MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma suis str. Illinois chromosome

Total Repeats: 429

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015155	ATTA	3	12	1120	1131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015155	TTAA	2	8	1150	1157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015155	TAGA	3	12	1160	1171	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015155	ATTA	3	12	1179	1190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015155	TACT	2	8	6345	6352	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015155	TAGG	2	8	9729	9736	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015155	TTAA	2	8	16395	16402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015155	TCCC	2	8	17774	17781	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_015155	CATG	3	12	19586	19597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015155	TAGT	2	8	29468	29475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015155	CTTT	2	8	30037	30044	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015155	ATAA	2	8	30133	30140	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015155	TACT	2	8	30182	30189	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015155	AAAT	2	8	35020	35027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015155	AAAG	2	8	39255	39262	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015155	AAGA	2	8	46557	46564	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015155	AGTA	2	8	46780	46787	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015155	CTAA	2	8	48298	48305	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015155	AGTT	2	8	48329	48336	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015155	TTAG	2	8	49163	49170	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015155	TTAA	2	8	50126	50133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015155	TTTA	2	8	53979	53986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015155	TTAT	2	8	55473	55480	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015155	ATTA	3	12	55482	55493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015155	TTAA	2	8	55527	55534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015155	ATTA	2	8	55550	55557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015155	ATTA	2	8	57056	57063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015155	TAAA	2	8	62724	62731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015155	TAGT	2	8	62732	62739	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015155	ACTA	2	8	68781	68788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015155	GCTA	2	8	68887	68894	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015155	AATT	2	8	78176	78183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015155	TTTC	2	8	78997	79004	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015155	TAGA	2	8	82222	82229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015155	AGAA	2	8	84117	84124	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015155	ATTA	2	8	84136	84143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015155	TATT	2	8	84536	84543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015155	AATG	2	8	84577	84584	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015155	AGTT	2	8	84594	84601	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015155	ACTT	2	8	89750	89757	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015155	TAGT	2	8	93321	93328	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015155	TTAA	2	8	93401	93408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015155	AAGA	2	8	104795	104802	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015155	AAAG	2	8	106346	106353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015155	ATTA	2	8	108398	108405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015155	AAAT	2	8	112474	112481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015155	GCAG	2	8	115005	115012	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015155	TAGT	2	8	115021	115028	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015155	GAAG	2	8	115047	115054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015155	ATTA	2	8	119905	119912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015155	ATAA	2	8	119918	119925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015155	AATT	2	8	122919	122926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015155	AAAT	2	8	124151	124158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015155	TTAG	2	8	124165	124172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015155	ATTA	2	8	126112	126119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015155	AATT	2	8	131172	131179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015155	ATAA	2	8	131863	131870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015155	AAGT	2	8	132146	132153	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015155	TCCC	2	8	132205	132212	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_015155	CTAA	2	8	132610	132617	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015155	TAAT	2	8	136231	136238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015155	TTTA	2	8	137448	137455	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015155	TAAA	2	8	138169	138176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015155	TAAT	2	8	139084	139091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015155	ATTT	2	8	143392	143399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015155	TCTT	2	8	145821	145828	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015155	CCTT	2	8	146856	146863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015155	AAGG	2	8	148120	148127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015155	TTAT	2	8	152488	152495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015155	TCTT	2	8	152579	152586	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015155	GAGG	2	8	156064	156071	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015155	AGTA	2	8	156961	156968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015155	GTTT	2	8	157023	157030	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015155	ATTT	2	8	157082	157089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015155	ATTA	2	8	157108	157115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015155	TAAT	2	8	159170	159177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015155	TGGA	2	8	160705	160712	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015155	TAGT	2	8	160820	160827	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015155	AAAT	2	8	163704	163711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015155	TAGT	2	8	163768	163775	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015155	TAAA	2	8	167965	167972	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015155	ATTA	2	8	168074	168081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015155	TTAA	2	8	168731	168738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015155	ATTA	2	8	169502	169509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015155	TTCT	2	8	174663	174670	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015155	GTTT	2	8	178723	178730	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015155	TTAA	2	8	178734	178741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015155	CTTT	2	8	179870	179877	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015155	TTTA	2	8	186200	186207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015155	TTAA	2	8	188408	188415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015155	ATTA	2	8	188503	188510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015155	ATTT	2	8	191388	191395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015155	ATAA	2	8	195177	195184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015155	TAAA	2	8	198283	198290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015155	TTAA	2	8	198314	198321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015155	AATT	2	8	199411	199418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015155	ATAA	2	8	200464	200471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015155	ATTT	2	8	206467	206474	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015155	TTAA	2	8	206584	206591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015155	TTAA	2	8	206626	206633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015155	TAAA	2	8	207142	207149	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015155	TTAG	2	8	211715	211722	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015155	ATTA	2	8	212503	212510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015155	TAAT	2	8	213533	213540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015155	TAAT	2	8	213986	213993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015155	ATTA	2	8	214024	214031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015155	TAGT	2	8	214464	214471	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015155	TTTA	2	8	215511	215518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015155	AAAT	2	8	217518	217525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015155	AATA	2	8	217587	217594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015155	TAAA	2	8	218784	218791	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015155	TTTA	2	8	226496	226503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015155	AGTT	2	8	228513	228520	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015155	AGGA	2	8	230517	230524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015155	TAGA	2	8	234662	234669	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015155	AATT	2	8	236287	236294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015155	AAGA	2	8	236400	236407	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015155	AATT	2	8	238612	238619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015155	TATT	2	8	246026	246033	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015155	CTTT	2	8	250114	250121	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015155	GAAA	2	8	250570	250577	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015155	AAGT	2	8	254050	254057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015155	TAGT	2	8	256584	256591	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015155	AAGA	2	8	259607	259614	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015155	CTTT	2	8	263955	263962	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015155	AAGT	2	8	270556	270563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015155	TTAG	2	8	272439	272446	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015155	CTAA	2	8	272501	272508	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015155	AAAT	2	8	273752	273759	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015155	TTAA	2	8	287378	287385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015155	ATAA	2	8	287544	287551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015155	AATT	2	8	287565	287572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015155	AAAG	2	8	287677	287684	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015155	AGAT	2	8	287948	287955	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015155	ATAA	2	8	287973	287980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015155	ATTA	2	8	289744	289751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015155	TTAA	2	8	293511	293518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015155	CTTA	2	8	302580	302587	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015155	TAGG	2	8	309865	309872	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015155	AATA	2	8	310049	310056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015155	CTTA	2	8	310128	310135	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015155	CTAA	2	8	315641	315648	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015155	AAGT	2	8	323001	323008	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015155	TACT	2	8	324524	324531	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015155	TAAA	2	8	325158	325165	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015155	TAAC	2	8	325328	325335	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015155	TTAA	2	8	328714	328721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015155	TAAA	2	8	328722	328729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015155	TTAT	2	8	328747	328754	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015155	TAAT	2	8	328882	328889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015155	TAAA	2	8	330792	330799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015155	TTAA	2	8	330803	330810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015155	TAAT	2	8	330863	330870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.