MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR02

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015162	GCTGT	2	10	3758	3767	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015162	CCACT	2	10	11127	11136	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_015162	GCCAC	2	10	11214	11223	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_015162	CCTGC	2	10	11383	11392	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_015162	AAATC	2	10	18729	18738	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015162	GCCCG	2	10	18985	18994	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_015162	TCCCC	2	10	24518	24527	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
8	NC_015162	CCTGG	2	10	26005	26014	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_015162	TCCCC	2	10	37268	37277	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
10	NC_015162	ACTCA	2	10	37399	37408	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_015162	CTGCC	2	10	62836	62845	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_015162	ACAGA	2	10	69543	69552	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015162	CTGCA	2	10	75903	75912	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_015162	TCCGG	2	10	95052	95061	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015162	AGGAA	2	10	136129	136138	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015162	TCGCC	2	10	153622	153631	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_015162	TTCTG	2	10	153957	153966	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015162	GGAAT	2	10	165903	165912	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015162	GCAGC	2	10	168206	168215	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_015162	GGGTC	2	10	177054	177063	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015162	TTGCT	2	10	195766	195775	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.