MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Arthrobacter phenanthrenivorans Sphe3 plasmid pASPHE301

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015146	GCGG	2	8	47	54	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015146	GCCG	2	8	370	377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015146	GTTG	2	8	1060	1067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015146	GCAA	2	8	1728	1735	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015146	ATCC	2	8	11952	11959	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015146	CGGG	2	8	13378	13385	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015146	CATC	2	8	17370	17377	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015146	TCGT	2	8	18437	18444	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015146	TCAT	2	8	19501	19508	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015146	TTGG	2	8	28278	28285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015146	TGCG	2	8	28360	28367	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015146	GCAG	2	8	29459	29466	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015146	GCAG	2	8	29478	29485	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015146	ATTT	2	8	29508	29515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015146	GCTG	2	8	31906	31913	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015146	TCGG	2	8	31919	31926	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015146	GGGC	2	8	31972	31979	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015146	TCGT	2	8	36637	36644	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015146	AGCC	2	8	36821	36828	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015146	CCTT	2	8	36964	36971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015146	GCCA	2	8	39141	39148	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015146	CGCT	2	8	39160	39167	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015146	GTCG	2	8	41846	41853	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015146	CGCC	2	8	41860	41867	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_015146	AGCC	2	8	41962	41969	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015146	CCAG	2	8	42239	42246	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015146	TGCG	2	8	44591	44598	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015146	CCAG	2	8	45027	45034	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015146	CGGC	2	8	45558	45565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015146	TCAA	2	8	45725	45732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015146	AGCC	4	16	47554	47569	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015146	AGGC	2	8	48115	48122	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015146	TGAC	2	8	49787	49794	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015146	CGTG	2	8	50084	50091	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015146	CGGG	2	8	50492	50499	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015146	TGTC	2	8	50613	50620	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015146	GGGC	2	8	51030	51037	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015146	CGGT	2	8	51185	51192	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015146	CCGG	2	8	51391	51398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015146	GCGG	2	8	51568	51575	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015146	AGCC	2	8	51912	51919	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015146	CCAG	2	8	52592	52599	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015146	TGCC	2	8	52877	52884	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015146	GCGG	2	8	52911	52918	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015146	GGCC	2	8	52922	52929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015146	GCAG	2	8	53251	53258	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015146	CGAG	2	8	53418	53425	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015146	CTGG	2	8	53887	53894	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015146	TGGG	2	8	54739	54746	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015146	CCTA	2	8	54770	54777	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015146	AGGC	2	8	55527	55534	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015146	CGGA	2	8	55666	55673	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015146	CGTT	2	8	57968	57975	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015146	AACG	2	8	59719	59726	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015146	TTCT	2	8	61035	61042	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015146	GTTG	2	8	61088	61095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015146	CCCG	2	8	61218	61225	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_015146	GGCC	2	8	64890	64897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015146	AGGG	2	8	66354	66361	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015146	CCAG	2	8	66781	66788	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015146	TCAA	2	8	67479	67486	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015146	GGGT	2	8	71859	71866	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015146	ACCT	2	8	71991	71998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015146	CGGC	2	8	72403	72410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015146	CTGC	2	8	74200	74207	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015146	CATC	2	8	74495	74502	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015146	AAGA	2	8	78046	78053	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015146	CGGA	2	8	81122	81129	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015146	ATTC	2	8	81202	81209	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015146	CGGT	2	8	86477	86484	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015146	GTTG	2	8	86585	86592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015146	AGGA	2	8	86777	86784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015146	ACCC	2	8	86999	87006	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_015146	GCGG	2	8	89182	89189	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015146	TGGA	2	8	91720	91727	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015146	GGTT	2	8	92029	92036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015146	AGCG	2	8	92141	92148	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015146	GCGG	2	8	95669	95676	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015146	CGAA	2	8	95840	95847	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015146	GACT	2	8	96220	96227	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015146	CGGC	2	8	98896	98903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015146	GCCG	2	8	98948	98955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015146	GATT	2	8	100661	100668	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015146	CGTC	2	8	101238	101245	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015146	ACAA	2	8	104544	104551	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015146	CAGC	2	8	105584	105591	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015146	CCGG	2	8	106396	106403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015146	CTGC	2	8	107374	107381	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015146	CGGT	2	8	107761	107768	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015146	GACT	2	8	119922	119929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015146	GTAG	2	8	120368	120375	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015146	GCCG	2	8	123965	123972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015146	ACGA	2	8	134082	134089	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015146	GCCA	2	8	137953	137960	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015146	GCGG	2	8	141116	141123	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015146	GTTG	2	8	142143	142150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015146	GCCG	2	8	143784	143791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015146	CCGG	2	8	148165	148172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015146	AAAG	2	8	148248	148255	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015146	CTGG	2	8	149189	149196	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015146	AAGC	2	8	150354	150361	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015146	GAGC	2	8	150538	150545	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015146	TTCC	2	8	153304	153311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015146	ACCC	2	8	162509	162516	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
105	NC_015146	GCGG	2	8	164692	164699	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015146	TGGA	2	8	167230	167237	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015146	TGGA	2	8	168552	168559	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015146	CGGC	2	8	169893	169900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015146	AAGC	3	12	170133	170144	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015146	ACCC	2	8	170206	170213	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_015146	CGGC	2	8	171347	171354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015146	AAGC	3	12	171587	171598	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015146	ACCC	2	8	171660	171667	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
114	NC_015146	CGGA	2	8	173102	173109	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015146	CCGG	2	8	174945	174952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015146	GCGG	2	8	176888	176895	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015146	CGGC	2	8	177543	177550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015146	AAGC	3	12	177783	177794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015146	ACCC	2	8	177856	177863	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
120	NC_015146	CCCG	2	8	179269	179276	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_015146	CCGC	2	8	179978	179985	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_015146	ACCG	2	8	180203	180210	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015146	TTCA	2	8	180300	180307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015146	ACGA	2	8	180347	180354	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015146	TATG	2	8	182909	182916	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015146	CTGC	2	8	183140	183147	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015146	AGTC	2	8	183848	183855	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015146	AAGG	2	8	183918	183925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.