MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR04

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015163	ATCT	2	8	227	234	25 %	50 %	0 %	25 %	325284458
2	NC_015163	CGTG	2	8	394	401	0 %	25 %	50 %	25 %	325284458
3	NC_015163	GCCG	2	8	1139	1146	0 %	0 %	50 %	50 %	325284458
4	NC_015163	TTCG	2	8	1758	1765	0 %	50 %	25 %	25 %	325284459
5	NC_015163	GGCA	2	8	2130	2137	25 %	0 %	50 %	25 %	325284460
6	NC_015163	CAGC	2	8	2179	2186	25 %	0 %	25 %	50 %	325284460
7	NC_015163	GGGC	2	8	3525	3532	0 %	0 %	75 %	25 %	325284463
8	NC_015163	GCTG	2	8	4080	4087	0 %	25 %	50 %	25 %	325284464
9	NC_015163	GGCG	2	8	4787	4794	0 %	0 %	75 %	25 %	325284466
10	NC_015163	GAAC	2	8	5052	5059	50 %	0 %	25 %	25 %	325284466
11	NC_015163	CTTC	2	8	5200	5207	0 %	50 %	0 %	50 %	325284467
12	NC_015163	AGCG	2	8	6065	6072	25 %	0 %	50 %	25 %	325284468
13	NC_015163	TGCT	2	8	7409	7416	0 %	50 %	25 %	25 %	325284470
14	NC_015163	CGGA	2	8	7724	7731	25 %	0 %	50 %	25 %	325284470
15	NC_015163	TGGG	2	8	7774	7781	0 %	25 %	75 %	0 %	325284470
16	NC_015163	CTGG	2	8	9719	9726	0 %	25 %	50 %	25 %	325284472
17	NC_015163	CTGG	2	8	9818	9825	0 %	25 %	50 %	25 %	325284473
18	NC_015163	GTGA	2	8	10028	10035	25 %	25 %	50 %	0 %	325284473
19	NC_015163	CCTA	2	8	10104	10111	25 %	25 %	0 %	50 %	325284473
20	NC_015163	GGCA	2	8	10892	10899	25 %	0 %	50 %	25 %	325284474
21	NC_015163	CAGC	2	8	11018	11025	25 %	0 %	25 %	50 %	325284474
22	NC_015163	GTCA	2	8	11390	11397	25 %	25 %	25 %	25 %	325284475
23	NC_015163	ATCT	2	8	11738	11745	25 %	50 %	0 %	25 %	325284475
24	NC_015163	TTTC	2	8	11804	11811	0 %	75 %	0 %	25 %	325284475
25	NC_015163	TCCG	2	8	11979	11986	0 %	25 %	25 %	50 %	325284475
26	NC_015163	GGCG	2	8	12249	12256	0 %	0 %	75 %	25 %	325284476
27	NC_015163	TGGA	2	8	13086	13093	25 %	25 %	50 %	0 %	325284477
28	NC_015163	GCCA	2	8	13283	13290	25 %	0 %	25 %	50 %	325284477
29	NC_015163	GCCT	2	8	14472	14479	0 %	25 %	25 %	50 %	325284477
30	NC_015163	CCAG	2	8	15763	15770	25 %	0 %	25 %	50 %	325284478
31	NC_015163	ACCC	2	8	16263	16270	25 %	0 %	0 %	75 %	325284478
32	NC_015163	CGTC	2	8	17221	17228	0 %	25 %	25 %	50 %	325284479
33	NC_015163	GATG	2	8	17551	17558	25 %	25 %	50 %	0 %	325284479
34	NC_015163	CGTC	2	8	17625	17632	0 %	25 %	25 %	50 %	325284479
35	NC_015163	CGCT	2	8	17794	17801	0 %	25 %	25 %	50 %	325284479
36	NC_015163	TGAG	2	8	17862	17869	25 %	25 %	50 %	0 %	325284479
37	NC_015163	CGGC	2	8	18201	18208	0 %	0 %	50 %	50 %	325284479
38	NC_015163	CTTA	2	8	18277	18284	25 %	50 %	0 %	25 %	325284479
39	NC_015163	TGCG	2	8	18585	18592	0 %	25 %	50 %	25 %	325284479
40	NC_015163	CGAG	2	8	18760	18767	25 %	0 %	50 %	25 %	325284479
41	NC_015163	CTAT	2	8	21585	21592	25 %	50 %	0 %	25 %	325284480
42	NC_015163	CCTC	2	8	23218	23225	0 %	25 %	0 %	75 %	325284481
43	NC_015163	TCCT	2	8	23694	23701	0 %	50 %	0 %	50 %	325284481
44	NC_015163	GAAA	2	8	23900	23907	75 %	0 %	25 %	0 %	325284481
45	NC_015163	ACCC	2	8	24172	24179	25 %	0 %	0 %	75 %	325284482
46	NC_015163	TCCT	2	8	24985	24992	0 %	50 %	0 %	50 %	325284483
47	NC_015163	ACCG	2	8	25015	25022	25 %	0 %	25 %	50 %	325284483
48	NC_015163	AGCC	2	8	25255	25262	25 %	0 %	25 %	50 %	325284483
49	NC_015163	GAGG	2	8	26270	26277	25 %	0 %	75 %	0 %	325284483
50	NC_015163	GGTC	2	8	26853	26860	0 %	25 %	50 %	25 %	325284484
51	NC_015163	GGGC	2	8	27370	27377	0 %	0 %	75 %	25 %	325284485
52	NC_015163	CCTC	2	8	27427	27434	0 %	25 %	0 %	75 %	325284485
53	NC_015163	CGCC	2	8	27524	27531	0 %	0 %	25 %	75 %	325284485
54	NC_015163	CGCC	2	8	28160	28167	0 %	0 %	25 %	75 %	325284486
55	NC_015163	CCAG	2	8	28526	28533	25 %	0 %	25 %	50 %	325284486
56	NC_015163	CCAG	2	8	28818	28825	25 %	0 %	25 %	50 %	325284487
57	NC_015163	GCTC	2	8	28915	28922	0 %	25 %	25 %	50 %	325284487
58	NC_015163	AGCC	2	8	29036	29043	25 %	0 %	25 %	50 %	325284487
59	NC_015163	GGGC	2	8	29174	29181	0 %	0 %	75 %	25 %	325284487
60	NC_015163	CGTC	2	8	33080	33087	0 %	25 %	25 %	50 %	325284488
61	NC_015163	AGAT	2	8	33212	33219	50 %	25 %	25 %	0 %	325284488
62	NC_015163	GTTC	2	8	33292	33299	0 %	50 %	25 %	25 %	325284488
63	NC_015163	GCCC	2	8	33309	33316	0 %	0 %	25 %	75 %	325284488
64	NC_015163	CTGT	2	8	33892	33899	0 %	50 %	25 %	25 %	325284489
65	NC_015163	GAAC	2	8	34530	34537	50 %	0 %	25 %	25 %	325284489
66	NC_015163	ATCA	2	8	35021	35028	50 %	25 %	0 %	25 %	325284490
67	NC_015163	GGAA	2	8	35481	35488	50 %	0 %	50 %	0 %	325284490
68	NC_015163	TTTC	2	8	36660	36667	0 %	75 %	0 %	25 %	325284491
69	NC_015163	GACG	2	8	36707	36714	25 %	0 %	50 %	25 %	325284491
70	NC_015163	TCCG	2	8	36838	36845	0 %	25 %	25 %	50 %	325284491
71	NC_015163	CTTC	2	8	37060	37067	0 %	50 %	0 %	50 %	325284492
72	NC_015163	GAAT	2	8	38304	38311	50 %	25 %	25 %	0 %	325284494
73	NC_015163	GAAT	2	8	38415	38422	50 %	25 %	25 %	0 %	325284494
74	NC_015163	AAGT	2	8	38939	38946	50 %	25 %	25 %	0 %	325284495
75	NC_015163	TGCG	2	8	40154	40161	0 %	25 %	50 %	25 %	325284497
76	NC_015163	GCGG	2	8	40507	40514	0 %	0 %	75 %	25 %	325284497
77	NC_015163	CAGA	2	8	40534	40541	50 %	0 %	25 %	25 %	325284497
78	NC_015163	GGGT	2	8	40667	40674	0 %	25 %	75 %	0 %	325284497
79	NC_015163	CACG	2	8	41524	41531	25 %	0 %	25 %	50 %	325284498
80	NC_015163	CAGG	2	8	41671	41678	25 %	0 %	50 %	25 %	325284498
81	NC_015163	GGGT	2	8	41768	41775	0 %	25 %	75 %	0 %	325284498
82	NC_015163	CGAG	2	8	47536	47543	25 %	0 %	50 %	25 %	325284501
83	NC_015163	TGGT	2	8	47741	47748	0 %	50 %	50 %	0 %	325284501
84	NC_015163	CAGG	2	8	47992	47999	25 %	0 %	50 %	25 %	325284501
85	NC_015163	CGGC	2	8	48046	48053	0 %	0 %	50 %	50 %	325284501
86	NC_015163	GGCT	2	8	49446	49453	0 %	25 %	50 %	25 %	325284503
87	NC_015163	ATCC	2	8	49657	49664	25 %	25 %	0 %	50 %	325284503
88	NC_015163	CCCA	2	8	50530	50537	25 %	0 %	0 %	75 %	325284504
89	NC_015163	GCTG	2	8	50721	50728	0 %	25 %	50 %	25 %	325284504
90	NC_015163	CCCA	2	8	50815	50822	25 %	0 %	0 %	75 %	325284504
91	NC_015163	TGCT	2	8	50875	50882	0 %	50 %	25 %	25 %	325284504
92	NC_015163	TGAC	2	8	52159	52166	25 %	25 %	25 %	25 %	325284505
93	NC_015163	GCGG	2	8	52440	52447	0 %	0 %	75 %	25 %	325284505
94	NC_015163	TCGG	2	8	52912	52919	0 %	25 %	50 %	25 %	325284505
95	NC_015163	GTAG	2	8	53899	53906	25 %	25 %	50 %	0 %	325284506
96	NC_015163	ATCT	2	8	56274	56281	25 %	50 %	0 %	25 %	325284507
97	NC_015163	CGGA	2	8	56404	56411	25 %	0 %	50 %	25 %	325284507
98	NC_015163	TGGC	2	8	59851	59858	0 %	25 %	50 %	25 %	325284510
99	NC_015163	GGCG	2	8	60000	60007	0 %	0 %	75 %	25 %	325284510
100	NC_015163	TGCG	2	8	60236	60243	0 %	25 %	50 %	25 %	325284510
101	NC_015163	GCTC	2	8	60721	60728	0 %	25 %	25 %	50 %	325284510
102	NC_015163	GCCA	2	8	61182	61189	25 %	0 %	25 %	50 %	325284511
103	NC_015163	CGGG	2	8	61684	61691	0 %	0 %	75 %	25 %	325284511
104	NC_015163	TGCC	2	8	62179	62186	0 %	25 %	25 %	50 %	325284511
105	NC_015163	CTGA	2	8	62351	62358	25 %	25 %	25 %	25 %	325284511
106	NC_015163	AGAT	2	8	62535	62542	50 %	25 %	25 %	0 %	325284511
107	NC_015163	ATGT	2	8	62651	62658	25 %	50 %	25 %	0 %	325284511
108	NC_015163	GGTG	2	8	62950	62957	0 %	25 %	75 %	0 %	325284511
109	NC_015163	GGCT	2	8	63348	63355	0 %	25 %	50 %	25 %	325284512
110	NC_015163	CGTC	2	8	63366	63373	0 %	25 %	25 %	50 %	325284512
111	NC_015163	GGGC	2	8	63892	63899	0 %	0 %	75 %	25 %	325284513
112	NC_015163	CGCA	2	8	66033	66040	25 %	0 %	25 %	50 %	325284514
113	NC_015163	AAGG	2	8	66908	66915	50 %	0 %	50 %	0 %	325284515
114	NC_015163	CTGT	2	8	66959	66966	0 %	50 %	25 %	25 %	325284515
115	NC_015163	TCAG	2	8	67437	67444	25 %	25 %	25 %	25 %	325284515
116	NC_015163	GCCA	2	8	68292	68299	25 %	0 %	25 %	50 %	325284516
117	NC_015163	GGGA	2	8	68441	68448	25 %	0 %	75 %	0 %	325284516
118	NC_015163	GTTC	2	8	68946	68953	0 %	50 %	25 %	25 %	325284517
119	NC_015163	GCCA	2	8	69060	69067	25 %	0 %	25 %	50 %	325284517
120	NC_015163	GGTC	2	8	69120	69127	0 %	25 %	50 %	25 %	325284517
121	NC_015163	GCCG	2	8	70696	70703	0 %	0 %	50 %	50 %	325284521
122	NC_015163	ACAG	2	8	70875	70882	50 %	0 %	25 %	25 %	325284521
123	NC_015163	TCAT	2	8	71134	71141	25 %	50 %	0 %	25 %	325284522
124	NC_015163	GACC	2	8	71207	71214	25 %	0 %	25 %	50 %	325284522
125	NC_015163	GCCT	2	8	71515	71522	0 %	25 %	25 %	50 %	325284523
126	NC_015163	CCGC	2	8	71772	71779	0 %	0 %	25 %	75 %	325284523
127	NC_015163	TGCT	2	8	71930	71937	0 %	50 %	25 %	25 %	325284523
128	NC_015163	GCTG	2	8	72414	72421	0 %	25 %	50 %	25 %	325284524
129	NC_015163	AGCC	2	8	72556	72563	25 %	0 %	25 %	50 %	325284524
130	NC_015163	CCTT	2	8	73046	73053	0 %	50 %	0 %	50 %	325284524
131	NC_015163	GGCA	2	8	73476	73483	25 %	0 %	50 %	25 %	325284525
132	NC_015163	GCGG	2	8	74542	74549	0 %	0 %	75 %	25 %	325284527
133	NC_015163	CTGC	2	8	74790	74797	0 %	25 %	25 %	50 %	325284527
134	NC_015163	CCAG	2	8	74898	74905	25 %	0 %	25 %	50 %	325284527
135	NC_015163	GCCA	2	8	77318	77325	25 %	0 %	25 %	50 %	325284528
136	NC_015163	ACTC	2	8	77605	77612	25 %	25 %	0 %	50 %	325284529
137	NC_015163	GGGT	2	8	77963	77970	0 %	25 %	75 %	0 %	325284530
138	NC_015163	CTTC	2	8	78974	78981	0 %	50 %	0 %	50 %	325284531
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.