MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR04

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015163	CGTGAC	2	12	3004	3015	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325284462
2	NC_015163	GTGAGG	2	12	5849	5860	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	325284468
3	NC_015163	ACCCTG	2	12	7699	7710	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325284470
4	NC_015163	TGATAA	2	12	8505	8516	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325284471
5	NC_015163	CAGCCG	2	12	9366	9377	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325284472
6	NC_015163	CGGCTG	2	12	12735	12746	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325284477
7	NC_015163	CGATGA	2	12	14590	14601	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325284477
8	NC_015163	TGCCGC	2	12	17158	17169	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325284479
9	NC_015163	CCCCAG	2	12	23317	23328	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	325284481
10	NC_015163	CCAGCA	2	12	23347	23358	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325284481
11	NC_015163	CACCCT	2	12	25023	25034	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	325284483
12	NC_015163	TACCAC	2	12	34020	34031	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	325284489
13	NC_015163	CACTGG	4	24	37765	37788	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325284493
14	NC_015163	CAAGGA	2	12	58900	58911	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	325284508
15	NC_015163	GCTGGC	2	12	59002	59013	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325284508
16	NC_015163	GCACAG	2	12	59030	59041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284508
17	NC_015163	GTATTC	2	12	66122	66133	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325284514
18	NC_015163	GATGCC	2	12	66794	66805	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325284515
19	NC_015163	GCCCGC	2	12	68346	68357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284516
20	NC_015163	CCCCAG	2	12	93060	93071	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	325284546
21	NC_015163	GTACGG	2	12	93350	93361	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325284547

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.