MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma suis KI3806

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015153	TAAATC	2	12	20489	20500	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015153	TAGATT	2	12	20511	20522	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015153	ACTAAC	2	12	20545	20556	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015153	TTAAAA	2	12	35737	35748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015153	TTAAAA	2	12	38590	38601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015153	GAAAGT	2	12	41331	41342	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015153	AATCCT	2	12	77017	77028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015153	ATGTCT	2	12	102596	102607	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015153	GAATCT	2	12	108269	108280	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015153	TAAAAA	2	12	109925	109936	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015153	ACAAAA	2	12	130174	130185	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015153	AAAAAG	2	12	140507	140518	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015153	TAGGAA	2	12	144747	144758	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015153	ATATTT	2	12	175526	175537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015153	ATTTAG	2	12	183734	183745	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015153	TTTAAA	2	12	205162	205173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015153	TTAAAT	2	12	252751	252762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015153	GGTGGA	2	12	290627	290638	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015153	AGAAAT	2	12	290917	290928	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015153	AATCAA	2	12	292308	292319	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015153	TATATT	2	12	309466	309477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015153	ATTTAA	2	12	312609	312620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015153	TGAAGT	2	12	330824	330835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015153	AACATA	2	12	330942	330953	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015153	TTATTT	2	12	334767	334778	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015153	GAAAAA	2	12	345656	345667	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015153	GAAAAA	2	12	361678	361689	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015153	TCTTTT	2	12	396655	396666	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015153	CTTTTT	2	12	396775	396786	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015153	ATTTTT	2	12	400579	400590	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015153	AGAAGC	2	12	412545	412556	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015153	TTTATA	2	12	413899	413910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015153	TATAAA	2	12	417406	417417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015153	TTTTTA	2	12	419413	419424	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015153	TAAAAA	2	12	421255	421266	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015153	TATTTT	2	12	432304	432315	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015153	AAAAGA	2	12	483801	483812	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015153	ACCCCC	2	12	517808	517819	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
39	NC_015153	GGAACC	2	12	534438	534449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015153	TTGCAA	2	12	535829	535840	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015153	AAAGAG	2	12	575787	575798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015153	AATTTA	2	12	589553	589564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015153	TTTGTG	2	12	598374	598385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015153	TTTTTA	2	12	607427	607438	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015153	ATTTAA	2	12	614133	614144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015153	TGGAGC	2	12	622623	622634	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015153	AAGAAA	2	12	641721	641732	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015153	ATAAAA	2	12	650326	650337	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.