MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR02

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015162	CGCAC	2	10	371	380	20 %	0 %	20 %	60 %	325284232
2	NC_015162	GACTG	2	10	4107	4116	20 %	20 %	40 %	20 %	325284234
3	NC_015162	AGGAG	2	10	5992	6001	40 %	0 %	60 %	0 %	325284235
4	NC_015162	GCAGC	2	10	15952	15961	20 %	0 %	40 %	40 %	325284249
5	NC_015162	CTGAG	2	10	18926	18935	20 %	20 %	40 %	20 %	325284254
6	NC_015162	GAAAC	2	10	20459	20468	60 %	0 %	20 %	20 %	325284258
7	NC_015162	GCGCT	2	10	20826	20835	0 %	20 %	40 %	40 %	325284259
8	NC_015162	AGCAC	2	10	22135	22144	40 %	0 %	20 %	40 %	325284261
9	NC_015162	GCGCC	2	10	23651	23660	0 %	0 %	40 %	60 %	325284266
10	NC_015162	CAGTC	2	10	24269	24278	20 %	20 %	20 %	40 %	325284266
11	NC_015162	GGTCC	2	10	25324	25333	0 %	20 %	40 %	40 %	325284269
12	NC_015162	GCCGG	3	15	25669	25683	0 %	0 %	60 %	40 %	325284269
13	NC_015162	CGCCA	2	10	27471	27480	20 %	0 %	20 %	60 %	325284271
14	NC_015162	GCAGC	2	10	29202	29211	20 %	0 %	40 %	40 %	325284272
15	NC_015162	CGGGC	2	10	29628	29637	0 %	0 %	60 %	40 %	325284273
16	NC_015162	CGGCG	2	10	30220	30229	0 %	0 %	60 %	40 %	325284274
17	NC_015162	TGCCC	2	10	32654	32663	0 %	20 %	20 %	60 %	325284279
18	NC_015162	GAGTG	2	10	35859	35868	20 %	20 %	60 %	0 %	325284284
19	NC_015162	CCTGA	2	10	40446	40455	20 %	20 %	20 %	40 %	325284286
20	NC_015162	GGCCA	2	10	44600	44609	20 %	0 %	40 %	40 %	325284291
21	NC_015162	GGCAC	2	10	45412	45421	20 %	0 %	40 %	40 %	325284292
22	NC_015162	GCTGC	2	10	46362	46371	0 %	20 %	40 %	40 %	325284293
23	NC_015162	GAACT	2	10	49832	49841	40 %	20 %	20 %	20 %	325284295
24	NC_015162	CAGCG	2	10	51570	51579	20 %	0 %	40 %	40 %	325284295
25	NC_015162	GCACA	2	10	51590	51599	40 %	0 %	20 %	40 %	325284295
26	NC_015162	GTGAA	2	10	51795	51804	40 %	20 %	40 %	0 %	325284295
27	NC_015162	GACTG	2	10	52104	52113	20 %	20 %	40 %	20 %	325284295
28	NC_015162	TGAGC	2	10	52603	52612	20 %	20 %	40 %	20 %	325284295
29	NC_015162	AGCCC	2	10	53112	53121	20 %	0 %	20 %	60 %	325284295
30	NC_015162	TGGCA	2	10	55143	55152	20 %	20 %	40 %	20 %	325284298
31	NC_015162	CGCTG	2	10	58377	58386	0 %	20 %	40 %	40 %	325284300
32	NC_015162	CTGCG	2	10	59929	59938	0 %	20 %	40 %	40 %	325284301
33	NC_015162	AGCGA	2	10	60104	60113	40 %	0 %	40 %	20 %	325284301
34	NC_015162	ACAGC	2	10	61810	61819	40 %	0 %	20 %	40 %	325284303
35	NC_015162	TGCCG	2	10	62335	62344	0 %	20 %	40 %	40 %	325284303
36	NC_015162	ACCAC	2	10	65632	65641	40 %	0 %	0 %	60 %	325284308
37	NC_015162	GCATC	2	10	68222	68231	20 %	20 %	20 %	40 %	325284311
38	NC_015162	GGCAG	2	10	75041	75050	20 %	0 %	60 %	20 %	325284320
39	NC_015162	AGCGC	2	10	76759	76768	20 %	0 %	40 %	40 %	325284322
40	NC_015162	AGCGC	2	10	77088	77097	20 %	0 %	40 %	40 %	325284323
41	NC_015162	AGCTG	2	10	77437	77446	20 %	20 %	40 %	20 %	325284324
42	NC_015162	AGCGA	2	10	78931	78940	40 %	0 %	40 %	20 %	325284326
43	NC_015162	AAAGC	2	10	79211	79220	60 %	0 %	20 %	20 %	325284326
44	NC_015162	ACTGG	2	10	79520	79529	20 %	20 %	40 %	20 %	325284326
45	NC_015162	GGGCT	2	10	79564	79573	0 %	20 %	60 %	20 %	325284326
46	NC_015162	GCCTT	2	10	79775	79784	0 %	40 %	20 %	40 %	325284326
47	NC_015162	GCACC	2	10	82145	82154	20 %	0 %	20 %	60 %	325284329
48	NC_015162	GCAGA	2	10	82683	82692	40 %	0 %	40 %	20 %	325284329
49	NC_015162	GCGCC	2	10	82943	82952	0 %	0 %	40 %	60 %	325284329
50	NC_015162	GTGGC	2	10	86348	86357	0 %	20 %	60 %	20 %	325284334
51	NC_015162	CCTCG	2	10	86783	86792	0 %	20 %	20 %	60 %	325284334
52	NC_015162	TGAGC	2	10	87238	87247	20 %	20 %	40 %	20 %	325284335
53	NC_015162	GATCA	2	10	89507	89516	40 %	20 %	20 %	20 %	325284338
54	NC_015162	CGCAG	2	10	89521	89530	20 %	0 %	40 %	40 %	325284338
55	NC_015162	CTGAA	2	10	90628	90637	40 %	20 %	20 %	20 %	325284341
56	NC_015162	AGCAG	2	10	91693	91702	40 %	0 %	40 %	20 %	325284342
57	NC_015162	CCGCG	2	10	93698	93707	0 %	0 %	40 %	60 %	325284345
58	NC_015162	TGCTC	2	10	96965	96974	0 %	40 %	20 %	40 %	325284348
59	NC_015162	TGTGT	2	10	97539	97548	0 %	60 %	40 %	0 %	325284348
60	NC_015162	GCTGG	2	10	98064	98073	0 %	20 %	60 %	20 %	325284349
61	NC_015162	CATCC	2	10	99606	99615	20 %	20 %	0 %	60 %	325284352
62	NC_015162	CTGGA	2	10	99961	99970	20 %	20 %	40 %	20 %	325284353
63	NC_015162	GGGCC	2	10	100649	100658	0 %	0 %	60 %	40 %	325284353
64	NC_015162	CCTGA	2	10	102331	102340	20 %	20 %	20 %	40 %	325284355
65	NC_015162	GAACA	2	10	103534	103543	60 %	0 %	20 %	20 %	325284359
66	NC_015162	CGGCG	2	10	103941	103950	0 %	0 %	60 %	40 %	325284360
67	NC_015162	CTGAA	2	10	104624	104633	40 %	20 %	20 %	20 %	325284361
68	NC_015162	CTTTG	2	10	105950	105959	0 %	60 %	20 %	20 %	325284362
69	NC_015162	CAGGG	2	10	110910	110919	20 %	0 %	60 %	20 %	325284364
70	NC_015162	CGGGC	2	10	111198	111207	0 %	0 %	60 %	40 %	325284364
71	NC_015162	GGCGC	2	10	111797	111806	0 %	0 %	60 %	40 %	325284364
72	NC_015162	ACGGC	2	10	114682	114691	20 %	0 %	40 %	40 %	325284368
73	NC_015162	AGGTC	2	10	117709	117718	20 %	20 %	40 %	20 %	325284373
74	NC_015162	CAGCG	2	10	119006	119015	20 %	0 %	40 %	40 %	325284374
75	NC_015162	CCTGC	2	10	119914	119923	0 %	20 %	20 %	60 %	325284376
76	NC_015162	GCCGG	2	10	120234	120243	0 %	0 %	60 %	40 %	325284376
77	NC_015162	GCAGG	2	10	120931	120940	20 %	0 %	60 %	20 %	325284377
78	NC_015162	TCAGC	2	10	121714	121723	20 %	20 %	20 %	40 %	325284378
79	NC_015162	ACCTG	2	10	122037	122046	20 %	20 %	20 %	40 %	325284379
80	NC_015162	CAGGG	2	10	122508	122517	20 %	0 %	60 %	20 %	325284379
81	NC_015162	GGCTG	2	10	122567	122576	0 %	20 %	60 %	20 %	325284379
82	NC_015162	GAAGT	2	10	123757	123766	40 %	20 %	40 %	0 %	325284381
83	NC_015162	ACCGC	2	10	133077	133086	20 %	0 %	20 %	60 %	325284391
84	NC_015162	CCCAG	2	10	133842	133851	20 %	0 %	20 %	60 %	325284391
85	NC_015162	GAAAC	2	10	134344	134353	60 %	0 %	20 %	20 %	325284392
86	NC_015162	AACTG	2	10	134376	134385	40 %	20 %	20 %	20 %	325284392
87	NC_015162	GCAGC	2	10	134992	135001	20 %	0 %	40 %	40 %	325284393
88	NC_015162	CCTCT	2	10	135307	135316	0 %	40 %	0 %	60 %	325284393
89	NC_015162	CGGCA	2	10	136814	136823	20 %	0 %	40 %	40 %	325284394
90	NC_015162	CTGGA	2	10	136894	136903	20 %	20 %	40 %	20 %	325284394
91	NC_015162	GACTG	2	10	137629	137638	20 %	20 %	40 %	20 %	325284394
92	NC_015162	CCCCT	2	10	138581	138590	0 %	20 %	0 %	80 %	325284395
93	NC_015162	ACCTG	2	10	139515	139524	20 %	20 %	20 %	40 %	325284395
94	NC_015162	CTGGA	2	10	139612	139621	20 %	20 %	40 %	20 %	325284396
95	NC_015162	ATCCT	2	10	140741	140750	20 %	40 %	0 %	40 %	325284396
96	NC_015162	CAGCG	2	10	140964	140973	20 %	0 %	40 %	40 %	325284397
97	NC_015162	CTGCG	2	10	142317	142326	0 %	20 %	40 %	40 %	325284400
98	NC_015162	TACAA	2	10	143118	143127	60 %	20 %	0 %	20 %	325284400
99	NC_015162	TGACC	2	10	143660	143669	20 %	20 %	20 %	40 %	325284400
100	NC_015162	GCCAG	2	10	144074	144083	20 %	0 %	40 %	40 %	325284401
101	NC_015162	AGCAC	2	10	147622	147631	40 %	0 %	20 %	40 %	325284403
102	NC_015162	CGGCT	2	10	149890	149899	0 %	20 %	40 %	40 %	325284408
103	NC_015162	CTGAA	2	10	150185	150194	40 %	20 %	20 %	20 %	325284408
104	NC_015162	CCTGG	2	10	150607	150616	0 %	20 %	40 %	40 %	325284408
105	NC_015162	TCCCT	2	10	154842	154851	0 %	40 %	0 %	60 %	325284412
106	NC_015162	GCTGG	2	10	155881	155890	0 %	20 %	60 %	20 %	325284413
107	NC_015162	GTCAG	2	10	157405	157414	20 %	20 %	40 %	20 %	325284416
108	NC_015162	TTCGG	2	10	159283	159292	0 %	40 %	40 %	20 %	325284418
109	NC_015162	CTGAG	2	10	159541	159550	20 %	20 %	40 %	20 %	325284418
110	NC_015162	GCCTG	2	10	159891	159900	0 %	20 %	40 %	40 %	325284418
111	NC_015162	GGCTC	2	10	159978	159987	0 %	20 %	40 %	40 %	325284418
112	NC_015162	CCAGA	2	10	164735	164744	40 %	0 %	20 %	40 %	325284423
113	NC_015162	TGACC	2	10	166697	166706	20 %	20 %	20 %	40 %	325284425
114	NC_015162	TGCCG	2	10	169348	169357	0 %	20 %	40 %	40 %	325284428
115	NC_015162	ACTGC	2	10	169515	169524	20 %	20 %	20 %	40 %	325284428
116	NC_015162	GGTCA	2	10	170798	170807	20 %	20 %	40 %	20 %	325284429
117	NC_015162	CCCTG	2	10	172157	172166	0 %	20 %	20 %	60 %	325284430
118	NC_015162	CAGCG	2	10	176217	176226	20 %	0 %	40 %	40 %	325284436
119	NC_015162	TGACC	2	10	179301	179310	20 %	20 %	20 %	40 %	325284439
120	NC_015162	AAGCC	2	10	183837	183846	40 %	0 %	20 %	40 %	325284442
121	NC_015162	GGCCC	2	10	185170	185179	0 %	0 %	40 %	60 %	325284442
122	NC_015162	AGGAC	2	10	185293	185302	40 %	0 %	40 %	20 %	325284442
123	NC_015162	CTCCA	2	10	186916	186925	20 %	20 %	0 %	60 %	325284443
124	NC_015162	AAAGA	2	10	187222	187231	80 %	0 %	20 %	0 %	325284443
125	NC_015162	GAACT	2	10	187363	187372	40 %	20 %	20 %	20 %	325284443
126	NC_015162	CGCCT	2	10	188904	188913	0 %	20 %	20 %	60 %	325284445
127	NC_015162	GCCGA	2	10	189255	189264	20 %	0 %	40 %	40 %	325284445
128	NC_015162	TCCCC	2	10	189590	189599	0 %	20 %	0 %	80 %	325284445
129	NC_015162	CGCTG	2	10	189643	189652	0 %	20 %	40 %	40 %	325284445
130	NC_015162	GCGGG	2	10	190348	190357	0 %	0 %	80 %	20 %	325284445
131	NC_015162	TCGGG	2	10	190545	190554	0 %	20 %	60 %	20 %	325284446
132	NC_015162	CTGGC	2	10	191425	191434	0 %	20 %	40 %	40 %	325284448
133	NC_015162	CTGAC	2	10	194074	194083	20 %	20 %	20 %	40 %	325284452
134	NC_015162	CTGGC	2	10	195191	195200	0 %	20 %	40 %	40 %	325284456
135	NC_015162	CCAGG	2	10	195351	195360	20 %	0 %	40 %	40 %	325284456
136	NC_015162	AGCGG	2	10	195735	195744	20 %	0 %	60 %	20 %	325284456

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.