MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma suis KI3806

Total Repeats: 321

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015153	TTTTGA	2	12	2295	2306	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	325989362
2	NC_015153	ATGTAA	2	12	4295	4306	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325989364
3	NC_015153	AGATTT	2	12	9507	9518	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	325989371
4	NC_015153	AAAGAT	2	12	10351	10362	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989371
5	NC_015153	AAGAAA	2	12	10908	10919	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989372
6	NC_015153	AGGGGA	2	12	16505	16516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325989376
7	NC_015153	TAGAAG	2	12	17463	17474	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325989377
8	NC_015153	ACATCA	2	12	18360	18371	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	325989379
9	NC_015153	TGGAAA	2	12	21388	21399	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325989381
10	NC_015153	TATTTA	2	12	27050	27061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325989384
11	NC_015153	AACTTA	2	12	31037	31048	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325989388
12	NC_015153	TGAAAA	2	12	36584	36595	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989392
13	NC_015153	AGAAAA	2	12	36889	36900	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989393
14	NC_015153	TGAAGA	2	12	39245	39256	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325989395
15	NC_015153	AAAGAG	2	12	42985	42996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325989399
16	NC_015153	AGAAAA	2	12	44275	44286	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989400
17	NC_015153	AATTCA	2	12	44399	44410	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325989400
18	NC_015153	CTTTAG	2	12	44458	44469	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325989401
19	NC_015153	AAATTC	2	12	44652	44663	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325989401
20	NC_015153	CTTATT	2	12	45226	45237	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	325989402
21	NC_015153	TAGGAA	2	12	46393	46404	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325989404
22	NC_015153	CTGAAG	2	12	47979	47990	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325989406
23	NC_015153	AGAAAA	2	12	53266	53277	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989412
24	NC_015153	CTCTTT	2	12	54387	54398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325989412
25	NC_015153	TCAAGA	2	12	54695	54706	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325989412
26	NC_015153	TTAGTT	2	12	59468	59479	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	325989417
27	NC_015153	AAATTC	2	12	60290	60301	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325989418
28	NC_015153	AAATAA	2	12	61338	61349	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	325989419
29	NC_015153	AAGTAA	2	12	61975	61986	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989419
30	NC_015153	GAGAAG	2	12	62301	62312	50 %	0 %	50 %	0 %	325989419
31	NC_015153	AAAAGA	2	12	62537	62548	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989420
32	NC_015153	AGATGC	2	12	63108	63119	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325989420
33	NC_015153	TATTTT	2	12	66183	66194	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	325989423
34	NC_015153	TTGCTT	2	12	66387	66398	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325989423
35	NC_015153	GTCTGG	2	12	74646	74657	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	325989431
36	NC_015153	ATTCAG	2	12	80565	80576	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325989436
37	NC_015153	AATAGC	2	12	81379	81390	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325989438
38	NC_015153	AAAGAA	2	12	82739	82750	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989439
39	NC_015153	AAAGAA	2	12	83285	83296	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989439
40	NC_015153	GAAAAT	2	12	84306	84317	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989440
41	NC_015153	AACAGG	2	12	84623	84634	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	325989441
42	NC_015153	AAAGAA	2	12	89425	89436	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989447
43	NC_015153	ATTCAG	2	12	89576	89587	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325989447
44	NC_015153	AAGGAA	2	12	91273	91284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325989448
45	NC_015153	TTTTTG	2	12	92431	92442	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	325989449
46	NC_015153	CTTTTA	2	12	93804	93815	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	325989449
47	NC_015153	TGTTCT	2	12	94070	94081	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325989449
48	NC_015153	TAGCTT	2	12	94524	94535	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325989450
49	NC_015153	TTCTTT	2	12	96479	96490	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	325989453
50	NC_015153	GAAACT	2	12	99225	99236	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325989458
51	NC_015153	AAGAAA	2	12	102229	102240	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989463
52	NC_015153	ATGGTG	2	12	103704	103715	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	325989465
53	NC_015153	AACACT	2	12	105680	105691	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	325989468
54	NC_015153	ATGGAA	2	12	105924	105935	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325989468
55	NC_015153	TACTTC	2	12	110697	110708	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	325989476
56	NC_015153	AGAAAA	2	12	112145	112156	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989477
57	NC_015153	AAAAAC	2	12	113326	113337	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	325989479
58	NC_015153	AAAAAG	2	12	113755	113766	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989480
59	NC_015153	AGTCTT	2	12	118719	118730	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325989489
60	NC_015153	TTGGAG	2	12	121027	121038	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	325989495
61	NC_015153	GAGATG	2	12	124424	124435	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	325989500
62	NC_015153	AGAATG	2	12	129900	129911	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325989508
63	NC_015153	AAAAAC	2	12	132586	132597	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	325989513
64	NC_015153	TTGAAA	2	12	134528	134539	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325989516
65	NC_015153	AGATAA	2	12	136863	136874	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989520
66	NC_015153	TCTTCC	2	12	141606	141617	0 %	50 %	0 %	50 %	325989528
67	NC_015153	AATTTC	2	12	148420	148431	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	325989537
68	NC_015153	AACTTG	2	12	148475	148486	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325989537
69	NC_015153	CAAAAA	2	12	150975	150986	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	325989541
70	NC_015153	AGTTCA	2	12	152936	152947	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325989544
71	NC_015153	TCAAAG	2	12	154100	154111	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325989546
72	NC_015153	CAGGAT	2	12	154954	154965	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325989547
73	NC_015153	AAAAAG	2	12	157152	157163	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989549
74	NC_015153	AGATAA	2	12	162681	162692	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989559
75	NC_015153	TTAGAG	2	12	163180	163191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325989560
76	NC_015153	AAAAAG	2	12	163587	163598	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989560
77	NC_015153	AGATTT	2	12	167675	167686	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	325989569
78	NC_015153	TAAAGA	2	12	169235	169246	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989571
79	NC_015153	TAGGTT	2	12	170273	170284	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	325989573
80	NC_015153	AAAGAA	2	12	171195	171206	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989574
81	NC_015153	AAAAAG	2	12	171406	171417	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989574
82	NC_015153	GGAGAA	2	12	173062	173073	50 %	0 %	50 %	0 %	325989577
83	NC_015153	AGAAAT	2	12	177724	177735	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989582
84	NC_015153	TTCTGA	2	12	181515	181526	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325989584
85	NC_015153	AAAGAT	2	12	185950	185961	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989585
86	NC_015153	TGACTT	2	12	187916	187927	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325989588
87	NC_015153	TATGAG	2	12	189078	189089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325989589
88	NC_015153	TCTAAA	2	12	190223	190234	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325989590
89	NC_015153	GAAACA	2	12	191409	191420	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	325989591
90	NC_015153	AAGGTA	2	12	192525	192536	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325989592
91	NC_015153	AGCTAG	2	12	193387	193398	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325989592
92	NC_015153	TAGAAA	2	12	194475	194486	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989595
93	NC_015153	TTTAAG	2	12	194504	194515	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	325989595
94	NC_015153	TTTTCA	2	12	197038	197049	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	325989599
95	NC_015153	AAAACT	2	12	203036	203047	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	325989604
96	NC_015153	AATTGA	2	12	205778	205789	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325989606
97	NC_015153	AAAAGA	2	12	207732	207743	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989607
98	NC_015153	TTGAAG	2	12	210503	210514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325989609
99	NC_015153	GAAAAA	2	12	213991	214002	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325989612
100	NC_015153	TAACTT	2	12	216179	216190	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	325989615
101	NC_015153	AATAGT	2	12	217135	217146	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325989615
102	NC_015153	ATTTTT	2	12	217254	217265	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	325989615
103	NC_015153	TTACTT	2	12	217564	217575	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	325989615
104	NC_015153	TTTGTA	2	12	217721	217732	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	325989615
105	NC_015153	TTTAGG	2	12	219274	219285	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	325989617
106	NC_015153	TTTAGG	2	12	220303	220314	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	325989619
107	NC_015153	CTTCAG	2	12	222068	222079	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325989622
108	NC_015153	CACTTT	2	12	229734	229745	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	325989636
109	NC_015153	TCAATA	2	12	235882	235893	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325989643
110	NC_015153	AGCTCT	2	12	236371	236382	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325989643
111	NC_015153	ATGTTT	2	12	236778	236789	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	325989643
112	NC_015153	TTTATA	2	12	238137	238148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325989644
113	NC_015153	ATTCTC	2	12	240369	240380	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	325989645
114	NC_015153	TCTGAT	2	12	241940	241951	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325989645
115	NC_015153	TAAAGA	2	12	244774	244785	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989646
116	NC_015153	TGAATT	2	12	256003	256014	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	325989657
117	NC_015153	AGACTT	2	12	260262	260273	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325989661
118	NC_015153	TCTAAA	2	12	266181	266192	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325989664
119	NC_015153	TATCAA	2	12	267426	267437	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325989665
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121	NC_015153	TCCCTT	2	12	272176	272187	0 %	50 %	0 %	50 %	325989668
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231	NC_015153	CCTTTC	2	12	519438	519449	0 %	50 %	0 %	50 %	325989982
232	NC_015153	CAACTA	2	12	520454	520465	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	325989983
233	NC_015153	ATAAGA	2	12	529681	529692	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325989994
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235	NC_015153	TTTGGA	2	12	532887	532898	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	325989996
236	NC_015153	AATGGA	2	12	534540	534551	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325989998
237	NC_015153	ACTTCT	2	12	538853	538864	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	325990002
238	NC_015153	AGCTAT	2	12	544345	544356	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325990002
239	NC_015153	TACATT	2	12	546974	546985	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	325990003
240	NC_015153	TCAATT	2	12	548917	548928	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	325990005
241	NC_015153	GCTATA	2	12	549508	549519	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325990005
242	NC_015153	GGAAGA	2	12	549754	549765	50 %	0 %	50 %	0 %	325990005
243	NC_015153	ATTTCT	2	12	553744	553755	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	325990008
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.