MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR04

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015163	CAGAA	2	10	6209	6218	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015163	TGGGA	2	10	14839	14848	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015163	TCCTG	2	10	21081	21090	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_015163	GAGCG	2	10	22197	22206	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015163	TGGCT	2	10	33696	33705	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015163	ACGCT	2	10	41055	41064	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_015163	AGTGT	2	10	54631	54640	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015163	GGAGC	2	10	54887	54896	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015163	TGGCT	2	10	55575	55584	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015163	AGCCA	2	10	55788	55797	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_015163	CTGCG	2	10	57344	57353	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015163	ACTTC	2	10	64353	64362	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_015163	GGGAT	2	10	64505	64514	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015163	CTGCG	2	10	65656	65665	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015163	TACAC	2	10	73859	73868	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_015163	CTGAG	2	10	79403	79412	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015163	CAGCG	2	10	79498	79507	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_015163	GCGCT	2	10	79620	79629	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_015163	CGTCC	2	10	79706	79715	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_015163	AGCCA	2	10	80163	80172	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_015163	CTGCG	2	10	86902	86911	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.