MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacteroides salanitronis DSM 18170 plasmid pBACSA02

Total Repeats: 224

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015168	TAA	2	6	246	251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015168	TAA	2	6	262	267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015168	ATA	2	6	296	301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015168	AAC	2	6	335	340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	324976988
5	NC_015168	TAA	2	6	380	385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324976988
6	NC_015168	ATC	2	6	498	503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324976988
7	NC_015168	GCA	2	6	590	595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324976988
8	NC_015168	GGC	2	6	738	743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	324976988
9	NC_015168	TGA	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976988
10	NC_015168	CTT	2	6	820	825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976988
11	NC_015168	AGG	2	6	892	897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	324976988
12	NC_015168	GGA	2	6	1010	1015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	324976988
13	NC_015168	GAC	2	6	1110	1115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015168	TGA	2	6	1378	1383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976989
15	NC_015168	AGG	2	6	1411	1416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	324976989
16	NC_015168	CAA	2	6	1543	1548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	324976989
17	NC_015168	CCA	2	6	1672	1677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	324976989
18	NC_015168	ACA	2	6	1773	1778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	324976989
19	NC_015168	TGC	2	6	1806	1811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324976989
20	NC_015168	TGA	2	6	1924	1929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976990
21	NC_015168	GTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976990
22	NC_015168	CTT	2	6	2209	2214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976990
23	NC_015168	TCA	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324976990
24	NC_015168	GCA	2	6	2471	2476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324976990
25	NC_015168	ATG	2	6	2823	2828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976990
26	NC_015168	ACT	3	9	2856	2864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324976990
27	NC_015168	GTT	2	6	2867	2872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976990
28	NC_015168	TGT	2	6	2913	2918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015168	TAT	3	9	2933	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015168	ATA	2	6	2966	2971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015168	ATA	2	6	3047	3052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015168	TCT	2	6	3355	3360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976991
33	NC_015168	AAC	2	6	3615	3620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	324976991
34	NC_015168	GCC	2	6	3876	3881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	324976991
35	NC_015168	GCT	2	6	3912	3917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324976991
36	NC_015168	CTT	2	6	3926	3931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976991
37	NC_015168	TCC	2	6	3939	3944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	324976991
38	NC_015168	GAA	2	6	4086	4091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324976991
39	NC_015168	TCC	2	6	4308	4313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	324976991
40	NC_015168	CTT	2	6	4394	4399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976991
41	NC_015168	TGC	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324976991
42	NC_015168	TCC	2	6	4443	4448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	324976991
43	NC_015168	TGC	2	6	4525	4530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324976991
44	NC_015168	TGG	2	6	4612	4617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015168	ATC	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015168	CGA	2	6	4855	4860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015168	TGG	2	6	4987	4992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	324976992
48	NC_015168	AGA	2	6	5011	5016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324976992
49	NC_015168	AAG	2	6	5020	5025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324976992
50	NC_015168	GGT	2	6	5163	5168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	324976992
51	NC_015168	TTG	2	6	5173	5178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976992
52	NC_015168	GGA	2	6	5343	5348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	324976993
53	NC_015168	GAA	2	6	5392	5397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324976993
54	NC_015168	AGG	2	6	5507	5512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	324976993
55	NC_015168	GAA	2	6	5733	5738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324976994
56	NC_015168	CCA	2	6	6327	6332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	324976995
57	NC_015168	ATC	2	6	6376	6381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324976995
58	NC_015168	CGG	2	6	6479	6484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	324976995
59	NC_015168	TCA	2	6	6566	6571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324976995
60	NC_015168	CTT	2	6	6706	6711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976995
61	NC_015168	GTT	2	6	6718	6723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976995
62	NC_015168	ATG	3	9	6863	6871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976995
63	NC_015168	TCC	2	6	6884	6889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	324976995
64	NC_015168	CGG	2	6	6918	6923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	324976995
65	NC_015168	GCC	2	6	6937	6942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	324976995
66	NC_015168	AGT	2	6	7001	7006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976995
67	NC_015168	ATA	2	6	7045	7050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324976996
68	NC_015168	CTG	2	6	7113	7118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324976996
69	NC_015168	TCT	2	6	7154	7159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976996
70	NC_015168	GCC	3	9	7177	7185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	324976996
71	NC_015168	TTG	2	6	7195	7200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976996
72	NC_015168	TGC	2	6	7205	7210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324976996
73	NC_015168	TGA	2	6	7253	7258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976996
74	NC_015168	AGC	2	6	7525	7530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324976996
75	NC_015168	TTG	2	6	7531	7536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976996
76	NC_015168	CAG	2	6	7545	7550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324976996
77	NC_015168	GAA	2	6	7578	7583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324976996
78	NC_015168	TGG	2	6	7649	7654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	324976996
79	NC_015168	ATA	2	6	7774	7779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324976996
80	NC_015168	TTC	2	6	7947	7952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976996
81	NC_015168	TTG	2	6	7987	7992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976996
82	NC_015168	CAC	2	6	8114	8119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	324976996
83	NC_015168	TAT	2	6	8121	8126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324976996
84	NC_015168	GTT	2	6	8144	8149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976996
85	NC_015168	CTT	2	6	8180	8185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976996
86	NC_015168	TAT	2	6	8187	8192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324976996
87	NC_015168	ATT	2	6	8193	8198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324976996
88	NC_015168	TAA	2	6	8222	8227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324976996
89	NC_015168	ATA	2	6	8264	8269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324976996
90	NC_015168	ATA	2	6	8275	8280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324976996
91	NC_015168	ATA	2	6	8297	8302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324976996
92	NC_015168	ATT	2	6	8307	8312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324976996
93	NC_015168	ATA	2	6	8336	8341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015168	GCA	2	6	8399	8404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015168	TAA	3	9	8408	8416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015168	TGG	2	6	8478	8483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	324976997
97	NC_015168	GAT	2	6	8539	8544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976997
98	NC_015168	AAT	2	6	8603	8608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015168	GTT	2	6	8609	8614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015168	TAA	2	6	8648	8653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015168	GAA	2	6	8707	8712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324976998
102	NC_015168	GAA	2	6	8832	8837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015168	TCC	2	6	8942	8947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	324976999
104	NC_015168	TTG	2	6	8996	9001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976999
105	NC_015168	TGT	2	6	9014	9019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015168	AAC	2	6	9062	9067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	324977000
107	NC_015168	ATC	2	6	9278	9283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015168	GAA	2	6	9286	9291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015168	CTT	2	6	9432	9437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015168	ATG	2	6	9454	9459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015168	TCA	2	6	9562	9567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015168	GAT	2	6	9622	9627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015168	TCA	2	6	9821	9826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015168	AGC	3	9	9834	9842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015168	CTT	2	6	9943	9948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015168	TGG	2	6	10127	10132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015168	ACA	2	6	10179	10184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015168	CCG	2	6	10382	10387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015168	AGG	2	6	10403	10408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015168	GAT	2	6	10414	10419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015168	CAA	2	6	10643	10648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015168	AAT	2	6	10672	10677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015168	GAA	2	6	10731	10736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015168	GGA	2	6	10914	10919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	324977001
125	NC_015168	TGA	2	6	11027	11032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015168	AAT	2	6	11034	11039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015168	ATG	2	6	11062	11067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324977002
128	NC_015168	TGG	2	6	11118	11123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	324977002
129	NC_015168	ACT	2	6	11137	11142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324977002
130	NC_015168	GAA	2	6	11210	11215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015168	GTA	2	6	11219	11224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015168	TCT	2	6	11245	11250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015168	ATT	2	6	11259	11264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015168	TTG	2	6	11315	11320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324977003
135	NC_015168	ATT	2	6	11429	11434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324977003
136	NC_015168	TCT	2	6	11435	11440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324977003
137	NC_015168	TTA	2	6	11450	11455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324977003
138	NC_015168	TAC	2	6	11515	11520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324977003
139	NC_015168	GTT	2	6	11549	11554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324977003
140	NC_015168	GTG	2	6	11604	11609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	324977003
141	NC_015168	TAA	3	9	11760	11768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324977003
142	NC_015168	TGT	2	6	11824	11829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324977003
143	NC_015168	ATT	2	6	12022	12027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324977003
144	NC_015168	ATT	2	6	12058	12063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324977003
145	NC_015168	TAT	2	6	12073	12078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324977003
146	NC_015168	CTT	2	6	12092	12097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324977003
147	NC_015168	GCG	2	6	12391	12396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	324977004
148	NC_015168	TCC	2	6	12432	12437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	324977004
149	NC_015168	CAA	2	6	12518	12523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	324977004
150	NC_015168	GCA	2	6	12641	12646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324977004
151	NC_015168	GAA	2	6	12668	12673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324977004
152	NC_015168	GAA	2	6	12740	12745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324977004
153	NC_015168	TAC	2	6	12774	12779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324977004
154	NC_015168	CAG	2	6	12795	12800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324977004
155	NC_015168	AGC	2	6	12984	12989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324977004
156	NC_015168	GAA	2	6	13244	13249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324977004
157	NC_015168	AGA	2	6	13336	13341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324977004
158	NC_015168	GCG	2	6	13478	13483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	324977005
159	NC_015168	GCA	2	6	13704	13709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324977005
160	NC_015168	AAG	2	6	13852	13857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324977005
161	NC_015168	TTC	2	6	13888	13893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324977005
162	NC_015168	GCT	2	6	13896	13901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324977005
163	NC_015168	CAC	2	6	13904	13909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	324977005
164	NC_015168	ATG	2	6	13921	13926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324977005
165	NC_015168	GTG	2	6	14047	14052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	324977005
166	NC_015168	GCC	2	6	14134	14139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	324977005
167	NC_015168	CTG	2	6	14164	14169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324977005
168	NC_015168	ATC	2	6	14212	14217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324977005
169	NC_015168	TCA	2	6	14252	14257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324977005
170	NC_015168	TGG	2	6	14276	14281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	324977005
171	NC_015168	ATG	2	6	14287	14292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324977005
172	NC_015168	TCT	2	6	14381	14386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324977005
173	NC_015168	AGC	2	6	14434	14439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324977005
174	NC_015168	TGG	2	6	14459	14464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	324977005
175	NC_015168	CCA	2	6	14483	14488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	324977005
176	NC_015168	GAA	2	6	14553	14558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324977005
177	NC_015168	GCA	2	6	14567	14572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324977005
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179	NC_015168	TCC	2	6	14746	14751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	324977005
180	NC_015168	GAC	2	6	14824	14829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324977005
181	NC_015168	AAG	2	6	14909	14914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324977005
182	NC_015168	GCA	2	6	15009	15014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324977005
183	NC_015168	CCG	2	6	15087	15092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	324977005
184	NC_015168	GCA	2	6	15111	15116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324977005
185	NC_015168	ATC	2	6	15139	15144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324977005
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189	NC_015168	ATT	2	6	15773	15778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324977006
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193	NC_015168	TTC	2	6	16180	16185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324977006
194	NC_015168	CTT	2	6	16257	16262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324977006
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202	NC_015168	AAC	2	6	17188	17193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	324977007
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204	NC_015168	CTT	2	6	17327	17332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
205	NC_015168	ATT	2	6	17392	17397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324977008
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211	NC_015168	GAA	2	6	17953	17958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324977009
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213	NC_015168	TAA	2	6	18085	18090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
214	NC_015168	GTT	2	6	18409	18414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324977010
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218	NC_015168	GTT	2	6	18700	18705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324977011
219	NC_015168	ATG	2	6	18779	18784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324977011
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222	NC_015168	TGC	2	6	19123	19128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324977011
223	NC_015168	CCT	2	6	19163	19168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	324977011
224	NC_015168	ATT	2	6	19178	19183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324977011

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.