MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Arthrobacter phenanthrenivorans Sphe3 plasmid pASPHE301

Total Repeats: 163

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015146	TCCGC	2	10	2847	2856	0 %	20 %	20 %	60 %	325965298
2	NC_015146	GCCCG	2	10	2963	2972	0 %	0 %	40 %	60 %	325965299
3	NC_015146	GCCTG	2	10	3610	3619	0 %	20 %	40 %	40 %	325965299
4	NC_015146	GGGGA	2	10	5452	5461	20 %	0 %	80 %	0 %	325965301
5	NC_015146	GATCA	2	10	6828	6837	40 %	20 %	20 %	20 %	325965302
6	NC_015146	CAGTT	2	10	7442	7451	20 %	40 %	20 %	20 %	325965303
7	NC_015146	GAGCG	2	10	7543	7552	20 %	0 %	60 %	20 %	325965303
8	NC_015146	TGCGC	2	10	9069	9078	0 %	20 %	40 %	40 %	325965303
9	NC_015146	TTGGC	2	10	16234	16243	0 %	40 %	40 %	20 %	325965310
10	NC_015146	CACGG	2	10	18045	18054	20 %	0 %	40 %	40 %	325965312
11	NC_015146	GTGCA	2	10	18180	18189	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015146	TTGGC	2	10	20176	20185	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015146	CAACC	2	10	21215	21224	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_015146	CGAAG	2	10	23548	23557	40 %	0 %	40 %	20 %	325965320
15	NC_015146	AACTT	2	10	24684	24693	40 %	40 %	0 %	20 %	325965322
16	NC_015146	GGCCC	2	10	26426	26435	0 %	0 %	40 %	60 %	325965323
17	NC_015146	AAGCC	2	10	29391	29400	40 %	0 %	20 %	40 %	325965327
18	NC_015146	GCGTG	2	10	31793	31802	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015146	CCCGG	2	10	32338	32347	0 %	0 %	40 %	60 %	325965329
20	NC_015146	GGATC	2	10	34009	34018	20 %	20 %	40 %	20 %	325965330
21	NC_015146	TTGCG	2	10	34258	34267	0 %	40 %	40 %	20 %	325965330
22	NC_015146	CACCG	2	10	36810	36819	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_015146	GATCT	2	10	37626	37635	20 %	40 %	20 %	20 %	325965333
24	NC_015146	TCCCG	2	10	38129	38138	0 %	20 %	20 %	60 %	325965333
25	NC_015146	CTCCA	2	10	38684	38693	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
26	NC_015146	GATCT	2	10	39969	39978	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015146	CGCGT	2	10	40999	41008	0 %	20 %	40 %	40 %	325965334
28	NC_015146	ATGCG	2	10	43114	43123	20 %	20 %	40 %	20 %	325965335
29	NC_015146	TGCAG	2	10	43497	43506	20 %	20 %	40 %	20 %	325965336
30	NC_015146	TCGTC	2	10	43615	43624	0 %	40 %	20 %	40 %	325965336
31	NC_015146	AGGTG	2	10	44287	44296	20 %	20 %	60 %	0 %	325965336
32	NC_015146	GGCTG	2	10	46112	46121	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015146	CCCAT	2	10	46393	46402	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
34	NC_015146	TCAAA	2	10	46493	46502	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015146	GCGTC	2	10	48101	48110	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_015146	CCGGG	2	10	50375	50384	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_015146	CGGTC	2	10	50655	50664	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_015146	GCGTC	2	10	57011	57020	0 %	20 %	40 %	40 %	325965344
39	NC_015146	GGCCA	2	10	58611	58620	20 %	0 %	40 %	40 %	325965345
40	NC_015146	CCGCG	2	10	61396	61405	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41	NC_015146	ACGGA	2	10	63829	63838	40 %	0 %	40 %	20 %	325965351
42	NC_015146	GCGTT	2	10	65197	65206	0 %	40 %	40 %	20 %	325965352
43	NC_015146	GGCTG	2	10	67866	67875	0 %	20 %	60 %	20 %	325965357
44	NC_015146	CCCAT	2	10	68147	68156	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
45	NC_015146	TCAAA	2	10	68247	68256	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015146	GGCCG	2	10	68639	68648	0 %	0 %	60 %	40 %	325965358
47	NC_015146	CCGTG	2	10	69791	69800	0 %	20 %	40 %	40 %	325965358
48	NC_015146	CGGGC	2	10	70197	70206	0 %	0 %	60 %	40 %	325965358
49	NC_015146	CGAGG	2	10	70250	70259	20 %	0 %	60 %	20 %	325965358
50	NC_015146	CGTGG	2	10	75166	75175	0 %	20 %	60 %	20 %	325965360
51	NC_015146	CCCAG	2	10	85769	85778	20 %	0 %	20 %	60 %	325965372
52	NC_015146	GCCAG	2	10	85899	85908	20 %	0 %	40 %	40 %	325965372
53	NC_015146	CTTCC	2	10	87681	87690	0 %	40 %	0 %	60 %	325965374
54	NC_015146	GGTCC	2	10	88340	88349	0 %	20 %	40 %	40 %	325965374
55	NC_015146	GCCCT	2	10	88795	88804	0 %	20 %	20 %	60 %	325965374
56	NC_015146	GCGCC	2	10	89414	89423	0 %	0 %	40 %	60 %	325965375
57	NC_015146	CGGTG	2	10	90001	90010	0 %	20 %	60 %	20 %	325965375
58	NC_015146	CAGCG	2	10	93964	93973	20 %	0 %	40 %	40 %	325965379
59	NC_015146	GCCGC	2	10	94227	94236	0 %	0 %	40 %	60 %	325965379
60	NC_015146	CAGAT	2	10	95119	95128	40 %	20 %	20 %	20 %	325965380
61	NC_015146	TGCGT	2	10	99502	99511	0 %	40 %	40 %	20 %	325965385
62	NC_015146	GATCC	2	10	103110	103119	20 %	20 %	20 %	40 %	325965388
63	NC_015146	GCAGC	2	10	104495	104504	20 %	0 %	40 %	40 %	325965389
64	NC_015146	CGGCG	2	10	105681	105690	0 %	0 %	60 %	40 %	325965391
65	NC_015146	CCCCG	2	10	106124	106133	0 %	0 %	20 %	80 %	325965392
66	NC_015146	GATGG	2	10	107650	107659	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015146	GTTCC	2	10	108156	108165	0 %	40 %	20 %	40 %	325965394
68	NC_015146	GCCGG	2	10	108637	108646	0 %	0 %	60 %	40 %	325965394
69	NC_015146	ACCTG	2	10	108934	108943	20 %	20 %	20 %	40 %	325965395
70	NC_015146	GGACG	2	10	109082	109091	20 %	0 %	60 %	20 %	325965395
71	NC_015146	CGGTC	2	10	109407	109416	0 %	20 %	40 %	40 %	325965396
72	NC_015146	GCGCC	2	10	109510	109519	0 %	0 %	40 %	60 %	325965396
73	NC_015146	CCCTT	2	10	109908	109917	0 %	40 %	0 %	60 %	325965396
74	NC_015146	CCGGC	2	10	110720	110729	0 %	0 %	40 %	60 %	325965398
75	NC_015146	GGCGC	2	10	111258	111267	0 %	0 %	60 %	40 %	325965399
76	NC_015146	CGCTC	2	10	112204	112213	0 %	20 %	20 %	60 %	325965400
77	NC_015146	CGCTG	2	10	112709	112718	0 %	20 %	40 %	40 %	325965400
78	NC_015146	CGGCG	2	10	112911	112920	0 %	0 %	60 %	40 %	325965400
79	NC_015146	TCCGT	2	10	112936	112945	0 %	40 %	20 %	40 %	325965400
80	NC_015146	TGCCG	2	10	114204	114213	0 %	20 %	40 %	40 %	325965401
81	NC_015146	CCGCG	2	10	116495	116504	0 %	0 %	40 %	60 %	325965404
82	NC_015146	GGGGT	2	10	117723	117732	0 %	20 %	80 %	0 %	325965406
83	NC_015146	CCCTG	2	10	118453	118462	0 %	20 %	20 %	60 %	325965407
84	NC_015146	CAGGG	2	10	125375	125384	20 %	0 %	60 %	20 %	325965413
85	NC_015146	CCGCA	2	10	125849	125858	20 %	0 %	20 %	60 %	325965414
86	NC_015146	GGCGA	2	10	126302	126311	20 %	0 %	60 %	20 %	325965414
87	NC_015146	GCCGT	2	10	126540	126549	0 %	20 %	40 %	40 %	325965414
88	NC_015146	ACCGA	2	10	127434	127443	40 %	0 %	20 %	40 %	325965414
89	NC_015146	GATCG	2	10	128887	128896	20 %	20 %	40 %	20 %	325965415
90	NC_015146	GTGCG	2	10	129564	129573	0 %	20 %	60 %	20 %	325965416
91	NC_015146	TCCAG	2	10	129704	129713	20 %	20 %	20 %	40 %	325965416
92	NC_015146	ACCAG	2	10	131976	131985	40 %	0 %	20 %	40 %	325965418
93	NC_015146	TCAAG	2	10	133956	133965	40 %	20 %	20 %	20 %	325965421
94	NC_015146	CCGGA	2	10	134455	134464	20 %	0 %	40 %	40 %	325965422
95	NC_015146	GCTCG	2	10	134862	134871	0 %	20 %	40 %	40 %	325965422
96	NC_015146	ACCGG	2	10	135510	135519	20 %	0 %	40 %	40 %	325965423
97	NC_015146	GGCGC	2	10	136234	136243	0 %	0 %	60 %	40 %	325965424
98	NC_015146	GCTGG	2	10	136469	136478	0 %	20 %	60 %	20 %	325965424
99	NC_015146	ACCAC	2	10	139200	139209	40 %	0 %	0 %	60 %	325965426
100	NC_015146	CTGGT	2	10	141307	141316	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015146	TGGTG	2	10	141319	141328	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015146	TGTGG	2	10	141339	141348	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015146	CTGGT	2	10	141394	141403	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_015146	TGTGG	2	10	141415	141424	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015146	TGTGG	2	10	141437	141446	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015146	TGGTG	2	10	141460	141469	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015146	TGGTG	2	10	141499	141508	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015146	TGTGG	2	10	141540	141549	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015146	TGGTG	2	10	141585	141594	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015146	GGTGC	2	10	141703	141712	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_015146	TGGTG	2	10	141802	141811	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015146	TTCCA	2	10	142569	142578	20 %	40 %	0 %	40 %	325965429
113	NC_015146	CGAGG	2	10	143111	143120	20 %	0 %	60 %	20 %	325965430
114	NC_015146	CCCTG	2	10	144912	144921	0 %	20 %	20 %	60 %	325965432
115	NC_015146	GAACC	2	10	145608	145617	40 %	0 %	20 %	40 %	325965432
116	NC_015146	CGGTC	2	10	147156	147165	0 %	20 %	40 %	40 %	325965434
117	NC_015146	CGGCC	2	10	147392	147401	0 %	0 %	40 %	60 %	325965434
118	NC_015146	GGCTG	2	10	148671	148680	0 %	20 %	60 %	20 %	325965435
119	NC_015146	CAAGC	2	10	150781	150790	40 %	0 %	20 %	40 %	325965437
120	NC_015146	TGCAG	2	10	151734	151743	20 %	20 %	40 %	20 %	325965438
121	NC_015146	TCGAT	2	10	153928	153937	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015146	CATAG	2	10	153954	153963	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015146	GGTCT	2	10	154624	154633	0 %	40 %	40 %	20 %	325965443
124	NC_015146	CCCAG	2	10	155634	155643	20 %	0 %	20 %	60 %	325965443
125	NC_015146	AGTCC	2	10	156891	156900	20 %	20 %	20 %	40 %	325965444
126	NC_015146	CTGTA	2	10	157891	157900	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_015146	GGGTG	2	10	157949	157958	0 %	20 %	80 %	0 %	325965445
128	NC_015146	GCCCG	2	10	160871	160880	0 %	0 %	40 %	60 %	325965447
129	NC_015146	GATGC	2	10	161304	161313	20 %	20 %	40 %	20 %	325965447
130	NC_015146	CTTCC	2	10	163191	163200	0 %	40 %	0 %	60 %	325965451
131	NC_015146	GGTCC	2	10	163850	163859	0 %	20 %	40 %	40 %	325965451
132	NC_015146	GCCCT	2	10	164305	164314	0 %	20 %	20 %	60 %	325965451
133	NC_015146	GCGCC	2	10	164924	164933	0 %	0 %	40 %	60 %	325965452
134	NC_015146	CGGTG	2	10	165511	165520	0 %	20 %	60 %	20 %	325965452
135	NC_015146	TCGCT	2	10	167447	167456	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_015146	GCAGC	2	10	168126	168135	20 %	0 %	40 %	40 %	325965455
137	NC_015146	TCCGC	2	10	169995	170004	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
138	NC_015146	GCCCG	2	10	170692	170701	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
139	NC_015146	TCCGC	2	10	171449	171458	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_015146	CCGGG	2	10	172713	172722	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
141	NC_015146	GGCAG	2	10	172817	172826	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
142	NC_015146	AGCTT	2	10	173133	173142	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_015146	GCCCG	2	10	173158	173167	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
144	NC_015146	CACCG	2	10	173692	173701	20 %	0 %	20 %	60 %	325965462
145	NC_015146	GCCAA	2	10	174090	174099	40 %	0 %	20 %	40 %	325965462
146	NC_015146	GCTTC	2	10	174748	174757	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_015146	GGCCG	2	10	175716	175725	0 %	0 %	60 %	40 %	325965464
148	NC_015146	GACCG	2	10	175952	175961	20 %	0 %	40 %	40 %	325965464
149	NC_015146	TCCGC	2	10	177645	177654	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
150	NC_015146	GAAGG	2	10	178946	178955	40 %	0 %	60 %	0 %	325965468
151	NC_015146	GGGGA	2	10	180893	180902	20 %	0 %	80 %	0 %	325965471
152	NC_015146	CCAAC	2	10	180934	180943	40 %	0 %	0 %	60 %	325965471
153	NC_015146	GTGAA	2	10	182248	182257	40 %	20 %	40 %	0 %	325965473
154	NC_015146	GCCGC	2	10	183684	183693	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
155	NC_015146	TGAGA	2	10	183750	183759	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015146	CGGAG	2	10	183870	183879	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
157	NC_015146	GCGCT	2	10	184155	184164	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
158	NC_015146	GGGGA	2	10	184172	184181	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015146	CGACG	2	10	184206	184215	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
160	NC_015146	GCGCC	2	10	186263	186272	0 %	0 %	40 %	60 %	325965478
161	NC_015146	CTGGC	2	10	186993	187002	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
162	NC_015146	GCCGC	2	10	188656	188665	0 %	0 %	40 %	60 %	325965481
163	NC_015146	GCCAG	2	10	188968	188977	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.