MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Arthrobacter phenanthrenivorans Sphe3 plasmid pASPHE301

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015146	CGCGTC	2	12	585	596	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325965295
2	NC_015146	CGGTGC	2	12	4673	4684	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325965301
3	NC_015146	CGGCGT	2	12	5048	5059	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325965301
4	NC_015146	ATGGCG	2	12	5869	5880	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325965302
5	NC_015146	CCGGGC	2	12	8256	8267	0 %	0 %	50 %	50 %	325965303
6	NC_015146	CCACGT	2	12	14697	14708	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325965307
7	NC_015146	CCGGGG	2	12	15431	15442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325965308
8	NC_015146	CCGGCG	2	12	17695	17706	0 %	0 %	50 %	50 %	325965311
9	NC_015146	CGGCCC	2	12	19338	19349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325965313
10	NC_015146	CTTCGC	2	12	24817	24828	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325965322
11	NC_015146	CGGGAG	2	12	26796	26807	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	325965324
12	NC_015146	ACTTTG	2	12	28589	28600	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325965327
13	NC_015146	AGGCAC	2	12	31567	31578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325965328
14	NC_015146	GGCCAG	2	12	32221	32232	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325965329
15	NC_015146	GTCAGG	2	12	32444	32455	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325965329
16	NC_015146	CCGGAG	2	12	32939	32950	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325965329
17	NC_015146	CCGCGG	2	12	34695	34706	0 %	0 %	50 %	50 %	325965331
18	NC_015146	CAGGCC	3	18	34879	34896	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325965331
19	NC_015146	GTCGGC	2	12	40924	40935	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325965334
20	NC_015146	ACTCGC	2	12	48744	48755	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325965340
21	NC_015146	ATCTCG	2	12	60728	60739	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325965346
22	NC_015146	ACGGCG	2	12	69034	69045	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325965358
23	NC_015146	CGATCG	2	12	69877	69888	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325965358
24	NC_015146	CCGCTG	2	12	79275	79286	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325965365
25	NC_015146	CTGCCG	2	12	87505	87516	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325965373
26	NC_015146	GCGATG	2	12	89357	89368	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325965375
27	NC_015146	TGTTCG	2	12	89706	89717	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	325965375
28	NC_015146	TCGAAA	2	12	89720	89731	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325965375
29	NC_015146	CCTGGG	2	12	91157	91168	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325965376
30	NC_015146	CTTCCG	2	12	91277	91288	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325965376
31	NC_015146	GCGGGC	2	12	99079	99090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325965384
32	NC_015146	CCGGCG	2	12	107045	107056	0 %	0 %	50 %	50 %	325965393
33	NC_015146	GTGCCT	2	12	107114	107125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325965393
34	NC_015146	GCCCGG	2	12	109888	109899	0 %	0 %	50 %	50 %	325965396
35	NC_015146	GGCCGG	2	12	110685	110696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325965398
36	NC_015146	CCTGAG	2	12	111226	111237	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325965399
37	NC_015146	GGCGAC	2	12	112187	112198	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325965400
38	NC_015146	CTACCT	2	12	112877	112888	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	325965400
39	NC_015146	GCGTAT	2	12	113829	113840	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325965401
40	NC_015146	CACCTG	2	12	116264	116275	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325965404
41	NC_015146	TCCCCG	2	12	116400	116411	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	325965404
42	NC_015146	AACAGC	2	12	117575	117586	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	325965406
43	NC_015146	CGGCCG	2	12	125800	125811	0 %	0 %	50 %	50 %	325965414
44	NC_015146	TTCGGC	2	12	126086	126097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325965414
45	NC_015146	CGGTGT	2	12	128913	128924	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	325965415
46	NC_015146	CCGGTA	2	12	130826	130837	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325965417
47	NC_015146	ACCGCC	2	12	131065	131076	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	325965417
48	NC_015146	ATGATC	2	12	131456	131467	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325965417
49	NC_015146	CCATGA	2	12	133216	133227	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325965420
50	NC_015146	CAGCGT	2	12	134205	134216	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325965422
51	NC_015146	GCCGTA	2	12	143412	143423	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325965430
52	NC_015146	CTCGGT	2	12	143476	143487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325965430
53	NC_015146	CGGATG	2	12	158849	158860	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325965446
54	NC_015146	CTGCCG	2	12	163015	163026	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325965450
55	NC_015146	GCGATG	2	12	164867	164878	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325965452
56	NC_015146	TGTTCG	2	12	165216	165227	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	325965452
57	NC_015146	TCGAAA	2	12	165230	165241	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325965452
58	NC_015146	CCTGGG	2	12	166667	166678	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325965453
59	NC_015146	CTTCCG	2	12	166787	166798	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325965453
60	NC_015146	CGAGGT	2	12	167601	167612	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325965454
61	NC_015146	GGACCT	2	12	167618	167629	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325965454
62	NC_015146	GCAACG	2	12	172112	172123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325965461
63	NC_015146	CAGCTG	2	12	174664	174675	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325965463
64	NC_015146	CGAAGC	2	12	182110	182121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325965473
65	NC_015146	CCGGAA	2	12	185164	185175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325965477
66	NC_015146	AGCGGC	2	12	185997	186008	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325965477
67	NC_015146	GGCCGA	2	12	186635	186646	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325965478
68	NC_015146	AGACCA	2	12	186815	186826	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	325965478
69	NC_015146	TGCCGA	2	12	187305	187316	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325965479

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.