MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Arthrobacter phenanthrenivorans Sphe3 plasmid pASPHE302

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015147	CGGTC	2	10	892	901	0 %	20 %	40 %	40 %	325965486
2	NC_015147	CGGCC	2	10	1128	1137	0 %	0 %	40 %	60 %	325965486
3	NC_015147	CGAAG	2	10	2095	2104	40 %	0 %	40 %	20 %	325965487
4	NC_015147	TTGGC	2	10	2754	2763	0 %	40 %	40 %	20 %	325965488
5	NC_015147	CGGTG	2	10	3152	3161	0 %	20 %	60 %	20 %	325965488
6	NC_015147	CCGGG	2	10	3685	3694	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_015147	AAGCT	2	10	3711	3720	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015147	CGTCT	2	10	4659	4668	0 %	40 %	20 %	40 %	325965489
9	NC_015147	GGGCA	2	10	4766	4775	20 %	0 %	60 %	20 %	325965489
10	NC_015147	GTGGG	2	10	5187	5196	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015147	GCTGC	2	10	5808	5817	0 %	20 %	40 %	40 %	325965490
12	NC_015147	GTGGG	2	10	6648	6657	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015147	TACCG	2	10	7111	7120	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_015147	TATGG	2	10	8704	8713	20 %	40 %	40 %	0 %	325965494
15	NC_015147	CGTAC	2	10	8942	8951	20 %	20 %	20 %	40 %	325965494
16	NC_015147	CGCAC	2	10	11662	11671	20 %	0 %	20 %	60 %	325965497
17	NC_015147	GATCC	2	10	11995	12004	20 %	20 %	20 %	40 %	325965497
18	NC_015147	TGCGG	2	10	13711	13720	0 %	20 %	60 %	20 %	325965498
19	NC_015147	GGGAC	2	10	14667	14676	20 %	0 %	60 %	20 %	325965498
20	NC_015147	GACGC	2	10	16473	16482	20 %	0 %	40 %	40 %	325965500
21	NC_015147	GACCA	2	10	16854	16863	40 %	0 %	20 %	40 %	325965500
22	NC_015147	ACGCT	2	10	17703	17712	20 %	20 %	20 %	40 %	325965500
23	NC_015147	GAGTA	2	10	18334	18343	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015147	CCCGT	2	10	18637	18646	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_015147	CCAAT	2	10	20976	20985	40 %	20 %	0 %	40 %	325965504
26	NC_015147	TCGGA	2	10	22455	22464	20 %	20 %	40 %	20 %	325965506
27	NC_015147	GCCGC	2	10	22534	22543	0 %	0 %	40 %	60 %	325965506
28	NC_015147	GGTCA	2	10	23440	23449	20 %	20 %	40 %	20 %	325965508
29	NC_015147	TTTCC	2	10	25985	25994	0 %	60 %	0 %	40 %	325965511
30	NC_015147	TGGTG	2	10	28227	28236	0 %	40 %	60 %	0 %	325965513
31	NC_015147	CGCGG	2	10	28255	28264	0 %	0 %	60 %	40 %	325965513
32	NC_015147	GCTGC	2	10	29399	29408	0 %	20 %	40 %	40 %	325965514
33	NC_015147	CGGGG	2	10	29952	29961	0 %	0 %	80 %	20 %	325965515
34	NC_015147	GAGCC	2	10	32314	32323	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_015147	GACCA	2	10	35534	35543	40 %	0 %	20 %	40 %	325965521
36	NC_015147	CCGAT	2	10	36128	36137	20 %	20 %	20 %	40 %	325965522
37	NC_015147	CTCAT	2	10	37288	37297	20 %	40 %	0 %	40 %	325965522
38	NC_015147	ACGGC	2	10	38473	38482	20 %	0 %	40 %	40 %	325965523
39	NC_015147	AGCCC	2	10	41704	41713	20 %	0 %	20 %	60 %	325965527
40	NC_015147	TCCGT	2	10	42116	42125	0 %	40 %	20 %	40 %	325965527
41	NC_015147	CCGCA	2	10	42531	42540	20 %	0 %	20 %	60 %	325965527
42	NC_015147	TTCCT	2	10	42670	42679	0 %	60 %	0 %	40 %	325965527
43	NC_015147	GGCGT	2	10	43336	43345	0 %	20 %	60 %	20 %	325965527
44	NC_015147	CTGCC	2	10	44551	44560	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_015147	CGGGC	2	10	47728	47737	0 %	0 %	60 %	40 %	325965532
46	NC_015147	ATGAC	2	10	48535	48544	40 %	20 %	20 %	20 %	325965532
47	NC_015147	GCTCG	2	10	50790	50799	0 %	20 %	40 %	40 %	325965534
48	NC_015147	CTGGC	2	10	51570	51579	0 %	20 %	40 %	40 %	325965535
49	NC_015147	GCCTG	2	10	53462	53471	0 %	20 %	40 %	40 %	325965537
50	NC_015147	TGGGT	2	10	53595	53604	0 %	40 %	60 %	0 %	325965537
51	NC_015147	CAATG	2	10	54453	54462	40 %	20 %	20 %	20 %	325965538
52	NC_015147	GCCGG	2	10	55376	55385	0 %	0 %	60 %	40 %	325965539
53	NC_015147	CGAGC	2	10	60247	60256	20 %	0 %	40 %	40 %	325965545
54	NC_015147	CGCTC	2	10	64157	64166	0 %	20 %	20 %	60 %	325965550
55	NC_015147	GATTC	2	10	64524	64533	20 %	40 %	20 %	20 %	325965550
56	NC_015147	CCGGA	2	10	65478	65487	20 %	0 %	40 %	40 %	325965551
57	NC_015147	GCCGG	2	10	67827	67836	0 %	0 %	60 %	40 %	325965554
58	NC_015147	ACCGC	2	10	69103	69112	20 %	0 %	20 %	60 %	325965554
59	NC_015147	TCGCG	2	10	69595	69604	0 %	20 %	40 %	40 %	325965555
60	NC_015147	CGGCA	2	10	70836	70845	20 %	0 %	40 %	40 %	325965556
61	NC_015147	GACGT	2	10	71306	71315	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015147	ACCTG	2	10	71489	71498	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_015147	GCGCG	2	10	73986	73995	0 %	0 %	60 %	40 %	325965559
64	NC_015147	GTGGC	2	10	78549	78558	0 %	20 %	60 %	20 %	325965565
65	NC_015147	CGAAC	2	10	80726	80735	40 %	0 %	20 %	40 %	325965568
66	NC_015147	AAGGG	2	10	81556	81565	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015147	GTTCC	2	10	81921	81930	0 %	40 %	20 %	40 %	325965569
68	NC_015147	GCCAG	2	10	83077	83086	20 %	0 %	40 %	40 %	325965571
69	NC_015147	GGGCA	2	10	84403	84412	20 %	0 %	60 %	20 %	325965572
70	NC_015147	CGTCC	2	10	84501	84510	0 %	20 %	20 %	60 %	325965572
71	NC_015147	CAGCG	2	10	85637	85646	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_015147	CGCTC	2	10	85920	85929	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_015147	CTTCA	2	10	87538	87547	20 %	40 %	0 %	40 %	325965577
74	NC_015147	GTTGG	2	10	88864	88873	0 %	40 %	60 %	0 %	325965579
75	NC_015147	TGGGC	2	10	90495	90504	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015147	CCTTC	2	10	90832	90841	0 %	40 %	0 %	60 %	325965582
77	NC_015147	CGATT	2	10	91370	91379	20 %	40 %	20 %	20 %	325965582
78	NC_015147	TGAGG	2	10	91814	91823	20 %	20 %	60 %	0 %	325965582
79	NC_015147	GTGGG	2	10	91925	91934	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015147	GTTCG	2	10	93362	93371	0 %	40 %	40 %	20 %	325965583
81	NC_015147	GTGGG	2	10	93437	93446	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.