MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR04

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015163	CAGGC	2	10	251	260	20 %	0 %	40 %	40 %	325284458
2	NC_015163	GCTCA	2	10	600	609	20 %	20 %	20 %	40 %	325284458
3	NC_015163	CCGAA	2	10	859	868	40 %	0 %	20 %	40 %	325284458
4	NC_015163	CTGTG	2	10	1351	1360	0 %	40 %	40 %	20 %	325284458
5	NC_015163	GGCTG	2	10	3022	3031	0 %	20 %	60 %	20 %	325284462
6	NC_015163	CCAGC	2	10	5665	5674	20 %	0 %	20 %	60 %	325284468
7	NC_015163	CAGAA	2	10	6209	6218	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015163	CTCAC	2	10	9747	9756	20 %	20 %	0 %	60 %	325284473
9	NC_015163	CTGGC	2	10	12231	12240	0 %	20 %	40 %	40 %	325284476
10	NC_015163	TCAGC	2	10	13108	13117	20 %	20 %	20 %	40 %	325284477
11	NC_015163	TTGAT	2	10	13929	13938	20 %	60 %	20 %	0 %	325284477
12	NC_015163	TGGGA	2	10	14839	14848	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015163	CCGTC	2	10	16289	16298	0 %	20 %	20 %	60 %	325284478
14	NC_015163	TGGCC	2	10	16337	16346	0 %	20 %	40 %	40 %	325284478
15	NC_015163	TCCTG	2	10	21081	21090	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_015163	CTGGG	2	10	21249	21258	0 %	20 %	60 %	20 %	325284480
17	NC_015163	GAGCG	2	10	22197	22206	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015163	CTCCA	2	10	23583	23592	20 %	20 %	0 %	60 %	325284481
19	NC_015163	CGCCT	2	10	24817	24826	0 %	20 %	20 %	60 %	325284482
20	NC_015163	GGGCC	2	10	25095	25104	0 %	0 %	60 %	40 %	325284483
21	NC_015163	GCCGA	2	10	25168	25177	20 %	0 %	40 %	40 %	325284483
22	NC_015163	TCCCC	2	10	25503	25512	0 %	20 %	0 %	80 %	325284483
23	NC_015163	CGCTG	2	10	25556	25565	0 %	20 %	40 %	40 %	325284483
24	NC_015163	TGGCT	2	10	33696	33705	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015163	AAGAA	2	10	35075	35084	80 %	0 %	20 %	0 %	325284490
26	NC_015163	GAAGT	2	10	35964	35973	40 %	20 %	40 %	0 %	325284490
27	NC_015163	CTGGA	2	10	39160	39169	20 %	20 %	40 %	20 %	325284496
28	NC_015163	TGGCC	2	10	39506	39515	0 %	20 %	40 %	40 %	325284496
29	NC_015163	GACAG	2	10	40041	40050	40 %	0 %	40 %	20 %	325284497
30	NC_015163	GGGCA	2	10	40738	40747	20 %	0 %	60 %	20 %	325284497
31	NC_015163	ACGCT	2	10	41055	41064	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_015163	ATCTC	2	10	46848	46857	20 %	40 %	0 %	40 %	325284501
33	NC_015163	TTTCA	2	10	47198	47207	20 %	60 %	0 %	20 %	325284501
34	NC_015163	GGCTT	2	10	48384	48393	0 %	40 %	40 %	20 %	325284502
35	NC_015163	GCCGC	2	10	49804	49813	0 %	0 %	40 %	60 %	325284503
36	NC_015163	AGTGT	2	10	51086	51095	20 %	40 %	40 %	0 %	325284504
37	NC_015163	GGCGT	2	10	52928	52937	0 %	20 %	60 %	20 %	325284505
38	NC_015163	AGTGT	2	10	54631	54640	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015163	GGAGC	2	10	54887	54896	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015163	TGGCT	2	10	55575	55584	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015163	AGCCA	2	10	55788	55797	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_015163	CTGCG	2	10	57344	57353	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_015163	ACTCC	2	10	60809	60818	20 %	20 %	0 %	60 %	325284510
44	NC_015163	TTCAG	2	10	61950	61959	20 %	40 %	20 %	20 %	325284511
45	NC_015163	CAGCA	2	10	62037	62046	40 %	0 %	20 %	40 %	325284511
46	NC_015163	CGACT	2	10	63245	63254	20 %	20 %	20 %	40 %	325284511
47	NC_015163	ACTTC	2	10	64353	64362	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_015163	GGGAT	2	10	64505	64514	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015163	CTGCG	2	10	65656	65665	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015163	TCTCA	2	10	65893	65902	20 %	40 %	0 %	40 %	325284514
51	NC_015163	TGAGA	2	10	72749	72758	40 %	20 %	40 %	0 %	325284524
52	NC_015163	TACAC	2	10	73859	73868	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_015163	CCCAG	2	10	74135	74144	20 %	0 %	20 %	60 %	325284526
54	NC_015163	GGCGG	2	10	74319	74328	0 %	0 %	80 %	20 %	325284526
55	NC_015163	CCAGC	2	10	79038	79047	20 %	0 %	20 %	60 %	325284531
56	NC_015163	CTGAG	2	10	79403	79412	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015163	CAGCG	2	10	79498	79507	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_015163	GCGCT	2	10	79620	79629	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_015163	CGTCC	2	10	79706	79715	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
60	NC_015163	AGCCA	2	10	80163	80172	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_015163	CGCTG	2	10	81481	81490	0 %	20 %	40 %	40 %	325284532
62	NC_015163	TGCGG	2	10	81595	81604	0 %	20 %	60 %	20 %	325284532
63	NC_015163	AGGCG	2	10	81639	81648	20 %	0 %	60 %	20 %	325284532
64	NC_015163	CGCTC	2	10	83578	83587	0 %	20 %	20 %	60 %	325284535
65	NC_015163	ACCGA	2	10	84101	84110	40 %	0 %	20 %	40 %	325284536
66	NC_015163	CAGGG	2	10	84963	84972	20 %	0 %	60 %	20 %	325284537
67	NC_015163	GCCAG	2	10	85607	85616	20 %	0 %	40 %	40 %	325284538
68	NC_015163	CTGCG	2	10	86902	86911	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_015163	AGGCC	2	10	92891	92900	20 %	0 %	40 %	40 %	325284546
70	NC_015163	GCGCC	2	10	92984	92993	0 %	0 %	40 %	60 %	325284546
71	NC_015163	GGGGA	2	10	94022	94031	20 %	0 %	80 %	0 %	325284547
72	NC_015163	GCAGC	2	10	94477	94486	20 %	0 %	40 %	40 %	325284548
73	NC_015163	GCGCG	2	10	94521	94530	0 %	0 %	60 %	40 %	325284548
74	NC_015163	CAGCC	2	10	95062	95071	20 %	0 %	20 %	60 %	325284548

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.