MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cellulophaga lytica DSM 7489 chromosome

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015167	TTATTT	2	12	11810	11821	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015167	AGGCAT	2	12	63273	63284	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015167	AATTGT	2	12	69160	69171	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015167	ATGATA	2	12	127159	127170	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015167	ACAATT	2	12	174356	174367	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015167	TTTTAC	2	12	188760	188771	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015167	TAATTT	2	12	196436	196447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015167	TAAACA	2	12	196467	196478	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015167	TAATTT	2	12	197163	197174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015167	GTTTTT	2	12	199493	199504	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015167	ATAAAA	2	12	219990	220001	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015167	AATGCA	2	12	246455	246466	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015167	AAAAAC	2	12	256160	256171	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015167	TCAACG	2	12	323001	323012	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015167	AACCTT	2	12	323142	323153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015167	AGCAAG	2	12	325867	325878	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015167	TATTTT	2	12	326458	326469	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015167	TATGCA	2	12	331233	331244	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015167	TTTGTT	2	12	341381	341392	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015167	TCTTAT	2	12	342002	342013	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015167	ATAAAA	2	12	357021	357032	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015167	TACTAA	2	12	366525	366536	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015167	AATAAG	2	12	371486	371497	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015167	TATAAT	2	12	376572	376583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015167	ATTTAG	2	12	377328	377339	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015167	AAAATT	2	12	390401	390412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015167	ATAAAA	2	12	507391	507402	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015167	TTTAAT	2	12	513335	513346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015167	ATAAAA	2	12	524594	524605	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015167	AAGTTA	2	12	574254	574265	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015167	TAAACT	2	12	614665	614676	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015167	TATCAA	2	12	670951	670962	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015167	TTATTT	2	12	684076	684087	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015167	TACTTT	2	12	705182	705193	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015167	TCAACG	2	12	732346	732357	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015167	AACCTT	2	12	732487	732498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015167	AGCAAG	2	12	735212	735223	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015167	TATTTT	2	12	735803	735814	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015167	TTAGCT	2	12	748108	748119	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015167	AATTAC	2	12	757523	757534	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015167	ATAAAA	2	12	811626	811637	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015167	AATGAA	2	12	826479	826490	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015167	GTATAC	2	12	842804	842815	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015167	TAATTT	2	12	871305	871316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015167	TTTTAT	2	12	885699	885710	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015167	ATCAAA	2	12	906171	906182	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015167	TTTTAT	2	12	948303	948314	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015167	GTTTTT	2	12	979854	979865	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015167	TAGTAT	2	12	980510	980521	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015167	TATCTT	2	12	991349	991360	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015167	TTAAAA	2	12	1015158	1015169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015167	TAAAGT	2	12	1015248	1015259	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015167	AATTTT	2	12	1018511	1018522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015167	AGTTTA	2	12	1020612	1020623	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015167	TGATAC	2	12	1036469	1036480	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015167	TAAAAA	2	12	1049920	1049931	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015167	AAAATA	2	12	1051983	1051994	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015167	TTATTT	2	12	1052224	1052235	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015167	ATATTT	2	12	1076755	1076766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015167	GGGCTT	2	12	1077885	1077896	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015167	CACTAC	2	12	1079732	1079743	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015167	CTTTTT	2	12	1088132	1088143	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015167	GTATAA	2	12	1100678	1100689	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015167	ACTGAC	2	12	1105952	1105963	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015167	TAAAAA	2	12	1144514	1144525	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015167	AAAAGA	2	12	1152761	1152772	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015167	TTTTAT	2	12	1156288	1156299	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015167	TCAACG	2	12	1165706	1165717	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015167	AGCAAG	2	12	1168572	1168583	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015167	TATTTT	2	12	1169164	1169175	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015167	CTTTTG	2	12	1192646	1192657	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015167	TAACAC	2	12	1257414	1257425	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015167	ACTTAT	2	12	1257430	1257441	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015167	TAATAT	2	12	1260403	1260414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015167	GTAAAA	2	12	1269188	1269199	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015167	AATTTT	2	12	1290894	1290905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015167	AAAACT	2	12	1320690	1320701	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015167	TTAATG	2	12	1359950	1359961	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015167	TTTATC	2	12	1373621	1373632	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015167	TAAAAA	2	12	1394167	1394178	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015167	TAAAAA	2	12	1402262	1402273	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015167	CGTTTT	2	12	1409496	1409507	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015167	AACTAA	2	12	1415388	1415399	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015167	AAAATT	2	12	1460128	1460139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015167	ATTTTA	2	12	1465590	1465601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015167	ACTTAA	2	12	1502600	1502611	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015167	AAATTT	2	12	1507047	1507058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015167	TTAATT	2	12	1515752	1515763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015167	TCAATT	2	12	1515909	1515920	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015167	TTTTTG	2	12	1516624	1516635	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015167	TAATGC	2	12	1527532	1527543	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_015167	ATGATA	2	12	1527644	1527655	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015167	AAGAAA	2	12	1554225	1554236	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015167	TTTTGG	2	12	1555314	1555325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015167	ATAAAA	2	12	1575999	1576010	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015167	GTTTTT	2	12	1585063	1585074	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015167	ATAAAC	2	12	1587606	1587617	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015167	TTTATT	2	12	1594615	1594626	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015167	GCAAAT	2	12	1599147	1599158	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_015167	ATTTCC	2	12	1656161	1656172	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015167	CTTTTT	2	12	1673920	1673931	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_015167	TTAGAA	2	12	1710294	1710305	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015167	ATTTTT	2	12	1713522	1713533	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015167	ATTTTT	2	12	1825831	1825842	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015167	TTTAAA	2	12	1833962	1833973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015167	ATATAA	2	12	1849627	1849638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015167	ATTAAA	2	12	1905799	1905810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015167	AATAGA	2	12	1914305	1914316	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015167	AAAAGA	2	12	1919944	1919955	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015167	TTCTTT	2	12	1951430	1951441	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015167	ATGTTA	2	12	1976651	1976662	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015167	ATACTA	2	12	1985330	1985341	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_015167	AGTATA	2	12	2005655	2005666	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015167	TATAAA	2	12	2029344	2029355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015167	TTTATT	2	12	2058829	2058840	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015167	GAATAC	2	12	2075542	2075553	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015167	TTAATA	2	12	2079360	2079371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015167	ACAAAC	2	12	2091336	2091347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015167	TTTAAC	2	12	2121168	2121179	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_015167	AATTCA	2	12	2177768	2177779	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_015167	AAAATT	2	12	2220969	2220980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015167	TTTTTA	2	12	2231477	2231488	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015167	AACCAA	2	12	2237678	2237689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015167	TTGTTT	2	12	2246413	2246424	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015167	TTAATA	2	12	2254199	2254210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015167	TTCTCT	2	12	2291881	2291892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015167	ACAATC	2	12	2307196	2307207	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015167	TGCATT	2	12	2329881	2329892	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.