MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR04

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015163	CGTGAC	2	12	3004	3015	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325284462
2	NC_015163	GTGAAG	2	12	5110	5121	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015163	GTGAGG	2	12	5849	5860	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	325284468
4	NC_015163	ACCCTG	2	12	7699	7710	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325284470
5	NC_015163	TGATAA	2	12	8505	8516	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325284471
6	NC_015163	CAGCCG	2	12	9366	9377	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325284472
7	NC_015163	CGGCTG	2	12	12735	12746	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325284477
8	NC_015163	CGATGA	2	12	14590	14601	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325284477
9	NC_015163	TGCCGC	2	12	17158	17169	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325284479
10	NC_015163	TCAGCT	2	12	22888	22899	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015163	CCAGCT	2	12	22947	22958	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015163	CCCCAG	2	12	23317	23328	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	325284481
13	NC_015163	CCAGCA	2	12	23347	23358	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325284481
14	NC_015163	CAGGCC	2	12	24110	24121	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015163	CGTCAC	2	12	24951	24962	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015163	CACCCT	2	12	25023	25034	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	325284483
17	NC_015163	TACCAC	2	12	34020	34031	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	325284489
18	NC_015163	CACTGG	4	24	37765	37788	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325284493
19	NC_015163	CATGAC	2	12	41352	41363	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015163	CTTGAG	2	12	41812	41823	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015163	TCACCG	2	12	43193	43204	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015163	GGACAT	2	12	54524	54535	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015163	GCTGAG	2	12	55410	55421	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015163	GGTACG	2	12	58220	58231	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015163	CAAGGA	2	12	58900	58911	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	325284508
26	NC_015163	GCTGGC	2	12	59002	59013	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325284508
27	NC_015163	GCACAG	2	12	59030	59041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284508
28	NC_015163	GTATTC	2	12	66122	66133	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325284514
29	NC_015163	GATGCC	2	12	66794	66805	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325284515
30	NC_015163	GCGGCA	2	12	68111	68122	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015163	GCCCGC	2	12	68346	68357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284516
32	NC_015163	TTTTCC	2	12	73974	73985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015163	TACCAC	2	12	75868	75879	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015163	TTGGCG	2	12	76772	76783	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015163	GAGGTA	2	12	78636	78647	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015163	CACCTC	2	12	86732	86743	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_015163	CCCCAG	2	12	93060	93071	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	325284546
38	NC_015163	GTACGG	2	12	93350	93361	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325284547
39	NC_015163	AAATTT	2	12	97082	97093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.