MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Arthrobacter phenanthrenivorans Sphe3 plasmid pASPHE301

Total Repeats: 374

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015146	CGGC	2	8	734	741	0 %	0 %	50 %	50 %	325965295
2	NC_015146	CAAC	2	8	1389	1396	50 %	0 %	0 %	50 %	325965296
3	NC_015146	TGGC	2	8	1836	1843	0 %	25 %	50 %	25 %	325965297
4	NC_015146	CCGG	2	8	2044	2051	0 %	0 %	50 %	50 %	325965297
5	NC_015146	GCCT	2	8	4105	4112	0 %	25 %	25 %	50 %	325965300
6	NC_015146	GCGT	2	8	4340	4347	0 %	25 %	50 %	25 %	325965300
7	NC_015146	CGGA	2	8	4953	4960	25 %	0 %	50 %	25 %	325965301
8	NC_015146	CAGC	2	8	5402	5409	25 %	0 %	25 %	50 %	325965301
9	NC_015146	TGGC	2	8	5578	5585	0 %	25 %	50 %	25 %	325965301
10	NC_015146	TCCG	2	8	5994	6001	0 %	25 %	25 %	50 %	325965302
11	NC_015146	TGCC	2	8	6146	6153	0 %	25 %	25 %	50 %	325965302
12	NC_015146	CGTC	2	8	6761	6768	0 %	25 %	25 %	50 %	325965302
13	NC_015146	AGGA	2	8	6940	6947	50 %	0 %	50 %	0 %	325965302
14	NC_015146	GATT	2	8	7372	7379	25 %	50 %	25 %	0 %	325965303
15	NC_015146	GCCT	2	8	8516	8523	0 %	25 %	25 %	50 %	325965303
16	NC_015146	CCGC	2	8	9018	9025	0 %	0 %	25 %	75 %	325965303
17	NC_015146	GGCA	2	8	9516	9523	25 %	0 %	50 %	25 %	325965304
18	NC_015146	CCAG	2	8	9746	9753	25 %	0 %	25 %	50 %	325965304
19	NC_015146	TGGC	2	8	9930	9937	0 %	25 %	50 %	25 %	325965304
20	NC_015146	GTAC	2	8	10532	10539	25 %	25 %	25 %	25 %	325965304
21	NC_015146	GTGC	2	8	10680	10687	0 %	25 %	50 %	25 %	325965304
22	NC_015146	GTGC	2	8	11006	11013	0 %	25 %	50 %	25 %	325965305
23	NC_015146	CGGA	2	8	11400	11407	25 %	0 %	50 %	25 %	325965305
24	NC_015146	TTGC	2	8	11500	11507	0 %	50 %	25 %	25 %	325965305
25	NC_015146	CAGC	2	8	11769	11776	25 %	0 %	25 %	50 %	325965305
26	NC_015146	TGGC	2	8	12200	12207	0 %	25 %	50 %	25 %	325965306
27	NC_015146	GACG	2	8	14361	14368	25 %	0 %	50 %	25 %	325965307
28	NC_015146	TGCC	2	8	14492	14499	0 %	25 %	25 %	50 %	325965307
29	NC_015146	GGGC	2	8	14785	14792	0 %	0 %	75 %	25 %	325965307
30	NC_015146	CGAA	2	8	14996	15003	50 %	0 %	25 %	25 %	325965308
31	NC_015146	CTTG	2	8	15165	15172	0 %	50 %	25 %	25 %	325965308
32	NC_015146	CTTC	2	8	15329	15336	0 %	50 %	0 %	50 %	325965308
33	NC_015146	CTAC	2	8	15338	15345	25 %	25 %	0 %	50 %	325965308
34	NC_015146	GACG	2	8	15663	15670	25 %	0 %	50 %	25 %	325965308
35	NC_015146	ACGT	2	8	16171	16178	25 %	25 %	25 %	25 %	325965310
36	NC_015146	GTCG	2	8	16539	16546	0 %	25 %	50 %	25 %	325965310
37	NC_015146	ATTG	2	8	16791	16798	25 %	50 %	25 %	0 %	325965310
38	NC_015146	GCCG	2	8	17446	17453	0 %	0 %	50 %	50 %	325965311
39	NC_015146	GGCC	2	8	17676	17683	0 %	0 %	50 %	50 %	325965311
40	NC_015146	CCGA	2	8	18916	18923	25 %	0 %	25 %	50 %	325965313
41	NC_015146	GCCC	2	8	19691	19698	0 %	0 %	25 %	75 %	325965314
42	NC_015146	GCTC	2	8	20430	20437	0 %	25 %	25 %	50 %	325965315
43	NC_015146	GATG	2	8	20518	20525	25 %	25 %	50 %	0 %	325965315
44	NC_015146	GCCG	2	8	20599	20606	0 %	0 %	50 %	50 %	325965315
45	NC_015146	GCCG	2	8	21927	21934	0 %	0 %	50 %	50 %	325965317
46	NC_015146	AGGT	2	8	22350	22357	25 %	25 %	50 %	0 %	325965317
47	NC_015146	ACCC	2	8	22482	22489	25 %	0 %	0 %	75 %	325965317
48	NC_015146	GGGC	2	8	24164	24171	0 %	0 %	75 %	25 %	325965321
49	NC_015146	GTCC	2	8	24432	24439	0 %	25 %	25 %	50 %	325965321
50	NC_015146	GCCG	2	8	24788	24795	0 %	0 %	50 %	50 %	325965322
51	NC_015146	CCCG	2	8	24804	24811	0 %	0 %	25 %	75 %	325965322
52	NC_015146	CGTG	2	8	25443	25450	0 %	25 %	50 %	25 %	325965323
53	NC_015146	CTGG	2	8	26350	26357	0 %	25 %	50 %	25 %	325965323
54	NC_015146	TGGA	2	8	26494	26501	25 %	25 %	50 %	0 %	325965323
55	NC_015146	CTGG	2	8	26593	26600	0 %	25 %	50 %	25 %	325965323
56	NC_015146	TGGA	2	8	27461	27468	25 %	25 %	50 %	0 %	325965326
57	NC_015146	GGGC	2	8	27906	27913	0 %	0 %	75 %	25 %	325965326
58	NC_015146	GGGC	2	8	28771	28778	0 %	0 %	75 %	25 %	325965327
59	NC_015146	GTCC	2	8	30424	30431	0 %	25 %	25 %	50 %	325965328
60	NC_015146	TGCC	2	8	31532	31539	0 %	25 %	25 %	50 %	325965328
61	NC_015146	ACGG	2	8	31606	31613	25 %	0 %	50 %	25 %	325965328
62	NC_015146	GTCG	2	8	31665	31672	0 %	25 %	50 %	25 %	325965328
63	NC_015146	GTGC	2	8	32378	32385	0 %	25 %	50 %	25 %	325965329
64	NC_015146	GATC	2	8	33004	33011	25 %	25 %	25 %	25 %	325965329
65	NC_015146	GGGC	2	8	34071	34078	0 %	0 %	75 %	25 %	325965330
66	NC_015146	CAGG	2	8	35362	35369	25 %	0 %	50 %	25 %	325965331
67	NC_015146	GGGT	2	8	35659	35666	0 %	25 %	75 %	0 %	325965332
68	NC_015146	ACCT	2	8	35791	35798	25 %	25 %	0 %	50 %	325965332
69	NC_015146	CGGC	2	8	36214	36221	0 %	0 %	50 %	50 %	325965332
70	NC_015146	GATC	2	8	37262	37269	25 %	25 %	25 %	25 %	325965333
71	NC_015146	CCGC	2	8	37612	37619	0 %	0 %	25 %	75 %	325965333
72	NC_015146	GCGT	2	8	37700	37707	0 %	25 %	50 %	25 %	325965333
73	NC_015146	ATCG	2	8	40315	40322	25 %	25 %	25 %	25 %	325965334
74	NC_015146	CGAT	2	8	40533	40540	25 %	25 %	25 %	25 %	325965334
75	NC_015146	TCCT	2	8	40621	40628	0 %	50 %	0 %	50 %	325965334
76	NC_015146	CGAG	2	8	40968	40975	25 %	0 %	50 %	25 %	325965334
77	NC_015146	GTTC	2	8	41295	41302	0 %	50 %	25 %	25 %	325965334
78	NC_015146	CGGT	2	8	42758	42765	0 %	25 %	50 %	25 %	325965335
79	NC_015146	ACGA	2	8	43632	43639	50 %	0 %	25 %	25 %	325965336
80	NC_015146	CGAA	2	8	44829	44836	50 %	0 %	25 %	25 %	325965337
81	NC_015146	GCCG	2	8	46858	46865	0 %	0 %	50 %	50 %	325965338
82	NC_015146	CCGG	2	8	46866	46873	0 %	0 %	50 %	50 %	325965338
83	NC_015146	AGGA	2	8	47360	47367	50 %	0 %	50 %	0 %	325965338
84	NC_015146	CCAG	2	8	47929	47936	25 %	0 %	25 %	50 %	325965339
85	NC_015146	AGCC	2	8	48047	48054	25 %	0 %	25 %	50 %	325965339
86	NC_015146	GGAA	2	8	48689	48696	50 %	0 %	50 %	0 %	325965340
87	NC_015146	GTAC	2	8	54123	54130	25 %	25 %	25 %	25 %	325965342
88	NC_015146	CCGG	2	8	54225	54232	0 %	0 %	50 %	50 %	325965342
89	NC_015146	CAAC	2	8	58521	58528	50 %	0 %	0 %	50 %	325965345
90	NC_015146	GAAG	2	8	58650	58657	50 %	0 %	50 %	0 %	325965345
91	NC_015146	CCGG	2	8	58947	58954	0 %	0 %	50 %	50 %	325965345
92	NC_015146	GAGG	2	8	60084	60091	25 %	0 %	75 %	0 %	325965346
93	NC_015146	AGGC	2	8	60538	60545	25 %	0 %	50 %	25 %	325965346
94	NC_015146	GGGT	2	8	62033	62040	0 %	25 %	75 %	0 %	325965348
95	NC_015146	ACCT	2	8	62165	62172	25 %	25 %	0 %	50 %	325965348
96	NC_015146	TCCT	2	8	62733	62740	0 %	50 %	0 %	50 %	325965349
97	NC_015146	ACAA	2	8	63991	63998	75 %	0 %	0 %	25 %	325965351
98	NC_015146	CAGC	2	8	64043	64050	25 %	0 %	25 %	50 %	325965351
99	NC_015146	ACGG	2	8	64132	64139	25 %	0 %	50 %	25 %	325965351
100	NC_015146	AACC	2	8	64154	64161	50 %	0 %	0 %	50 %	325965351
101	NC_015146	CAGC	2	8	64385	64392	25 %	0 %	25 %	50 %	325965351
102	NC_015146	CGTC	2	8	64714	64721	0 %	25 %	25 %	50 %	325965351
103	NC_015146	GCCC	2	8	65123	65130	0 %	0 %	25 %	75 %	325965352
104	NC_015146	CGAA	2	8	65164	65171	50 %	0 %	25 %	25 %	325965352
105	NC_015146	CCGC	2	8	65346	65353	0 %	0 %	25 %	75 %	325965352
106	NC_015146	CGAA	2	8	66583	66590	50 %	0 %	25 %	25 %	325965354
107	NC_015146	CGGC	2	8	67312	67319	0 %	0 %	50 %	50 %	325965355
108	NC_015146	CGGC	2	8	68609	68616	0 %	0 %	50 %	50 %	325965358
109	NC_015146	ACCG	2	8	68844	68851	25 %	0 %	25 %	50 %	325965358
110	NC_015146	CCGC	2	8	68882	68889	0 %	0 %	25 %	75 %	325965358
111	NC_015146	GTTC	2	8	69380	69387	0 %	50 %	25 %	25 %	325965358
112	NC_015146	CGGG	2	8	69852	69859	0 %	0 %	75 %	25 %	325965358
113	NC_015146	CGCC	2	8	70157	70164	0 %	0 %	25 %	75 %	325965358
114	NC_015146	CGTC	2	8	70351	70358	0 %	25 %	25 %	50 %	325965358
115	NC_015146	TCGT	2	8	70608	70615	0 %	50 %	25 %	25 %	325965358
116	NC_015146	CCAG	2	8	72614	72621	25 %	0 %	25 %	50 %	325965359
117	NC_015146	GGTG	2	8	72773	72780	0 %	25 %	75 %	0 %	325965359
118	NC_015146	CTTT	2	8	72866	72873	0 %	75 %	0 %	25 %	325965359
119	NC_015146	GCGG	2	8	75070	75077	0 %	0 %	75 %	25 %	325965360
120	NC_015146	AGCG	2	8	75124	75131	25 %	0 %	50 %	25 %	325965360
121	NC_015146	ACGA	2	8	75359	75366	50 %	0 %	25 %	25 %	325965360
122	NC_015146	CGAT	2	8	75587	75594	25 %	25 %	25 %	25 %	325965361
123	NC_015146	GTTT	2	8	75708	75715	0 %	75 %	25 %	0 %	325965361
124	NC_015146	TCGG	2	8	76124	76131	0 %	25 %	50 %	25 %	325965361
125	NC_015146	GCAG	2	8	77422	77429	25 %	0 %	50 %	25 %	325965363
126	NC_015146	CGCT	2	8	77699	77706	0 %	25 %	25 %	50 %	325965363
127	NC_015146	GCCG	2	8	78149	78156	0 %	0 %	50 %	50 %	325965364
128	NC_015146	GCTG	2	8	78359	78366	0 %	25 %	50 %	25 %	325965364
129	NC_015146	GAAG	2	8	78370	78377	50 %	0 %	50 %	0 %	325965364
130	NC_015146	ACGC	2	8	79155	79162	25 %	0 %	25 %	50 %	325965365
131	NC_015146	GCTG	2	8	79576	79583	0 %	25 %	50 %	25 %	325965365
132	NC_015146	GGTT	2	8	79634	79641	0 %	50 %	50 %	0 %	325965365
133	NC_015146	GCGG	2	8	79805	79812	0 %	0 %	75 %	25 %	325965365
134	NC_015146	TCTT	2	8	79819	79826	0 %	75 %	0 %	25 %	325965365
135	NC_015146	CGTG	2	8	79831	79838	0 %	25 %	50 %	25 %	325965365
136	NC_015146	TGCC	2	8	80387	80394	0 %	25 %	25 %	50 %	325965366
137	NC_015146	GAAA	2	8	80493	80500	75 %	0 %	25 %	0 %	325965366
138	NC_015146	TCGG	2	8	80624	80631	0 %	25 %	50 %	25 %	325965366
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.