MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma suis str. Illinois chromosome

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015155	TAAAT	2	10	1133	1142	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015155	ACTAA	2	10	6279	6288	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015155	TGTAG	2	10	39737	39746	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015155	TAATT	2	10	50843	50852	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015155	ATTTA	2	10	119875	119884	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015155	TTAAA	2	10	128582	128591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015155	TTTTC	2	10	163727	163736	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015155	AAATT	2	10	170107	170116	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015155	AAGAA	2	10	183029	183038	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015155	TTCTT	2	10	183053	183062	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015155	GTTTT	2	10	188355	188364	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015155	AGAGA	2	10	201419	201428	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015155	TAAAT	2	10	204798	204807	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015155	TTTAA	2	10	226508	226517	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015155	CTACT	2	10	250230	250239	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_015155	TTTAG	2	10	256499	256508	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015155	GAGAA	2	10	256805	256814	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015155	TAAAT	2	10	264753	264762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015155	ATTTA	2	10	287464	287473	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015155	AGTTA	2	10	288537	288546	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015155	TCTAA	2	10	289694	289703	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015155	TCTTT	2	10	302555	302564	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015155	CTTTT	2	10	325867	325876	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015155	AGAAA	2	10	327219	327228	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015155	AAAAG	2	10	330093	330102	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015155	TAAGA	2	10	350387	350396	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015155	ATTTT	2	10	350413	350422	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015155	ACTAA	2	10	354647	354656	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015155	AGATT	2	10	360073	360082	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015155	TAGTT	2	10	375252	375261	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015155	TCCCT	2	10	375891	375900	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_015155	AGAGG	2	10	380822	380831	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015155	AATTA	2	10	398779	398788	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015155	AGTCT	2	10	400743	400752	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015155	ATTTA	2	10	424380	424389	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015155	ATTTA	2	10	458336	458345	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015155	TTAAT	2	10	459077	459086	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015155	AGAAA	2	10	474709	474718	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015155	AAATT	2	10	483154	483163	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015155	GAAAA	2	10	484344	484353	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015155	ACTTG	2	10	484746	484755	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_015155	AAATT	2	10	494124	494133	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015155	TTCAA	2	10	499320	499329	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015155	TTCTT	2	10	503658	503667	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_015155	AAATT	2	10	516821	516830	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015155	CTTTT	2	10	517808	517817	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015155	CTTAA	2	10	519926	519935	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015155	CTTTT	2	10	534775	534784	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015155	AATTT	2	10	542255	542264	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015155	AGTTA	2	10	549303	549312	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015155	TTAAA	2	10	551227	551236	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015155	AAATT	2	10	557682	557691	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015155	CAGCG	2	10	564680	564689	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_015155	TTTAA	2	10	581455	581464	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015155	TTAAA	2	10	588392	588401	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015155	GGCTG	2	10	598366	598375	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015155	TTTCT	2	10	600294	600303	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015155	GAAAA	2	10	605796	605805	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015155	AGTAA	2	10	615703	615712	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015155	CATTC	2	10	625897	625906	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_015155	GTTAA	2	10	626917	626926	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015155	TAAAT	2	10	626945	626954	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015155	CTTCT	2	10	627260	627269	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_015155	CACTT	2	10	628922	628931	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_015155	TTAAT	2	10	630056	630065	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015155	GTTTG	2	10	633681	633690	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015155	AATTA	2	10	636490	636499	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015155	GAAAA	2	10	647304	647313	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015155	TAAAA	2	10	648914	648923	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015155	AATTA	2	10	649038	649047	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015155	GAAAA	2	10	649256	649265	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015155	CTAGT	2	10	650184	650193	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_015155	CAAAT	2	10	652169	652178	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015155	TCCCC	2	10	652708	652717	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
75	NC_015155	CTTAA	2	10	652719	652728	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015155	ACTTA	2	10	655085	655094	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015155	AAATT	2	10	658701	658710	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015155	AATGG	2	10	658770	658779	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015155	AACAA	2	10	660300	660309	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_015155	CTTAA	2	10	665163	665172	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015155	AGAGA	2	10	685452	685461	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015155	CTAAA	2	10	685875	685884	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015155	ATTAA	2	10	707584	707593	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015155	TCTTT	2	10	708002	708011	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_015155	TACCT	2	10	716006	716015	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_015155	AATTT	2	10	717337	717346	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015155	TTTTG	2	10	718557	718566	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015155	TTTGA	2	10	718867	718876	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015155	CTAAA	2	10	722964	722973	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.