MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR04

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015163	TTTA	2	8	16	23	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015163	GTAT	2	8	38	45	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015163	CAGA	2	8	163	170	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015163	GACG	2	8	171	178	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015163	TGGT	2	8	3677	3684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015163	CAGC	2	8	5148	5155	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015163	TGAG	2	8	10535	10542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015163	CTGG	2	8	14925	14932	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015163	GGAG	2	8	15003	15010	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015163	TCGT	2	8	17034	17041	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015163	CATG	2	8	18944	18951	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015163	ATTG	2	8	19565	19572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015163	CGAG	2	8	20335	20342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015163	CTGA	2	8	21993	22000	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015163	GGGC	2	8	22185	22192	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015163	ACCA	2	8	22981	22988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015163	CAGG	2	8	24153	24160	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015163	ACTG	2	8	26368	26375	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015163	CTGG	2	8	29812	29819	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015163	GTTC	2	8	29930	29937	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015163	TGGC	2	8	30062	30069	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015163	TGCT	2	8	34775	34782	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015163	GGCA	2	8	37699	37706	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015163	CAGC	2	8	42119	42126	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015163	CTTG	2	8	43790	43797	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015163	AACC	2	8	44027	44034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015163	GCTG	2	8	44307	44314	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015163	GCCA	2	8	44408	44415	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015163	TCAG	2	8	44485	44492	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015163	GCCC	2	8	45321	45328	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_015163	GACG	2	8	45846	45853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015163	AGCC	2	8	45864	45871	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015163	GACG	2	8	46246	46253	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015163	AGCC	2	8	46264	46271	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015163	TCTT	2	8	46742	46749	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015163	CATC	2	8	50266	50273	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015163	CATC	2	8	54542	54549	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015163	GCCA	2	8	54829	54836	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015163	TGCC	2	8	54845	54852	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015163	CGGG	2	8	54979	54986	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015163	GACG	2	8	55196	55203	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015163	CTTG	2	8	56849	56856	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015163	TGAA	2	8	57200	57207	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015163	ACCT	2	8	57302	57309	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015163	GCAG	2	8	57379	57386	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015163	GGTC	2	8	57694	57701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015163	GCGT	2	8	58145	58152	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015163	CAGG	2	8	60903	60910	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015163	GTTG	2	8	63289	63296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015163	GTTG	2	8	64045	64052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015163	TTCC	2	8	64837	64844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015163	GTCC	2	8	68099	68106	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015163	CCGG	2	8	71998	72005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015163	CTGT	2	8	75740	75747	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015163	GAAC	2	8	76388	76395	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015163	ACCC	2	8	76798	76805	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_015163	CTGG	2	8	76940	76947	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015163	AACG	2	8	77076	77083	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015163	GACC	2	8	78712	78719	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015163	ATCT	2	8	80649	80656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015163	CGGA	2	8	80780	80787	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015163	ACCA	2	8	84529	84536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015163	ACCA	2	8	85008	85015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015163	CGGA	2	8	85861	85868	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015163	AGAA	2	8	86035	86042	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015163	AGAT	2	8	86102	86109	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015163	TGAC	2	8	86450	86457	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015163	GCTT	2	8	89074	89081	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015163	GTCC	2	8	89366	89373	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015163	GCCC	2	8	89861	89868	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_015163	GACG	2	8	90387	90394	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015163	AGCC	2	8	90405	90412	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015163	TCAA	2	8	91418	91425	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015163	GCAG	2	8	94385	94392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015163	AAAG	2	8	97034	97041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015163	GCAA	2	8	97139	97146	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.