MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma suis KI3806

Total Repeats: 444

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015153	ATTA	3	12	1828	1839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015153	ATTA	2	8	1844	1851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015153	TTAA	2	8	1853	1860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015153	TAGA	3	12	1863	1874	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015153	ATTA	3	12	1882	1893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015153	TACT	2	8	7046	7053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015153	TAGG	2	8	10430	10437	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015153	AACT	2	8	11852	11859	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015153	TTAC	2	8	11900	11907	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015153	CTAT	2	8	11911	11918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015153	TTAA	2	8	17094	17101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015153	TCCC	2	8	18472	18479	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_015153	CCTT	2	8	20081	20088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015153	CATG	3	12	20284	20295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015153	TAGT	2	8	30166	30173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015153	CTTT	2	8	30734	30741	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015153	ATAA	2	8	30830	30837	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015153	AGGT	2	8	33675	33682	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015153	TAAA	2	8	41203	41210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015153	AAAG	2	8	41391	41398	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015153	TAAA	2	8	42447	42454	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015153	TAAT	2	8	42492	42499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015153	CTAA	2	8	48876	48883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015153	TAAA	2	8	49097	49104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015153	TTAT	2	8	50361	50368	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015153	ATTA	3	12	50370	50381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015153	TTAA	2	8	50415	50422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015153	ATTA	2	8	50438	50445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015153	ATTA	2	8	51944	51951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015153	TAAA	2	8	57594	57601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015153	TAGT	2	8	57602	57609	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015153	ACTA	2	8	63652	63659	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015153	GCTA	2	8	63758	63765	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015153	AATT	2	8	73047	73054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015153	TTTC	2	8	73868	73875	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015153	TAAC	2	8	75449	75456	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015153	CAAA	2	8	75556	75563	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015153	TACT	2	8	75672	75679	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015153	CTTT	2	8	76112	76119	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015153	AGAA	2	8	76232	76239	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015153	TAGA	2	8	77093	77100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015153	AGAA	2	8	78991	78998	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015153	ATTA	2	8	79010	79017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015153	AATG	2	8	79449	79456	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015153	AGTT	2	8	79466	79473	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015153	TTAA	2	8	79490	79497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015153	ACTT	2	8	86065	86072	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015153	TAGT	2	8	89642	89649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015153	TTAA	2	8	89722	89729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015153	AAGA	2	8	101116	101123	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015153	AAAG	2	8	102667	102674	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015153	ATTA	2	8	104718	104725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015153	ATTT	2	8	108353	108360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015153	AGAA	2	8	108623	108630	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015153	AAAT	2	8	109893	109900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015153	GTTA	2	8	110029	110036	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015153	TAGT	2	8	112461	112468	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015153	GAAG	2	8	112487	112494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015153	TAAA	2	8	112740	112747	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015153	CATG	2	8	114019	114026	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015153	TAGT	2	8	114688	114695	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015153	ATTA	2	8	117345	117352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015153	ATAA	2	8	117358	117365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015153	AAAT	2	8	121588	121595	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015153	TTAG	2	8	121602	121609	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015153	ATTA	2	8	123551	123558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015153	AATT	2	8	130638	130645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015153	AAGA	2	8	131475	131482	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015153	AAGT	2	8	131643	131650	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015153	TAAA	2	8	131714	131721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015153	ATTT	2	8	132091	132098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015153	CTAA	2	8	132111	132118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015153	TAAA	2	8	137087	137094	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015153	TAAT	2	8	137999	138006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015153	GAAC	2	8	140322	140329	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015153	CAAG	2	8	140539	140546	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015153	ATTA	2	8	141148	141155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015153	TAAA	2	8	142342	142349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015153	TAAA	2	8	143510	143517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015153	TCTT	2	8	144799	144806	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015153	CCTT	2	8	145834	145841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015153	TTAT	2	8	151461	151468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015153	TTAA	2	8	155919	155926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015153	TTTG	2	8	155998	156005	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015153	ATTT	2	8	156056	156063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015153	ATTA	2	8	156082	156089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015153	TAAT	2	8	158128	158135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015153	TAGT	2	8	159775	159782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015153	TTGA	2	8	164487	164494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015153	ATTT	2	8	165589	165596	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015153	TTAA	2	8	165706	165713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015153	TTAA	2	8	165748	165755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015153	TAAA	2	8	166262	166269	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015153	TTAG	2	8	170835	170842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015153	ATTA	2	8	171623	171630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015153	TAAT	2	8	172653	172660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015153	TAAT	2	8	173106	173113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015153	ATTA	2	8	173144	173151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015153	TTTA	2	8	174631	174638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015153	AATT	2	8	175561	175568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015153	TGAA	2	8	175829	175836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015153	GAAG	2	8	175840	175847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015153	AACT	2	8	176366	176373	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015153	AAAT	2	8	176637	176644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015153	AATA	2	8	176706	176713	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015153	TAAA	2	8	177904	177911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015153	TCAA	2	8	179939	179946	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015153	AATT	2	8	180078	180085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015153	TATT	2	8	180276	180283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015153	AAGA	2	8	180566	180573	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015153	TTAT	2	8	180713	180720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015153	ACAG	2	8	180782	180789	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015153	ATAG	2	8	181228	181235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015153	ATAA	2	8	183556	183563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015153	TTGG	2	8	183635	183642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015153	CAAT	2	8	184493	184500	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015153	TTCT	2	8	184681	184688	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015153	TCTT	2	8	184689	184696	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015153	AAGA	2	8	184707	184714	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015153	GGAA	2	8	184926	184933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015153	AAAT	2	8	185096	185103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015153	CTAT	2	8	185109	185116	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015153	TTTA	2	8	185617	185624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015153	AGTT	2	8	187633	187640	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015153	AGGA	2	8	189637	189644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015153	TAGA	2	8	193782	193789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015153	AATT	2	8	197732	197739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015153	TATT	2	8	205146	205153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015153	GAAA	2	8	209689	209696	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015153	AAGT	2	8	213177	213184	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015153	TAGT	2	8	215711	215718	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015153	AAGA	2	8	218734	218741	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015153	CTTT	2	8	223086	223093	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015153	TTTG	2	8	228010	228017	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015153	AAGT	2	8	229663	229670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015153	TTAG	2	8	231544	231551	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015153	CTAA	2	8	231606	231613	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015153	AAAT	2	8	232857	232864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015153	TTAA	2	8	246485	246492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015153	ATAA	2	8	246651	246658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015153	AATT	2	8	246672	246679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015153	ATTA	2	8	248851	248858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015153	ATCT	2	8	250892	250899	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015153	ACTG	2	8	250933	250940	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015153	AATA	2	8	250950	250957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015153	TCAG	2	8	250958	250965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015153	TTAA	2	8	252615	252622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015153	CTTA	2	8	261682	261689	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015153	TAGG	2	8	268967	268974	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015153	AATA	2	8	269151	269158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015153	CTTA	2	8	269230	269237	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_015153	CTAA	2	8	274753	274760	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_015153	CTAA	2	8	282611	282618	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.