71262	71267	0 %	0 %	50 %	50 %	325284615
64	NC_015169	GC	3	6	71737	71742	0 %	0 %	50 %	50 %	325284615
65	NC_015169	CG	3	6	72978	72983	0 %	0 %	50 %	50 %	325284615
66	NC_015169	GC	3	6	74050	74055	0 %	0 %	50 %	50 %	325284616
67	NC_015169	GC	3	6	74244	74249	0 %	0 %	50 %	50 %	325284616
68	NC_015169	GC	3	6	75557	75562	0 %	0 %	50 %	50 %	325284618
69	NC_015169	AG	3	6	77168	77173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015169	GT	4	8	77923	77930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015169	CT	3	6	78598	78603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015169	AG	3	6	78937	78942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015169	CT	3	6	78998	79003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015169	GC	3	6	80502	80507	0 %	0 %	50 %	50 %	325284621
75	NC_015169	GC	3	6	81027	81032	0 %	0 %	50 %	50 %	325284621
76	NC_015169	GT	3	6	81392	81397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015169	GC	3	6	81627	81632	0 %	0 %	50 %	50 %	325284622
78	NC_015169	GC	3	6	82917	82922	0 %	0 %	50 %	50 %	325284623
79	NC_015169	GC	3	6	83002	83007	0 %	0 %	50 %	50 %	325284623
80	NC_015169	CA	3	6	84092	84097	50 %	0 %	0 %	50 %	325284624
81	NC_015169	TA	3	6	84671	84676	50 %	50 %	0 %	0 %	325284624
82	NC_015169	GC	3	6	84861	84866	0 %	0 %	50 %	50 %	325284625
83	NC_015169	GT	3	6	85311	85316	0 %	50 %	50 %	0 %	325284625
84	NC_015169	GA	3	6	92126	92131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015169	CG	3	6	93525	93530	0 %	0 %	50 %	50 %	325284630
86	NC_015169	TC	3	6	96298	96303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015169	CG	3	6	97930	97935	0 %	0 %	50 %	50 %	325284633
88	NC_015169	GC	3	6	98178	98183	0 %	0 %	50 %	50 %	325284633
89	NC_015169	GC	3	6	100368	100373	0 %	0 %	50 %	50 %	325284635
90	NC_015169	CG	3	6	101970	101975	0 %	0 %	50 %	50 %	325284637
91	NC_015169	GC	3	6	105945	105950	0 %	0 %	50 %	50 %	325284639
92	NC_015169	GC	3	6	106872	106877	0 %	0 %	50 %	50 %	325284640
93	NC_015169	GC	3	6	108650	108655	0 %	0 %	50 %	50 %	325284642
94	NC_015169	GT	3	6	109523	109528	0 %	50 %	50 %	0 %	325284642
95	NC_015169	TG	3	6	112517	112522	0 %	50 %	50 %	0 %	325284645
96	NC_015169	TC	3	6	113368	113373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015169	AG	3	6	113808	113813	50 %	0 %	50 %	0 %	325284646
98	NC_015169	GC	3	6	116367	116372	0 %	0 %	50 %	50 %	325284648
99	NC_015169	GC	3	6	118181	118186	0 %	0 %	50 %	50 %	325284649
100	NC_015169	GC	3	6	118756	118761	0 %	0 %	50 %	50 %	325284649
101	NC_015169	GC	3	6	119490	119495	0 %	0 %	50 %	50 %	325284650
102	NC_015169	GC	3	6	121153	121158	0 %	0 %	50 %	50 %	325284652
103	NC_015169	GT	3	6	122035	122040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015169	TG	3	6	122733	122738	0 %	50 %	50 %	0 %	325284653
105	NC_015169	GC	3	6	129919	129924	0 %	0 %	50 %	50 %	325284659
106	NC_015169	GC	3	6	130595	130600	0 %	0 %	50 %	50 %	325284660
107	NC_015169	CG	3	6	137858	137863	0 %	0 %	50 %	50 %	325284669
108	NC_015169	TC	3	6	139014	139019	0 %	50 %	0 %	50 %	325284671
109	NC_015169	GC	3	6	144582	144587	0 %	0 %	50 %	50 %	325284675
110	NC_015169	GC	3	6	144816	144821	0 %	0 %	50 %	50 %	325284675
111	NC_015169	AC	4	8	145369	145376	50 %	0 %	0 %	50 %	325284676
112	NC_015169	CA	3	6	145544	145549	50 %	0 %	0 %	50 %	325284676
113	NC_015169	GC	3	6	146978	146983	0 %	0 %	50 %	50 %	325284677
114	NC_015169	GC	3	6	148256	148261	0 %	0 %	50 %	50 %	325284678
115	NC_015169	GC	3	6	148670	148675	0 %	0 %	50 %	50 %	325284678
116	NC_015169	GC	3	6	148877	148882	0 %	0 %	50 %	50 %	325284678
117	NC_015169	AG	3	6	149523	149528	50 %	0 %	50 %	0 %	325284679
118	NC_015169	AG	3	6	153149	153154	50 %	0 %	50 %	0 %	325284680
119	NC_015169	CT	3	6	155983	155988	0 %	50 %	0 %	50 %	325284683
120	NC_015169	TC	3	6	156341	156346	0 %	50 %	0 %	50 %	325284683
121	NC_015169	CA	3	6	156434	156439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015169	TG	3	6	156479	156484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015169	TC	3	6	156868	156873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015169	AC	3	6	157729	157734	50 %	0 %	0 %	50 %	325284686
125	NC_015169	GC	3	6	158219	158224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015169	CT	3	6	158352	158357	0 %	50 %	0 %	50 %	325284687
127	NC_015169	AC	3	6	159023	159028	50 %	0 %	0 %	50 %	325284687
128	NC_015169	CT	3	6	159703	159708	0 %	50 %	0 %	50 %	325284687
129	NC_015169	AC	3	6	160704	160709	50 %	0 %	0 %	50 %	325284688
130	NC_015169	GC	3	6	160828	160833	0 %	0 %	50 %	50 %	325284688
131	NC_015169	GA	3	6	162147	162152	50 %	0 %	50 %	0 %	325284688
132	NC_015169	TC	3	6	164086	164091	0 %	50 %	0 %	50 %	325284691
133	NC_015169	CG	3	6	164612	164617	0 %	0 %	50 %	50 %	325284691
134	NC_015169	AT	4	8	165206	165213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015169	AT	3	6	165312	165317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015169	CA	3	6	165410	165415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015169	TC	3	6	166744	166749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015169	TG	3	6	169362	169367	0 %	50 %	50 %	0 %	325284698
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140	NC_015169	GC	3	6	172352	172357	0 %	0 %	50 %	50 %	325284701
141	NC_015169	AT	3	6	174706	174711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015169	GA	3	6	176751	176756	50 %	0 %	50 %	0 %	325284705
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.