MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP chromosome

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015161	GTGCAG	2	12	41308	41319	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015161	TTCCAG	2	12	43223	43234	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015161	CGCTGA	2	12	89075	89086	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015161	GCTATG	2	12	97279	97290	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015161	AGGGGA	2	12	118487	118498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015161	TCCTTT	2	12	133601	133612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015161	GGTGAG	2	12	140109	140120	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015161	GCTGGC	2	12	142524	142535	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015161	GCTATG	2	12	172625	172636	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015161	CACGGC	2	12	223020	223031	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015161	GCCGCA	2	12	325778	325789	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015161	CAGCTG	2	12	350184	350195	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015161	CTTCCC	2	12	389938	389949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015161	GCCGGC	2	12	411506	411517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015161	TTTTGG	2	12	416593	416604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015161	CTGGCC	2	12	438838	438849	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015161	CGTGAC	2	12	441758	441769	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015161	GCTTTA	2	12	492594	492605	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015161	GCAGGC	2	12	502759	502770	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015161	AGGCTA	2	12	511034	511045	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015161	AGATGA	2	12	512961	512972	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015161	CTGGGC	2	12	528821	528832	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015161	CACCCG	2	12	528901	528912	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_015161	GCCTGC	2	12	539445	539456	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015161	TTTCTG	2	12	544295	544306	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015161	GCCATA	2	12	553639	553650	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015161	GCCTGG	2	12	578003	578014	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015161	CTGCGG	2	12	588307	588318	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015161	ATCAGC	2	12	595031	595042	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015161	CTACCA	2	12	596282	596293	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015161	TGCCCG	2	12	606595	606606	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015161	CCGGCT	2	12	625994	626005	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015161	CAGCCG	2	12	626022	626033	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015161	CTCCGT	2	12	627391	627402	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015161	CCAGCG	2	12	638026	638037	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015161	AGGCGG	2	12	649965	649976	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015161	AGGGGT	2	12	668404	668415	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015161	CAGGGC	2	12	688989	689000	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015161	GCCAGC	2	12	738816	738827	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015161	CGTCCG	2	12	741089	741100	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015161	CTACCG	2	12	743456	743467	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015161	TCCCTG	2	12	746011	746022	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015161	CAGGTG	2	12	820270	820281	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015161	GAAAAC	2	12	820322	820333	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015161	CCCTGC	2	12	837645	837656	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_015161	TGCTCT	2	12	839819	839830	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015161	GCGCCC	2	12	851445	851456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015161	ATGAGG	2	12	851551	851562	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015161	GCAGAC	2	12	862810	862821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015161	GGCAGC	2	12	875342	875353	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015161	GGGGAG	2	12	875524	875535	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015161	CCAAGA	2	12	925756	925767	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015161	CGGGGC	2	12	990216	990227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015161	CTGTCC	2	12	1022197	1022208	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015161	CCCTGT	2	12	1025083	1025094	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015161	CAGGTA	2	12	1060208	1060219	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015161	CCCCTA	2	12	1062978	1062989	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_015161	ACGTCT	2	12	1073401	1073412	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015161	ATCGCC	2	12	1100039	1100050	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015161	CCACCC	2	12	1114924	1114935	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
61	NC_015161	GCCCAG	2	12	1127865	1127876	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015161	AGGGGC	3	18	1148364	1148381	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015161	GGCGGG	2	12	1155108	1155119	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015161	CGGCTG	2	12	1196553	1196564	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015161	GATGTT	2	12	1196586	1196597	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015161	CCTGCA	2	12	1207921	1207932	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015161	CTTTCC	2	12	1224651	1224662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015161	CGTACT	2	12	1233375	1233386	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015161	CCTGCT	2	12	1249498	1249509	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015161	CTGTCC	2	12	1308500	1308511	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015161	CTGGTG	2	12	1331953	1331964	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015161	TCAGGC	2	12	1369547	1369558	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015161	CGGCCA	2	12	1399088	1399099	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015161	ACGTTT	2	12	1429405	1429416	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015161	GCCGCA	2	12	1457997	1458008	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015161	TGCTCG	2	12	1467940	1467951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015161	CGGCCA	2	12	1481099	1481110	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015161	GGCACG	2	12	1481149	1481160	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015161	GCAGTA	2	12	1481416	1481427	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015161	TCTCCT	2	12	1499631	1499642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015161	CCTTGA	2	12	1527992	1528003	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015161	GGCCGG	2	12	1560415	1560426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015161	GCACCC	2	12	1580797	1580808	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015161	CCTTTC	2	12	1594383	1594394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015161	CCACAC	2	12	1611589	1611600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_015161	TGTATT	2	12	1615308	1615319	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015161	CTTACC	2	12	1639705	1639716	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015161	TTTCTA	2	12	1673835	1673846	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015161	GCAGGC	2	12	1690015	1690026	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015161	CGGCCC	2	12	1700021	1700032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_015161	GCCGGA	2	12	1701908	1701919	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015161	GCGCCC	2	12	1737547	1737558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_015161	GCGGGC	2	12	1743458	1743469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015161	CGGCCC	2	12	1793866	1793877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_015161	GCACCC	2	12	1805368	1805379	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015161	GCCGGG	2	12	1805426	1805437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015161	GCGCGG	2	12	1823234	1823245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015161	ACCCCG	2	12	1829782	1829793	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_015161	CCCGGC	2	12	1831929	1831940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_015161	CCCCCT	2	12	1832631	1832642	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
101	NC_015161	GCCTCT	2	12	1835873	1835884	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015161	GCTGAA	2	12	1836091	1836102	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015161	GCAGAG	2	12	1837807	1837818	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_015161	GGGCTG	2	12	1874353	1874364	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_015161	CCGCCT	2	12	1875391	1875402	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_015161	TCACCT	2	12	1896339	1896350	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015161	CAGGCG	2	12	1934201	1934212	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015161	GGGCGC	2	12	1940780	1940791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015161	TCCTGT	2	12	1981451	1981462	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015161	AAGGCG	2	12	1990246	1990257	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015161	CATAGC	2	12	2029612	2029623	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015161	CCGAAA	2	12	2035750	2035761	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015161	GCGGGC	2	12	2039127	2039138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015161	GCCTAC	2	12	2041407	2041418	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015161	GGCCCC	2	12	2041473	2041484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_015161	AGGGCA	2	12	2068207	2068218	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015161	TGAGGG	2	12	2076055	2076066	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015161	GCTCCC	2	12	2099281	2099292	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015161	GCGGCA	2	12	2105854	2105865	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015161	GGGGCC	2	12	2116830	2116841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015161	GCCCGC	2	12	2129180	2129191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.