MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cellulophaga lytica DSM 7489 chromosome

Total Repeats: 487

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015167	ATTAA	2	10	3375	3384	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015167	TATTT	2	10	9009	9018	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015167	TACAA	2	10	12255	12264	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015167	AAACT	2	10	19936	19945	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015167	TGTTT	2	10	43072	43081	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015167	ATTAA	2	10	47769	47778	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015167	ATATT	2	10	67127	67136	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015167	TATAT	2	10	69128	69137	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015167	GTAAA	2	10	69187	69196	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015167	AGTAT	2	10	106645	106654	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015167	TTAAA	2	10	110531	110540	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015167	TATAA	2	10	110975	110984	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015167	TAAAT	2	10	123380	123389	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015167	TAATT	2	10	133678	133687	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015167	TATTT	2	10	137296	137305	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015167	AAAAG	2	10	139400	139409	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015167	TTTAT	2	10	142634	142643	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015167	ACCAA	2	10	161782	161791	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_015167	ATTAA	2	10	169990	169999	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015167	ATAAA	2	10	184209	184218	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015167	AATTA	2	10	184361	184370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015167	GTTTA	2	10	189668	189677	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015167	ATTAA	2	10	196516	196525	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015167	TAAAA	2	10	209348	209357	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015167	TATAT	2	10	209374	209383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015167	ATATT	2	10	234549	234558	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015167	TAAAA	2	10	256098	256107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015167	ATAAA	2	10	259384	259393	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015167	TAAAA	2	10	268455	268464	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015167	TTTTA	2	10	293448	293457	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015167	CAATT	2	10	304171	304180	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015167	ATTTT	2	10	304207	304216	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015167	TAAAC	2	10	310361	310370	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015167	AGTTA	2	10	316870	316879	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015167	ATCCC	2	10	321096	321105	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
36	NC_015167	TTCAA	2	10	321935	321944	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015167	ATCAT	2	10	323672	323681	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015167	AATTA	2	10	323923	323932	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015167	TCCGA	2	10	324662	324671	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_015167	CTACA	2	10	325279	325288	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_015167	TTACC	2	10	325699	325708	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_015167	CTAAA	2	10	325994	326003	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015167	ATTTA	2	10	326214	326223	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015167	AAAAT	2	10	346182	346191	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015167	AAAAT	2	10	346740	346749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015167	TTATT	2	10	362753	362762	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015167	AAAAT	2	10	364565	364574	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015167	AGTTT	2	10	365644	365653	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015167	ATTAA	2	10	366365	366374	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015167	ACATT	2	10	371952	371961	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015167	ATTAC	2	10	376586	376595	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015167	TAATT	2	10	385741	385750	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015167	TTACT	2	10	386292	386301	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015167	ACTTA	2	10	413471	413480	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015167	AATAA	2	10	417055	417064	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015167	TAAAA	2	10	461896	461905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015167	TCTTT	2	10	471932	471941	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015167	GTAGA	2	10	479271	479280	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015167	AAATA	2	10	486084	486093	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015167	AAAAT	2	10	494986	494995	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015167	ATATT	2	10	500646	500655	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015167	AAAAT	2	10	529366	529375	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015167	GTTTG	2	10	534770	534779	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015167	TATTT	2	10	534905	534914	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015167	AAAAT	2	10	540277	540286	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015167	ATATT	2	10	542584	542593	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015167	ACAAA	2	10	550195	550204	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015167	ACTTT	2	10	561711	561720	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_015167	TAATG	2	10	566545	566554	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015167	TTATG	2	10	584738	584747	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015167	AAATT	2	10	586980	586989	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015167	AATGT	2	10	587974	587983	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015167	TAATT	2	10	589323	589332	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015167	ATTTT	2	10	589633	589642	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015167	TAAAA	2	10	599118	599127	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015167	AAACA	2	10	611478	611487	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015167	AAAAT	2	10	611621	611630	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015167	CTTTT	2	10	613646	613655	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015167	ATTTT	2	10	613686	613695	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015167	AATTA	2	10	617192	617201	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015167	TTTAA	2	10	624918	624927	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015167	ACCAA	2	10	643836	643845	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_015167	CTCTA	2	10	646198	646207	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_015167	AAAAT	2	10	670992	671001	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015167	ACACT	2	10	691056	691065	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_015167	ACTTA	2	10	718321	718330	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015167	GTTAA	2	10	719334	719343	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015167	CAACA	2	10	719825	719834	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_015167	AATTA	2	10	727885	727894	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015167	TTTAA	2	10	729143	729152	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015167	ATCCC	2	10	730441	730450	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
92	NC_015167	TTCAA	2	10	731280	731289	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_015167	ATCAT	2	10	733017	733026	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015167	AATTA	2	10	733268	733277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015167	TCCGA	2	10	734007	734016	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_015167	CTACA	2	10	734624	734633	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_015167	TTACC	2	10	735044	735053	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_015167	CTAAA	2	10	735339	735348	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015167	ATTTA	2	10	735558	735567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015167	CTTTT	2	10	738172	738181	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015167	AAACA	2	10	753540	753549	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015167	TTAAT	2	10	753720	753729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015167	TAAAG	2	10	755540	755549	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015167	CTTCT	2	10	756424	756433	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_015167	ACTTA	2	10	757121	757130	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015167	ATAGT	2	10	758049	758058	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015167	AGAAC	2	10	766943	766952	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015167	TGCAA	2	10	774295	774304	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_015167	TAAAT	2	10	774480	774489	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015167	ATGCA	2	10	774511	774520	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_015167	CTAAA	2	10	782097	782106	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015167	TAAAC	2	10	790313	790322	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_015167	AATTA	2	10	812223	812232	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015167	TAAAA	2	10	812365	812374	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015167	AGAAA	3	15	816505	816519	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015167	AAAAG	2	10	820536	820545	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015167	TTATT	2	10	868020	868029	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015167	TTTTG	2	10	868967	868976	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015167	ACATA	2	10	888386	888395	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015167	GTTTT	2	10	906143	906152	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015167	AATTT	2	10	916355	916364	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015167	ATTAA	2	10	931895	931904	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015167	TTTTA	2	10	965935	965944	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015167	ACAAA	2	10	979824	979833	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015167	ACACA	2	10	985285	985294	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_015167	TTTTA	2	10	987427	987436	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015167	AGTAC	2	10	989466	989475	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_015167	TAAAA	2	10	991204	991213	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015167	ATTAA	2	10	1018548	1018557	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015167	AACAC	2	10	1020646	1020655	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_015167	AGTAA	2	10	1024904	1024913	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015167	ACAAA	2	10	1025019	1025028	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015167	AATTT	2	10	1028792	1028801	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015167	TTAAT	2	10	1028904	1028913	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015167	AAGAA	2	10	1033989	1033998	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015167	AATAA	2	10	1034018	1034027	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015167	TAAAA	2	10	1038738	1038747	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015167	ATATT	2	10	1040516	1040525	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015167	AACAA	2	10	1042547	1042556	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015167	TAAAA	2	10	1045903	1045912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015167	GAAAA	2	10	1049157	1049166	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015167	CTATT	2	10	1050583	1050592	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_015167	TAAAT	2	10	1053501	1053510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015167	ACCAA	2	10	1062820	1062829	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_015167	AAAAC	2	10	1065303	1065312	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_015167	AAGTA	2	10	1075972	1075981	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015167	TAGAA	2	10	1077933	1077942	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.