MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Spirochaeta sp. Buddy chromosome

Total Repeats: 909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015152	GAAG	2	8	7714	7721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015152	CCTT	2	8	11755	11762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015152	TACT	2	8	16283	16290	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015152	AGTT	2	8	18109	18116	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015152	GATA	2	8	18380	18387	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015152	TCAA	2	8	31781	31788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015152	GGGT	2	8	35162	35169	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015152	GCCT	2	8	41545	41552	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015152	ACCA	2	8	41564	41571	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015152	TTGC	2	8	42287	42294	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015152	GTTC	2	8	42356	42363	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015152	GCAA	2	8	47649	47656	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015152	AGTA	2	8	47745	47752	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015152	ATCC	2	8	60410	60417	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015152	GAAA	2	8	64044	64051	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015152	TCCA	2	8	64056	64063	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015152	TTGT	2	8	80488	80495	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015152	CCTT	2	8	81137	81144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015152	ATCT	2	8	81202	81209	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015152	ACTT	2	8	81279	81286	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015152	GGAT	2	8	81445	81452	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015152	AATA	2	8	82032	82039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015152	TGGA	2	8	82052	82059	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015152	ACGT	2	8	90119	90126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015152	ATAA	2	8	91241	91248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015152	TTAA	3	12	91249	91260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015152	CTTG	2	8	103978	103985	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015152	ATTC	2	8	104296	104303	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015152	TCCC	2	8	115401	115408	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_015152	CCTC	2	8	127840	127847	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_015152	TTCC	2	8	133090	133097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015152	GCAA	2	8	133147	133154	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015152	GTAT	2	8	160670	160677	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015152	AGTA	2	8	160802	160809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015152	CAGG	2	8	160814	160821	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015152	TGTT	2	8	163768	163775	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015152	TACA	2	8	164478	164485	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015152	AGAT	2	8	165645	165652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015152	AGGA	2	8	166434	166441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015152	GCAA	2	8	171396	171403	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015152	TGCA	2	8	173146	173153	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015152	TTGA	2	8	183351	183358	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015152	TCCT	2	8	183365	183372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015152	AATG	2	8	185387	185394	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015152	AAGA	2	8	190156	190163	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015152	ACTT	2	8	191041	191048	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015152	CCTC	2	8	194501	194508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
48	NC_015152	ATTG	2	8	194942	194949	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015152	CAAC	2	8	202443	202450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015152	GCAA	2	8	204776	204783	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015152	AATA	2	8	207439	207446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015152	TGCA	2	8	207666	207673	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015152	TGAG	2	8	214413	214420	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015152	TTCC	2	8	216205	216212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015152	GAGG	2	8	216221	216228	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015152	AGGG	2	8	224403	224410	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015152	CTAC	2	8	227546	227553	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015152	TAAA	2	8	227593	227600	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015152	GGCC	2	8	229516	229523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015152	GTAG	2	8	235108	235115	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015152	CAGA	2	8	240212	240219	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015152	AATT	2	8	241887	241894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015152	TCCC	2	8	241985	241992	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_015152	CTGC	2	8	242160	242167	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015152	TTCC	2	8	248960	248967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015152	GCCT	2	8	249084	249091	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015152	CATG	2	8	257046	257053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015152	AAGG	2	8	261018	261025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015152	AGGA	2	8	262399	262406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015152	GTTT	3	12	263589	263600	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015152	ATCT	2	8	263918	263925	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015152	TTCC	2	8	268742	268749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015152	GAAA	2	8	276923	276930	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015152	ATTG	2	8	277081	277088	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015152	GGAA	2	8	277886	277893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015152	TACC	2	8	277905	277912	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015152	GGTT	2	8	278317	278324	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015152	GTTT	2	8	278431	278438	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015152	AGGA	2	8	289025	289032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015152	CAAA	2	8	299600	299607	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015152	TAAG	2	8	309563	309570	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015152	GAAA	2	8	310574	310581	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015152	GACA	2	8	316161	316168	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015152	CGGG	2	8	317374	317381	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015152	ACCA	2	8	320432	320439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015152	TGGT	2	8	320502	320509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015152	AAGA	2	8	327056	327063	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015152	ATCG	2	8	328556	328563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015152	TGCT	2	8	331949	331956	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015152	AGAA	2	8	332076	332083	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015152	GAAA	2	8	338334	338341	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015152	CTTC	2	8	338845	338852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015152	TGGT	2	8	339278	339285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015152	GTGA	2	8	339878	339885	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015152	AAAC	2	8	340005	340012	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015152	TACA	2	8	340127	340134	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015152	TTTC	2	8	340144	340151	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015152	CATT	2	8	347840	347847	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015152	CATA	2	8	347958	347965	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015152	CTGC	2	8	352062	352069	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015152	ATAG	2	8	358058	358065	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015152	ATGT	2	8	363859	363866	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015152	GTCT	2	8	364043	364050	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015152	AGGA	2	8	367527	367534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015152	CCTA	2	8	372524	372531	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015152	TCTG	2	8	373031	373038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015152	AAAT	2	8	378391	378398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015152	GATT	2	8	394021	394028	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015152	GTTT	2	8	400814	400821	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015152	AATA	2	8	406026	406033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015152	TTGC	2	8	406063	406070	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015152	CTTT	2	8	406099	406106	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015152	ATGT	2	8	406957	406964	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015152	TGAT	2	8	411527	411534	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015152	GCAG	2	8	423114	423121	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015152	ATCC	2	8	428365	428372	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015152	CTTC	2	8	429143	429150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015152	GAAA	2	8	429574	429581	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015152	TTGT	2	8	429650	429657	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015152	AGGC	2	8	437344	437351	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015152	ACTG	2	8	447768	447775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015152	AAGG	2	8	450186	450193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015152	TGAG	2	8	461632	461639	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015152	ATGC	2	8	463285	463292	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015152	CGGG	2	8	473762	473769	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015152	TTTG	2	8	475548	475555	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015152	AAGT	2	8	481459	481466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015152	TTTG	2	8	484968	484975	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015152	CTGC	2	8	486596	486603	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015152	TTCA	2	8	487911	487918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015152	ACCT	2	8	487970	487977	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015152	TGAG	2	8	504968	504975	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015152	TGAG	2	8	506412	506419	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015152	AAAG	2	8	506490	506497	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015152	CATA	2	8	512211	512218	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015152	CTTT	2	8	522302	522309	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015152	TTAG	2	8	523423	523430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015152	CTCA	2	8	533890	533897	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015152	ATTT	2	8	545105	545112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015152	ACAT	2	8	555917	555924	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015152	AAAT	2	8	575260	575267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015152	CCGA	2	8	576646	576653	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015152	TCGG	2	8	576659	576666	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015152	TGCA	2	8	583147	583154	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015152	GGAG	2	8	583178	583185	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015152	CTTT	2	8	586336	586343	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015152	CATC	2	8	588104	588111	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_015152	GTAT	2	8	588988	588995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015152	TTGA	2	8	600412	600419	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015152	AATA	2	8	608125	608132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015152	AAAG	2	8	613749	613756	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_015152	CAAA	2	8	1936815	1936822	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_015152	AATG	2	8	2001607	2001614	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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