MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Arthrobacter phenanthrenivorans Sphe3 plasmid pASPHE302

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015147	CCGG	2	8	1901	1908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015147	TCCG	2	8	3744	3751	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015147	GCCG	2	8	5505	5512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015147	CCGC	2	8	5722	5729	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_015147	GCCG	2	8	6965	6972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015147	GGTG	2	8	8595	8602	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015147	ATGT	2	8	8688	8695	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015147	GAGC	2	8	9537	9544	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015147	CCTA	2	8	10946	10953	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015147	CTAG	2	8	18723	18730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015147	GGTC	2	8	18820	18827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015147	GTGC	2	8	19316	19323	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015147	GACT	2	8	19443	19450	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015147	CTAC	2	8	19456	19463	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015147	ATAC	2	8	19538	19545	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015147	AGAC	2	8	20392	20399	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015147	CCTC	2	8	21554	21561	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_015147	CGGA	2	8	21688	21695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015147	GGAC	2	8	22009	22016	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015147	GCTC	2	8	22969	22976	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015147	CAGC	2	8	25516	25523	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015147	CAGA	2	8	41469	41476	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015147	CACC	2	8	43877	43884	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_015147	GTGA	2	8	44655	44662	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015147	CTAT	2	8	45733	45740	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015147	TGGA	2	8	52832	52839	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015147	GGTG	2	8	64984	64991	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015147	TTGG	2	8	65180	65187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015147	CGGC	2	8	71123	71130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015147	CGGG	2	8	71139	71146	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015147	CATT	2	8	71153	71160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015147	GAGG	2	8	71985	71992	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015147	TTTG	2	8	75669	75676	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015147	CGCC	2	8	77747	77754	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_015147	CGAC	2	8	77966	77973	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015147	GGCG	2	8	81694	81701	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015147	CCGG	2	8	82635	82642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015147	GGAC	2	8	82687	82694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015147	TCCT	2	8	85875	85882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015147	GACT	2	8	85946	85953	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015147	GGCA	2	8	86651	86658	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015147	CAAA	2	8	87075	87082	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015147	TCGT	2	8	89452	89459	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015147	TGAA	2	8	89499	89506	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015147	TGCT	2	8	89817	89824	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015147	GCTT	2	8	90221	90228	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015147	GGCC	2	8	90255	90262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015147	GGCG	2	8	90374	90381	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015147	CGGG	2	8	90511	90518	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015147	GCCG	2	8	92243	92250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015147	CCGC	2	8	92460	92467	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_015147	CGGC	3	12	94002	94013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015147	CGGC	2	8	94434	94441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.