MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vulcanisaeta moutnovskia 768-28 chromosome

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015151	TTTAAT	2	12	23853	23864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015151	TATTTG	2	12	85420	85431	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015151	GTTTGG	2	12	87098	87109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015151	ACCACA	2	12	87243	87254	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015151	ATGACT	2	12	89644	89655	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015151	GAAAGA	2	12	140865	140876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015151	ATTTTT	2	12	155549	155560	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015151	CTACGA	2	12	163726	163737	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015151	CCCGGC	2	12	168919	168930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_015151	AAAAAC	2	12	176793	176804	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015151	AATTCC	2	12	182250	182261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015151	CTTCAT	2	12	182323	182334	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015151	TAAATA	2	12	191178	191189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015151	AGGGCT	2	12	239837	239848	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015151	GGCATG	2	12	239994	240005	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015151	TCCTTA	2	12	299480	299491	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015151	GGTTTT	2	12	318080	318091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015151	CCCGGC	2	12	339786	339797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015151	TGTTTT	2	12	354358	354369	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015151	GTATTT	2	12	504273	504284	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015151	GGCATG	2	12	521897	521908	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015151	TAAAAA	2	12	522094	522105	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015151	TAGAAA	2	12	522943	522954	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015151	GAACAC	2	12	530947	530958	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015151	GGATTT	2	12	538493	538504	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015151	TTTGAA	2	12	541361	541372	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015151	AATTTC	2	12	542891	542902	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015151	TATAAA	2	12	649741	649752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015151	TAATCC	2	12	660373	660384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015151	ATTACT	2	12	684043	684054	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015151	AATTTC	2	12	695352	695363	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015151	ACCAAG	2	12	726073	726084	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015151	ACAGAA	2	12	728939	728950	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015151	TAAAAT	2	12	741294	741305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015151	AAAATT	2	12	759088	759099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015151	AAAAAT	2	12	761544	761555	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015151	AATACC	2	12	775019	775030	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015151	TATCGA	2	12	798203	798214	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015151	CCCGGC	2	12	817206	817217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015151	CAATGA	2	12	897554	897565	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015151	TTAAAT	2	12	903631	903642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015151	ATTTAA	2	12	907033	907044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015151	GCCGGG	2	12	948316	948327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015151	ATTTAA	2	12	972588	972599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015151	TAACAT	2	12	1058157	1058168	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015151	AACCAT	2	12	1132369	1132380	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015151	ATTGGT	2	12	1161725	1161736	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015151	AGTAAA	2	12	1161770	1161781	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015151	ATAATG	2	12	1182164	1182175	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015151	TTTTAA	2	12	1197031	1197042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015151	ATTAAA	2	12	1215750	1215761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015151	TATGAT	2	12	1219615	1219626	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015151	TTTAAG	2	12	1223306	1223317	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015151	ATTTAT	2	12	1229053	1229064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015151	AATATA	2	12	1233318	1233329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015151	TAAGTA	2	12	1254099	1254110	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015151	AGGGTT	2	12	1254761	1254772	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015151	ATTAAA	2	12	1262095	1262106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015151	ACCGAG	2	12	1268408	1268419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015151	CAAGTC	2	12	1319002	1319013	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015151	TAAAAT	2	12	1349926	1349937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015151	TTTATA	2	12	1361776	1361787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015151	TCACTA	2	12	1404896	1404907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015151	TGCATA	2	12	1444849	1444860	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015151	ATGGTG	2	12	1452386	1452397	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015151	AGTACG	2	12	1480535	1480546	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015151	CCAACC	2	12	1483885	1483896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_015151	GTTGGG	2	12	1488582	1488593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015151	GGTTGG	2	12	1488597	1488608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015151	TTTTTA	2	12	1499114	1499125	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015151	ATATTA	2	12	1507004	1507015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015151	ATGGAA	2	12	1520988	1520999	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015151	GGGTTT	2	12	1530766	1530777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015151	AAAATA	2	12	1543672	1543683	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015151	AAATTA	2	12	1564606	1564617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015151	TAAATA	2	12	1583981	1583992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015151	TATTTA	2	12	1595940	1595951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015151	GTAGAC	2	12	1607022	1607033	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_015151	TACGTA	2	12	1607062	1607073	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015151	AGCTAC	2	12	1614678	1614689	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015151	TTGGTT	2	12	1620846	1620857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015151	GCTCTC	2	12	1675248	1675259	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015151	TTGGTT	2	12	1695279	1695290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015151	AACACA	2	12	1698349	1698360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015151	GCTTAT	2	12	1700596	1700607	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015151	TTCATC	2	12	1742168	1742179	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015151	ATGCAT	2	12	1775773	1775784	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_015151	AAATTA	2	12	1793780	1793791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015151	CTCATT	2	12	1811618	1811629	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015151	ATTTTA	2	12	1812993	1813004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015151	AAATTA	2	12	1833202	1833213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015151	TCGAGC	2	12	1840092	1840103	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015151	GAGATA	2	12	1852310	1852321	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015151	TGGCGA	2	12	1863527	1863538	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015151	GGATAG	2	12	1876649	1876660	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015151	GAGGTT	2	12	1892129	1892140	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015151	GAAACA	2	12	1892365	1892376	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015151	TCTTTC	2	12	1913182	1913193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015151	TTAATT	2	12	1929464	1929475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015151	ACCCAC	2	12	1953215	1953226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_015151	TAAGTT	2	12	1978806	1978817	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015151	TAAAAA	2	12	1978879	1978890	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015151	ATCTTA	2	12	1980250	1980261	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_015151	AACATC	2	12	1982586	1982597	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015151	CATTAA	2	12	2071121	2071132	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_015151	TTAAAT	2	12	2081593	2081604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015151	TGAAAA	2	12	2089132	2089143	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015151	ACGACA	2	12	2119567	2119578	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015151	TATACT	2	12	2160830	2160841	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_015151	ATTTCT	2	12	2167849	2167860	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015151	ATAAAA	2	12	2167880	2167891	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015151	GCCGGG	2	12	2192959	2192970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015151	TTAAAA	2	12	2212945	2212956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015151	TTTACA	2	12	2212966	2212977	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_015151	CCATGA	2	12	2219980	2219991	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015151	AATGCC	2	12	2220486	2220497	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015151	GAGGGT	2	12	2220582	2220593	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015151	GATAAT	2	12	2232491	2232502	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015151	GTATCA	2	12	2233396	2233407	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_015151	TGACAT	2	12	2270084	2270095	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_015151	TAAATA	2	12	2286879	2286890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015151	TTAAAA	2	12	2290599	2290610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015151	TATAAC	2	12	2298036	2298047	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_015151	AGCCCT	2	12	2298549	2298560	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.