MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR04

Total Repeats: 251

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015163	TTTA	2	8	16	23	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015163	GTAT	2	8	38	45	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015163	CAGA	2	8	163	170	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015163	GACG	2	8	171	178	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015163	ATCT	2	8	227	234	25 %	50 %	0 %	25 %	325284458
6	NC_015163	CGTG	2	8	394	401	0 %	25 %	50 %	25 %	325284458
7	NC_015163	GCCG	2	8	1139	1146	0 %	0 %	50 %	50 %	325284458
8	NC_015163	TTCG	2	8	1758	1765	0 %	50 %	25 %	25 %	325284459
9	NC_015163	GGCA	2	8	2130	2137	25 %	0 %	50 %	25 %	325284460
10	NC_015163	CAGC	2	8	2179	2186	25 %	0 %	25 %	50 %	325284460
11	NC_015163	GGGC	2	8	3525	3532	0 %	0 %	75 %	25 %	325284463
12	NC_015163	TGGT	2	8	3677	3684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015163	GCTG	2	8	4080	4087	0 %	25 %	50 %	25 %	325284464
14	NC_015163	GGCG	2	8	4787	4794	0 %	0 %	75 %	25 %	325284466
15	NC_015163	GAAC	2	8	5052	5059	50 %	0 %	25 %	25 %	325284466
16	NC_015163	CAGC	2	8	5148	5155	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015163	CTTC	2	8	5200	5207	0 %	50 %	0 %	50 %	325284467
18	NC_015163	AGCG	2	8	6065	6072	25 %	0 %	50 %	25 %	325284468
19	NC_015163	TGCT	2	8	7409	7416	0 %	50 %	25 %	25 %	325284470
20	NC_015163	CGGA	2	8	7724	7731	25 %	0 %	50 %	25 %	325284470
21	NC_015163	TGGG	2	8	7774	7781	0 %	25 %	75 %	0 %	325284470
22	NC_015163	CTGG	2	8	9719	9726	0 %	25 %	50 %	25 %	325284472
23	NC_015163	CTGG	2	8	9818	9825	0 %	25 %	50 %	25 %	325284473
24	NC_015163	GTGA	2	8	10028	10035	25 %	25 %	50 %	0 %	325284473
25	NC_015163	CCTA	2	8	10104	10111	25 %	25 %	0 %	50 %	325284473
26	NC_015163	TGAG	2	8	10535	10542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015163	GGCA	2	8	10892	10899	25 %	0 %	50 %	25 %	325284474
28	NC_015163	CAGC	2	8	11018	11025	25 %	0 %	25 %	50 %	325284474
29	NC_015163	GTCA	2	8	11390	11397	25 %	25 %	25 %	25 %	325284475
30	NC_015163	ATCT	2	8	11738	11745	25 %	50 %	0 %	25 %	325284475
31	NC_015163	TTTC	2	8	11804	11811	0 %	75 %	0 %	25 %	325284475
32	NC_015163	TCCG	2	8	11979	11986	0 %	25 %	25 %	50 %	325284475
33	NC_015163	GGCG	2	8	12249	12256	0 %	0 %	75 %	25 %	325284476
34	NC_015163	TGGA	2	8	13086	13093	25 %	25 %	50 %	0 %	325284477
35	NC_015163	GCCA	2	8	13283	13290	25 %	0 %	25 %	50 %	325284477
36	NC_015163	GCCT	2	8	14472	14479	0 %	25 %	25 %	50 %	325284477
37	NC_015163	CTGG	2	8	14925	14932	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015163	GGAG	2	8	15003	15010	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015163	CCAG	2	8	15763	15770	25 %	0 %	25 %	50 %	325284478
40	NC_015163	ACCC	2	8	16263	16270	25 %	0 %	0 %	75 %	325284478
41	NC_015163	TCGT	2	8	17034	17041	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015163	CGTC	2	8	17221	17228	0 %	25 %	25 %	50 %	325284479
43	NC_015163	GATG	2	8	17551	17558	25 %	25 %	50 %	0 %	325284479
44	NC_015163	CGTC	2	8	17625	17632	0 %	25 %	25 %	50 %	325284479
45	NC_015163	CGCT	2	8	17794	17801	0 %	25 %	25 %	50 %	325284479
46	NC_015163	TGAG	2	8	17862	17869	25 %	25 %	50 %	0 %	325284479
47	NC_015163	CGGC	2	8	18201	18208	0 %	0 %	50 %	50 %	325284479
48	NC_015163	CTTA	2	8	18277	18284	25 %	50 %	0 %	25 %	325284479
49	NC_015163	TGCG	2	8	18585	18592	0 %	25 %	50 %	25 %	325284479
50	NC_015163	CGAG	2	8	18760	18767	25 %	0 %	50 %	25 %	325284479
51	NC_015163	CATG	2	8	18944	18951	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015163	ATTG	2	8	19565	19572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015163	CGAG	2	8	20335	20342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015163	CTAT	2	8	21585	21592	25 %	50 %	0 %	25 %	325284480
55	NC_015163	CTGA	2	8	21993	22000	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015163	GGGC	2	8	22185	22192	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015163	ACCA	2	8	22981	22988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015163	CCTC	2	8	23218	23225	0 %	25 %	0 %	75 %	325284481
59	NC_015163	TCCT	2	8	23694	23701	0 %	50 %	0 %	50 %	325284481
60	NC_015163	GAAA	2	8	23900	23907	75 %	0 %	25 %	0 %	325284481
61	NC_015163	CAGG	2	8	24153	24160	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015163	ACCC	2	8	24172	24179	25 %	0 %	0 %	75 %	325284482
63	NC_015163	TCCT	2	8	24985	24992	0 %	50 %	0 %	50 %	325284483
64	NC_015163	ACCG	2	8	25015	25022	25 %	0 %	25 %	50 %	325284483
65	NC_015163	AGCC	2	8	25255	25262	25 %	0 %	25 %	50 %	325284483
66	NC_015163	GAGG	2	8	26270	26277	25 %	0 %	75 %	0 %	325284483
67	NC_015163	ACTG	2	8	26368	26375	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015163	GGTC	2	8	26853	26860	0 %	25 %	50 %	25 %	325284484
69	NC_015163	GGGC	2	8	27370	27377	0 %	0 %	75 %	25 %	325284485
70	NC_015163	CCTC	2	8	27427	27434	0 %	25 %	0 %	75 %	325284485
71	NC_015163	CGCC	2	8	27524	27531	0 %	0 %	25 %	75 %	325284485
72	NC_015163	CGCC	2	8	28160	28167	0 %	0 %	25 %	75 %	325284486
73	NC_015163	CCAG	2	8	28526	28533	25 %	0 %	25 %	50 %	325284486
74	NC_015163	CCAG	2	8	28818	28825	25 %	0 %	25 %	50 %	325284487
75	NC_015163	GCTC	2	8	28915	28922	0 %	25 %	25 %	50 %	325284487
76	NC_015163	AGCC	2	8	29036	29043	25 %	0 %	25 %	50 %	325284487
77	NC_015163	GGGC	2	8	29174	29181	0 %	0 %	75 %	25 %	325284487
78	NC_015163	CTGG	2	8	29812	29819	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015163	GTTC	2	8	29930	29937	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015163	TGGC	2	8	30062	30069	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015163	CGTC	2	8	33080	33087	0 %	25 %	25 %	50 %	325284488
82	NC_015163	AGAT	2	8	33212	33219	50 %	25 %	25 %	0 %	325284488
83	NC_015163	GTTC	2	8	33292	33299	0 %	50 %	25 %	25 %	325284488
84	NC_015163	GCCC	2	8	33309	33316	0 %	0 %	25 %	75 %	325284488
85	NC_015163	CTGT	2	8	33892	33899	0 %	50 %	25 %	25 %	325284489
86	NC_015163	GAAC	2	8	34530	34537	50 %	0 %	25 %	25 %	325284489
87	NC_015163	TGCT	2	8	34775	34782	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015163	ATCA	2	8	35021	35028	50 %	25 %	0 %	25 %	325284490
89	NC_015163	GGAA	2	8	35481	35488	50 %	0 %	50 %	0 %	325284490
90	NC_015163	TTTC	2	8	36660	36667	0 %	75 %	0 %	25 %	325284491
91	NC_015163	GACG	2	8	36707	36714	25 %	0 %	50 %	25 %	325284491
92	NC_015163	TCCG	2	8	36838	36845	0 %	25 %	25 %	50 %	325284491
93	NC_015163	CTTC	2	8	37060	37067	0 %	50 %	0 %	50 %	325284492
94	NC_015163	GGCA	2	8	37699	37706	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015163	GAAT	2	8	38304	38311	50 %	25 %	25 %	0 %	325284494
96	NC_015163	GAAT	2	8	38415	38422	50 %	25 %	25 %	0 %	325284494
97	NC_015163	AAGT	2	8	38939	38946	50 %	25 %	25 %	0 %	325284495
98	NC_015163	TGCG	2	8	40154	40161	0 %	25 %	50 %	25 %	325284497
99	NC_015163	GCGG	2	8	40507	40514	0 %	0 %	75 %	25 %	325284497
100	NC_015163	CAGA	2	8	40534	40541	50 %	0 %	25 %	25 %	325284497
101	NC_015163	GGGT	2	8	40667	40674	0 %	25 %	75 %	0 %	325284497
102	NC_015163	CACG	2	8	41524	41531	25 %	0 %	25 %	50 %	325284498
103	NC_015163	CAGG	2	8	41671	41678	25 %	0 %	50 %	25 %	325284498
104	NC_015163	GGGT	2	8	41768	41775	0 %	25 %	75 %	0 %	325284498
105	NC_015163	CAGC	2	8	42119	42126	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015163	CTTG	2	8	43790	43797	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015163	AACC	2	8	44027	44034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015163	GCTG	2	8	44307	44314	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015163	GCCA	2	8	44408	44415	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015163	TCAG	2	8	44485	44492	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015163	GCCC	2	8	45321	45328	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
112	NC_015163	GACG	2	8	45846	45853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015163	AGCC	2	8	45864	45871	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015163	GACG	2	8	46246	46253	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015163	AGCC	2	8	46264	46271	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015163	TCTT	2	8	46742	46749	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015163	CGAG	2	8	47536	47543	25 %	0 %	50 %	25 %	325284501
118	NC_015163	TGGT	2	8	47741	47748	0 %	50 %	50 %	0 %	325284501
119	NC_015163	CAGG	2	8	47992	47999	25 %	0 %	50 %	25 %	325284501
120	NC_015163	CGGC	2	8	48046	48053	0 %	0 %	50 %	50 %	325284501
121	NC_015163	GGCT	2	8	49446	49453	0 %	25 %	50 %	25 %	325284503
122	NC_015163	ATCC	2	8	49657	49664	25 %	25 %	0 %	50 %	325284503
123	NC_015163	CATC	2	8	50266	50273	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015163	CCCA	2	8	50530	50537	25 %	0 %	0 %	75 %	325284504
125	NC_015163	GCTG	2	8	50721	50728	0 %	25 %	50 %	25 %	325284504
126	NC_015163	CCCA	2	8	50815	50822	25 %	0 %	0 %	75 %	325284504
127	NC_015163	TGCT	2	8	50875	50882	0 %	50 %	25 %	25 %	325284504
128	NC_015163	TGAC	2	8	52159	52166	25 %	25 %	25 %	25 %	325284505
129	NC_015163	GCGG	2	8	52440	52447	0 %	0 %	75 %	25 %	325284505
130	NC_015163	TCGG	2	8	52912	52919	0 %	25 %	50 %	25 %	325284505
131	NC_015163	GTAG	2	8	53899	53906	25 %	25 %	50 %	0 %	325284506
132	NC_015163	CATC	2	8	54542	54549	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015163	GCCA	2	8	54829	54836	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015163	TGCC	2	8	54845	54852	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015163	CGGG	2	8	54979	54986	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015163	GACG	2	8	55196	55203	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015163	ATCT	2	8	56274	56281	25 %	50 %	0 %	25 %	325284507
138	NC_015163	CGGA	2	8	56404	56411	25 %	0 %	50 %	25 %	325284507
139	NC_015163	CTTG	2	8	56849	56856	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015163	TGAA	2	8	57200	57207	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015163	ACCT	2	8	57302	57309	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015163	GCAG	2	8	57379	57386	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015163	GGTC	2	8	57694	57701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015163	GCGT	2	8	58145	58152	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015163	TGGC	2	8	59851	59858	0 %	25 %	50 %	25 %	325284510
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188	NC_015163	CTGT	2	8	75740	75747	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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249	NC_015163	TGCG	2	8	95884	95891	0 %	25 %	50 %	25 %	325284549
250	NC_015163	AAAG	2	8	97034	97041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.