MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 2039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015152	CTGAA	2	10	670	679	40 %	20 %	20 %	20 %	325969850
2	NC_015152	CAAAC	2	10	1207	1216	60 %	0 %	0 %	40 %	325969850
3	NC_015152	ATCAT	2	10	2800	2809	40 %	40 %	0 %	20 %	325969851
4	NC_015152	TGGAA	2	10	3090	3099	40 %	20 %	40 %	0 %	325969852
5	NC_015152	GTGAA	2	10	3132	3141	40 %	20 %	40 %	0 %	325969852
6	NC_015152	CCAAT	2	10	5365	5374	40 %	20 %	0 %	40 %	325969856
7	NC_015152	ATCAG	2	10	5392	5401	40 %	20 %	20 %	20 %	325969856
8	NC_015152	TGGCT	2	10	6018	6027	0 %	40 %	40 %	20 %	325969856
9	NC_015152	CTTCC	2	10	6438	6447	0 %	40 %	0 %	60 %	325969856
10	NC_015152	TGAAG	2	10	6701	6710	40 %	20 %	40 %	0 %	325969856
11	NC_015152	CTGAG	2	10	13672	13681	20 %	20 %	40 %	20 %	325969862
12	NC_015152	AAGGA	2	10	14052	14061	60 %	0 %	40 %	0 %	325969863
13	NC_015152	AATCA	2	10	16821	16830	60 %	20 %	0 %	20 %	325969865
14	NC_015152	CCTTT	2	10	18146	18155	0 %	60 %	0 %	40 %	325969866
15	NC_015152	TTGCC	2	10	19341	19350	0 %	40 %	20 %	40 %	325969868
16	NC_015152	CCCAG	2	10	19424	19433	20 %	0 %	20 %	60 %	325969868
17	NC_015152	GAAGC	2	10	23061	23070	40 %	0 %	40 %	20 %	325969871
18	NC_015152	TGGCA	2	10	24989	24998	20 %	20 %	40 %	20 %	325969872
19	NC_015152	TCGCC	2	10	25890	25899	0 %	20 %	20 %	60 %	325969873
20	NC_015152	GCGTT	2	10	26312	26321	0 %	40 %	40 %	20 %	325969873
21	NC_015152	ACTGC	2	10	27088	27097	20 %	20 %	20 %	40 %	325969873
22	NC_015152	CTTCA	2	10	27525	27534	20 %	40 %	0 %	40 %	325969874
23	NC_015152	GACAA	2	10	28152	28161	60 %	0 %	20 %	20 %	325969874
24	NC_015152	GTACA	2	10	28593	28602	40 %	20 %	20 %	20 %	325969874
25	NC_015152	CGAAG	2	10	30472	30481	40 %	0 %	40 %	20 %	325969876
26	NC_015152	CCATA	2	10	33535	33544	40 %	20 %	0 %	40 %	325969878
27	NC_015152	CAGGG	2	10	34709	34718	20 %	0 %	60 %	20 %	325969878
28	NC_015152	GAAGA	2	10	35267	35276	60 %	0 %	40 %	0 %	325969879
29	NC_015152	TGGAA	2	10	36815	36824	40 %	20 %	40 %	0 %	325969881
30	NC_015152	TCCGC	2	10	36930	36939	0 %	20 %	20 %	60 %	325969881
31	NC_015152	TTTGG	2	10	39979	39988	0 %	60 %	40 %	0 %	325969883
32	NC_015152	AGCCT	2	10	40498	40507	20 %	20 %	20 %	40 %	325969883
33	NC_015152	AGTTG	2	10	43263	43272	20 %	40 %	40 %	0 %	325969885
34	NC_015152	GCAAG	2	10	46924	46933	40 %	0 %	40 %	20 %	325969888
35	NC_015152	ACAGG	2	10	47487	47496	40 %	0 %	40 %	20 %	325969888
36	NC_015152	TTACT	2	10	48332	48341	20 %	60 %	0 %	20 %	325969890
37	NC_015152	AAACC	2	10	49171	49180	60 %	0 %	0 %	40 %	325969890
38	NC_015152	GCTTG	2	10	51890	51899	0 %	40 %	40 %	20 %	325969891
39	NC_015152	CATAC	2	10	54242	54251	40 %	20 %	0 %	40 %	325969894
40	NC_015152	GAGCA	2	10	55610	55619	40 %	0 %	40 %	20 %	325969895
41	NC_015152	AGGAT	2	10	59654	59663	40 %	20 %	40 %	0 %	325969898
42	NC_015152	CTGCC	2	10	62412	62421	0 %	20 %	20 %	60 %	325969901
43	NC_015152	GTACG	2	10	67480	67489	20 %	20 %	40 %	20 %	325969907
44	NC_015152	GACCA	2	10	67716	67725	40 %	0 %	20 %	40 %	325969907
45	NC_015152	CAATC	2	10	67883	67892	40 %	20 %	0 %	40 %	325969907
46	NC_015152	CAAGT	2	10	68150	68159	40 %	20 %	20 %	20 %	325969908
47	NC_015152	AAATC	2	10	68467	68476	60 %	20 %	0 %	20 %	325969908
48	NC_015152	AAGGC	2	10	69651	69660	40 %	0 %	40 %	20 %	325969908
49	NC_015152	GGAGG	2	10	69938	69947	20 %	0 %	80 %	0 %	325969908
50	NC_015152	ATCCT	2	10	70506	70515	20 %	40 %	0 %	40 %	325969908
51	NC_015152	CGGAG	2	10	74240	74249	20 %	0 %	60 %	20 %	325969910
52	NC_015152	CTGTT	2	10	76111	76120	0 %	60 %	20 %	20 %	325969911
53	NC_015152	ACCGC	2	10	82469	82478	20 %	0 %	20 %	60 %	325969915
54	NC_015152	ATGGA	2	10	87291	87300	40 %	20 %	40 %	0 %	325969919
55	NC_015152	ACAAT	2	10	88477	88486	60 %	20 %	0 %	20 %	325969921
56	NC_015152	GAATC	2	10	91852	91861	40 %	20 %	20 %	20 %	325969924
57	NC_015152	GTTCT	2	10	92869	92878	0 %	60 %	20 %	20 %	325969925
58	NC_015152	TCGGC	2	10	94142	94151	0 %	20 %	40 %	40 %	325969926
59	NC_015152	TGCTC	2	10	96301	96310	0 %	40 %	20 %	40 %	325969927
60	NC_015152	CTCTT	2	10	98465	98474	0 %	60 %	0 %	40 %	325969929
61	NC_015152	GCAGA	2	10	100552	100561	40 %	0 %	40 %	20 %	325969933
62	NC_015152	TTTCC	2	10	101252	101261	0 %	60 %	0 %	40 %	325969934
63	NC_015152	CCATT	2	10	105023	105032	20 %	40 %	0 %	40 %	325969937
64	NC_015152	GTGTG	2	10	105996	106005	0 %	40 %	60 %	0 %	325969937
65	NC_015152	AGAAT	2	10	106317	106326	60 %	20 %	20 %	0 %	325969938
66	NC_015152	TGCAG	2	10	106534	106543	20 %	20 %	40 %	20 %	325969938
67	NC_015152	CCCTG	2	10	108084	108093	0 %	20 %	20 %	60 %	325969939
68	NC_015152	GCCAT	2	10	111942	111951	20 %	20 %	20 %	40 %	325969944
69	NC_015152	TGCAC	2	10	112251	112260	20 %	20 %	20 %	40 %	325969944
70	NC_015152	GCATC	2	10	116342	116351	20 %	20 %	20 %	40 %	325969947
71	NC_015152	AAGGA	2	10	119269	119278	60 %	0 %	40 %	0 %	325969950
72	NC_015152	CATTA	2	10	119592	119601	40 %	40 %	0 %	20 %	325969950
73	NC_015152	TGAAC	2	10	120425	120434	40 %	20 %	20 %	20 %	325969950
74	NC_015152	GATCT	2	10	120642	120651	20 %	40 %	20 %	20 %	325969950
75	NC_015152	TCAGT	2	10	122614	122623	20 %	40 %	20 %	20 %	325969952
76	NC_015152	GAATC	2	10	123134	123143	40 %	20 %	20 %	20 %	325969953
77	NC_015152	TCGAC	2	10	126458	126467	20 %	20 %	20 %	40 %	325969955
78	NC_015152	CCGAT	2	10	126759	126768	20 %	20 %	20 %	40 %	325969956
79	NC_015152	TTTGC	2	10	127066	127075	0 %	60 %	20 %	20 %	325969956
80	NC_015152	TCACT	2	10	127809	127818	20 %	40 %	0 %	40 %	325969956
81	NC_015152	CGCAT	2	10	128280	128289	20 %	20 %	20 %	40 %	325969957
82	NC_015152	GCCTC	2	10	128885	128894	0 %	20 %	20 %	60 %	325969958
83	NC_015152	ATGGC	2	10	129137	129146	20 %	20 %	40 %	20 %	325969958
84	NC_015152	CCACC	2	10	132267	132276	20 %	0 %	0 %	80 %	325969961
85	NC_015152	TACTC	2	10	135658	135667	20 %	40 %	0 %	40 %	325969963
86	NC_015152	GCAAG	2	10	135776	135785	40 %	0 %	40 %	20 %	325969963
87	NC_015152	ACGCC	2	10	138235	138244	20 %	0 %	20 %	60 %	325969964
88	NC_015152	CAGAG	2	10	139375	139384	40 %	0 %	40 %	20 %	325969966
89	NC_015152	CGACC	2	10	140961	140970	20 %	0 %	20 %	60 %	325969968
90	NC_015152	AGCGG	2	10	141001	141010	20 %	0 %	60 %	20 %	325969968
91	NC_015152	CTTCG	2	10	144719	144728	0 %	40 %	20 %	40 %	325969971
92	NC_015152	GCTGT	2	10	148755	148764	0 %	40 %	40 %	20 %	325969976
93	NC_015152	CCTTG	2	10	148864	148873	0 %	40 %	20 %	40 %	325969976
94	NC_015152	CATTG	2	10	149047	149056	20 %	40 %	20 %	20 %	325969976
95	NC_015152	TGCTT	2	10	153575	153584	0 %	60 %	20 %	20 %	325969980
96	NC_015152	ATTTC	2	10	153719	153728	20 %	60 %	0 %	20 %	325969980
97	NC_015152	ACAAT	2	10	159858	159867	60 %	20 %	0 %	20 %	325969984
98	NC_015152	AATAA	2	10	160650	160659	80 %	20 %	0 %	0 %	325969984
99	NC_015152	ACTTG	2	10	161449	161458	20 %	40 %	20 %	20 %	325969985
100	NC_015152	AGATG	2	10	161516	161525	40 %	20 %	40 %	0 %	325969986
101	NC_015152	TTTTG	2	10	161597	161606	0 %	80 %	20 %	0 %	325969986
102	NC_015152	GGCAA	2	10	164592	164601	40 %	0 %	40 %	20 %	325969990
103	NC_015152	ATGTT	2	10	169166	169175	20 %	60 %	20 %	0 %	325969993
104	NC_015152	GCTCA	2	10	169555	169564	20 %	20 %	20 %	40 %	325969993
105	NC_015152	TTTCT	2	10	171219	171228	0 %	80 %	0 %	20 %	325969996
106	NC_015152	GAACC	2	10	172317	172326	40 %	0 %	20 %	40 %	325969998
107	NC_015152	GAAGA	2	10	173888	173897	60 %	0 %	40 %	0 %	325969999
108	NC_015152	ATCAT	2	10	174252	174261	40 %	40 %	0 %	20 %	325969999
109	NC_015152	ATAGC	2	10	174966	174975	40 %	20 %	20 %	20 %	325970000
110	NC_015152	TGATT	2	10	175361	175370	20 %	60 %	20 %	0 %	325970001
111	NC_015152	CAGGG	2	10	177943	177952	20 %	0 %	60 %	20 %	325970005
112	NC_015152	ACATC	2	10	181069	181078	40 %	20 %	0 %	40 %	325970008
113	NC_015152	TTGTG	2	10	182337	182346	0 %	60 %	40 %	0 %	325970008
114	NC_015152	GTACC	2	10	182581	182590	20 %	20 %	20 %	40 %	325970008
115	NC_015152	ATTCC	2	10	182600	182609	20 %	40 %	0 %	40 %	325970008
116	NC_015152	AGCGG	2	10	184244	184253	20 %	0 %	60 %	20 %	325970009
117	NC_015152	CAAGG	2	10	186646	186655	40 %	0 %	40 %	20 %	325970013
118	NC_015152	CAAGG	2	10	187981	187990	40 %	0 %	40 %	20 %	325970014
119	NC_015152	GCCTT	2	10	188605	188614	0 %	40 %	20 %	40 %	325970015
120	NC_015152	AAGGC	2	10	189477	189486	40 %	0 %	40 %	20 %	325970016
121	NC_015152	AGTGG	2	10	191483	191492	20 %	20 %	60 %	0 %	325970018
122	NC_015152	GGCTG	2	10	192596	192605	0 %	20 %	60 %	20 %	325970018
123	NC_015152	TCAAA	2	10	197314	197323	60 %	20 %	0 %	20 %	325970020
124	NC_015152	GAAGA	2	10	202573	202582	60 %	0 %	40 %	0 %	325970026
125	NC_015152	TCAGC	2	10	203353	203362	20 %	20 %	20 %	40 %	325970026
126	NC_015152	GCAAG	2	10	203435	203444	40 %	0 %	40 %	20 %	325970026
127	NC_015152	AAAGC	2	10	203874	203883	60 %	0 %	20 %	20 %	325970026
128	NC_015152	TGTAG	2	10	203935	203944	20 %	40 %	40 %	0 %	325970026
129	NC_015152	TTTGA	2	10	205313	205322	20 %	60 %	20 %	0 %	325970028
130	NC_015152	CCCCT	2	10	209674	209683	0 %	20 %	0 %	80 %	325970032
131	NC_015152	CAAGA	2	10	210452	210461	60 %	0 %	20 %	20 %	325970032
132	NC_015152	GGTGA	2	10	210863	210872	20 %	20 %	60 %	0 %	325970033
133	NC_015152	ATGAA	2	10	213062	213071	60 %	20 %	20 %	0 %	325970035
134	NC_015152	TGTCG	2	10	217121	217130	0 %	40 %	40 %	20 %	325970040
135	NC_015152	TTGCC	2	10	217703	217712	0 %	40 %	20 %	40 %	325970040
136	NC_015152	TCCCC	2	10	221196	221205	0 %	20 %	0 %	80 %	325970043
137	NC_015152	GTCCT	2	10	221606	221615	0 %	40 %	20 %	40 %	325970044
138	NC_015152	TCGGT	2	10	225557	225566	0 %	40 %	40 %	20 %	325970047
139	NC_015152	GGCCA	2	10	226865	226874	20 %	0 %	40 %	40 %	325970048
140	NC_015152	GCACA	2	10	231617	231626	40 %	0 %	20 %	40 %	325970053
141	NC_015152	CCTTC	2	10	231643	231652	0 %	40 %	0 %	60 %	325970053
142	NC_015152	TTCGA	2	10	234876	234885	20 %	40 %	20 %	20 %	325970054
143	NC_015152	GAAGT	2	10	235489	235498	40 %	20 %	40 %	0 %	325970055
144	NC_015152	GAATC	2	10	235711	235720	40 %	20 %	20 %	20 %	325970055
145	NC_015152	CGACC	2	10	237320	237329	20 %	0 %	20 %	60 %	325970056
146	NC_015152	GAACA	2	10	238145	238154	60 %	0 %	20 %	20 %	325970057
147	NC_015152	CTTCC	2	10	238460	238469	0 %	40 %	0 %	60 %	325970057
148	NC_015152	GGAAG	2	10	240804	240813	40 %	0 %	60 %	0 %	325970059
149	NC_015152	AGGTG	2	10	245553	245562	20 %	20 %	60 %	0 %	325970064
150	NC_015152	GCAGA	2	10	247643	247652	40 %	0 %	40 %	20 %	325970066
151	NC_015152	GTTTT	2	10	248475	248484	0 %	80 %	20 %	0 %	325970066
152	NC_015152	ATTGA	2	10	249402	249411	40 %	40 %	20 %	0 %	325970067
153	NC_015152	CCAAG	2	10	249572	249581	40 %	0 %	20 %	40 %	325970067
154	NC_015152	GACAA	2	10	252926	252935	60 %	0 %	20 %	20 %	325970070
155	NC_015152	ACAGT	2	10	256717	256726	40 %	20 %	20 %	20 %	325970073
156	NC_015152	AGGGC	2	10	271039	271048	20 %	0 %	60 %	20 %	325970087
157	NC_015152	AGTTC	2	10	273101	273110	20 %	40 %	20 %	20 %	325970089
158	NC_015152	GACGC	2	10	278705	278714	20 %	0 %	40 %	40 %	325970094
159	NC_015152	CCAAC	2	10	278812	278821	40 %	0 %	0 %	60 %	325970094
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161	NC_015152	CGGTA	2	10	283420	283429	20 %	20 %	40 %	20 %	325970099
162	NC_015152	GATGT	2	10	286578	286587	20 %	40 %	40 %	0 %	325970102
163	NC_015152	AGTGA	2	10	288735	288744	40 %	20 %	40 %	0 %	325970103
164	NC_015152	ATTGG	2	10	289328	289337	20 %	40 %	40 %	0 %	325970104
165	NC_015152	CATTG	2	10	290069	290078	20 %	40 %	20 %	20 %	325970104
166	NC_015152	GTTGT	2	10	292616	292625	0 %	60 %	40 %	0 %	325970106
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168	NC_015152	TTGGT	2	10	293666	293675	0 %	60 %	40 %	0 %	325970107
169	NC_015152	TAGTA	2	10	295328	295337	40 %	40 %	20 %	0 %	325970109
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173	NC_015152	AAGGT	2	10	301491	301500	40 %	20 %	40 %	0 %	325970114
174	NC_015152	GGGTG	2	10	304829	304838	0 %	20 %	80 %	0 %	325970116
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176	NC_015152	GATCA	2	10	307871	307880	40 %	20 %	20 %	20 %	325970120
177	NC_015152	CACAA	2	10	308238	308247	60 %	0 %	0 %	40 %	325970122
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201	NC_015152	GAAAA	2	10	360741	360750	80 %	0 %	20 %	0 %	325970175
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211	NC_015152	ATGGC	2	10	385274	385283	20 %	20 %	40 %	20 %	325970196
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213	NC_015152	TCGTA	2	10	388564	388573	20 %	40 %	20 %	20 %	325970199
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234	NC_015152	AACCT	2	10	418568	418577	40 %	20 %	0 %	40 %	325970226
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237	NC_015152	CTGGG	2	10	420198	420207	0 %	20 %	60 %	20 %	325970227
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241	NC_015152	CGTAT	2	10	427568	427577	20 %	40 %	20 %	20 %	325970234
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244	NC_015152	GCATT	2	10	431520	431529	20 %	40 %	20 %	20 %	325970236
245	NC_015152	CCATT	2	10	431587	431596	20 %	40 %	0 %	40 %	325970236
246	NC_015152	ACAGA	2	10	432860	432869	60 %	0 %	20 %	20 %	325970237
247	NC_015152	GCTCT	2	10	441844	441853	0 %	40 %	20 %	40 %	325970244
248	NC_015152	TTTGG	2	10	452740	452749	0 %	60 %	40 %	0 %	325970252
249	NC_015152	GTACG	2	10	454625	454634	20 %	20 %	40 %	20 %	325970253
250	NC_015152	TACCA	2	10	459606	459615	40 %	20 %	0 %	40 %	325970257
251	NC_015152	CATGA	2	10	460814	460823	40 %	20 %	20 %	20 %	325970258
252	NC_015152	TGGTG	2	10	461819	461828	0 %	40 %	60 %	0 %	325970259
253	NC_015152	GCAGT	2	10	462926	462935	20 %	20 %	40 %	20 %	325970261
254	NC_015152	CAGAT	2	10	464946	464955	40 %	20 %	20 %	20 %	325970264
255	NC_015152	GTCGA	2	10	465986	465995	20 %	20 %	40 %	20 %	325970264
256	NC_015152	CCGGT	2	10	466523	466532	0 %	20 %	40 %	40 %	325970265
257	NC_015152	TTTCC	2	10	468476	468485	0 %	60 %	0 %	40 %	325970267
258	NC_015152	TGCTT	2	10	468600	468609	0 %	60 %	20 %	20 %	325970267
259	NC_015152	GGCAG	2	10	474824	474833	20 %	0 %	60 %	20 %	325970273
260	NC_015152	CATGG	2	10	476289	476298	20 %	20 %	40 %	20 %	325970274
261	NC_015152	GATGA	2	10	476950	476959	40 %	20 %	40 %	0 %	325970274
262	NC_015152	TCCGG	2	10	480261	480270	0 %	20 %	40 %	40 %	325970278
263	NC_015152	CGGTG	2	10	483267	483276	0 %	20 %	60 %	20 %	325970280
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