MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma suis str. Illinois chromosome

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015155	TAAATC	2	12	19791	19802	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015155	TAGATT	2	12	19813	19824	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015155	ACTAAC	2	12	19847	19858	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015155	GAAAAA	2	12	29986	29997	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015155	TTAAAA	2	12	34991	35002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015155	TTAAAA	2	12	36999	37010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015155	TTAAAA	2	12	39839	39850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015155	ATGTCT	2	12	106275	106286	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015155	TAGGAA	2	12	145769	145780	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015155	CAGGAT	2	12	155993	156004	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015155	CTTTAG	2	12	185301	185312	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015155	TTTAAA	2	12	246042	246053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015155	CACTTT	2	12	270629	270640	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015155	CTAGAA	2	12	287808	287819	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015155	TTAAAT	2	12	293647	293658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015155	TATATT	2	12	350427	350438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015155	ATTTAA	2	12	353569	353580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015155	AACATA	2	12	371862	371873	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015155	TTATTT	2	12	375687	375698	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015155	GAAAAA	2	12	386703	386714	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015155	GAAAAA	2	12	402711	402722	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015155	TCTTTT	2	12	437695	437706	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015155	CTTTTT	2	12	437815	437826	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015155	AGAAGC	2	12	453576	453587	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015155	TTTATA	2	12	454929	454940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015155	TATAAA	2	12	458436	458447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015155	TATTTT	2	12	462361	462372	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015155	GTTTTT	2	12	473074	473085	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015155	AAAAAG	2	12	482421	482432	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015155	GAACTA	2	12	498989	499000	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015155	GAACTA	2	12	501525	501536	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015155	AAAAGA	2	12	507736	507747	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015155	ATTTTC	2	12	509913	509924	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015155	ATTTTT	2	12	519273	519284	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015155	TAAAGA	2	12	546232	546243	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015155	TTGCAA	2	12	558039	558050	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015155	AAAGAG	2	12	600119	600130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015155	GAAACT	2	12	616195	616206	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015155	TTTGTG	2	12	626169	626180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015155	TTTTTA	2	12	634507	634518	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015155	ATTTAA	2	12	641209	641220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015155	TGGAGC	2	12	649699	649710	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015155	AAAGAG	2	12	659081	659092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015155	GAAAAC	2	12	660082	660093	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015155	AAGAAA	2	12	668791	668802	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015155	ATAAAA	2	12	681894	681905	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015155	TTTCTT	2	12	718246	718257	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.