MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 228

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015138	TTTTTC	2	12	20876	20887	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015138	AATTGC	2	12	55953	55964	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015138	ATCGGA	2	12	58387	58398	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015138	CCGCAT	2	12	121886	121897	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015138	CGCATG	2	12	123481	123492	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015138	GGCCGG	2	12	148595	148606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015138	CGGAAA	2	12	155941	155952	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015138	CCGGGC	2	12	163208	163219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015138	CGGTAA	2	12	170364	170375	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015138	GAAGGC	2	12	172879	172890	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015138	CGGGCG	2	12	175079	175090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015138	CGTGCG	2	12	179762	179773	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015138	CGAGGG	2	12	193198	193209	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015138	CCGTGG	2	12	218707	218718	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015138	TATGGC	2	12	315650	315661	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015138	GGGGCG	2	12	374724	374735	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015138	TCGAGT	2	12	406000	406011	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015138	TCGACC	2	12	413730	413741	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015138	CATGTG	2	12	415688	415699	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015138	CTTTTT	2	12	478213	478224	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015138	GTGGAT	2	12	489285	489296	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015138	CCTGGC	2	12	555770	555781	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015138	GTCATG	2	12	559692	559703	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015138	GCCCCG	2	12	579137	579148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_015138	CGAAAC	2	12	621214	621225	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015138	GTTTTT	2	12	638523	638534	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015138	ATCCGA	2	12	701246	701257	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015138	GGGGCT	2	12	778265	778276	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015138	TGGTTT	2	12	780284	780295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015138	TGCGCC	2	12	785122	785133	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015138	CCGGAT	2	12	838836	838847	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015138	CCCCGG	2	12	857070	857081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_015138	CGTTTC	3	18	870041	870058	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015138	TGCCAG	2	12	891671	891682	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015138	GGGCGA	2	12	909999	910010	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015138	GGGCCG	2	12	980148	980159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015138	GCCAAG	2	12	1000188	1000199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015138	ACCGGT	3	18	1028580	1028597	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015138	GATCCC	2	12	1051944	1051955	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015138	GGATGC	2	12	1062952	1062963	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015138	TTTCCC	2	12	1146134	1146145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015138	GCCCCG	2	12	1158410	1158421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_015138	GCCCCG	2	12	1194468	1194479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015138	GACAAA	2	12	1256832	1256843	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015138	CTTTTT	2	12	1292090	1292101	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015138	GGGCCT	2	12	1318165	1318176	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015138	TGGGGG	2	12	1396870	1396881	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015138	CACGAG	2	12	1406925	1406936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015138	CCGGGG	2	12	1468632	1468643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015138	GCTCCC	2	12	1494523	1494534	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_015138	GAAATG	2	12	1518741	1518752	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015138	GGTATC	2	12	1558417	1558428	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015138	TCTTGC	2	12	1562355	1562366	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015138	ATCGGG	2	12	1638661	1638672	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015138	CGATGC	2	12	1673605	1673616	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015138	ATTTCC	2	12	1696232	1696243	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015138	ATGGCC	2	12	1721909	1721920	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015138	GTCCCC	2	12	1775983	1775994	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_015138	CAAGTT	2	12	1785372	1785383	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015138	CTCGGC	2	12	1785679	1785690	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015138	TTCCCG	2	12	1789065	1789076	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015138	CGCGAC	2	12	1824426	1824437	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015138	ACTCCC	2	12	1855495	1855506	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_015138	TCGCGC	2	12	1910608	1910619	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015138	GGCCCG	2	12	1911803	1911814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015138	GCTGCC	2	12	1917686	1917697	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015138	CAGCGC	2	12	1918222	1918233	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015138	GGCGCG	2	12	2041005	2041016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015138	CCGGCC	2	12	2043363	2043374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_015138	CCCTTT	2	12	2074871	2074882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015138	AGCGTG	2	12	2085622	2085633	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015138	GCGATG	2	12	2087256	2087267	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015138	TCAAGG	2	12	2121111	2121122	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015138	GCAGGC	2	12	2126765	2126776	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015138	CATGTT	2	12	2160935	2160946	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015138	CCGGCA	2	12	2161607	2161618	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015138	TCTCCC	2	12	2163710	2163721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_015138	GCGGCT	2	12	2199179	2199190	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015138	CGCTGG	2	12	2224379	2224390	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015138	ACATCG	2	12	2264346	2264357	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015138	CGGCAT	2	12	2308172	2308183	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015138	CCGGGC	2	12	2343729	2343740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015138	CGGCCC	2	12	2351620	2351631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015138	GGGCAA	2	12	2364294	2364305	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015138	GCGAGC	2	12	2391732	2391743	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015138	TTCGTA	2	12	2391817	2391828	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015138	CCGACG	2	12	2394813	2394824	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015138	CGACAA	2	12	2401702	2401713	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015138	GTGCAC	2	12	2405250	2405261	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015138	GGCCCG	2	12	2408147	2408158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015138	GTGCCG	2	12	2408845	2408856	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015138	GAAGGG	2	12	2408889	2408900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015138	GGCGAG	4	24	2408922	2408945	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015138	CGCCAC	2	12	2408968	2408979	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_015138	GGAGGC	2	12	2430271	2430282	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015138	GGAGGC	2	12	2430299	2430310	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_015138	CTTTTT	2	12	2430424	2430435	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015138	GCGGGG	2	12	2504814	2504825	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015138	GAAAAA	2	12	2583751	2583762	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015138	AGGACG	2	12	2586567	2586578	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015138	CCTGAT	2	12	2655357	2655368	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015138	TGACGT	2	12	2660107	2660118	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015138	AGGGCT	2	12	2670278	2670289	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_015138	CATGCC	2	12	2798100	2798111	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015138	CCCATT	2	12	2799889	2799900	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015138	GCCAGG	4	24	2844854	2844877	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015138	CCATGG	2	12	2848423	2848434	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015138	GCGGCC	2	12	2850383	2850394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015138	TGCCGG	2	12	2910457	2910468	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015138	CCGGCG	2	12	2936320	2936331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015138	TACGAA	2	12	2937348	2937359	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_015138	GCTCGC	2	12	2937433	2937444	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015138	TGCCGG	2	12	2974520	2974531	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015138	TCCTTG	2	12	2997809	2997820	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015138	GCGAGC	2	12	3010151	3010162	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015138	TTCGTA	2	12	3010236	3010247	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015138	TGCGCT	2	12	3034956	3034967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015138	AAACCA	2	12	3036194	3036205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015138	TGCCCG	2	12	3070042	3070053	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015138	CATCCA	2	12	3070115	3070126	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015138	GCCATG	2	12	3095430	3095441	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015138	CACGCG	2	12	3149287	3149298	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015138	GGCCAT	2	12	3167784	3167795	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015138	TGAGCG	2	12	3171786	3171797	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_015138	GCACGG	2	12	3171831	3171842	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015138	CGATGA	2	12	3172140	3172151	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_015138	AAAAAC	2	12	3177275	3177286	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_015138	CCGGCC	2	12	3182137	3182148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_015138	AGGCCG	2	12	3221260	3221271	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015138	CGCGGC	2	12	3228595	3228606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015138	CGGCGC	2	12	3233216	3233227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015138	GCTCGC	2	12	3252390	3252401	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015138	ATCCGT	2	12	3343353	3343364	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015138	TGCAGG	2	12	3404384	3404395	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_015138	CTTTCC	2	12	3414778	3414789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015138	GCCTCG	2	12	3449824	3449835	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015138	CCCCGG	2	12	3450537	3450548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_015138	TACGAA	2	12	3482251	3482262	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_015138	GCTCGC	2	12	3482336	3482347	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015138	CGATCC	2	12	3489205	3489216	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015138	CCGCCC	2	12	3490728	3490739	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
142	NC_015138	GCGCAC	2	12	3581339	3581350	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015138	CCCCGG	2	12	3596651	3596662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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145	NC_015138	CCGGCC	2	12	3651069	3651080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_015138	TACGAA	2	12	3668338	3668349	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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150	NC_015138	ACCGCG	2	12	3733536	3733547	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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152	NC_015138	GGACGG	2	12	3817055	3817066	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_015138	AGGCAA	2	12	3819858	3819869	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_015138	GACGCC	2	12	3842051	3842062	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
155	NC_015138	CGCGCA	2	12	3844611	3844622	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
156	NC_015138	GGAAGG	2	12	3851368	3851379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015138	TTTGAT	2	12	3870700	3870711	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015138	CCCGCC	2	12	3870781	3870792	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
159	NC_015138	ACCTCG	2	12	3908094	3908105	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
160	NC_015138	CGGCCG	2	12	3959540	3959551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_015138	GCCTTG	2	12	3971086	3971097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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227	NC_015138	GGCGCG	2	12	5455825	5455836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.