MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Arthrobacter phenanthrenivorans Sphe3 plasmid pASPHE301

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015146	GTGCA	2	10	18180	18189	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015146	TTGGC	2	10	20176	20185	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015146	CAACC	2	10	21215	21224	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_015146	GCGTG	2	10	31793	31802	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015146	CACCG	2	10	36810	36819	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_015146	CTCCA	2	10	38684	38693	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_015146	GATCT	2	10	39969	39978	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015146	GGCTG	2	10	46112	46121	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015146	CCCAT	2	10	46393	46402	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_015146	TCAAA	2	10	46493	46502	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015146	GCGTC	2	10	48101	48110	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015146	CCGGG	2	10	50375	50384	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_015146	CGGTC	2	10	50655	50664	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_015146	CCGCG	2	10	61396	61405	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_015146	CCCAT	2	10	68147	68156	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_015146	TCAAA	2	10	68247	68256	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015146	GATGG	2	10	107650	107659	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015146	CTGGT	2	10	141307	141316	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015146	TGGTG	2	10	141319	141328	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015146	TGTGG	2	10	141339	141348	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015146	CTGGT	2	10	141394	141403	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015146	TGTGG	2	10	141415	141424	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015146	TGTGG	2	10	141437	141446	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015146	TGGTG	2	10	141460	141469	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015146	TGGTG	2	10	141499	141508	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015146	TGTGG	2	10	141540	141549	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015146	TGGTG	2	10	141585	141594	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015146	GGTGC	2	10	141703	141712	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015146	TGGTG	2	10	141802	141811	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015146	TCGAT	2	10	153928	153937	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015146	CATAG	2	10	153954	153963	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015146	CTGTA	2	10	157891	157900	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015146	TCGCT	2	10	167447	167456	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_015146	TCCGC	2	10	169995	170004	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_015146	GCCCG	2	10	170692	170701	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_015146	TCCGC	2	10	171449	171458	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_015146	CCGGG	2	10	172713	172722	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38	NC_015146	GGCAG	2	10	172817	172826	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015146	AGCTT	2	10	173133	173142	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015146	GCCCG	2	10	173158	173167	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41	NC_015146	GCTTC	2	10	174748	174757	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_015146	TCCGC	2	10	177645	177654	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_015146	GCCGC	2	10	183684	183693	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
44	NC_015146	TGAGA	2	10	183750	183759	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015146	CGGAG	2	10	183870	183879	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015146	GCGCT	2	10	184155	184164	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_015146	GGGGA	2	10	184172	184181	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015146	CGACG	2	10	184206	184215	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_015146	CTGGC	2	10	186993	187002	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015146	GCCAG	2	10	188968	188977	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.