MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR02

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015162	TC	3	6	1137	1142	0 %	50 %	0 %	50 %	325284232
2	NC_015162	CG	3	6	4084	4089	0 %	0 %	50 %	50 %	325284234
3	NC_015162	GT	3	6	4782	4787	0 %	50 %	50 %	0 %	325284234
4	NC_015162	AG	3	6	4922	4927	50 %	0 %	50 %	0 %	325284235
5	NC_015162	TC	3	6	5480	5485	0 %	50 %	0 %	50 %	325284235
6	NC_015162	AT	3	6	5809	5814	50 %	50 %	0 %	0 %	325284235
7	NC_015162	TC	3	6	5836	5841	0 %	50 %	0 %	50 %	325284235
8	NC_015162	TA	3	6	5951	5956	50 %	50 %	0 %	0 %	325284235
9	NC_015162	TC	3	6	6177	6182	0 %	50 %	0 %	50 %	325284236
10	NC_015162	TC	3	6	9847	9852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015162	CA	3	6	10945	10950	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015162	CG	3	6	11281	11286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015162	AG	3	6	11646	11651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015162	CA	3	6	14569	14574	50 %	0 %	0 %	50 %	325284246
15	NC_015162	CA	4	8	14605	14612	50 %	0 %	0 %	50 %	325284246
16	NC_015162	TG	3	6	15727	15732	0 %	50 %	50 %	0 %	325284248
17	NC_015162	GC	3	6	15885	15890	0 %	0 %	50 %	50 %	325284249
18	NC_015162	GC	3	6	15972	15977	0 %	0 %	50 %	50 %	325284249
19	NC_015162	GA	3	6	16217	16222	50 %	0 %	50 %	0 %	325284249
20	NC_015162	CG	3	6	17415	17420	0 %	0 %	50 %	50 %	325284252
21	NC_015162	CA	3	6	17816	17821	50 %	0 %	0 %	50 %	325284253
22	NC_015162	AG	3	6	18698	18703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015162	CA	3	6	19405	19410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015162	CA	3	6	19417	19422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015162	GC	3	6	20844	20849	0 %	0 %	50 %	50 %	325284259
26	NC_015162	GC	3	6	21607	21612	0 %	0 %	50 %	50 %	325284260
27	NC_015162	CG	3	6	24397	24402	0 %	0 %	50 %	50 %	325284267
28	NC_015162	GC	3	6	25147	25152	0 %	0 %	50 %	50 %	325284268
29	NC_015162	CG	3	6	26554	26559	0 %	0 %	50 %	50 %	325284270
30	NC_015162	CG	3	6	26769	26774	0 %	0 %	50 %	50 %	325284271
31	NC_015162	CG	3	6	27709	27714	0 %	0 %	50 %	50 %	325284271
32	NC_015162	CG	4	8	28038	28045	0 %	0 %	50 %	50 %	325284271
33	NC_015162	TC	3	6	30202	30207	0 %	50 %	0 %	50 %	325284274
34	NC_015162	GC	3	6	31412	31417	0 %	0 %	50 %	50 %	325284277
35	NC_015162	GC	3	6	32887	32892	0 %	0 %	50 %	50 %	325284280
36	NC_015162	CG	3	6	33242	33247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015162	GC	3	6	34146	34151	0 %	0 %	50 %	50 %	325284282
38	NC_015162	GC	4	8	35704	35711	0 %	0 %	50 %	50 %	325284284
39	NC_015162	CT	3	6	37653	37658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015162	AC	3	6	38498	38503	50 %	0 %	0 %	50 %	325284285
41	NC_015162	GC	3	6	38628	38633	0 %	0 %	50 %	50 %	325284286
42	NC_015162	TG	3	6	39752	39757	0 %	50 %	50 %	0 %	325284286
43	NC_015162	GC	3	6	40206	40211	0 %	0 %	50 %	50 %	325284286
44	NC_015162	GC	3	6	40665	40670	0 %	0 %	50 %	50 %	325284287
45	NC_015162	AC	3	6	41376	41381	50 %	0 %	0 %	50 %	325284288
46	NC_015162	GC	3	6	43099	43104	0 %	0 %	50 %	50 %	325284290
47	NC_015162	GC	3	6	43192	43197	0 %	0 %	50 %	50 %	325284290
48	NC_015162	GC	3	6	43595	43600	0 %	0 %	50 %	50 %	325284290
49	NC_015162	GC	3	6	44228	44233	0 %	0 %	50 %	50 %	325284291
50	NC_015162	GC	3	6	44721	44726	0 %	0 %	50 %	50 %	325284291
51	NC_015162	CG	4	8	45593	45600	0 %	0 %	50 %	50 %	325284292
52	NC_015162	AG	3	6	46398	46403	50 %	0 %	50 %	0 %	325284293
53	NC_015162	CG	3	6	47854	47859	0 %	0 %	50 %	50 %	325284294
54	NC_015162	AC	3	6	48880	48885	50 %	0 %	0 %	50 %	325284295
55	NC_015162	TC	3	6	50365	50370	0 %	50 %	0 %	50 %	325284295
56	NC_015162	GC	3	6	51028	51033	0 %	0 %	50 %	50 %	325284295
57	NC_015162	GA	3	6	51537	51542	50 %	0 %	50 %	0 %	325284295
58	NC_015162	TG	3	6	51815	51820	0 %	50 %	50 %	0 %	325284295
59	NC_015162	GA	3	6	53004	53009	50 %	0 %	50 %	0 %	325284295
60	NC_015162	CG	3	6	54364	54369	0 %	0 %	50 %	50 %	325284297
61	NC_015162	AC	3	6	55077	55082	50 %	0 %	0 %	50 %	325284298
62	NC_015162	GC	4	8	56086	56093	0 %	0 %	50 %	50 %	325284298
63	NC_015162	AG	3	6	56562	56567	50 %	0 %	50 %	0 %	325284298
64	NC_015162	CA	3	6	57603	57608	50 %	0 %	0 %	50 %	325284300
65	NC_015162	GT	3	6	58308	58313	0 %	50 %	50 %	0 %	325284300
66	NC_015162	GA	3	6	59889	59894	50 %	0 %	50 %	0 %	325284301
67	NC_015162	AC	3	6	60279	60284	50 %	0 %	0 %	50 %	325284301
68	NC_015162	AC	3	6	60494	60499	50 %	0 %	0 %	50 %	325284301
69	NC_015162	CA	3	6	60766	60771	50 %	0 %	0 %	50 %	325284302
70	NC_015162	CA	3	6	60919	60924	50 %	0 %	0 %	50 %	325284302
71	NC_015162	GC	3	6	61063	61068	0 %	0 %	50 %	50 %	325284302
72	NC_015162	CA	3	6	61646	61651	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015162	GC	3	6	63205	63210	0 %	0 %	50 %	50 %	325284305
74	NC_015162	CA	3	6	64063	64068	50 %	0 %	0 %	50 %	325284306
75	NC_015162	AG	3	6	64302	64307	50 %	0 %	50 %	0 %	325284306
76	NC_015162	GC	3	6	64548	64553	0 %	0 %	50 %	50 %	325284307
77	NC_015162	AC	3	6	65218	65223	50 %	0 %	0 %	50 %	325284308
78	NC_015162	GC	3	6	65492	65497	0 %	0 %	50 %	50 %	325284308
79	NC_015162	GC	3	6	66017	66022	0 %	0 %	50 %	50 %	325284309
80	NC_015162	TC	3	6	66290	66295	0 %	50 %	0 %	50 %	325284309
81	NC_015162	CA	3	6	66705	66710	50 %	0 %	0 %	50 %	325284309
82	NC_015162	CA	3	6	66800	66805	50 %	0 %	0 %	50 %	325284309
83	NC_015162	TC	3	6	68955	68960	0 %	50 %	0 %	50 %	325284312
84	NC_015162	AC	3	6	69695	69700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015162	GC	3	6	70383	70388	0 %	0 %	50 %	50 %	325284314
86	NC_015162	AC	3	6	71202	71207	50 %	0 %	0 %	50 %	325284316
87	NC_015162	TG	3	6	72248	72253	0 %	50 %	50 %	0 %	325284316
88	NC_015162	CG	3	6	72820	72825	0 %	0 %	50 %	50 %	325284317
89	NC_015162	CA	3	6	73478	73483	50 %	0 %	0 %	50 %	325284318
90	NC_015162	CA	3	6	73981	73986	50 %	0 %	0 %	50 %	325284319
91	NC_015162	GA	3	6	75422	75427	50 %	0 %	50 %	0 %	325284321
92	NC_015162	TC	3	6	76854	76859	0 %	50 %	0 %	50 %	325284322
93	NC_015162	AC	3	6	76906	76911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015162	CT	3	6	76944	76949	0 %	50 %	0 %	50 %	325284323
95	NC_015162	GC	3	6	76973	76978	0 %	0 %	50 %	50 %	325284323
96	NC_015162	CT	3	6	78078	78083	0 %	50 %	0 %	50 %	325284325
97	NC_015162	GT	3	6	78375	78380	0 %	50 %	50 %	0 %	325284325
98	NC_015162	AG	3	6	79676	79681	50 %	0 %	50 %	0 %	325284326
99	NC_015162	CT	3	6	79687	79692	0 %	50 %	0 %	50 %	325284326
100	NC_015162	CA	3	6	80642	80647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015162	CA	3	6	81718	81723	50 %	0 %	0 %	50 %	325284328
102	NC_015162	CA	3	6	84331	84336	50 %	0 %	0 %	50 %	325284331
103	NC_015162	GC	3	6	85671	85676	0 %	0 %	50 %	50 %	325284333
104	NC_015162	GC	3	6	85834	85839	0 %	0 %	50 %	50 %	325284333
105	NC_015162	GT	3	6	86076	86081	0 %	50 %	50 %	0 %	325284333
106	NC_015162	GC	4	8	87246	87253	0 %	0 %	50 %	50 %	325284335
107	NC_015162	GC	3	6	87533	87538	0 %	0 %	50 %	50 %	325284335
108	NC_015162	CA	3	6	87965	87970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015162	CA	3	6	89948	89953	50 %	0 %	0 %	50 %	325284339
110	NC_015162	GT	3	6	90781	90786	0 %	50 %	50 %	0 %	325284341
111	NC_015162	CT	4	8	91865	91872	0 %	50 %	0 %	50 %	325284342
112	NC_015162	CA	3	6	91927	91932	50 %	0 %	0 %	50 %	325284342
113	NC_015162	AG	3	6	92332	92337	50 %	0 %	50 %	0 %	325284342
114	NC_015162	GC	3	6	92954	92959	0 %	0 %	50 %	50 %	325284343
115	NC_015162	CT	3	6	93671	93676	0 %	50 %	0 %	50 %	325284345
116	NC_015162	AC	3	6	95097	95102	50 %	0 %	0 %	50 %	325284348
117	NC_015162	CG	3	6	97151	97156	0 %	0 %	50 %	50 %	325284348
118	NC_015162	CG	3	6	98205	98210	0 %	0 %	50 %	50 %	325284349
119	NC_015162	CA	3	6	98433	98438	50 %	0 %	0 %	50 %	325284350
120	NC_015162	TG	3	6	99361	99366	0 %	50 %	50 %	0 %	325284352
121	NC_015162	TG	3	6	100123	100128	0 %	50 %	50 %	0 %	325284353
122	NC_015162	AG	3	6	100148	100153	50 %	0 %	50 %	0 %	325284353
123	NC_015162	GT	3	6	101723	101728	0 %	50 %	50 %	0 %	325284355
124	NC_015162	GT	3	6	101972	101977	0 %	50 %	50 %	0 %	325284355
125	NC_015162	GC	4	8	103234	103241	0 %	0 %	50 %	50 %	325284358
126	NC_015162	GA	3	6	103419	103424	50 %	0 %	50 %	0 %	325284358
127	NC_015162	CT	3	6	103875	103880	0 %	50 %	0 %	50 %	325284360
128	NC_015162	TC	3	6	103924	103929	0 %	50 %	0 %	50 %	325284360
129	NC_015162	TG	3	6	105608	105613	0 %	50 %	50 %	0 %	325284362
130	NC_015162	GC	3	6	106091	106096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015162	AC	3	6	107619	107624	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015162	GA	3	6	107938	107943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015162	AC	3	6	109715	109720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015162	GT	3	6	111024	111029	0 %	50 %	50 %	0 %	325284364
135	NC_015162	AC	3	6	112099	112104	50 %	0 %	0 %	50 %	325284364
136	NC_015162	TG	3	6	115410	115415	0 %	50 %	50 %	0 %	325284369
137	NC_015162	GC	3	6	115583	115588	0 %	0 %	50 %	50 %	325284369
138	NC_015162	AG	3	6	117682	117687	50 %	0 %	50 %	0 %	325284373
139	NC_015162	GC	3	6	119286	119291	0 %	0 %	50 %	50 %	325284374
140	NC_015162	GC	3	6	120383	120388	0 %	0 %	50 %	50 %	325284376
141	NC_015162	CA	3	6	121244	121249	50 %	0 %	0 %	50 %	325284377
142	NC_015162	CA	3	6	121840	121845	50 %	0 %	0 %	50 %	325284379
143	NC_015162	GA	3	6	121879	121884	50 %	0 %	50 %	0 %	325284379
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.