MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR01

Total Repeats: 218

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015169	CG	3	6	2582	2587	0 %	0 %	50 %	50 %	325284554
2	NC_015169	AG	3	6	4819	4824	50 %	0 %	50 %	0 %	325284556
3	NC_015169	GC	3	6	5679	5684	0 %	0 %	50 %	50 %	325284557
4	NC_015169	AG	3	6	7280	7285	50 %	0 %	50 %	0 %	325284558
5	NC_015169	CA	3	6	9170	9175	50 %	0 %	0 %	50 %	325284559
6	NC_015169	CG	3	6	11778	11783	0 %	0 %	50 %	50 %	325284562
7	NC_015169	CT	3	6	13421	13426	0 %	50 %	0 %	50 %	325284563
8	NC_015169	AC	3	6	14930	14935	50 %	0 %	0 %	50 %	325284564
9	NC_015169	GC	3	6	15232	15237	0 %	0 %	50 %	50 %	325284564
10	NC_015169	GC	3	6	15678	15683	0 %	0 %	50 %	50 %	325284565
11	NC_015169	GA	3	6	16489	16494	50 %	0 %	50 %	0 %	325284566
12	NC_015169	GC	3	6	17056	17061	0 %	0 %	50 %	50 %	325284566
13	NC_015169	GA	3	6	17191	17196	50 %	0 %	50 %	0 %	325284566
14	NC_015169	CT	3	6	17484	17489	0 %	50 %	0 %	50 %	325284566
15	NC_015169	GC	3	6	20780	20785	0 %	0 %	50 %	50 %	325284569
16	NC_015169	GC	3	6	22764	22769	0 %	0 %	50 %	50 %	325284572
17	NC_015169	GC	3	6	26842	26847	0 %	0 %	50 %	50 %	325284575
18	NC_015169	TC	3	6	27097	27102	0 %	50 %	0 %	50 %	325284575
19	NC_015169	GC	3	6	27755	27760	0 %	0 %	50 %	50 %	325284576
20	NC_015169	CT	3	6	28211	28216	0 %	50 %	0 %	50 %	325284576
21	NC_015169	CA	3	6	29545	29550	50 %	0 %	0 %	50 %	325284576
22	NC_015169	CA	3	6	29749	29754	50 %	0 %	0 %	50 %	325284577
23	NC_015169	GC	3	6	31010	31015	0 %	0 %	50 %	50 %	325284580
24	NC_015169	GC	3	6	33010	33015	0 %	0 %	50 %	50 %	325284581
25	NC_015169	CG	3	6	33187	33192	0 %	0 %	50 %	50 %	325284581
26	NC_015169	GC	3	6	35257	35262	0 %	0 %	50 %	50 %	325284582
27	NC_015169	GC	3	6	35567	35572	0 %	0 %	50 %	50 %	325284582
28	NC_015169	GT	3	6	35824	35829	0 %	50 %	50 %	0 %	325284583
29	NC_015169	GC	3	6	38082	38087	0 %	0 %	50 %	50 %	325284584
30	NC_015169	CA	3	6	39006	39011	50 %	0 %	0 %	50 %	325284585
31	NC_015169	CA	3	6	39851	39856	50 %	0 %	0 %	50 %	325284586
32	NC_015169	CG	3	6	40055	40060	0 %	0 %	50 %	50 %	325284586
33	NC_015169	CG	3	6	40685	40690	0 %	0 %	50 %	50 %	325284587
34	NC_015169	GT	3	6	40966	40971	0 %	50 %	50 %	0 %	325284587
35	NC_015169	CA	3	6	44173	44178	50 %	0 %	0 %	50 %	325284589
36	NC_015169	TG	3	6	44926	44931	0 %	50 %	50 %	0 %	325284590
37	NC_015169	GA	3	6	46650	46655	50 %	0 %	50 %	0 %	325284592
38	NC_015169	CA	3	6	48079	48084	50 %	0 %	0 %	50 %	325284593
39	NC_015169	GC	3	6	48327	48332	0 %	0 %	50 %	50 %	325284593
40	NC_015169	GC	3	6	49461	49466	0 %	0 %	50 %	50 %	325284594
41	NC_015169	GC	3	6	56450	56455	0 %	0 %	50 %	50 %	325284598
42	NC_015169	GA	4	8	59545	59552	50 %	0 %	50 %	0 %	325284603
43	NC_015169	CT	3	6	60326	60331	0 %	50 %	0 %	50 %	325284604
44	NC_015169	GT	3	6	60872	60877	0 %	50 %	50 %	0 %	325284605
45	NC_015169	GC	3	6	61173	61178	0 %	0 %	50 %	50 %	325284605
46	NC_015169	CG	3	6	61415	61420	0 %	0 %	50 %	50 %	325284605
47	NC_015169	CG	3	6	61641	61646	0 %	0 %	50 %	50 %	325284605
48	NC_015169	TC	3	6	62141	62146	0 %	50 %	0 %	50 %	325284605
49	NC_015169	CG	3	6	63032	63037	0 %	0 %	50 %	50 %	325284606
50	NC_015169	GC	3	6	63710	63715	0 %	0 %	50 %	50 %	325284607
51	NC_015169	AC	3	6	63926	63931	50 %	0 %	0 %	50 %	325284607
52	NC_015169	CA	3	6	64063	64068	50 %	0 %	0 %	50 %	325284607
53	NC_015169	CG	3	6	64550	64555	0 %	0 %	50 %	50 %	325284608
54	NC_015169	GC	3	6	65155	65160	0 %	0 %	50 %	50 %	325284609
55	NC_015169	CG	3	6	65233	65238	0 %	0 %	50 %	50 %	325284609
56	NC_015169	CG	3	6	66902	66907	0 %	0 %	50 %	50 %	325284611
57	NC_015169	GA	3	6	67637	67642	50 %	0 %	50 %	0 %	325284611
58	NC_015169	GC	3	6	71262	71267	0 %	0 %	50 %	50 %	325284615
59	NC_015169	GC	3	6	71737	71742	0 %	0 %	50 %	50 %	325284615
60	NC_015169	CG	3	6	72978	72983	0 %	0 %	50 %	50 %	325284615
61	NC_015169	GC	3	6	74050	74055	0 %	0 %	50 %	50 %	325284616
62	NC_015169	GC	3	6	74244	74249	0 %	0 %	50 %	50 %	325284616
63	NC_015169	GC	3	6	75557	75562	0 %	0 %	50 %	50 %	325284618
64	NC_015169	GC	3	6	80502	80507	0 %	0 %	50 %	50 %	325284621
65	NC_015169	GC	3	6	81027	81032	0 %	0 %	50 %	50 %	325284621
66	NC_015169	GC	3	6	81627	81632	0 %	0 %	50 %	50 %	325284622
67	NC_015169	GC	3	6	82917	82922	0 %	0 %	50 %	50 %	325284623
68	NC_015169	GC	3	6	83002	83007	0 %	0 %	50 %	50 %	325284623
69	NC_015169	CA	3	6	84092	84097	50 %	0 %	0 %	50 %	325284624
70	NC_015169	TA	3	6	84671	84676	50 %	50 %	0 %	0 %	325284624
71	NC_015169	GC	3	6	84861	84866	0 %	0 %	50 %	50 %	325284625
72	NC_015169	GT	3	6	85311	85316	0 %	50 %	50 %	0 %	325284625
73	NC_015169	CG	3	6	93525	93530	0 %	0 %	50 %	50 %	325284630
74	NC_015169	CG	3	6	97930	97935	0 %	0 %	50 %	50 %	325284633
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82	NC_015169	TG	3	6	112517	112522	0 %	50 %	50 %	0 %	325284645
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90	NC_015169	GC	3	6	129919	129924	0 %	0 %	50 %	50 %	325284659
91	NC_015169	GC	3	6	130595	130600	0 %	0 %	50 %	50 %	325284660
92	NC_015169	CG	3	6	137858	137863	0 %	0 %	50 %	50 %	325284669
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101	NC_015169	GC	3	6	148877	148882	0 %	0 %	50 %	50 %	325284678
102	NC_015169	AG	3	6	149523	149528	50 %	0 %	50 %	0 %	325284679
103	NC_015169	AG	3	6	153149	153154	50 %	0 %	50 %	0 %	325284680
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105	NC_015169	TC	3	6	156341	156346	0 %	50 %	0 %	50 %	325284683
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107	NC_015169	CT	3	6	158352	158357	0 %	50 %	0 %	50 %	325284687
108	NC_015169	AC	3	6	159023	159028	50 %	0 %	0 %	50 %	325284687
109	NC_015169	CT	3	6	159703	159708	0 %	50 %	0 %	50 %	325284687
110	NC_015169	AC	3	6	160704	160709	50 %	0 %	0 %	50 %	325284688
111	NC_015169	GC	3	6	160828	160833	0 %	0 %	50 %	50 %	325284688
112	NC_015169	GA	3	6	162147	162152	50 %	0 %	50 %	0 %	325284688
113	NC_015169	TC	3	6	164086	164091	0 %	50 %	0 %	50 %	325284691
114	NC_015169	CG	3	6	164612	164617	0 %	0 %	50 %	50 %	325284691
115	NC_015169	TG	3	6	169362	169367	0 %	50 %	50 %	0 %	325284698
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118	NC_015169	GA	3	6	176751	176756	50 %	0 %	50 %	0 %	325284705
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120	NC_015169	GC	5	10	177122	177131	0 %	0 %	50 %	50 %	325284705
121	NC_015169	AC	4	8	177698	177705	50 %	0 %	0 %	50 %	325284705
122	NC_015169	CG	3	6	178039	178044	0 %	0 %	50 %	50 %	325284705
123	NC_015169	AC	3	6	178203	178208	50 %	0 %	0 %	50 %	325284705
124	NC_015169	TC	3	6	178974	178979	0 %	50 %	0 %	50 %	325284705
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126	NC_015169	AC	3	6	182495	182500	50 %	0 %	0 %	50 %	325284708
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130	NC_015169	GA	3	6	185122	185127	50 %	0 %	50 %	0 %	325284709
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.