MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Arthrobacter phenanthrenivorans Sphe3 plasmid pASPHE301

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015146	TCCGC	2	10	2847	2856	0 %	20 %	20 %	60 %	325965298
2	NC_015146	GCCCG	2	10	2963	2972	0 %	0 %	40 %	60 %	325965299
3	NC_015146	GCCTG	2	10	3610	3619	0 %	20 %	40 %	40 %	325965299
4	NC_015146	GGGGA	2	10	5452	5461	20 %	0 %	80 %	0 %	325965301
5	NC_015146	GATCA	2	10	6828	6837	40 %	20 %	20 %	20 %	325965302
6	NC_015146	CAGTT	2	10	7442	7451	20 %	40 %	20 %	20 %	325965303
7	NC_015146	GAGCG	2	10	7543	7552	20 %	0 %	60 %	20 %	325965303
8	NC_015146	TGCGC	2	10	9069	9078	0 %	20 %	40 %	40 %	325965303
9	NC_015146	TTGGC	2	10	16234	16243	0 %	40 %	40 %	20 %	325965310
10	NC_015146	CACGG	2	10	18045	18054	20 %	0 %	40 %	40 %	325965312
11	NC_015146	CGAAG	2	10	23548	23557	40 %	0 %	40 %	20 %	325965320
12	NC_015146	AACTT	2	10	24684	24693	40 %	40 %	0 %	20 %	325965322
13	NC_015146	GGCCC	2	10	26426	26435	0 %	0 %	40 %	60 %	325965323
14	NC_015146	AAGCC	2	10	29391	29400	40 %	0 %	20 %	40 %	325965327
15	NC_015146	CCCGG	2	10	32338	32347	0 %	0 %	40 %	60 %	325965329
16	NC_015146	GGATC	2	10	34009	34018	20 %	20 %	40 %	20 %	325965330
17	NC_015146	TTGCG	2	10	34258	34267	0 %	40 %	40 %	20 %	325965330
18	NC_015146	GATCT	2	10	37626	37635	20 %	40 %	20 %	20 %	325965333
19	NC_015146	TCCCG	2	10	38129	38138	0 %	20 %	20 %	60 %	325965333
20	NC_015146	CGCGT	2	10	40999	41008	0 %	20 %	40 %	40 %	325965334
21	NC_015146	ATGCG	2	10	43114	43123	20 %	20 %	40 %	20 %	325965335
22	NC_015146	TGCAG	2	10	43497	43506	20 %	20 %	40 %	20 %	325965336
23	NC_015146	TCGTC	2	10	43615	43624	0 %	40 %	20 %	40 %	325965336
24	NC_015146	AGGTG	2	10	44287	44296	20 %	20 %	60 %	0 %	325965336
25	NC_015146	GCGTC	2	10	57011	57020	0 %	20 %	40 %	40 %	325965344
26	NC_015146	GGCCA	2	10	58611	58620	20 %	0 %	40 %	40 %	325965345
27	NC_015146	ACGGA	2	10	63829	63838	40 %	0 %	40 %	20 %	325965351
28	NC_015146	GCGTT	2	10	65197	65206	0 %	40 %	40 %	20 %	325965352
29	NC_015146	GGCTG	2	10	67866	67875	0 %	20 %	60 %	20 %	325965357
30	NC_015146	GGCCG	2	10	68639	68648	0 %	0 %	60 %	40 %	325965358
31	NC_015146	CCGTG	2	10	69791	69800	0 %	20 %	40 %	40 %	325965358
32	NC_015146	CGGGC	2	10	70197	70206	0 %	0 %	60 %	40 %	325965358
33	NC_015146	CGAGG	2	10	70250	70259	20 %	0 %	60 %	20 %	325965358
34	NC_015146	CGTGG	2	10	75166	75175	0 %	20 %	60 %	20 %	325965360
35	NC_015146	CCCAG	2	10	85769	85778	20 %	0 %	20 %	60 %	325965372
36	NC_015146	GCCAG	2	10	85899	85908	20 %	0 %	40 %	40 %	325965372
37	NC_015146	CTTCC	2	10	87681	87690	0 %	40 %	0 %	60 %	325965374
38	NC_015146	GGTCC	2	10	88340	88349	0 %	20 %	40 %	40 %	325965374
39	NC_015146	GCCCT	2	10	88795	88804	0 %	20 %	20 %	60 %	325965374
40	NC_015146	GCGCC	2	10	89414	89423	0 %	0 %	40 %	60 %	325965375
41	NC_015146	CGGTG	2	10	90001	90010	0 %	20 %	60 %	20 %	325965375
42	NC_015146	CAGCG	2	10	93964	93973	20 %	0 %	40 %	40 %	325965379
43	NC_015146	GCCGC	2	10	94227	94236	0 %	0 %	40 %	60 %	325965379
44	NC_015146	CAGAT	2	10	95119	95128	40 %	20 %	20 %	20 %	325965380
45	NC_015146	TGCGT	2	10	99502	99511	0 %	40 %	40 %	20 %	325965385
46	NC_015146	GATCC	2	10	103110	103119	20 %	20 %	20 %	40 %	325965388
47	NC_015146	GCAGC	2	10	104495	104504	20 %	0 %	40 %	40 %	325965389
48	NC_015146	CGGCG	2	10	105681	105690	0 %	0 %	60 %	40 %	325965391
49	NC_015146	CCCCG	2	10	106124	106133	0 %	0 %	20 %	80 %	325965392
50	NC_015146	GTTCC	2	10	108156	108165	0 %	40 %	20 %	40 %	325965394
51	NC_015146	GCCGG	2	10	108637	108646	0 %	0 %	60 %	40 %	325965394
52	NC_015146	ACCTG	2	10	108934	108943	20 %	20 %	20 %	40 %	325965395
53	NC_015146	GGACG	2	10	109082	109091	20 %	0 %	60 %	20 %	325965395
54	NC_015146	CGGTC	2	10	109407	109416	0 %	20 %	40 %	40 %	325965396
55	NC_015146	GCGCC	2	10	109510	109519	0 %	0 %	40 %	60 %	325965396
56	NC_015146	CCCTT	2	10	109908	109917	0 %	40 %	0 %	60 %	325965396
57	NC_015146	CCGGC	2	10	110720	110729	0 %	0 %	40 %	60 %	325965398
58	NC_015146	GGCGC	2	10	111258	111267	0 %	0 %	60 %	40 %	325965399
59	NC_015146	CGCTC	2	10	112204	112213	0 %	20 %	20 %	60 %	325965400
60	NC_015146	CGCTG	2	10	112709	112718	0 %	20 %	40 %	40 %	325965400
61	NC_015146	CGGCG	2	10	112911	112920	0 %	0 %	60 %	40 %	325965400
62	NC_015146	TCCGT	2	10	112936	112945	0 %	40 %	20 %	40 %	325965400
63	NC_015146	TGCCG	2	10	114204	114213	0 %	20 %	40 %	40 %	325965401
64	NC_015146	CCGCG	2	10	116495	116504	0 %	0 %	40 %	60 %	325965404
65	NC_015146	GGGGT	2	10	117723	117732	0 %	20 %	80 %	0 %	325965406
66	NC_015146	CCCTG	2	10	118453	118462	0 %	20 %	20 %	60 %	325965407
67	NC_015146	CAGGG	2	10	125375	125384	20 %	0 %	60 %	20 %	325965413
68	NC_015146	CCGCA	2	10	125849	125858	20 %	0 %	20 %	60 %	325965414
69	NC_015146	GGCGA	2	10	126302	126311	20 %	0 %	60 %	20 %	325965414
70	NC_015146	GCCGT	2	10	126540	126549	0 %	20 %	40 %	40 %	325965414
71	NC_015146	ACCGA	2	10	127434	127443	40 %	0 %	20 %	40 %	325965414
72	NC_015146	GATCG	2	10	128887	128896	20 %	20 %	40 %	20 %	325965415
73	NC_015146	GTGCG	2	10	129564	129573	0 %	20 %	60 %	20 %	325965416
74	NC_015146	TCCAG	2	10	129704	129713	20 %	20 %	20 %	40 %	325965416
75	NC_015146	ACCAG	2	10	131976	131985	40 %	0 %	20 %	40 %	325965418
76	NC_015146	TCAAG	2	10	133956	133965	40 %	20 %	20 %	20 %	325965421
77	NC_015146	CCGGA	2	10	134455	134464	20 %	0 %	40 %	40 %	325965422
78	NC_015146	GCTCG	2	10	134862	134871	0 %	20 %	40 %	40 %	325965422
79	NC_015146	ACCGG	2	10	135510	135519	20 %	0 %	40 %	40 %	325965423
80	NC_015146	GGCGC	2	10	136234	136243	0 %	0 %	60 %	40 %	325965424
81	NC_015146	GCTGG	2	10	136469	136478	0 %	20 %	60 %	20 %	325965424
82	NC_015146	ACCAC	2	10	139200	139209	40 %	0 %	0 %	60 %	325965426
83	NC_015146	TTCCA	2	10	142569	142578	20 %	40 %	0 %	40 %	325965429
84	NC_015146	CGAGG	2	10	143111	143120	20 %	0 %	60 %	20 %	325965430
85	NC_015146	CCCTG	2	10	144912	144921	0 %	20 %	20 %	60 %	325965432
86	NC_015146	GAACC	2	10	145608	145617	40 %	0 %	20 %	40 %	325965432
87	NC_015146	CGGTC	2	10	147156	147165	0 %	20 %	40 %	40 %	325965434
88	NC_015146	CGGCC	2	10	147392	147401	0 %	0 %	40 %	60 %	325965434
89	NC_015146	GGCTG	2	10	148671	148680	0 %	20 %	60 %	20 %	325965435
90	NC_015146	CAAGC	2	10	150781	150790	40 %	0 %	20 %	40 %	325965437
91	NC_015146	TGCAG	2	10	151734	151743	20 %	20 %	40 %	20 %	325965438
92	NC_015146	GGTCT	2	10	154624	154633	0 %	40 %	40 %	20 %	325965443
93	NC_015146	CCCAG	2	10	155634	155643	20 %	0 %	20 %	60 %	325965443
94	NC_015146	AGTCC	2	10	156891	156900	20 %	20 %	20 %	40 %	325965444
95	NC_015146	GGGTG	2	10	157949	157958	0 %	20 %	80 %	0 %	325965445
96	NC_015146	GCCCG	2	10	160871	160880	0 %	0 %	40 %	60 %	325965447
97	NC_015146	GATGC	2	10	161304	161313	20 %	20 %	40 %	20 %	325965447
98	NC_015146	CTTCC	2	10	163191	163200	0 %	40 %	0 %	60 %	325965451
99	NC_015146	GGTCC	2	10	163850	163859	0 %	20 %	40 %	40 %	325965451
100	NC_015146	GCCCT	2	10	164305	164314	0 %	20 %	20 %	60 %	325965451
101	NC_015146	GCGCC	2	10	164924	164933	0 %	0 %	40 %	60 %	325965452
102	NC_015146	CGGTG	2	10	165511	165520	0 %	20 %	60 %	20 %	325965452
103	NC_015146	GCAGC	2	10	168126	168135	20 %	0 %	40 %	40 %	325965455
104	NC_015146	CACCG	2	10	173692	173701	20 %	0 %	20 %	60 %	325965462
105	NC_015146	GCCAA	2	10	174090	174099	40 %	0 %	20 %	40 %	325965462
106	NC_015146	GGCCG	2	10	175716	175725	0 %	0 %	60 %	40 %	325965464
107	NC_015146	GACCG	2	10	175952	175961	20 %	0 %	40 %	40 %	325965464
108	NC_015146	GAAGG	2	10	178946	178955	40 %	0 %	60 %	0 %	325965468
109	NC_015146	GGGGA	2	10	180893	180902	20 %	0 %	80 %	0 %	325965471
110	NC_015146	CCAAC	2	10	180934	180943	40 %	0 %	0 %	60 %	325965471
111	NC_015146	GTGAA	2	10	182248	182257	40 %	20 %	40 %	0 %	325965473
112	NC_015146	GCGCC	2	10	186263	186272	0 %	0 %	40 %	60 %	325965478
113	NC_015146	GCCGC	2	10	188656	188665	0 %	0 %	40 %	60 %	325965481

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.