MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Arthrobacter phenanthrenivorans Sphe3 plasmid pASPHE302

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015147	TCCT	2	8	425	432	0 %	50 %	0 %	50 %	325965485
2	NC_015147	CGGG	2	8	741	748	0 %	0 %	75 %	25 %	325965486
3	NC_015147	ACGC	2	8	1698	1705	25 %	0 %	25 %	50 %	325965486
4	NC_015147	CCCG	2	8	2331	2338	0 %	0 %	25 %	75 %	325965487
5	NC_015147	CTGC	2	8	3046	3053	0 %	25 %	25 %	50 %	325965488
6	NC_015147	CCAG	2	8	4319	4326	25 %	0 %	25 %	50 %	325965489
7	NC_015147	GCTT	2	8	4599	4606	0 %	50 %	25 %	25 %	325965489
8	NC_015147	GGGC	2	8	4897	4904	0 %	0 %	75 %	25 %	325965489
9	NC_015147	AACC	2	8	4997	5004	50 %	0 %	0 %	50 %	325965489
10	NC_015147	TGCT	2	8	6303	6310	0 %	50 %	25 %	25 %	325965491
11	NC_015147	TCCA	2	8	6514	6521	25 %	25 %	0 %	50 %	325965491
12	NC_015147	TTCG	2	8	7897	7904	0 %	50 %	25 %	25 %	325965493
13	NC_015147	GTCC	2	8	10478	10485	0 %	25 %	25 %	50 %	325965496
14	NC_015147	ACTC	2	8	11045	11052	25 %	25 %	0 %	50 %	325965497
15	NC_015147	GACC	2	8	11394	11401	25 %	0 %	25 %	50 %	325965497
16	NC_015147	GAAC	2	8	11463	11470	50 %	0 %	25 %	25 %	325965497
17	NC_015147	GTTC	2	8	11533	11540	0 %	50 %	25 %	25 %	325965497
18	NC_015147	CCGA	2	8	11623	11630	25 %	0 %	25 %	50 %	325965497
19	NC_015147	ATGA	2	8	11860	11867	50 %	25 %	25 %	0 %	325965497
20	NC_015147	AGGC	2	8	12036	12043	25 %	0 %	50 %	25 %	325965497
21	NC_015147	GTCC	2	8	12491	12498	0 %	25 %	25 %	50 %	325965498
22	NC_015147	ACCT	2	8	12878	12885	25 %	25 %	0 %	50 %	325965498
23	NC_015147	AGAC	2	8	13311	13318	50 %	0 %	25 %	25 %	325965498
24	NC_015147	AAGT	2	8	14139	14146	50 %	25 %	25 %	0 %	325965498
25	NC_015147	GACC	2	8	14433	14440	25 %	0 %	25 %	50 %	325965498
26	NC_015147	GATG	2	8	14914	14921	25 %	25 %	50 %	0 %	325965498
27	NC_015147	GATC	2	8	14983	14990	25 %	25 %	25 %	25 %	325965498
28	NC_015147	GTCG	2	8	15543	15550	0 %	25 %	50 %	25 %	325965499
29	NC_015147	GGCT	2	8	16548	16555	0 %	25 %	50 %	25 %	325965500
30	NC_015147	ACCT	2	8	16869	16876	25 %	25 %	0 %	50 %	325965500
31	NC_015147	TCGC	2	8	17075	17082	0 %	25 %	25 %	50 %	325965500
32	NC_015147	CTTC	2	8	17159	17166	0 %	50 %	0 %	50 %	325965500
33	NC_015147	TCCA	2	8	17202	17209	25 %	25 %	0 %	50 %	325965500
34	NC_015147	GACT	2	8	17513	17520	25 %	25 %	25 %	25 %	325965500
35	NC_015147	GGGA	2	8	17980	17987	25 %	0 %	75 %	0 %	325965500
36	NC_015147	GCAA	2	8	18076	18083	50 %	0 %	25 %	25 %	325965500
37	NC_015147	AGTT	2	8	19212	19219	25 %	50 %	25 %	0 %	325965501
38	NC_015147	TGAC	2	8	20140	20147	25 %	25 %	25 %	25 %	325965503
39	NC_015147	GGTT	2	8	20216	20223	0 %	50 %	50 %	0 %	325965503
40	NC_015147	CCGG	2	8	22511	22518	0 %	0 %	50 %	50 %	325965506
41	NC_015147	GACT	2	8	23074	23081	25 %	25 %	25 %	25 %	325965508
42	NC_015147	GCCG	2	8	23223	23230	0 %	0 %	50 %	50 %	325965508
43	NC_015147	TTCG	2	8	23258	23265	0 %	50 %	25 %	25 %	325965508
44	NC_015147	TCGT	2	8	23281	23288	0 %	50 %	25 %	25 %	325965508
45	NC_015147	TTCC	2	8	23491	23498	0 %	50 %	0 %	50 %	325965508
46	NC_015147	CTTG	2	8	23507	23514	0 %	50 %	25 %	25 %	325965508
47	NC_015147	TCAA	2	8	24562	24569	50 %	25 %	0 %	25 %	325965510
48	NC_015147	GGTT	2	8	24878	24885	0 %	50 %	50 %	0 %	325965510
49	NC_015147	GGCG	2	8	26067	26074	0 %	0 %	75 %	25 %	325965511
50	NC_015147	TAAG	2	8	26235	26242	50 %	25 %	25 %	0 %	325965511
51	NC_015147	CGCA	2	8	26800	26807	25 %	0 %	25 %	50 %	325965511
52	NC_015147	GCTG	2	8	28674	28681	0 %	25 %	50 %	25 %	325965513
53	NC_015147	CGGA	2	8	28950	28957	25 %	0 %	50 %	25 %	325965513
54	NC_015147	TTGC	2	8	29666	29673	0 %	50 %	25 %	25 %	325965514
55	NC_015147	CCGC	2	8	29732	29739	0 %	0 %	25 %	75 %	325965514
56	NC_015147	CCGG	2	8	30814	30821	0 %	0 %	50 %	50 %	325965515
57	NC_015147	GTCC	2	8	31235	31242	0 %	25 %	25 %	50 %	325965516
58	NC_015147	GGGA	2	8	31562	31569	25 %	0 %	75 %	0 %	325965517
59	NC_015147	GGCT	2	8	31734	31741	0 %	25 %	50 %	25 %	325965517
60	NC_015147	GCCG	2	8	32235	32242	0 %	0 %	50 %	50 %	325965518
61	NC_015147	CAGC	2	8	32517	32524	25 %	0 %	25 %	50 %	325965519
62	NC_015147	CGCC	2	8	32568	32575	0 %	0 %	25 %	75 %	325965519
63	NC_015147	AAAC	2	8	32649	32656	75 %	0 %	0 %	25 %	325965519
64	NC_015147	ACCG	2	8	32683	32690	25 %	0 %	25 %	50 %	325965519
65	NC_015147	TGGC	2	8	32841	32848	0 %	25 %	50 %	25 %	325965519
66	NC_015147	CAGG	2	8	33088	33095	25 %	0 %	50 %	25 %	325965520
67	NC_015147	TGTC	2	8	33308	33315	0 %	50 %	25 %	25 %	325965520
68	NC_015147	GGTT	2	8	33697	33704	0 %	50 %	50 %	0 %	325965520
69	NC_015147	GGCA	2	8	34203	34210	25 %	0 %	50 %	25 %	325965520
70	NC_015147	GCGG	2	8	34249	34256	0 %	0 %	75 %	25 %	325965520
71	NC_015147	GTTT	2	8	34455	34462	0 %	75 %	25 %	0 %	325965521
72	NC_015147	GGCT	2	8	34871	34878	0 %	25 %	50 %	25 %	325965521
73	NC_015147	GCCG	2	8	35504	35511	0 %	0 %	50 %	50 %	325965521
74	NC_015147	CGCC	2	8	35937	35944	0 %	0 %	25 %	75 %	325965522
75	NC_015147	CCAT	2	8	36169	36176	25 %	25 %	0 %	50 %	325965522
76	NC_015147	GAAC	2	8	36444	36451	50 %	0 %	25 %	25 %	325965522
77	NC_015147	CGAC	2	8	36761	36768	25 %	0 %	25 %	50 %	325965522
78	NC_015147	GCCT	2	8	36916	36923	0 %	25 %	25 %	50 %	325965522
79	NC_015147	GGAT	2	8	37522	37529	25 %	25 %	50 %	0 %	325965523
80	NC_015147	TGCG	2	8	37762	37769	0 %	25 %	50 %	25 %	325965523
81	NC_015147	GAAG	2	8	38615	38622	50 %	0 %	50 %	0 %	325965523
82	NC_015147	GGGA	2	8	39224	39231	25 %	0 %	75 %	0 %	325965523
83	NC_015147	AGCC	2	8	39317	39324	25 %	0 %	25 %	50 %	325965524
84	NC_015147	CACG	2	8	40209	40216	25 %	0 %	25 %	50 %	325965525
85	NC_015147	CGGG	2	8	40259	40266	0 %	0 %	75 %	25 %	325965525
86	NC_015147	GAAG	2	8	40530	40537	50 %	0 %	50 %	0 %	325965525
87	NC_015147	CGCC	2	8	40539	40546	0 %	0 %	25 %	75 %	325965525
88	NC_015147	TTCC	2	8	40584	40591	0 %	50 %	0 %	50 %	325965525
89	NC_015147	GCAC	2	8	40766	40773	25 %	0 %	25 %	50 %	325965525
90	NC_015147	GCCA	2	8	41337	41344	25 %	0 %	25 %	50 %	325965526
91	NC_015147	CGCC	2	8	41345	41352	0 %	0 %	25 %	75 %	325965526
92	NC_015147	AGCA	2	8	42096	42103	50 %	0 %	25 %	25 %	325965527
93	NC_015147	GGCA	2	8	42261	42268	25 %	0 %	50 %	25 %	325965527
94	NC_015147	CGCC	2	8	42562	42569	0 %	0 %	25 %	75 %	325965527
95	NC_015147	AATG	2	8	42710	42717	50 %	25 %	25 %	0 %	325965527
96	NC_015147	GGCA	2	8	43252	43259	25 %	0 %	50 %	25 %	325965527
97	NC_015147	AGCG	2	8	44857	44864	25 %	0 %	50 %	25 %	325965529
98	NC_015147	GCCC	2	8	45305	45312	0 %	0 %	25 %	75 %	325965529
99	NC_015147	GCCC	2	8	45364	45371	0 %	0 %	25 %	75 %	325965529
100	NC_015147	CGGT	2	8	45449	45456	0 %	25 %	50 %	25 %	325965529
101	NC_015147	CCGA	2	8	46690	46697	25 %	0 %	25 %	50 %	325965530
102	NC_015147	CGAG	2	8	46712	46719	25 %	0 %	50 %	25 %	325965530
103	NC_015147	CGCC	2	8	46842	46849	0 %	0 %	25 %	75 %	325965530
104	NC_015147	GGCC	2	8	47047	47054	0 %	0 %	50 %	50 %	325965531
105	NC_015147	CCGC	2	8	47227	47234	0 %	0 %	25 %	75 %	325965531
106	NC_015147	GCCA	2	8	47472	47479	25 %	0 %	25 %	50 %	325965531
107	NC_015147	GGCC	2	8	47573	47580	0 %	0 %	50 %	50 %	325965531
108	NC_015147	GGCT	2	8	47645	47652	0 %	25 %	50 %	25 %	325965532
109	NC_015147	CTCG	2	8	48037	48044	0 %	25 %	25 %	50 %	325965532
110	NC_015147	CGAC	2	8	48144	48151	25 %	0 %	25 %	50 %	325965532
111	NC_015147	CGCC	2	8	48343	48350	0 %	0 %	25 %	75 %	325965532
112	NC_015147	GATG	2	8	49730	49737	25 %	25 %	50 %	0 %	325965533
113	NC_015147	GACC	2	8	50379	50386	25 %	0 %	25 %	50 %	325965534
114	NC_015147	CAGG	2	8	50434	50441	25 %	0 %	50 %	25 %	325965534
115	NC_015147	CGTC	2	8	51043	51050	0 %	25 %	25 %	50 %	325965535
116	NC_015147	GTCG	2	8	51251	51258	0 %	25 %	50 %	25 %	325965535
117	NC_015147	GCTG	2	8	51530	51537	0 %	25 %	50 %	25 %	325965535
118	NC_015147	CATC	2	8	51996	52003	25 %	25 %	0 %	50 %	325965536
119	NC_015147	CGCA	2	8	52042	52049	25 %	0 %	25 %	50 %	325965536
120	NC_015147	CATC	2	8	52449	52456	25 %	25 %	0 %	50 %	325965536
121	NC_015147	GGGC	2	8	52998	53005	0 %	0 %	75 %	25 %	325965537
122	NC_015147	GGGC	2	8	53402	53409	0 %	0 %	75 %	25 %	325965537
123	NC_015147	TGCT	2	8	53943	53950	0 %	50 %	25 %	25 %	325965538
124	NC_015147	GTTC	2	8	54239	54246	0 %	50 %	25 %	25 %	325965538
125	NC_015147	CCTC	2	8	54259	54266	0 %	25 %	0 %	75 %	325965538
126	NC_015147	CACG	2	8	54833	54840	25 %	0 %	25 %	50 %	325965539
127	NC_015147	CTGC	2	8	54841	54848	0 %	25 %	25 %	50 %	325965539
128	NC_015147	CAGC	2	8	55303	55310	25 %	0 %	25 %	50 %	325965539
129	NC_015147	AGCA	2	8	55554	55561	50 %	0 %	25 %	25 %	325965539
130	NC_015147	CGGC	2	8	56395	56402	0 %	0 %	50 %	50 %	325965542
131	NC_015147	CACG	2	8	56420	56427	25 %	0 %	25 %	50 %	325965542
132	NC_015147	CCAG	2	8	56750	56757	25 %	0 %	25 %	50 %	325965542
133	NC_015147	GGGA	2	8	56791	56798	25 %	0 %	75 %	0 %	325965542
134	NC_015147	GCCC	2	8	56828	56835	0 %	0 %	25 %	75 %	325965542
135	NC_015147	GCCC	2	8	56957	56964	0 %	0 %	25 %	75 %	325965543
136	NC_015147	GCCG	2	8	56966	56973	0 %	0 %	50 %	50 %	325965543
137	NC_015147	CGTC	2	8	58017	58024	0 %	25 %	25 %	50 %	325965543
138	NC_015147	TCCG	2	8	58243	58250	0 %	25 %	25 %	50 %	325965543
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.